Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A425BIJ4

Protein Details
Accession A0A425BIJ4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
356-380KGGDEVPKSRRKKLEKEWKAQQSAHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
298-315RAAKERAAEEKRLAKEQR
362-388PKSRRKKLEKEWKAQQSAHEKWKKERN
Subcellular Location(s) nucl 12.5, mito 11, cyto_nucl 8.666, cyto_mito 8.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024909  Cys-tRNA/MSH_ligase  
IPR014729  Rossmann-like_a/b/a_fold  
IPR009080  tRNAsynth_Ia_anticodon-bd  
Gene Ontology GO:0004812  F:aminoacyl-tRNA ligase activity  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006418  P:tRNA aminoacylation for protein translation  
Amino Acid Sequences MNLSIRGQKMSKSLKNFTSIREALAPGEDGVPAWTPRMLRIVLLLSSWKDGIEITEGLVNIAKGWEEKVINFFLKAIDIQLAAKDTPNNKASTSHTLSAALETAKKETDAALCDSFNTSLVMQAISNVVTEANSAMSNDPNTDPAAILSIAHWITRIITIFGLNGSTSPDTNSIGWEGISIPTPAQPIIYQLSKIRDEVRRQARSKAVEPEVLEKLASQPVPATPTSENKPYVTAYETFQSQVKTALAQSAGIETELLRLCDSLRDTVLWDQDIYLEDRDAPLPALVRPLDANMKAARAAKERAAEEKRLAKEQRLAEEAAKKAALAEKAKVPPQEMFKTDEFAEWDENGLPTKLKGGDEVPKSRRKKLEKEWKAQQSAHEKWKKERN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.63
3 0.62
4 0.57
5 0.57
6 0.5
7 0.45
8 0.41
9 0.38
10 0.31
11 0.3
12 0.27
13 0.18
14 0.18
15 0.14
16 0.11
17 0.12
18 0.13
19 0.12
20 0.12
21 0.13
22 0.13
23 0.15
24 0.2
25 0.18
26 0.16
27 0.19
28 0.2
29 0.18
30 0.19
31 0.2
32 0.17
33 0.18
34 0.18
35 0.15
36 0.12
37 0.12
38 0.12
39 0.13
40 0.12
41 0.1
42 0.13
43 0.13
44 0.13
45 0.14
46 0.12
47 0.09
48 0.09
49 0.09
50 0.07
51 0.08
52 0.12
53 0.12
54 0.13
55 0.17
56 0.2
57 0.21
58 0.2
59 0.2
60 0.16
61 0.16
62 0.15
63 0.13
64 0.1
65 0.1
66 0.1
67 0.1
68 0.12
69 0.11
70 0.12
71 0.16
72 0.17
73 0.23
74 0.26
75 0.26
76 0.25
77 0.28
78 0.31
79 0.35
80 0.39
81 0.34
82 0.32
83 0.32
84 0.31
85 0.29
86 0.25
87 0.17
88 0.14
89 0.13
90 0.14
91 0.13
92 0.13
93 0.12
94 0.12
95 0.14
96 0.14
97 0.17
98 0.17
99 0.16
100 0.17
101 0.18
102 0.16
103 0.14
104 0.13
105 0.09
106 0.09
107 0.1
108 0.09
109 0.08
110 0.08
111 0.08
112 0.07
113 0.07
114 0.06
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.06
122 0.06
123 0.08
124 0.08
125 0.1
126 0.1
127 0.1
128 0.1
129 0.1
130 0.09
131 0.08
132 0.09
133 0.07
134 0.07
135 0.06
136 0.09
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.07
141 0.08
142 0.09
143 0.09
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.06
151 0.05
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.08
156 0.09
157 0.1
158 0.1
159 0.1
160 0.09
161 0.09
162 0.09
163 0.08
164 0.07
165 0.06
166 0.07
167 0.07
168 0.06
169 0.07
170 0.08
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.08
175 0.1
176 0.1
177 0.1
178 0.12
179 0.16
180 0.16
181 0.17
182 0.2
183 0.23
184 0.26
185 0.34
186 0.42
187 0.46
188 0.47
189 0.51
190 0.52
191 0.5
192 0.51
193 0.48
194 0.41
195 0.35
196 0.34
197 0.34
198 0.3
199 0.26
200 0.22
201 0.15
202 0.14
203 0.14
204 0.13
205 0.09
206 0.08
207 0.09
208 0.12
209 0.12
210 0.13
211 0.12
212 0.17
213 0.2
214 0.24
215 0.24
216 0.22
217 0.24
218 0.21
219 0.21
220 0.19
221 0.18
222 0.15
223 0.15
224 0.15
225 0.14
226 0.16
227 0.15
228 0.12
229 0.13
230 0.12
231 0.11
232 0.11
233 0.12
234 0.1
235 0.1
236 0.1
237 0.09
238 0.09
239 0.08
240 0.07
241 0.05
242 0.09
243 0.09
244 0.09
245 0.09
246 0.09
247 0.09
248 0.12
249 0.13
250 0.11
251 0.11
252 0.11
253 0.13
254 0.16
255 0.18
256 0.16
257 0.14
258 0.13
259 0.13
260 0.14
261 0.14
262 0.12
263 0.1
264 0.09
265 0.1
266 0.11
267 0.1
268 0.09
269 0.08
270 0.09
271 0.09
272 0.13
273 0.12
274 0.12
275 0.12
276 0.14
277 0.18
278 0.17
279 0.2
280 0.17
281 0.18
282 0.19
283 0.23
284 0.24
285 0.24
286 0.26
287 0.27
288 0.31
289 0.32
290 0.38
291 0.39
292 0.39
293 0.4
294 0.45
295 0.44
296 0.48
297 0.48
298 0.44
299 0.47
300 0.48
301 0.48
302 0.43
303 0.42
304 0.39
305 0.43
306 0.4
307 0.35
308 0.3
309 0.24
310 0.23
311 0.25
312 0.26
313 0.22
314 0.24
315 0.29
316 0.34
317 0.39
318 0.39
319 0.37
320 0.36
321 0.41
322 0.44
323 0.39
324 0.4
325 0.36
326 0.38
327 0.36
328 0.34
329 0.28
330 0.25
331 0.25
332 0.2
333 0.2
334 0.18
335 0.18
336 0.17
337 0.16
338 0.14
339 0.12
340 0.16
341 0.18
342 0.17
343 0.19
344 0.22
345 0.29
346 0.37
347 0.46
348 0.49
349 0.56
350 0.6
351 0.67
352 0.72
353 0.73
354 0.75
355 0.77
356 0.81
357 0.82
358 0.87
359 0.89
360 0.89
361 0.87
362 0.79
363 0.76
364 0.75
365 0.73
366 0.74
367 0.71
368 0.66