Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A423VMA5

Protein Details
Accession A0A423VMA5    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
105-124GVAPRAKMNQQRSRRFRAAQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
412-439RRKETEDRREANFKRRKLNEQRNGGGRN
Subcellular Location(s) mito 11, cyto 9, nucl 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGIPAAFRWLSTKYPKIISPVVEDQPITMDDGTVIPVDATGPNPNGEEFDNLYLDMNGIVHPCSHPEDRPPPKDEEEMMVEIFKYTDRVVNMVRPRKLLMIAVDGVAPRAKMNQQRSRRFRAAQEAKEKEEDKQQLITLLKQQNGGHHPAESTEEVVKKAFDSNSITPGTPFMDILASSLRYWCSYKLNTDPAWAKMKVIISDATVPGEGEHKIMNFVRSQRSSADHDPNTRHVIYGLDADLIMLGLATHEPHFRVLREDVFAQDTRTRMCKLCGQKGHDAQNCRGEAKDKDTDFDGKDNAVPLKPFIWLHVAILREYLAVELSVPDLPFRWDIERAIDDWVFMCFFVGNDFLPHLPALEIRENGIDTLTAIWKDNLPYMGGFLTKDGHCDLERAQLILAGLAKQEDAIFRRRKETEDRREANFKRRKLNEQRNGGGRNDGPPHGRSKATKVDNMVPGLAPDAAFMPISSLPGPIPKAITHDMVVNRSSLQSANTANKSAASVLKSQILKGKTAEPKEESATGEETSQTQEAQQSAGLKRKAELIEQDGTSTPSTDSPGAATPAAPEDEGPTDSVRLWEDGYSDRYYEQKFHVDPKDTEFRKKVAHAYVEGLAWVLMYYFQGCPSWDWYYPYHYAPFAADFVELDQVKIDFKKGRISKPYEQLMSVLPAASRHSIPEVFHDLMTNEKSEIIDFYPEDFQVDLNGKKMAWQGVALLPFIDMPRLLTAMDKKYELMTADEIARNEMGKDVLILSDAHPELYEEIITHFYSKKQGPPKYTLNPRTSDGLGGEIEKIEDYLPHGTLTYPLERKAMPDIDYDRSLSVNYEMPSSAHTHKSMLLRGVKLPTPALDRNDIEDLRNKARRSGRSYGGVPLGGNNYRGRNQQFNYGPGRTYQGGGRGSDRGPPGGGYGGRNNYSQAPRNDGGYPAPPPNWIPPPPGAAGFGSGLPPPPPPAHSYGNGGGYGGYGGGYGGGGYNQGYGNGGGGGGYGAPPPPAPGQYYGGGGGRGGYQGQGYQPPPGGNGYNGGYGGDRGHDRGYGNNGGYRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.46
3 0.49
4 0.51
5 0.47
6 0.47
7 0.47
8 0.45
9 0.43
10 0.41
11 0.34
12 0.32
13 0.29
14 0.24
15 0.16
16 0.13
17 0.11
18 0.12
19 0.13
20 0.1
21 0.1
22 0.07
23 0.07
24 0.08
25 0.09
26 0.1
27 0.13
28 0.15
29 0.16
30 0.17
31 0.17
32 0.18
33 0.19
34 0.2
35 0.19
36 0.2
37 0.2
38 0.19
39 0.2
40 0.17
41 0.16
42 0.13
43 0.1
44 0.08
45 0.09
46 0.09
47 0.09
48 0.1
49 0.13
50 0.18
51 0.21
52 0.23
53 0.31
54 0.42
55 0.51
56 0.57
57 0.59
58 0.59
59 0.6
60 0.62
61 0.55
62 0.49
63 0.44
64 0.4
65 0.36
66 0.3
67 0.25
68 0.21
69 0.19
70 0.14
71 0.11
72 0.1
73 0.13
74 0.13
75 0.17
76 0.2
77 0.28
78 0.37
79 0.44
80 0.46
81 0.45
82 0.46
83 0.45
84 0.44
85 0.39
86 0.32
87 0.29
88 0.27
89 0.25
90 0.24
91 0.21
92 0.2
93 0.18
94 0.15
95 0.1
96 0.13
97 0.19
98 0.26
99 0.37
100 0.45
101 0.55
102 0.66
103 0.74
104 0.79
105 0.81
106 0.78
107 0.74
108 0.75
109 0.75
110 0.73
111 0.76
112 0.71
113 0.67
114 0.69
115 0.64
116 0.55
117 0.54
118 0.5
119 0.42
120 0.4
121 0.37
122 0.36
123 0.36
124 0.36
125 0.36
126 0.37
127 0.36
128 0.37
129 0.38
130 0.39
131 0.42
132 0.44
133 0.36
134 0.32
135 0.3
136 0.26
137 0.29
138 0.23
139 0.21
140 0.2
141 0.21
142 0.21
143 0.21
144 0.2
145 0.17
146 0.21
147 0.19
148 0.18
149 0.23
150 0.25
151 0.29
152 0.31
153 0.3
154 0.26
155 0.27
156 0.25
157 0.18
158 0.16
159 0.11
160 0.1
161 0.1
162 0.11
163 0.12
164 0.12
165 0.11
166 0.13
167 0.14
168 0.15
169 0.17
170 0.18
171 0.22
172 0.24
173 0.29
174 0.35
175 0.41
176 0.39
177 0.44
178 0.45
179 0.42
180 0.46
181 0.4
182 0.34
183 0.31
184 0.33
185 0.28
186 0.27
187 0.23
188 0.18
189 0.21
190 0.21
191 0.18
192 0.15
193 0.14
194 0.12
195 0.14
196 0.12
197 0.1
198 0.1
199 0.09
200 0.13
201 0.14
202 0.16
203 0.18
204 0.22
205 0.3
206 0.3
207 0.32
208 0.31
209 0.34
210 0.39
211 0.43
212 0.47
213 0.44
214 0.48
215 0.5
216 0.51
217 0.52
218 0.45
219 0.38
220 0.29
221 0.26
222 0.21
223 0.2
224 0.16
225 0.11
226 0.1
227 0.1
228 0.09
229 0.08
230 0.06
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.04
236 0.05
237 0.07
238 0.08
239 0.11
240 0.13
241 0.14
242 0.18
243 0.2
244 0.21
245 0.23
246 0.23
247 0.22
248 0.24
249 0.24
250 0.22
251 0.22
252 0.21
253 0.21
254 0.23
255 0.24
256 0.22
257 0.24
258 0.29
259 0.35
260 0.43
261 0.48
262 0.5
263 0.56
264 0.61
265 0.68
266 0.65
267 0.62
268 0.56
269 0.57
270 0.52
271 0.44
272 0.38
273 0.33
274 0.31
275 0.33
276 0.36
277 0.29
278 0.29
279 0.31
280 0.34
281 0.32
282 0.31
283 0.26
284 0.19
285 0.19
286 0.2
287 0.2
288 0.17
289 0.16
290 0.14
291 0.14
292 0.15
293 0.15
294 0.13
295 0.16
296 0.15
297 0.16
298 0.18
299 0.18
300 0.15
301 0.16
302 0.14
303 0.1
304 0.1
305 0.09
306 0.06
307 0.05
308 0.05
309 0.04
310 0.06
311 0.07
312 0.07
313 0.07
314 0.07
315 0.09
316 0.1
317 0.11
318 0.12
319 0.13
320 0.14
321 0.17
322 0.18
323 0.17
324 0.2
325 0.18
326 0.15
327 0.14
328 0.14
329 0.1
330 0.09
331 0.08
332 0.05
333 0.05
334 0.06
335 0.06
336 0.06
337 0.06
338 0.07
339 0.07
340 0.08
341 0.08
342 0.07
343 0.06
344 0.07
345 0.11
346 0.13
347 0.13
348 0.13
349 0.14
350 0.14
351 0.13
352 0.12
353 0.08
354 0.06
355 0.07
356 0.08
357 0.07
358 0.08
359 0.08
360 0.09
361 0.1
362 0.12
363 0.11
364 0.1
365 0.1
366 0.1
367 0.1
368 0.09
369 0.09
370 0.08
371 0.1
372 0.1
373 0.11
374 0.11
375 0.12
376 0.12
377 0.13
378 0.14
379 0.17
380 0.18
381 0.17
382 0.16
383 0.15
384 0.15
385 0.14
386 0.14
387 0.07
388 0.06
389 0.06
390 0.06
391 0.05
392 0.06
393 0.07
394 0.08
395 0.17
396 0.22
397 0.23
398 0.29
399 0.3
400 0.34
401 0.43
402 0.51
403 0.54
404 0.59
405 0.61
406 0.6
407 0.68
408 0.68
409 0.68
410 0.65
411 0.59
412 0.58
413 0.59
414 0.64
415 0.66
416 0.74
417 0.72
418 0.72
419 0.72
420 0.7
421 0.68
422 0.58
423 0.5
424 0.39
425 0.35
426 0.29
427 0.26
428 0.22
429 0.21
430 0.24
431 0.23
432 0.25
433 0.22
434 0.25
435 0.32
436 0.33
437 0.34
438 0.34
439 0.37
440 0.38
441 0.37
442 0.32
443 0.23
444 0.19
445 0.18
446 0.14
447 0.08
448 0.06
449 0.06
450 0.05
451 0.05
452 0.05
453 0.06
454 0.06
455 0.07
456 0.07
457 0.07
458 0.06
459 0.09
460 0.1
461 0.09
462 0.1
463 0.09
464 0.13
465 0.14
466 0.15
467 0.14
468 0.17
469 0.18
470 0.18
471 0.19
472 0.15
473 0.13
474 0.12
475 0.13
476 0.09
477 0.09
478 0.09
479 0.11
480 0.15
481 0.16
482 0.17
483 0.16
484 0.16
485 0.15
486 0.14
487 0.13
488 0.11
489 0.12
490 0.12
491 0.17
492 0.17
493 0.17
494 0.21
495 0.2
496 0.19
497 0.19
498 0.25
499 0.26
500 0.27
501 0.3
502 0.27
503 0.28
504 0.28
505 0.29
506 0.22
507 0.18
508 0.17
509 0.15
510 0.13
511 0.11
512 0.1
513 0.1
514 0.09
515 0.08
516 0.07
517 0.08
518 0.08
519 0.08
520 0.08
521 0.11
522 0.13
523 0.19
524 0.19
525 0.18
526 0.18
527 0.23
528 0.23
529 0.2
530 0.21
531 0.19
532 0.2
533 0.2
534 0.21
535 0.16
536 0.17
537 0.15
538 0.14
539 0.1
540 0.08
541 0.09
542 0.09
543 0.08
544 0.08
545 0.09
546 0.09
547 0.09
548 0.08
549 0.07
550 0.08
551 0.08
552 0.07
553 0.06
554 0.06
555 0.08
556 0.08
557 0.09
558 0.08
559 0.08
560 0.08
561 0.09
562 0.08
563 0.08
564 0.08
565 0.07
566 0.08
567 0.1
568 0.13
569 0.13
570 0.12
571 0.12
572 0.15
573 0.16
574 0.17
575 0.17
576 0.19
577 0.2
578 0.26
579 0.3
580 0.32
581 0.32
582 0.35
583 0.43
584 0.39
585 0.43
586 0.39
587 0.36
588 0.35
589 0.36
590 0.36
591 0.31
592 0.31
593 0.27
594 0.27
595 0.26
596 0.23
597 0.21
598 0.15
599 0.1
600 0.08
601 0.06
602 0.04
603 0.03
604 0.03
605 0.04
606 0.04
607 0.05
608 0.06
609 0.07
610 0.08
611 0.12
612 0.15
613 0.15
614 0.18
615 0.18
616 0.23
617 0.25
618 0.25
619 0.23
620 0.19
621 0.19
622 0.17
623 0.16
624 0.12
625 0.1
626 0.08
627 0.07
628 0.07
629 0.11
630 0.11
631 0.09
632 0.09
633 0.09
634 0.1
635 0.1
636 0.13
637 0.12
638 0.13
639 0.22
640 0.27
641 0.33
642 0.41
643 0.48
644 0.52
645 0.57
646 0.61
647 0.53
648 0.49
649 0.43
650 0.36
651 0.3
652 0.23
653 0.16
654 0.1
655 0.1
656 0.11
657 0.12
658 0.11
659 0.09
660 0.12
661 0.13
662 0.13
663 0.17
664 0.21
665 0.2
666 0.2
667 0.2
668 0.18
669 0.19
670 0.2
671 0.16
672 0.11
673 0.1
674 0.1
675 0.1
676 0.11
677 0.09
678 0.1
679 0.09
680 0.11
681 0.12
682 0.12
683 0.12
684 0.11
685 0.1
686 0.11
687 0.14
688 0.12
689 0.12
690 0.13
691 0.12
692 0.15
693 0.17
694 0.16
695 0.13
696 0.13
697 0.13
698 0.16
699 0.17
700 0.14
701 0.12
702 0.1
703 0.1
704 0.1
705 0.09
706 0.06
707 0.06
708 0.06
709 0.07
710 0.07
711 0.09
712 0.14
713 0.17
714 0.19
715 0.18
716 0.18
717 0.19
718 0.2
719 0.18
720 0.16
721 0.13
722 0.13
723 0.15
724 0.17
725 0.16
726 0.16
727 0.15
728 0.13
729 0.12
730 0.12
731 0.09
732 0.07
733 0.07
734 0.06
735 0.06
736 0.07
737 0.07
738 0.07
739 0.12
740 0.12
741 0.11
742 0.11
743 0.11
744 0.11
745 0.11
746 0.11
747 0.06
748 0.07
749 0.09
750 0.09
751 0.11
752 0.11
753 0.12
754 0.18
755 0.2
756 0.27
757 0.34
758 0.4
759 0.44
760 0.5
761 0.57
762 0.6
763 0.69
764 0.7
765 0.65
766 0.63
767 0.59
768 0.56
769 0.48
770 0.4
771 0.3
772 0.23
773 0.19
774 0.16
775 0.14
776 0.11
777 0.1
778 0.09
779 0.08
780 0.06
781 0.06
782 0.08
783 0.1
784 0.1
785 0.1
786 0.1
787 0.1
788 0.13
789 0.16
790 0.2
791 0.2
792 0.2
793 0.23
794 0.22
795 0.24
796 0.27
797 0.28
798 0.22
799 0.25
800 0.28
801 0.3
802 0.32
803 0.31
804 0.25
805 0.22
806 0.21
807 0.17
808 0.15
809 0.15
810 0.14
811 0.15
812 0.14
813 0.14
814 0.16
815 0.19
816 0.21
817 0.2
818 0.21
819 0.21
820 0.25
821 0.29
822 0.31
823 0.33
824 0.34
825 0.33
826 0.35
827 0.38
828 0.36
829 0.33
830 0.31
831 0.27
832 0.28
833 0.31
834 0.3
835 0.32
836 0.31
837 0.33
838 0.38
839 0.35
840 0.31
841 0.33
842 0.35
843 0.38
844 0.43
845 0.4
846 0.42
847 0.5
848 0.56
849 0.57
850 0.59
851 0.57
852 0.57
853 0.59
854 0.55
855 0.5
856 0.43
857 0.35
858 0.3
859 0.29
860 0.24
861 0.25
862 0.23
863 0.24
864 0.27
865 0.33
866 0.35
867 0.39
868 0.39
869 0.46
870 0.47
871 0.49
872 0.52
873 0.48
874 0.43
875 0.36
876 0.4
877 0.31
878 0.29
879 0.25
880 0.25
881 0.26
882 0.27
883 0.28
884 0.27
885 0.27
886 0.31
887 0.3
888 0.24
889 0.22
890 0.21
891 0.2
892 0.21
893 0.22
894 0.2
895 0.25
896 0.29
897 0.3
898 0.3
899 0.3
900 0.33
901 0.38
902 0.42
903 0.38
904 0.41
905 0.4
906 0.43
907 0.42
908 0.37
909 0.34
910 0.3
911 0.31
912 0.27
913 0.27
914 0.26
915 0.28
916 0.33
917 0.36
918 0.35
919 0.35
920 0.34
921 0.37
922 0.37
923 0.36
924 0.31
925 0.24
926 0.23
927 0.2
928 0.18
929 0.15
930 0.13
931 0.14
932 0.13
933 0.13
934 0.15
935 0.16
936 0.18
937 0.21
938 0.27
939 0.3
940 0.32
941 0.37
942 0.37
943 0.37
944 0.35
945 0.31
946 0.25
947 0.2
948 0.17
949 0.11
950 0.07
951 0.04
952 0.04
953 0.04
954 0.04
955 0.04
956 0.04
957 0.04
958 0.05
959 0.05
960 0.07
961 0.07
962 0.07
963 0.09
964 0.08
965 0.09
966 0.08
967 0.08
968 0.06
969 0.06
970 0.06
971 0.05
972 0.05
973 0.06
974 0.06
975 0.07
976 0.07
977 0.1
978 0.13
979 0.15
980 0.17
981 0.2
982 0.24
983 0.25
984 0.26
985 0.25
986 0.24
987 0.22
988 0.19
989 0.16
990 0.13
991 0.12
992 0.11
993 0.1
994 0.09
995 0.11
996 0.14
997 0.19
998 0.2
999 0.23
1000 0.25
1001 0.25
1002 0.26
1003 0.28
1004 0.27
1005 0.22
1006 0.25
1007 0.23
1008 0.22
1009 0.21
1010 0.2
1011 0.17
1012 0.16
1013 0.16
1014 0.16
1015 0.15
1016 0.16
1017 0.17
1018 0.19
1019 0.2
1020 0.24
1021 0.29
1022 0.32
1023 0.32