Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G8JXG1

Protein Details
Accession G8JXG1    Localization Confidence High Confidence Score 20.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
328-355PVINKTKISGSKKRKDRRKKGAMSDVSGHydrophilic
443-469ADEVSKGKLSMRRKKERSKNGVDGVTNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
334-348KISGSKKRKDRRKKG
428-432KLAKK
448-461KGKLSMRRKKERSK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
KEGG erc:Ecym_8252  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MSRFNKKTAQKFVVVHRPHDDPNFYDNDASEHILVPVEMPNRGGNNALPKSSSSVRFVRKSNEFNEHIGEASLYGIKFDDTSYDYTKHLKPIGLDPENSIYISSKSKVDKVKVNKQNIEELFVEPEYQDGKRKEAEAVFFRGMAKPEYLEKMQDIPDELRGFQPDMNPALREVLEALEDDAYVVNSDVIVGDGRKLPKDGAVGDDDANNKKSGSVEAGQEEEDEDLFAELLGSGEVKDKERFQDDFDEWDIDNFEGYEEQCFQDEIAQFDNIENLRDLQAIDIGADVRRFKKVQSKQQNANEWDSDDNFSEAPDEAEEENDDILGDMPVINKTKISGSKKRKDRRKKGAMSDVSGYSMSSSAIARTEVMTILDDKYDQIISGYENYEEEQENNDENYVPFDMARERADFEELLDDFLDNYELEKGGRKLAKKDKEIDNLKIAADEVSKGKLSMRRKKERSKNGVDGVTNCLQSLRF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.67
2 0.63
3 0.57
4 0.56
5 0.53
6 0.54
7 0.49
8 0.42
9 0.43
10 0.43
11 0.4
12 0.36
13 0.31
14 0.29
15 0.27
16 0.26
17 0.21
18 0.17
19 0.16
20 0.15
21 0.15
22 0.12
23 0.15
24 0.15
25 0.14
26 0.15
27 0.18
28 0.19
29 0.2
30 0.21
31 0.19
32 0.27
33 0.29
34 0.29
35 0.27
36 0.26
37 0.31
38 0.35
39 0.36
40 0.32
41 0.37
42 0.44
43 0.49
44 0.51
45 0.54
46 0.57
47 0.59
48 0.6
49 0.6
50 0.55
51 0.52
52 0.52
53 0.44
54 0.36
55 0.3
56 0.24
57 0.16
58 0.14
59 0.14
60 0.1
61 0.09
62 0.09
63 0.09
64 0.09
65 0.09
66 0.11
67 0.1
68 0.15
69 0.19
70 0.2
71 0.21
72 0.27
73 0.29
74 0.31
75 0.32
76 0.3
77 0.28
78 0.34
79 0.43
80 0.41
81 0.39
82 0.36
83 0.37
84 0.36
85 0.34
86 0.26
87 0.18
88 0.16
89 0.19
90 0.18
91 0.19
92 0.21
93 0.27
94 0.33
95 0.37
96 0.43
97 0.49
98 0.59
99 0.63
100 0.69
101 0.69
102 0.65
103 0.68
104 0.6
105 0.55
106 0.46
107 0.38
108 0.32
109 0.26
110 0.24
111 0.15
112 0.15
113 0.13
114 0.13
115 0.19
116 0.17
117 0.2
118 0.22
119 0.23
120 0.26
121 0.27
122 0.32
123 0.29
124 0.33
125 0.3
126 0.29
127 0.29
128 0.27
129 0.25
130 0.21
131 0.18
132 0.13
133 0.16
134 0.19
135 0.18
136 0.18
137 0.17
138 0.19
139 0.2
140 0.19
141 0.19
142 0.16
143 0.2
144 0.2
145 0.19
146 0.18
147 0.18
148 0.18
149 0.17
150 0.18
151 0.15
152 0.17
153 0.18
154 0.17
155 0.16
156 0.16
157 0.15
158 0.13
159 0.11
160 0.08
161 0.08
162 0.07
163 0.08
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.05
168 0.05
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.03
173 0.03
174 0.03
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.05
179 0.08
180 0.1
181 0.1
182 0.11
183 0.11
184 0.13
185 0.14
186 0.14
187 0.13
188 0.14
189 0.15
190 0.14
191 0.16
192 0.16
193 0.17
194 0.17
195 0.15
196 0.13
197 0.12
198 0.12
199 0.11
200 0.12
201 0.12
202 0.13
203 0.14
204 0.15
205 0.14
206 0.14
207 0.13
208 0.1
209 0.07
210 0.06
211 0.05
212 0.04
213 0.04
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.03
218 0.03
219 0.03
220 0.03
221 0.06
222 0.07
223 0.09
224 0.1
225 0.11
226 0.13
227 0.17
228 0.17
229 0.17
230 0.22
231 0.21
232 0.22
233 0.22
234 0.22
235 0.18
236 0.18
237 0.17
238 0.11
239 0.1
240 0.07
241 0.06
242 0.05
243 0.05
244 0.06
245 0.06
246 0.07
247 0.07
248 0.07
249 0.07
250 0.11
251 0.11
252 0.11
253 0.12
254 0.12
255 0.12
256 0.12
257 0.14
258 0.1
259 0.1
260 0.09
261 0.08
262 0.09
263 0.09
264 0.09
265 0.07
266 0.07
267 0.07
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.07
273 0.09
274 0.09
275 0.12
276 0.13
277 0.15
278 0.24
279 0.32
280 0.42
281 0.52
282 0.59
283 0.65
284 0.73
285 0.8
286 0.73
287 0.68
288 0.58
289 0.48
290 0.41
291 0.34
292 0.27
293 0.19
294 0.17
295 0.12
296 0.11
297 0.11
298 0.09
299 0.08
300 0.07
301 0.08
302 0.07
303 0.08
304 0.08
305 0.08
306 0.08
307 0.07
308 0.07
309 0.05
310 0.05
311 0.05
312 0.04
313 0.04
314 0.05
315 0.08
316 0.1
317 0.1
318 0.09
319 0.1
320 0.15
321 0.23
322 0.3
323 0.38
324 0.47
325 0.57
326 0.68
327 0.77
328 0.83
329 0.86
330 0.89
331 0.9
332 0.91
333 0.91
334 0.9
335 0.91
336 0.85
337 0.77
338 0.69
339 0.59
340 0.49
341 0.39
342 0.3
343 0.19
344 0.15
345 0.11
346 0.08
347 0.08
348 0.07
349 0.08
350 0.08
351 0.08
352 0.09
353 0.09
354 0.09
355 0.09
356 0.09
357 0.1
358 0.1
359 0.1
360 0.1
361 0.09
362 0.1
363 0.1
364 0.09
365 0.08
366 0.08
367 0.09
368 0.12
369 0.12
370 0.11
371 0.12
372 0.12
373 0.14
374 0.14
375 0.14
376 0.14
377 0.15
378 0.17
379 0.17
380 0.17
381 0.15
382 0.15
383 0.17
384 0.14
385 0.12
386 0.1
387 0.12
388 0.14
389 0.15
390 0.18
391 0.16
392 0.18
393 0.19
394 0.21
395 0.2
396 0.18
397 0.21
398 0.18
399 0.18
400 0.16
401 0.15
402 0.12
403 0.13
404 0.13
405 0.07
406 0.08
407 0.08
408 0.08
409 0.09
410 0.15
411 0.15
412 0.22
413 0.28
414 0.3
415 0.39
416 0.49
417 0.58
418 0.59
419 0.67
420 0.68
421 0.74
422 0.76
423 0.72
424 0.68
425 0.61
426 0.54
427 0.46
428 0.37
429 0.29
430 0.23
431 0.2
432 0.15
433 0.16
434 0.16
435 0.16
436 0.21
437 0.26
438 0.35
439 0.43
440 0.52
441 0.61
442 0.7
443 0.81
444 0.87
445 0.91
446 0.91
447 0.91
448 0.9
449 0.87
450 0.84
451 0.76
452 0.68
453 0.63
454 0.58
455 0.48
456 0.38