Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G8JVD4

Protein Details
Accession G8JVD4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
309-331ADKMKLRTRQYAKRQIKWIRKMLHydrophilic
426-448LHLTSRRHRYNLNKDKKKMTTSDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16, mito 7.5, cyto_mito 5.5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039657  Dimethylallyltransferase  
IPR030666  IPP_transferase_euk  
IPR018022  IPT  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0016020  C:membrane  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0052381  F:tRNA dimethylallyltransferase activity  
GO:0008033  P:tRNA processing  
KEGG erc:Ecym_6231  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01715  IPPT  
Amino Acid Sequences MPFIYMYIYVYICIYIYLSGCMCTHINGTRMFKRMYSQIHKPKVIVIAGTTGVGKSQLSIQLAKRFNGEVINSDSMQVYRGLPIITNKHPFANREGIAHHVMDHVDWKEEYYLHRFEDECLKSIKEIHSRGKIPIIVGGTHYYLQILFAKRVLIGGRVPSEKEKRILESKDRRELYEALRNVDLSIANKYHPNDTRRVRRMLEIYYTSGVKPSDAFSNQRKELKFDALFLWVYSRPEELEGRLDDRVDQMLEQGGIEEIKSLHTFYRMSKFTQEQLENGIWQVIGFKEFLPWLEGNAEQHGGMSFQECADKMKLRTRQYAKRQIKWIRKMLVPDLNGNIYILDATKLDEWEATVSRRAINITESFLENNIITNERFVPHGLEFLISQPTDTSSPKNDGEWHHYRCDICRDKDQQPLIAIGKRNWELHLTSRRHRYNLNKDKKKMTTSDR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.08
3 0.09
4 0.1
5 0.1
6 0.12
7 0.12
8 0.15
9 0.15
10 0.15
11 0.18
12 0.2
13 0.24
14 0.29
15 0.36
16 0.39
17 0.44
18 0.44
19 0.41
20 0.41
21 0.44
22 0.48
23 0.49
24 0.53
25 0.59
26 0.67
27 0.68
28 0.64
29 0.61
30 0.57
31 0.5
32 0.4
33 0.31
34 0.25
35 0.23
36 0.23
37 0.19
38 0.13
39 0.11
40 0.11
41 0.1
42 0.07
43 0.1
44 0.14
45 0.16
46 0.21
47 0.26
48 0.34
49 0.37
50 0.37
51 0.36
52 0.33
53 0.32
54 0.31
55 0.27
56 0.22
57 0.26
58 0.28
59 0.26
60 0.25
61 0.25
62 0.2
63 0.2
64 0.18
65 0.12
66 0.1
67 0.12
68 0.11
69 0.12
70 0.17
71 0.23
72 0.28
73 0.32
74 0.32
75 0.36
76 0.39
77 0.4
78 0.4
79 0.42
80 0.37
81 0.33
82 0.33
83 0.32
84 0.31
85 0.29
86 0.24
87 0.17
88 0.16
89 0.14
90 0.17
91 0.14
92 0.14
93 0.13
94 0.14
95 0.14
96 0.15
97 0.18
98 0.19
99 0.21
100 0.2
101 0.22
102 0.22
103 0.22
104 0.31
105 0.29
106 0.26
107 0.26
108 0.25
109 0.24
110 0.28
111 0.32
112 0.3
113 0.34
114 0.39
115 0.45
116 0.46
117 0.47
118 0.48
119 0.43
120 0.35
121 0.33
122 0.27
123 0.19
124 0.19
125 0.19
126 0.16
127 0.15
128 0.14
129 0.11
130 0.09
131 0.1
132 0.13
133 0.13
134 0.13
135 0.13
136 0.14
137 0.13
138 0.15
139 0.14
140 0.11
141 0.11
142 0.13
143 0.16
144 0.17
145 0.18
146 0.23
147 0.28
148 0.29
149 0.32
150 0.31
151 0.32
152 0.38
153 0.41
154 0.45
155 0.5
156 0.55
157 0.6
158 0.59
159 0.56
160 0.52
161 0.51
162 0.45
163 0.43
164 0.37
165 0.3
166 0.3
167 0.29
168 0.25
169 0.23
170 0.18
171 0.11
172 0.12
173 0.11
174 0.11
175 0.14
176 0.15
177 0.2
178 0.25
179 0.27
180 0.32
181 0.4
182 0.49
183 0.52
184 0.55
185 0.51
186 0.49
187 0.49
188 0.44
189 0.4
190 0.32
191 0.29
192 0.25
193 0.25
194 0.2
195 0.19
196 0.16
197 0.12
198 0.1
199 0.09
200 0.12
201 0.13
202 0.17
203 0.21
204 0.28
205 0.31
206 0.35
207 0.34
208 0.34
209 0.34
210 0.37
211 0.32
212 0.27
213 0.25
214 0.21
215 0.21
216 0.18
217 0.17
218 0.12
219 0.12
220 0.11
221 0.1
222 0.09
223 0.11
224 0.11
225 0.1
226 0.12
227 0.12
228 0.14
229 0.14
230 0.13
231 0.12
232 0.12
233 0.12
234 0.09
235 0.08
236 0.06
237 0.07
238 0.07
239 0.06
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.04
244 0.05
245 0.04
246 0.05
247 0.06
248 0.06
249 0.07
250 0.09
251 0.1
252 0.12
253 0.2
254 0.2
255 0.22
256 0.25
257 0.27
258 0.29
259 0.35
260 0.33
261 0.26
262 0.29
263 0.28
264 0.23
265 0.21
266 0.18
267 0.1
268 0.09
269 0.1
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.07
275 0.07
276 0.08
277 0.1
278 0.1
279 0.1
280 0.11
281 0.12
282 0.12
283 0.13
284 0.13
285 0.1
286 0.1
287 0.09
288 0.08
289 0.07
290 0.07
291 0.06
292 0.06
293 0.08
294 0.08
295 0.11
296 0.13
297 0.18
298 0.2
299 0.28
300 0.35
301 0.39
302 0.48
303 0.54
304 0.61
305 0.67
306 0.75
307 0.76
308 0.76
309 0.81
310 0.81
311 0.83
312 0.82
313 0.8
314 0.74
315 0.68
316 0.65
317 0.62
318 0.59
319 0.5
320 0.44
321 0.39
322 0.34
323 0.31
324 0.27
325 0.2
326 0.12
327 0.11
328 0.08
329 0.06
330 0.05
331 0.07
332 0.08
333 0.08
334 0.09
335 0.09
336 0.09
337 0.11
338 0.13
339 0.13
340 0.16
341 0.17
342 0.18
343 0.19
344 0.19
345 0.17
346 0.19
347 0.19
348 0.19
349 0.2
350 0.2
351 0.19
352 0.19
353 0.19
354 0.15
355 0.15
356 0.13
357 0.14
358 0.12
359 0.14
360 0.15
361 0.14
362 0.15
363 0.15
364 0.17
365 0.15
366 0.17
367 0.15
368 0.14
369 0.14
370 0.15
371 0.18
372 0.14
373 0.14
374 0.13
375 0.15
376 0.17
377 0.19
378 0.21
379 0.21
380 0.27
381 0.28
382 0.29
383 0.32
384 0.35
385 0.42
386 0.47
387 0.47
388 0.46
389 0.48
390 0.48
391 0.47
392 0.52
393 0.53
394 0.49
395 0.54
396 0.57
397 0.59
398 0.67
399 0.66
400 0.6
401 0.52
402 0.52
403 0.47
404 0.46
405 0.44
406 0.38
407 0.42
408 0.41
409 0.41
410 0.37
411 0.36
412 0.34
413 0.39
414 0.47
415 0.45
416 0.5
417 0.59
418 0.63
419 0.63
420 0.69
421 0.7
422 0.72
423 0.76
424 0.79
425 0.79
426 0.8
427 0.86
428 0.86
429 0.82