Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A423VA13

Protein Details
Accession A0A423VA13    Localization Confidence High Confidence Score 20.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
16-36GARVRGYRPRRGGPRGGRGGABasic
359-383LTMKKASKKAEQKAKKLKTKFKDPEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
10-34RGARGGGARVRGYRPRRGGPRGGRG
145-164ARLRRGGRGRGGGRRARGGA
362-378KKASKKAEQKAKKLKTK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007811  RPC4  
Gene Ontology GO:0005666  C:RNA polymerase III complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006383  P:transcription by RNA polymerase III  
Pfam View protein in Pfam  
PF05132  RNA_pol_Rpc4  
Amino Acid Sequences MAPEGEGSARGARGGGARVRGYRPRRGGPRGGRGGATTAAPSNGNNAPDADMGDATAPAPAPAAAAAAAPTDSQANTNAPSNPQPDSTPSSSTTRPVASRPTPARAGAAGAAKFLPRAVRRSQLDREAIAQKESQKQEDRAAQEARLRRGGRGRGGGRRARGGAPGGYQDRIIKGGAGGFASMIEATGSRGSSSGFGRLYDYGSAGGSGGGSGGGSWGGGGGVKSEGGPSGFSTESSRPTGKRMNTDKIVEYVVIEDEEEQVKNKEGAAVLLPKGMQRADPKEPDQPVIATAEEVEAADRGETIIPVSSGGSEEDEVDGDVFFNDADVEMRDDERQWPGAKPESRVKVEGEEVTEIDTLTMKKASKKAEQKAKKLKTKFKDPEDQLAAETLAFQRRLFGVESDEDSDSEAPKEVKAPRKPAIIDGNLYMFQFPPVLPPLHVERPQRSQNPVKDEPNDDMVMLDAPDHKPVDLTAADDFNTIKQEEGAANAAKNASQSDEAPSGFLGKLIIRKSGKMQIDYGGMIFDCESGIPVEFLRTAVLTEMDDEKKTDGYAGTAYGMGQIAGKFVSVPKWSDEEEWVVDPSELPPNGVDAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.21
3 0.24
4 0.28
5 0.32
6 0.39
7 0.47
8 0.5
9 0.55
10 0.59
11 0.63
12 0.69
13 0.73
14 0.77
15 0.77
16 0.82
17 0.8
18 0.75
19 0.66
20 0.58
21 0.53
22 0.44
23 0.35
24 0.26
25 0.19
26 0.18
27 0.17
28 0.16
29 0.18
30 0.2
31 0.19
32 0.18
33 0.18
34 0.19
35 0.19
36 0.19
37 0.16
38 0.12
39 0.12
40 0.11
41 0.1
42 0.08
43 0.09
44 0.08
45 0.06
46 0.07
47 0.06
48 0.06
49 0.06
50 0.06
51 0.05
52 0.06
53 0.06
54 0.06
55 0.07
56 0.06
57 0.07
58 0.08
59 0.08
60 0.09
61 0.11
62 0.12
63 0.14
64 0.18
65 0.19
66 0.21
67 0.26
68 0.28
69 0.27
70 0.27
71 0.27
72 0.29
73 0.34
74 0.34
75 0.32
76 0.32
77 0.35
78 0.35
79 0.36
80 0.34
81 0.31
82 0.3
83 0.3
84 0.35
85 0.34
86 0.43
87 0.45
88 0.47
89 0.45
90 0.44
91 0.43
92 0.34
93 0.32
94 0.26
95 0.26
96 0.21
97 0.19
98 0.19
99 0.17
100 0.16
101 0.16
102 0.19
103 0.17
104 0.22
105 0.26
106 0.34
107 0.38
108 0.46
109 0.51
110 0.52
111 0.52
112 0.48
113 0.49
114 0.46
115 0.43
116 0.38
117 0.34
118 0.31
119 0.36
120 0.38
121 0.39
122 0.39
123 0.4
124 0.45
125 0.49
126 0.47
127 0.44
128 0.44
129 0.4
130 0.4
131 0.43
132 0.41
133 0.42
134 0.4
135 0.38
136 0.43
137 0.46
138 0.46
139 0.49
140 0.5
141 0.51
142 0.58
143 0.6
144 0.55
145 0.53
146 0.5
147 0.43
148 0.4
149 0.34
150 0.27
151 0.24
152 0.26
153 0.24
154 0.22
155 0.21
156 0.2
157 0.18
158 0.18
159 0.16
160 0.11
161 0.09
162 0.1
163 0.1
164 0.09
165 0.08
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.04
171 0.03
172 0.03
173 0.05
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.07
179 0.09
180 0.1
181 0.13
182 0.12
183 0.13
184 0.15
185 0.15
186 0.16
187 0.14
188 0.14
189 0.1
190 0.09
191 0.09
192 0.07
193 0.06
194 0.05
195 0.04
196 0.04
197 0.03
198 0.03
199 0.02
200 0.03
201 0.02
202 0.02
203 0.02
204 0.02
205 0.02
206 0.03
207 0.03
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.06
216 0.05
217 0.08
218 0.08
219 0.09
220 0.13
221 0.14
222 0.17
223 0.2
224 0.22
225 0.19
226 0.24
227 0.3
228 0.29
229 0.37
230 0.4
231 0.44
232 0.46
233 0.47
234 0.44
235 0.39
236 0.37
237 0.27
238 0.21
239 0.14
240 0.11
241 0.08
242 0.07
243 0.06
244 0.06
245 0.07
246 0.07
247 0.07
248 0.08
249 0.09
250 0.09
251 0.09
252 0.09
253 0.08
254 0.09
255 0.1
256 0.11
257 0.11
258 0.11
259 0.11
260 0.1
261 0.11
262 0.11
263 0.11
264 0.13
265 0.18
266 0.23
267 0.26
268 0.28
269 0.33
270 0.34
271 0.32
272 0.29
273 0.24
274 0.19
275 0.17
276 0.14
277 0.09
278 0.08
279 0.06
280 0.06
281 0.05
282 0.05
283 0.03
284 0.03
285 0.03
286 0.03
287 0.03
288 0.03
289 0.03
290 0.04
291 0.04
292 0.04
293 0.04
294 0.04
295 0.04
296 0.04
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.05
303 0.05
304 0.05
305 0.05
306 0.04
307 0.04
308 0.03
309 0.03
310 0.03
311 0.03
312 0.03
313 0.03
314 0.04
315 0.05
316 0.05
317 0.06
318 0.07
319 0.08
320 0.09
321 0.1
322 0.12
323 0.13
324 0.14
325 0.16
326 0.23
327 0.25
328 0.28
329 0.33
330 0.37
331 0.38
332 0.39
333 0.37
334 0.31
335 0.31
336 0.28
337 0.22
338 0.17
339 0.14
340 0.14
341 0.13
342 0.11
343 0.09
344 0.09
345 0.07
346 0.07
347 0.1
348 0.1
349 0.14
350 0.19
351 0.24
352 0.32
353 0.41
354 0.49
355 0.57
356 0.64
357 0.71
358 0.77
359 0.81
360 0.81
361 0.81
362 0.81
363 0.78
364 0.81
365 0.79
366 0.76
367 0.76
368 0.71
369 0.71
370 0.65
371 0.58
372 0.47
373 0.39
374 0.32
375 0.22
376 0.19
377 0.12
378 0.12
379 0.11
380 0.11
381 0.11
382 0.12
383 0.14
384 0.14
385 0.13
386 0.13
387 0.14
388 0.16
389 0.17
390 0.17
391 0.15
392 0.16
393 0.15
394 0.13
395 0.12
396 0.12
397 0.1
398 0.1
399 0.15
400 0.2
401 0.29
402 0.34
403 0.41
404 0.44
405 0.49
406 0.5
407 0.5
408 0.52
409 0.45
410 0.41
411 0.35
412 0.33
413 0.28
414 0.27
415 0.21
416 0.14
417 0.11
418 0.1
419 0.09
420 0.1
421 0.12
422 0.13
423 0.13
424 0.15
425 0.21
426 0.27
427 0.34
428 0.36
429 0.38
430 0.44
431 0.52
432 0.54
433 0.55
434 0.57
435 0.58
436 0.62
437 0.64
438 0.62
439 0.58
440 0.56
441 0.52
442 0.48
443 0.41
444 0.32
445 0.25
446 0.2
447 0.16
448 0.13
449 0.11
450 0.09
451 0.1
452 0.13
453 0.13
454 0.12
455 0.12
456 0.12
457 0.15
458 0.13
459 0.14
460 0.13
461 0.14
462 0.14
463 0.14
464 0.15
465 0.12
466 0.14
467 0.12
468 0.11
469 0.1
470 0.11
471 0.11
472 0.13
473 0.15
474 0.14
475 0.14
476 0.15
477 0.15
478 0.14
479 0.14
480 0.13
481 0.12
482 0.12
483 0.13
484 0.16
485 0.19
486 0.19
487 0.18
488 0.18
489 0.18
490 0.16
491 0.15
492 0.12
493 0.11
494 0.16
495 0.17
496 0.25
497 0.24
498 0.26
499 0.31
500 0.39
501 0.42
502 0.39
503 0.39
504 0.35
505 0.36
506 0.34
507 0.29
508 0.22
509 0.16
510 0.14
511 0.12
512 0.09
513 0.07
514 0.06
515 0.07
516 0.06
517 0.07
518 0.08
519 0.08
520 0.09
521 0.1
522 0.1
523 0.1
524 0.09
525 0.09
526 0.1
527 0.1
528 0.09
529 0.11
530 0.16
531 0.18
532 0.18
533 0.19
534 0.19
535 0.19
536 0.19
537 0.19
538 0.13
539 0.13
540 0.13
541 0.13
542 0.13
543 0.13
544 0.12
545 0.12
546 0.11
547 0.1
548 0.1
549 0.09
550 0.09
551 0.09
552 0.09
553 0.08
554 0.09
555 0.15
556 0.16
557 0.19
558 0.21
559 0.25
560 0.27
561 0.29
562 0.31
563 0.3
564 0.3
565 0.3
566 0.28
567 0.25
568 0.23
569 0.21
570 0.2
571 0.23
572 0.2
573 0.19
574 0.18