Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G8JPE0

Protein Details
Accession G8JPE0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
391-410NDSTRKTRPIIQTQPRPSIEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008669  LSM_interact  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR034397  Prp24_RRM1  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR031766  RRM_occluded  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG erc:Ecym_2700  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05391  Lsm_interact  
PF00076  RRM_1  
PF16842  RRM_occluded  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12296  RRM1_Prp24  
Amino Acid Sequences MQVGKRDLEDVKEEENQFGKKQNTVTTNRREFTTIIVRNLPKSYNNNKVRKYFQACGIIKQVDVVLAKDGKSKLGRVEFNSYDGVLSALTKTFKLIGSHEITVEHLENMTLWITNFPPYYNVTDLRNLLNSFEGCCLNVRLPSLRFNSDRRFAYADMDSQEHATEIAEELNGKVIEGFKIVIKKSNPLEKDFRTDAGTRERREIYISQLDSERVTADKLRALFTQFGTIESINIPSANHNEFANHKKGFAFIMYETDKAASAAVSLNNTEFEGTNIIVSIADRKAYLERKRVKQLLNSKSSKDNVISLFPFSDKVSKSQIQRIIKDHASFLQNEMIKDIFLVTDHEGALILLNDEKIAAKLILALNGCKYASRTLKCGTIKELSRHYPSINDSTRKTRPIIQTQPRPSIETSNDKKMNNEDFRKLLLQND
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.39
3 0.38
4 0.35
5 0.39
6 0.37
7 0.35
8 0.38
9 0.41
10 0.45
11 0.51
12 0.58
13 0.61
14 0.68
15 0.65
16 0.63
17 0.58
18 0.5
19 0.48
20 0.5
21 0.44
22 0.4
23 0.46
24 0.46
25 0.47
26 0.49
27 0.45
28 0.41
29 0.45
30 0.49
31 0.52
32 0.6
33 0.66
34 0.7
35 0.74
36 0.73
37 0.74
38 0.73
39 0.68
40 0.66
41 0.67
42 0.61
43 0.59
44 0.6
45 0.5
46 0.42
47 0.38
48 0.3
49 0.23
50 0.22
51 0.18
52 0.16
53 0.17
54 0.17
55 0.22
56 0.22
57 0.24
58 0.26
59 0.27
60 0.3
61 0.36
62 0.4
63 0.39
64 0.47
65 0.42
66 0.43
67 0.42
68 0.34
69 0.27
70 0.22
71 0.18
72 0.1
73 0.09
74 0.07
75 0.09
76 0.09
77 0.09
78 0.1
79 0.12
80 0.14
81 0.15
82 0.17
83 0.21
84 0.24
85 0.25
86 0.25
87 0.23
88 0.22
89 0.22
90 0.21
91 0.14
92 0.1
93 0.09
94 0.09
95 0.09
96 0.09
97 0.07
98 0.06
99 0.07
100 0.08
101 0.11
102 0.11
103 0.11
104 0.13
105 0.15
106 0.18
107 0.2
108 0.21
109 0.21
110 0.24
111 0.25
112 0.25
113 0.26
114 0.22
115 0.19
116 0.2
117 0.18
118 0.16
119 0.16
120 0.15
121 0.12
122 0.13
123 0.14
124 0.13
125 0.14
126 0.14
127 0.16
128 0.17
129 0.23
130 0.26
131 0.29
132 0.31
133 0.35
134 0.4
135 0.42
136 0.42
137 0.39
138 0.38
139 0.34
140 0.34
141 0.3
142 0.27
143 0.22
144 0.21
145 0.19
146 0.16
147 0.15
148 0.11
149 0.1
150 0.07
151 0.06
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.08
158 0.07
159 0.07
160 0.07
161 0.07
162 0.07
163 0.08
164 0.08
165 0.07
166 0.11
167 0.12
168 0.17
169 0.17
170 0.22
171 0.25
172 0.32
173 0.32
174 0.33
175 0.39
176 0.36
177 0.41
178 0.38
179 0.35
180 0.31
181 0.3
182 0.28
183 0.33
184 0.36
185 0.31
186 0.34
187 0.34
188 0.31
189 0.33
190 0.31
191 0.26
192 0.27
193 0.26
194 0.22
195 0.22
196 0.22
197 0.19
198 0.19
199 0.14
200 0.07
201 0.08
202 0.08
203 0.08
204 0.09
205 0.1
206 0.12
207 0.12
208 0.13
209 0.14
210 0.14
211 0.17
212 0.15
213 0.15
214 0.15
215 0.14
216 0.13
217 0.11
218 0.12
219 0.08
220 0.08
221 0.07
222 0.07
223 0.1
224 0.11
225 0.11
226 0.1
227 0.12
228 0.15
229 0.2
230 0.25
231 0.22
232 0.21
233 0.21
234 0.22
235 0.21
236 0.18
237 0.15
238 0.09
239 0.14
240 0.15
241 0.15
242 0.15
243 0.14
244 0.14
245 0.11
246 0.11
247 0.06
248 0.05
249 0.06
250 0.07
251 0.07
252 0.07
253 0.08
254 0.08
255 0.08
256 0.08
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.07
261 0.07
262 0.06
263 0.07
264 0.06
265 0.06
266 0.09
267 0.07
268 0.08
269 0.08
270 0.09
271 0.15
272 0.23
273 0.29
274 0.35
275 0.44
276 0.5
277 0.59
278 0.64
279 0.63
280 0.64
281 0.67
282 0.67
283 0.68
284 0.65
285 0.58
286 0.58
287 0.56
288 0.5
289 0.41
290 0.36
291 0.28
292 0.29
293 0.27
294 0.23
295 0.22
296 0.19
297 0.19
298 0.16
299 0.2
300 0.17
301 0.19
302 0.24
303 0.29
304 0.32
305 0.38
306 0.46
307 0.47
308 0.51
309 0.52
310 0.52
311 0.51
312 0.48
313 0.42
314 0.38
315 0.34
316 0.3
317 0.28
318 0.28
319 0.26
320 0.24
321 0.25
322 0.2
323 0.17
324 0.17
325 0.15
326 0.09
327 0.07
328 0.1
329 0.1
330 0.11
331 0.11
332 0.11
333 0.11
334 0.1
335 0.11
336 0.08
337 0.07
338 0.06
339 0.06
340 0.06
341 0.06
342 0.07
343 0.06
344 0.08
345 0.07
346 0.06
347 0.11
348 0.12
349 0.15
350 0.16
351 0.17
352 0.16
353 0.18
354 0.19
355 0.15
356 0.16
357 0.2
358 0.28
359 0.3
360 0.34
361 0.35
362 0.43
363 0.46
364 0.47
365 0.44
366 0.44
367 0.47
368 0.48
369 0.53
370 0.51
371 0.54
372 0.54
373 0.5
374 0.47
375 0.46
376 0.49
377 0.49
378 0.49
379 0.47
380 0.53
381 0.59
382 0.58
383 0.56
384 0.55
385 0.56
386 0.61
387 0.67
388 0.69
389 0.74
390 0.78
391 0.84
392 0.77
393 0.72
394 0.63
395 0.6
396 0.56
397 0.57
398 0.55
399 0.56
400 0.6
401 0.57
402 0.58
403 0.58
404 0.62
405 0.62
406 0.62
407 0.58
408 0.55
409 0.58
410 0.59