Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G8JVA5

Protein Details
Accession G8JVA5    Localization Confidence High Confidence Score 18.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-28MAKAATTKKAAKKDLKKQKKAATPVTSSHydrophilic
191-212DRSKDEKSQKKHKKDSPTEPATBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-20KKAAKKDLKKQKK
200-201KK
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG erc:Ecym_6201  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12447  RRM1_gar2  
Amino Acid Sequences MAKAATTKKAAKKDLKKQKKAATPVTSSSSSEDSSSSSSSESSSDSEAESNSTSSSSEAESNSSSSSEDESSSDDESSDSSSSDSESESEKPNKKTKSSSEDEDSSSKSDSSDSEQSDSESESDSEEKAKNDETSSSSSSDDDSSDDSSDESSSSSSEDAATGVMKTDEEEEEEEEEGSKKRKSTDSANLDRSKDEKSQKKHKKDSPTEPATIFVGRLSWSIDDEWLKTEFEHIGGVISARVIYERGTERSRGYGYVDFEDKSYAEKAIKEMQGKEIDGRPINVDMSTSKPASNPKEDRAKKFGDVPSQPSDTLFLGNLSFNADRDNIFELFKDYGSIISVRIPTHPETNQPKGFGYVQYASIEEAQKALDKLQGEYIDNRPVRLDFSSPRPPQSGNGGNSGFRGGRGGARFTPRGGPTARTGSGANSAPLGKGRQSAAFQGTKKTFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.84
2 0.87
3 0.89
4 0.9
5 0.9
6 0.89
7 0.88
8 0.87
9 0.84
10 0.79
11 0.73
12 0.7
13 0.62
14 0.54
15 0.48
16 0.4
17 0.32
18 0.27
19 0.23
20 0.19
21 0.2
22 0.19
23 0.17
24 0.15
25 0.14
26 0.14
27 0.15
28 0.14
29 0.14
30 0.15
31 0.15
32 0.15
33 0.16
34 0.15
35 0.16
36 0.15
37 0.14
38 0.12
39 0.12
40 0.11
41 0.11
42 0.11
43 0.11
44 0.13
45 0.13
46 0.15
47 0.16
48 0.17
49 0.17
50 0.16
51 0.15
52 0.13
53 0.15
54 0.14
55 0.13
56 0.13
57 0.15
58 0.16
59 0.17
60 0.16
61 0.14
62 0.13
63 0.12
64 0.14
65 0.12
66 0.1
67 0.09
68 0.09
69 0.1
70 0.1
71 0.1
72 0.09
73 0.11
74 0.14
75 0.2
76 0.29
77 0.35
78 0.41
79 0.49
80 0.53
81 0.56
82 0.61
83 0.63
84 0.63
85 0.62
86 0.62
87 0.61
88 0.58
89 0.57
90 0.51
91 0.44
92 0.37
93 0.32
94 0.26
95 0.19
96 0.17
97 0.15
98 0.18
99 0.23
100 0.23
101 0.24
102 0.24
103 0.24
104 0.24
105 0.24
106 0.18
107 0.13
108 0.12
109 0.11
110 0.12
111 0.12
112 0.15
113 0.16
114 0.16
115 0.16
116 0.18
117 0.18
118 0.18
119 0.2
120 0.19
121 0.22
122 0.23
123 0.23
124 0.22
125 0.2
126 0.2
127 0.19
128 0.16
129 0.12
130 0.12
131 0.12
132 0.11
133 0.11
134 0.1
135 0.1
136 0.1
137 0.09
138 0.07
139 0.06
140 0.06
141 0.07
142 0.07
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.07
155 0.07
156 0.08
157 0.09
158 0.09
159 0.1
160 0.11
161 0.1
162 0.09
163 0.1
164 0.11
165 0.13
166 0.13
167 0.14
168 0.17
169 0.21
170 0.24
171 0.3
172 0.39
173 0.46
174 0.51
175 0.58
176 0.58
177 0.55
178 0.53
179 0.46
180 0.4
181 0.37
182 0.38
183 0.38
184 0.43
185 0.53
186 0.62
187 0.71
188 0.77
189 0.77
190 0.8
191 0.81
192 0.83
193 0.82
194 0.77
195 0.69
196 0.6
197 0.54
198 0.44
199 0.35
200 0.25
201 0.14
202 0.1
203 0.07
204 0.07
205 0.07
206 0.06
207 0.07
208 0.07
209 0.09
210 0.09
211 0.09
212 0.1
213 0.1
214 0.1
215 0.09
216 0.1
217 0.09
218 0.09
219 0.08
220 0.06
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.04
225 0.04
226 0.03
227 0.03
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.07
232 0.09
233 0.13
234 0.15
235 0.16
236 0.17
237 0.2
238 0.2
239 0.18
240 0.19
241 0.19
242 0.19
243 0.19
244 0.2
245 0.18
246 0.17
247 0.17
248 0.14
249 0.12
250 0.11
251 0.11
252 0.1
253 0.11
254 0.13
255 0.19
256 0.22
257 0.23
258 0.24
259 0.27
260 0.28
261 0.28
262 0.28
263 0.25
264 0.25
265 0.23
266 0.23
267 0.19
268 0.18
269 0.18
270 0.15
271 0.13
272 0.1
273 0.13
274 0.16
275 0.15
276 0.15
277 0.17
278 0.23
279 0.28
280 0.35
281 0.35
282 0.39
283 0.49
284 0.54
285 0.58
286 0.57
287 0.56
288 0.48
289 0.52
290 0.5
291 0.48
292 0.46
293 0.45
294 0.44
295 0.43
296 0.41
297 0.33
298 0.31
299 0.23
300 0.2
301 0.15
302 0.11
303 0.1
304 0.1
305 0.09
306 0.11
307 0.11
308 0.1
309 0.12
310 0.12
311 0.11
312 0.13
313 0.16
314 0.14
315 0.14
316 0.14
317 0.14
318 0.15
319 0.15
320 0.13
321 0.1
322 0.1
323 0.11
324 0.11
325 0.09
326 0.11
327 0.14
328 0.13
329 0.15
330 0.18
331 0.19
332 0.24
333 0.25
334 0.31
335 0.36
336 0.44
337 0.45
338 0.44
339 0.42
340 0.4
341 0.41
342 0.33
343 0.31
344 0.24
345 0.23
346 0.22
347 0.22
348 0.19
349 0.21
350 0.21
351 0.16
352 0.14
353 0.13
354 0.14
355 0.15
356 0.15
357 0.14
358 0.14
359 0.15
360 0.19
361 0.21
362 0.21
363 0.25
364 0.27
365 0.33
366 0.33
367 0.32
368 0.29
369 0.27
370 0.27
371 0.26
372 0.27
373 0.23
374 0.3
375 0.41
376 0.42
377 0.45
378 0.45
379 0.45
380 0.42
381 0.47
382 0.48
383 0.4
384 0.44
385 0.42
386 0.39
387 0.38
388 0.39
389 0.29
390 0.21
391 0.2
392 0.15
393 0.19
394 0.21
395 0.25
396 0.27
397 0.34
398 0.35
399 0.36
400 0.42
401 0.38
402 0.4
403 0.38
404 0.36
405 0.35
406 0.4
407 0.39
408 0.33
409 0.33
410 0.3
411 0.33
412 0.32
413 0.26
414 0.21
415 0.21
416 0.2
417 0.23
418 0.24
419 0.2
420 0.22
421 0.24
422 0.27
423 0.29
424 0.33
425 0.37
426 0.41
427 0.41
428 0.46