Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G8JNW6

Protein Details
Accession G8JNW6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
144-169AAPSSTPKERTKRRHNHKPATRHVSRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
153-161RTKRRHNHK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020401  mRNA_transport_factor_GFD1  
KEGG erc:Ecym_2681  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17331  GFD1  
Amino Acid Sequences MPLDSKWATAAETSPQSETRGRKASLSNKKYGQRNGGANPMKWSSARSGQNDEPAHIRSTTGKLKSRGTEVPASSGSANSVTSDLELSESRPSTGGSDLNPRNRIFDRHVSSDTAGAGRSGTSEENDGIQEQKPNPLAVVLGLAAPSSTPKERTKRRHNHKPATRHVSRTHVSEAASTNRLHASNALAARLGFNADAKDQSDVSGHDKDERPSKGSPLRTNVLKKKIEEQKRMLEEKKHKALQKQILDEFLCDECPLEWDESELVGQLDRLQFKPGSNNIK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.25
3 0.28
4 0.33
5 0.36
6 0.38
7 0.41
8 0.41
9 0.43
10 0.5
11 0.57
12 0.62
13 0.64
14 0.63
15 0.64
16 0.7
17 0.74
18 0.72
19 0.7
20 0.66
21 0.66
22 0.62
23 0.65
24 0.62
25 0.55
26 0.53
27 0.46
28 0.41
29 0.34
30 0.32
31 0.28
32 0.31
33 0.37
34 0.36
35 0.42
36 0.43
37 0.51
38 0.5
39 0.46
40 0.4
41 0.36
42 0.33
43 0.26
44 0.24
45 0.19
46 0.24
47 0.3
48 0.34
49 0.38
50 0.4
51 0.45
52 0.47
53 0.49
54 0.47
55 0.44
56 0.44
57 0.38
58 0.38
59 0.33
60 0.32
61 0.27
62 0.23
63 0.19
64 0.13
65 0.12
66 0.09
67 0.09
68 0.07
69 0.07
70 0.07
71 0.06
72 0.07
73 0.08
74 0.08
75 0.11
76 0.11
77 0.11
78 0.12
79 0.12
80 0.11
81 0.13
82 0.13
83 0.12
84 0.2
85 0.25
86 0.31
87 0.35
88 0.33
89 0.36
90 0.36
91 0.38
92 0.35
93 0.39
94 0.38
95 0.38
96 0.4
97 0.37
98 0.36
99 0.33
100 0.28
101 0.19
102 0.14
103 0.1
104 0.08
105 0.06
106 0.06
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.07
111 0.07
112 0.08
113 0.08
114 0.08
115 0.08
116 0.09
117 0.12
118 0.11
119 0.14
120 0.15
121 0.14
122 0.14
123 0.12
124 0.11
125 0.08
126 0.08
127 0.05
128 0.04
129 0.04
130 0.04
131 0.03
132 0.03
133 0.04
134 0.05
135 0.06
136 0.1
137 0.16
138 0.25
139 0.35
140 0.45
141 0.56
142 0.65
143 0.74
144 0.82
145 0.87
146 0.89
147 0.88
148 0.88
149 0.86
150 0.85
151 0.78
152 0.72
153 0.64
154 0.61
155 0.54
156 0.48
157 0.41
158 0.34
159 0.3
160 0.27
161 0.26
162 0.22
163 0.23
164 0.2
165 0.18
166 0.18
167 0.18
168 0.16
169 0.15
170 0.13
171 0.15
172 0.16
173 0.15
174 0.13
175 0.13
176 0.13
177 0.12
178 0.11
179 0.06
180 0.07
181 0.07
182 0.08
183 0.09
184 0.09
185 0.11
186 0.1
187 0.11
188 0.11
189 0.12
190 0.15
191 0.18
192 0.17
193 0.22
194 0.24
195 0.27
196 0.33
197 0.34
198 0.34
199 0.32
200 0.39
201 0.4
202 0.45
203 0.48
204 0.47
205 0.5
206 0.54
207 0.62
208 0.63
209 0.65
210 0.62
211 0.58
212 0.61
213 0.66
214 0.68
215 0.68
216 0.66
217 0.66
218 0.69
219 0.74
220 0.7
221 0.69
222 0.69
223 0.7
224 0.73
225 0.7
226 0.67
227 0.68
228 0.73
229 0.73
230 0.71
231 0.69
232 0.62
233 0.61
234 0.56
235 0.5
236 0.42
237 0.33
238 0.26
239 0.18
240 0.17
241 0.11
242 0.12
243 0.14
244 0.13
245 0.12
246 0.13
247 0.14
248 0.14
249 0.14
250 0.13
251 0.11
252 0.09
253 0.09
254 0.11
255 0.15
256 0.18
257 0.19
258 0.23
259 0.24
260 0.26
261 0.35