Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A423WV66

Protein Details
Accession A0A423WV66    Localization Confidence High Confidence Score 15.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
29-51GFPEHKKRAKVSAFKKNRQGPDSHydrophilic
163-186AVENKTTARKEQKRKKSVRFEDELHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
34-38KKRAK
172-178KEQKRKK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 13.5, nucl 13, cyto 12
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013929  RNA_pol_II_AP1_C  
IPR013930  RNA_pol_II_AP1_N  
IPR039913  RPAP1/Rba50  
Gene Ontology GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF08620  RPAP1_C  
PF08621  RPAP1_N  
Amino Acid Sequences MDFVLDIKEKDVGAVKAPSFPAPKSATTGFPEHKKRAKVSAFKKNRQGPDSPFSEPQNVPATTQPPAPAPVQQSASGRIGGGQERKIIDQENRDLLASMSPDQIEEERQELLNRLDPRIVQMFLRRANIEETNSPSPFDEPPEAPKEEDKAEPPKPEESPATAVENKTTARKEQKRKKSVRFEDELPPPEPPSDLFEAASEPPPPTTTSTAPTNADAFAPNSTHFPHPDPLPDLDPSDPNFLQTLHSKYFPNLPADPSKLAWMAPIPTPDSVADRESPYYPGQDSLPISALRFDFKGQLLAPSTSRTIPVTQGLHHHGQAPEAAGYTVAELGILARSAVPAQRCIAFQTLGRILYKLGQGVWGDAEGDLAKGIWRTAQENRVMDSLLEAAEVPEGQGHRGSRSYAIEALWLFEKGGWKEKFQGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.26
3 0.29
4 0.31
5 0.34
6 0.32
7 0.32
8 0.34
9 0.33
10 0.34
11 0.34
12 0.36
13 0.35
14 0.36
15 0.43
16 0.42
17 0.47
18 0.54
19 0.57
20 0.62
21 0.64
22 0.65
23 0.67
24 0.71
25 0.71
26 0.73
27 0.75
28 0.79
29 0.8
30 0.86
31 0.85
32 0.84
33 0.78
34 0.75
35 0.72
36 0.68
37 0.65
38 0.6
39 0.55
40 0.5
41 0.52
42 0.45
43 0.42
44 0.42
45 0.37
46 0.34
47 0.33
48 0.33
49 0.28
50 0.3
51 0.27
52 0.21
53 0.24
54 0.23
55 0.23
56 0.25
57 0.28
58 0.28
59 0.3
60 0.3
61 0.31
62 0.32
63 0.28
64 0.24
65 0.2
66 0.2
67 0.22
68 0.25
69 0.22
70 0.24
71 0.25
72 0.26
73 0.27
74 0.28
75 0.28
76 0.3
77 0.33
78 0.33
79 0.33
80 0.32
81 0.31
82 0.27
83 0.24
84 0.19
85 0.16
86 0.13
87 0.12
88 0.12
89 0.13
90 0.14
91 0.13
92 0.13
93 0.13
94 0.13
95 0.13
96 0.14
97 0.15
98 0.16
99 0.21
100 0.21
101 0.21
102 0.21
103 0.21
104 0.24
105 0.25
106 0.24
107 0.19
108 0.22
109 0.27
110 0.29
111 0.32
112 0.28
113 0.26
114 0.3
115 0.3
116 0.28
117 0.25
118 0.28
119 0.29
120 0.29
121 0.28
122 0.25
123 0.24
124 0.22
125 0.23
126 0.2
127 0.17
128 0.22
129 0.26
130 0.26
131 0.25
132 0.26
133 0.25
134 0.24
135 0.25
136 0.24
137 0.26
138 0.29
139 0.32
140 0.33
141 0.34
142 0.32
143 0.33
144 0.31
145 0.27
146 0.26
147 0.24
148 0.26
149 0.25
150 0.24
151 0.22
152 0.22
153 0.19
154 0.2
155 0.2
156 0.21
157 0.29
158 0.39
159 0.49
160 0.58
161 0.68
162 0.74
163 0.82
164 0.87
165 0.88
166 0.87
167 0.84
168 0.79
169 0.72
170 0.69
171 0.66
172 0.59
173 0.49
174 0.41
175 0.33
176 0.29
177 0.25
178 0.18
179 0.15
180 0.14
181 0.14
182 0.13
183 0.12
184 0.14
185 0.14
186 0.15
187 0.12
188 0.09
189 0.09
190 0.1
191 0.1
192 0.11
193 0.13
194 0.14
195 0.16
196 0.18
197 0.2
198 0.2
199 0.2
200 0.18
201 0.15
202 0.14
203 0.12
204 0.1
205 0.09
206 0.09
207 0.08
208 0.09
209 0.11
210 0.12
211 0.12
212 0.14
213 0.16
214 0.16
215 0.18
216 0.19
217 0.19
218 0.2
219 0.19
220 0.18
221 0.17
222 0.18
223 0.17
224 0.19
225 0.17
226 0.16
227 0.16
228 0.15
229 0.16
230 0.17
231 0.2
232 0.17
233 0.19
234 0.19
235 0.2
236 0.26
237 0.27
238 0.28
239 0.24
240 0.26
241 0.28
242 0.3
243 0.3
244 0.24
245 0.23
246 0.19
247 0.18
248 0.15
249 0.12
250 0.11
251 0.12
252 0.13
253 0.13
254 0.12
255 0.14
256 0.13
257 0.15
258 0.14
259 0.14
260 0.15
261 0.15
262 0.17
263 0.16
264 0.19
265 0.17
266 0.17
267 0.16
268 0.15
269 0.14
270 0.16
271 0.16
272 0.15
273 0.16
274 0.15
275 0.15
276 0.16
277 0.16
278 0.14
279 0.14
280 0.13
281 0.14
282 0.14
283 0.16
284 0.14
285 0.17
286 0.18
287 0.19
288 0.19
289 0.18
290 0.19
291 0.17
292 0.18
293 0.17
294 0.16
295 0.16
296 0.21
297 0.2
298 0.2
299 0.24
300 0.28
301 0.29
302 0.28
303 0.3
304 0.25
305 0.24
306 0.24
307 0.2
308 0.16
309 0.13
310 0.13
311 0.08
312 0.08
313 0.08
314 0.07
315 0.05
316 0.04
317 0.04
318 0.04
319 0.05
320 0.04
321 0.04
322 0.04
323 0.05
324 0.06
325 0.09
326 0.1
327 0.12
328 0.14
329 0.16
330 0.17
331 0.19
332 0.21
333 0.19
334 0.19
335 0.23
336 0.25
337 0.25
338 0.25
339 0.22
340 0.2
341 0.23
342 0.23
343 0.18
344 0.15
345 0.16
346 0.16
347 0.17
348 0.17
349 0.13
350 0.12
351 0.11
352 0.11
353 0.08
354 0.08
355 0.07
356 0.06
357 0.07
358 0.07
359 0.07
360 0.09
361 0.11
362 0.15
363 0.22
364 0.28
365 0.34
366 0.36
367 0.38
368 0.37
369 0.36
370 0.31
371 0.26
372 0.21
373 0.14
374 0.12
375 0.09
376 0.08
377 0.08
378 0.08
379 0.07
380 0.09
381 0.09
382 0.1
383 0.14
384 0.15
385 0.18
386 0.2
387 0.22
388 0.24
389 0.27
390 0.29
391 0.27
392 0.26
393 0.27
394 0.25
395 0.25
396 0.22
397 0.19
398 0.16
399 0.16
400 0.22
401 0.21
402 0.31
403 0.31
404 0.32