Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A420HIM1

Protein Details
Accession A0A420HIM1    Localization Confidence Low Confidence Score 5.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
155-176IKSSWTSPDHIKRKKERSPISVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) plas 24, nucl 1, mito 1, E.R. 1, mito_nucl 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007603  Choline_transptr-like  
Gene Ontology GO:0005886  C:plasma membrane  
GO:0022857  F:transmembrane transporter activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF04515  Choline_transpo  
Amino Acid Sequences MFSEYASRFLAQSQSRISNFVQPTDNAEASHGTPYDKYRRIGQPLRNLSRVYLSRHGNPYQSTSHLSNFNLASRYSAAPDAPLFHSAQDEFRDDDEAERERETADFFALQKSRRVFASARLEDSSEADLEVSAETLDSRNDETRVFEDRGNRFDIKSSWTSPDHIKRKKERSPISVSEEHEFGQQVKKQSLSSASEVEKDRMDDIRLGSTIESDGPPEDLQVDMSTSGSPPAFQKFCPVPGHEDIKLPAFGHRQSSPVGYSRSMNFTNSMPPIVSIITGETPMYDVFWGSIFLISLGGMFATFFLVFLHTETPNKTLGDTIYTTLHASFYLLAVDTVVSIIVSLIWLALLRSFIRPLVYLILIAVPIVLLSFSLHPFIASFKSTGSDNNASDQAMRWLSLVPGVCSLVWIYTIYRGRYSLNKAVGILEFASRILSANPGLLFLGFAILGIVACWTWIWLGMFTRVFLGGQISSSLARFIIDTSSWWLGVYFILIYIWTLSIISGIQRSTAAATVSEWYFHRNIKPSPSPNEVVTAAFTHAITTMFGTISLISLVSLVIRLPLLVFPRRITRILSLFTYSWISTPIMVLTNPLTLTYAAIHSQSLQRSAQALSQMHFLTPQTQITTLTPRSFNVRNRQQIPLFPYRLAKLLLFGTRFIMAVSLSLSGWVFSAKKLKITSLEGEGIRGSAYSYVVGLIAGLIGWGVLGAVEGILSGIVDASLVCWGSEKGMSARGGSYCLEAGYLFGDARTRDLA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.38
3 0.41
4 0.41
5 0.42
6 0.41
7 0.41
8 0.38
9 0.32
10 0.37
11 0.4
12 0.39
13 0.3
14 0.3
15 0.27
16 0.25
17 0.28
18 0.23
19 0.18
20 0.2
21 0.26
22 0.35
23 0.38
24 0.39
25 0.44
26 0.52
27 0.6
28 0.67
29 0.68
30 0.69
31 0.74
32 0.79
33 0.75
34 0.67
35 0.59
36 0.58
37 0.54
38 0.5
39 0.47
40 0.45
41 0.48
42 0.54
43 0.56
44 0.52
45 0.5
46 0.48
47 0.44
48 0.42
49 0.4
50 0.36
51 0.37
52 0.37
53 0.35
54 0.35
55 0.33
56 0.33
57 0.3
58 0.27
59 0.25
60 0.24
61 0.25
62 0.22
63 0.22
64 0.18
65 0.19
66 0.19
67 0.21
68 0.19
69 0.2
70 0.19
71 0.17
72 0.2
73 0.19
74 0.21
75 0.2
76 0.21
77 0.2
78 0.2
79 0.23
80 0.2
81 0.22
82 0.23
83 0.23
84 0.22
85 0.21
86 0.21
87 0.18
88 0.19
89 0.18
90 0.15
91 0.14
92 0.14
93 0.14
94 0.21
95 0.24
96 0.25
97 0.29
98 0.31
99 0.31
100 0.3
101 0.33
102 0.28
103 0.33
104 0.43
105 0.4
106 0.41
107 0.4
108 0.4
109 0.36
110 0.37
111 0.29
112 0.18
113 0.15
114 0.11
115 0.1
116 0.09
117 0.09
118 0.07
119 0.05
120 0.05
121 0.05
122 0.06
123 0.06
124 0.07
125 0.1
126 0.13
127 0.14
128 0.15
129 0.17
130 0.19
131 0.25
132 0.25
133 0.25
134 0.31
135 0.34
136 0.37
137 0.39
138 0.37
139 0.32
140 0.33
141 0.32
142 0.3
143 0.31
144 0.31
145 0.31
146 0.31
147 0.34
148 0.39
149 0.47
150 0.52
151 0.55
152 0.62
153 0.67
154 0.75
155 0.81
156 0.83
157 0.81
158 0.79
159 0.8
160 0.77
161 0.75
162 0.7
163 0.64
164 0.56
165 0.48
166 0.4
167 0.33
168 0.27
169 0.2
170 0.21
171 0.22
172 0.23
173 0.25
174 0.26
175 0.25
176 0.26
177 0.3
178 0.28
179 0.27
180 0.28
181 0.27
182 0.31
183 0.32
184 0.31
185 0.27
186 0.23
187 0.23
188 0.2
189 0.2
190 0.18
191 0.17
192 0.18
193 0.17
194 0.17
195 0.15
196 0.13
197 0.13
198 0.11
199 0.1
200 0.08
201 0.08
202 0.1
203 0.09
204 0.09
205 0.09
206 0.07
207 0.08
208 0.07
209 0.08
210 0.06
211 0.07
212 0.07
213 0.06
214 0.08
215 0.07
216 0.08
217 0.09
218 0.15
219 0.15
220 0.15
221 0.22
222 0.22
223 0.27
224 0.3
225 0.3
226 0.3
227 0.34
228 0.39
229 0.34
230 0.34
231 0.29
232 0.28
233 0.27
234 0.22
235 0.2
236 0.19
237 0.19
238 0.21
239 0.21
240 0.2
241 0.2
242 0.22
243 0.2
244 0.21
245 0.22
246 0.19
247 0.2
248 0.21
249 0.25
250 0.24
251 0.22
252 0.2
253 0.18
254 0.22
255 0.21
256 0.19
257 0.14
258 0.13
259 0.13
260 0.12
261 0.11
262 0.07
263 0.07
264 0.07
265 0.07
266 0.07
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.04
282 0.04
283 0.04
284 0.03
285 0.03
286 0.03
287 0.03
288 0.03
289 0.03
290 0.03
291 0.04
292 0.05
293 0.05
294 0.06
295 0.08
296 0.08
297 0.1
298 0.11
299 0.13
300 0.14
301 0.14
302 0.13
303 0.12
304 0.11
305 0.13
306 0.13
307 0.12
308 0.11
309 0.12
310 0.12
311 0.11
312 0.11
313 0.08
314 0.07
315 0.06
316 0.05
317 0.05
318 0.05
319 0.04
320 0.04
321 0.04
322 0.04
323 0.03
324 0.03
325 0.02
326 0.02
327 0.02
328 0.02
329 0.02
330 0.02
331 0.02
332 0.02
333 0.02
334 0.02
335 0.03
336 0.04
337 0.05
338 0.05
339 0.06
340 0.07
341 0.07
342 0.08
343 0.08
344 0.09
345 0.08
346 0.08
347 0.07
348 0.07
349 0.06
350 0.06
351 0.05
352 0.03
353 0.02
354 0.02
355 0.02
356 0.02
357 0.03
358 0.04
359 0.04
360 0.05
361 0.05
362 0.05
363 0.06
364 0.07
365 0.08
366 0.08
367 0.08
368 0.07
369 0.08
370 0.09
371 0.09
372 0.13
373 0.15
374 0.15
375 0.17
376 0.17
377 0.16
378 0.16
379 0.15
380 0.13
381 0.1
382 0.1
383 0.08
384 0.08
385 0.08
386 0.1
387 0.1
388 0.08
389 0.08
390 0.08
391 0.08
392 0.08
393 0.08
394 0.05
395 0.05
396 0.05
397 0.05
398 0.1
399 0.13
400 0.14
401 0.15
402 0.15
403 0.17
404 0.21
405 0.26
406 0.27
407 0.26
408 0.26
409 0.25
410 0.26
411 0.24
412 0.2
413 0.15
414 0.1
415 0.07
416 0.07
417 0.07
418 0.05
419 0.06
420 0.05
421 0.06
422 0.06
423 0.07
424 0.07
425 0.07
426 0.07
427 0.06
428 0.06
429 0.05
430 0.05
431 0.03
432 0.03
433 0.03
434 0.03
435 0.03
436 0.03
437 0.03
438 0.02
439 0.02
440 0.02
441 0.03
442 0.03
443 0.04
444 0.04
445 0.05
446 0.06
447 0.1
448 0.1
449 0.1
450 0.11
451 0.1
452 0.09
453 0.08
454 0.09
455 0.06
456 0.06
457 0.06
458 0.07
459 0.07
460 0.07
461 0.07
462 0.06
463 0.06
464 0.05
465 0.06
466 0.06
467 0.06
468 0.07
469 0.1
470 0.11
471 0.11
472 0.11
473 0.1
474 0.09
475 0.09
476 0.08
477 0.05
478 0.04
479 0.04
480 0.04
481 0.04
482 0.04
483 0.04
484 0.04
485 0.04
486 0.03
487 0.04
488 0.04
489 0.05
490 0.06
491 0.06
492 0.06
493 0.07
494 0.07
495 0.07
496 0.09
497 0.08
498 0.07
499 0.08
500 0.1
501 0.1
502 0.11
503 0.1
504 0.12
505 0.14
506 0.16
507 0.2
508 0.23
509 0.26
510 0.33
511 0.41
512 0.44
513 0.48
514 0.52
515 0.5
516 0.44
517 0.45
518 0.38
519 0.3
520 0.25
521 0.2
522 0.15
523 0.13
524 0.12
525 0.09
526 0.09
527 0.09
528 0.08
529 0.07
530 0.07
531 0.06
532 0.07
533 0.07
534 0.06
535 0.06
536 0.06
537 0.05
538 0.04
539 0.04
540 0.04
541 0.04
542 0.04
543 0.04
544 0.04
545 0.04
546 0.04
547 0.05
548 0.07
549 0.11
550 0.15
551 0.16
552 0.18
553 0.24
554 0.27
555 0.28
556 0.29
557 0.3
558 0.31
559 0.32
560 0.32
561 0.29
562 0.26
563 0.26
564 0.26
565 0.21
566 0.17
567 0.16
568 0.15
569 0.12
570 0.12
571 0.11
572 0.1
573 0.1
574 0.11
575 0.1
576 0.11
577 0.11
578 0.11
579 0.11
580 0.09
581 0.1
582 0.1
583 0.1
584 0.1
585 0.1
586 0.1
587 0.11
588 0.15
589 0.16
590 0.19
591 0.17
592 0.18
593 0.19
594 0.2
595 0.21
596 0.23
597 0.22
598 0.2
599 0.24
600 0.23
601 0.21
602 0.21
603 0.2
604 0.16
605 0.17
606 0.18
607 0.16
608 0.16
609 0.18
610 0.19
611 0.26
612 0.27
613 0.29
614 0.28
615 0.27
616 0.32
617 0.38
618 0.43
619 0.47
620 0.53
621 0.58
622 0.61
623 0.67
624 0.64
625 0.63
626 0.63
627 0.62
628 0.55
629 0.48
630 0.47
631 0.41
632 0.41
633 0.37
634 0.29
635 0.23
636 0.24
637 0.26
638 0.24
639 0.23
640 0.22
641 0.21
642 0.2
643 0.18
644 0.14
645 0.09
646 0.09
647 0.09
648 0.08
649 0.07
650 0.08
651 0.08
652 0.07
653 0.08
654 0.09
655 0.09
656 0.11
657 0.2
658 0.2
659 0.25
660 0.27
661 0.3
662 0.32
663 0.37
664 0.38
665 0.35
666 0.39
667 0.34
668 0.34
669 0.3
670 0.26
671 0.2
672 0.16
673 0.12
674 0.08
675 0.08
676 0.07
677 0.07
678 0.07
679 0.07
680 0.07
681 0.06
682 0.05
683 0.04
684 0.04
685 0.03
686 0.03
687 0.02
688 0.02
689 0.02
690 0.02
691 0.02
692 0.02
693 0.02
694 0.02
695 0.02
696 0.02
697 0.03
698 0.03
699 0.03
700 0.03
701 0.03
702 0.03
703 0.03
704 0.03
705 0.03
706 0.05
707 0.06
708 0.06
709 0.07
710 0.08
711 0.1
712 0.11
713 0.14
714 0.14
715 0.2
716 0.21
717 0.21
718 0.24
719 0.23
720 0.24
721 0.22
722 0.22
723 0.16
724 0.16
725 0.15
726 0.12
727 0.11
728 0.1
729 0.11
730 0.08
731 0.08
732 0.12
733 0.11