FuNGI

A0A420HDF4

Protein Details

Accession

A0A420HDF4

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
87-106	GVAPRAKMNQQRARRFRTAL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto 11.5, cyto_nucl 11, nucl 9.5, mito 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR016494 5_3_exoribonuclease_1 IPR014722 Rib_L2_dom2 IPR041385 SH3_12 IPR040992 XRN1_D1 IPR047007 XRN1_D1_sf IPR041106 XRN1_D2_D3 IPR040486 Xrn1_D3 IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR047008 XRN1_SH3_sf
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF18129 SH3_12 PF18332 XRN1_D1 PF18334 XRN1_D2_D3 PF18194 Xrn1_D3 PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPKFFRWMSERYPAISQLIAENRIPEFDCLYLDMNGIIHNCTHKDSENTTFRMTEEQMFVTVFNYIEHLYGKIKPKQLFFMAVDGVAPRAKMNQQRARRFRTALDVELAREKAIKEGKEIPKEDAFDSNSITPGTEFMHKLTIQLKFFINKKISEDTDWQGVKIILSGHEVPGEGEHKIMEYIRHAKAQPEYNPNIRHCLYGLDADLIMLGLLSHDPHFCLLREEVTFGRASKSKSKELEHQKFYLTHLCIVREYLDLEFQELREPGAMKFNFDLERVIDDFILMAFFVGNDFLPNLPNLHINEGALALMFKIYKTVLPKAGGYINEGGVINLNRLNVLLDEISHVEYRYFESDVSDQNWFNSKQMSKQDVMLKNKAPDKVIMTSSQRETWQAIKAFLADKSKPIVDLPHTLIAADRKFFRDLADRLHLEWNTIEDDTGNRCMQISRPPTSINNVDENGELLMEVCQVIKMYDDAETMDVSVAQAKAEMDRKYEEKFREWKDTYYNEKFGWHLNDDAKLVQICENYVMGLQWVLFYYYRGVVSWAWYYQYHYSPMISDVVRGLKVNLVFDLGQPFRPFEQLMGVLPDRSKKIVPTIYHDLMTNPRSPIIDFYPRNFELDMNGKRMEWEAVVKIPFIDEKRLLTAMAPINKLLSEEEKKRNEFGLTFQYLYDPTSDFEYPSSLIGIFPDIPHCHCIESVFDLPTMEGLKYHIGLMDGVKLGDAALAGFPSLSTLPYSAALKFHGVSVFQSESSNESMVVTLRDSELRSNIKTAKTKLGKKVYVGYPYLQEGRVFKVSDELFDYFPSTDQTAHPIQKSHNQREIEDFSRKAERIEDNYSKHLGIIIGPVESIIHVEMLKGLTKTDEGNTIKEYALIPGMDTEFASQAIVDEVLNEDQRFLEHAALPIDEEFPPGSRAFFLGEFNYGRPLVIIDLKDDRANVWLSATKFKEEEFGHQVIQKYETTSTYLPAYTVAQMLGLNSFVLSKITSSFSVAALGNSRLNLGLNLKFESKKLKVLGYTRRSEKGWEYSHSAIELLTTYMTKFPDFFAGIHRNIRASEYKATDFYAAEVADSKIKEIVAWLKSIESNKFEKIPLDSEQLDSNVIAAIEKAIDAELEANSEVTYKKFTGVPRNALLKPSDAEHRLGRQTFALGDRVIYVQESGRVPIATRGFVVGITRTNSTMLLDVLFSLSFMSGTTLGDRCTPYRGSTVPSTSVINISNKQVVASAFQEHLTPEHSTKNSQSPTQFNRSQVNYRDAVAPPPRRGSYRGTAFGQNQNRVNYRDENQSAPNRTRGSSQQNARAALTRGNQAVRSGLPRQFSRGKGERTKPS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.45
2	0.43
3	0.4
4	0.35
5	0.29
6	0.27
7	0.3
8	0.3
9	0.27
10	0.28
11	0.26
12	0.27
13	0.28
14	0.22
15	0.19
16	0.17
17	0.17
18	0.17
19	0.19
20	0.17
21	0.16
22	0.15
23	0.13
24	0.15
25	0.14
26	0.13
27	0.12
28	0.15
29	0.16
30	0.19
31	0.22
32	0.23
33	0.28
34	0.32
35	0.4
36	0.45
37	0.47
38	0.46
39	0.44
40	0.41
41	0.41
42	0.39
43	0.34
44	0.29
45	0.26
46	0.25
47	0.24
48	0.23
49	0.18
50	0.17
51	0.13
52	0.1
53	0.11
54	0.1
55	0.11
56	0.12
57	0.13
58	0.15
59	0.21
60	0.29
61	0.34
62	0.41
63	0.45
64	0.48
65	0.52
66	0.53
67	0.53
68	0.46
69	0.44
70	0.38
71	0.33
72	0.3
73	0.23
74	0.21
75	0.16
76	0.14
77	0.1
78	0.13
79	0.2
80	0.28
81	0.38
82	0.46
83	0.55
84	0.66
85	0.75
86	0.8
87	0.8
88	0.75
89	0.68
90	0.68
91	0.63
92	0.55
93	0.52
94	0.45
95	0.4
96	0.42
97	0.39
98	0.29
99	0.26
100	0.23
101	0.25
102	0.3
103	0.28
104	0.28
105	0.37
106	0.46
107	0.53
108	0.54
109	0.52
110	0.51
111	0.53
112	0.49
113	0.45
114	0.39
115	0.32
116	0.33
117	0.29
118	0.26
119	0.23
120	0.22
121	0.16
122	0.14
123	0.15
124	0.17
125	0.16
126	0.16
127	0.22
128	0.21
129	0.24
130	0.28
131	0.32
132	0.29
133	0.31
134	0.33
135	0.33
136	0.36
137	0.42
138	0.4
139	0.36
140	0.4
141	0.43
142	0.43
143	0.42
144	0.44
145	0.39
146	0.44
147	0.42
148	0.37
149	0.33
150	0.3
151	0.25
152	0.21
153	0.19
154	0.12
155	0.16
156	0.17
157	0.15
158	0.16
159	0.16
160	0.14
161	0.16
162	0.17
163	0.12
164	0.12
165	0.11
166	0.11
167	0.12
168	0.13
169	0.11
170	0.16
171	0.23
172	0.25
173	0.3
174	0.3
175	0.34
176	0.39
177	0.45
178	0.47
179	0.48
180	0.52
181	0.55
182	0.61
183	0.58
184	0.59
185	0.51
186	0.45
187	0.37
188	0.34
189	0.28
190	0.23
191	0.23
192	0.17
193	0.16
194	0.14
195	0.14
196	0.11
197	0.08
198	0.05
199	0.04
200	0.03
201	0.03
202	0.05
203	0.06
204	0.06
205	0.07
206	0.09
207	0.11
208	0.11
209	0.15
210	0.15
211	0.17
212	0.18
213	0.2
214	0.19
215	0.19
216	0.2
217	0.17
218	0.2
219	0.2
220	0.24
221	0.3
222	0.36
223	0.41
224	0.46
225	0.5
226	0.55
227	0.63
228	0.69
229	0.65
230	0.62
231	0.58
232	0.53
233	0.52
234	0.5
235	0.4
236	0.36
237	0.33
238	0.33
239	0.29
240	0.29
241	0.27
242	0.2
243	0.2
244	0.15
245	0.16
246	0.14
247	0.16
248	0.16
249	0.15
250	0.17
251	0.16
252	0.16
253	0.15
254	0.16
255	0.14
256	0.22
257	0.22
258	0.21
259	0.21
260	0.24
261	0.23
262	0.23
263	0.23
264	0.15
265	0.19
266	0.17
267	0.17
268	0.14
269	0.12
270	0.12
271	0.1
272	0.09
273	0.05
274	0.04
275	0.03
276	0.03
277	0.04
278	0.04
279	0.04
280	0.04
281	0.05
282	0.06
283	0.07
284	0.07
285	0.09
286	0.09
287	0.13
288	0.14
289	0.16
290	0.17
291	0.16
292	0.16
293	0.15
294	0.13
295	0.09
296	0.08
297	0.05
298	0.05
299	0.05
300	0.05
301	0.06
302	0.06
303	0.09
304	0.13
305	0.18
306	0.21
307	0.23
308	0.24
309	0.25
310	0.28
311	0.26
312	0.25
313	0.22
314	0.18
315	0.18
316	0.18
317	0.15
318	0.14
319	0.14
320	0.12
321	0.12
322	0.11
323	0.1
324	0.1
325	0.1
326	0.08
327	0.09
328	0.08
329	0.07
330	0.08
331	0.09
332	0.11
333	0.11
334	0.11
335	0.09
336	0.1
337	0.12
338	0.13
339	0.13
340	0.11
341	0.13
342	0.15
343	0.18
344	0.2
345	0.2
346	0.18
347	0.19
348	0.24
349	0.22
350	0.21
351	0.24
352	0.22
353	0.26
354	0.34
355	0.37
356	0.33
357	0.38
358	0.46
359	0.48
360	0.53
361	0.52
362	0.48
363	0.49
364	0.53
365	0.49
366	0.42
367	0.36
368	0.34
369	0.32
370	0.3
371	0.3
372	0.29
373	0.31
374	0.32
375	0.32
376	0.29
377	0.27
378	0.27
379	0.26
380	0.28
381	0.25
382	0.24
383	0.21
384	0.22
385	0.22
386	0.23
387	0.25
388	0.19
389	0.19
390	0.21
391	0.21
392	0.2
393	0.19
394	0.2
395	0.18
396	0.22
397	0.23
398	0.24
399	0.23
400	0.23
401	0.23
402	0.24
403	0.22
404	0.19
405	0.18
406	0.17
407	0.19
408	0.19
409	0.2
410	0.23
411	0.23
412	0.28
413	0.33
414	0.31
415	0.32
416	0.37
417	0.34
418	0.27
419	0.26
420	0.21
421	0.16
422	0.16
423	0.13
424	0.09
425	0.1
426	0.12
427	0.15
428	0.14
429	0.12
430	0.12
431	0.13
432	0.15
433	0.22
434	0.25
435	0.25
436	0.27
437	0.29
438	0.31
439	0.35
440	0.37
441	0.32
442	0.3
443	0.27
444	0.26
445	0.23
446	0.22
447	0.17
448	0.12
449	0.09
450	0.06
451	0.05
452	0.04
453	0.04
454	0.04
455	0.04
456	0.04
457	0.04
458	0.04
459	0.05
460	0.05
461	0.06
462	0.06
463	0.07
464	0.07
465	0.07
466	0.07
467	0.07
468	0.06
469	0.05
470	0.07
471	0.06
472	0.06
473	0.06
474	0.06
475	0.09
476	0.14
477	0.15
478	0.15
479	0.18
480	0.2
481	0.22
482	0.28
483	0.28
484	0.29
485	0.37
486	0.39
487	0.47
488	0.47
489	0.46
490	0.46
491	0.5
492	0.52
493	0.49
494	0.48
495	0.38
496	0.37
497	0.36
498	0.33
499	0.31
500	0.23
501	0.21
502	0.2
503	0.21
504	0.21
505	0.2
506	0.18
507	0.14
508	0.13
509	0.12
510	0.11
511	0.09
512	0.1
513	0.09
514	0.08
515	0.08
516	0.07
517	0.05
518	0.05
519	0.05
520	0.04
521	0.04
522	0.05
523	0.05
524	0.06
525	0.07
526	0.08
527	0.08
528	0.08
529	0.09
530	0.08
531	0.11
532	0.12
533	0.11
534	0.12
535	0.12
536	0.14
537	0.16
538	0.17
539	0.17
540	0.16
541	0.16
542	0.15
543	0.16
544	0.16
545	0.13
546	0.12
547	0.11
548	0.12
549	0.12
550	0.12
551	0.11
552	0.1
553	0.11
554	0.11
555	0.09
556	0.09
557	0.09
558	0.09
559	0.14
560	0.12
561	0.13
562	0.13
563	0.14
564	0.13
565	0.14
566	0.14
567	0.09
568	0.11
569	0.1
570	0.1
571	0.12
572	0.12
573	0.11
574	0.12
575	0.14
576	0.13
577	0.13
578	0.14
579	0.11
580	0.17
581	0.21
582	0.22
583	0.27
584	0.34
585	0.33
586	0.33
587	0.33
588	0.28
589	0.27
590	0.28
591	0.23
592	0.16
593	0.16
594	0.16
595	0.16
596	0.17
597	0.17
598	0.24
599	0.23
600	0.24
601	0.3
602	0.3
603	0.31
604	0.29
605	0.24
606	0.18
607	0.25
608	0.26
609	0.22
610	0.22
611	0.21
612	0.21
613	0.21
614	0.19
615	0.11
616	0.11
617	0.09
618	0.11
619	0.11
620	0.11
621	0.1
622	0.09
623	0.11
624	0.1
625	0.12
626	0.11
627	0.11
628	0.13
629	0.13
630	0.13
631	0.11
632	0.15
633	0.15
634	0.18
635	0.18
636	0.16
637	0.16
638	0.16
639	0.16
640	0.12
641	0.13
642	0.14
643	0.2
644	0.28
645	0.32
646	0.33
647	0.34
648	0.34
649	0.31
650	0.27
651	0.24
652	0.23
653	0.2
654	0.2
655	0.18
656	0.18
657	0.17
658	0.17
659	0.15
660	0.08
661	0.07
662	0.1
663	0.1
664	0.09
665	0.09
666	0.1
667	0.09
668	0.09
669	0.09
670	0.06
671	0.06
672	0.06
673	0.06
674	0.06
675	0.06
676	0.08
677	0.08
678	0.09
679	0.11
680	0.11
681	0.1
682	0.1
683	0.11
684	0.09
685	0.13
686	0.14
687	0.13
688	0.12
689	0.12
690	0.11
691	0.12
692	0.11
693	0.07
694	0.05
695	0.06
696	0.06
697	0.07
698	0.07
699	0.07
700	0.06
701	0.07
702	0.07
703	0.08
704	0.07
705	0.07
706	0.06
707	0.06
708	0.05
709	0.05
710	0.04
711	0.03
712	0.03
713	0.03
714	0.03
715	0.03
716	0.03
717	0.03
718	0.04
719	0.04
720	0.04
721	0.05
722	0.05
723	0.07
724	0.08
725	0.08
726	0.08
727	0.09
728	0.1
729	0.09
730	0.1
731	0.09
732	0.08
733	0.08
734	0.11
735	0.11
736	0.1
737	0.1
738	0.1
739	0.11
740	0.12
741	0.12
742	0.09
743	0.08
744	0.08
745	0.08
746	0.08
747	0.07
748	0.06
749	0.06
750	0.08
751	0.08
752	0.09
753	0.13
754	0.15
755	0.15
756	0.18
757	0.21
758	0.25
759	0.29
760	0.31
761	0.36
762	0.41
763	0.47
764	0.53
765	0.58
766	0.54
767	0.51
768	0.56
769	0.5
770	0.47
771	0.42
772	0.35
773	0.28
774	0.28
775	0.28
776	0.21
777	0.18
778	0.15
779	0.17
780	0.19
781	0.18
782	0.15
783	0.2
784	0.19
785	0.19
786	0.21
787	0.18
788	0.16
789	0.16
790	0.17
791	0.11
792	0.12
793	0.12
794	0.1
795	0.09
796	0.09
797	0.13
798	0.17
799	0.19
800	0.2
801	0.21
802	0.22
803	0.29
804	0.38
805	0.41
806	0.44
807	0.42
808	0.42
809	0.47
810	0.5
811	0.47
812	0.42
813	0.35
814	0.31
815	0.34
816	0.34
817	0.28
818	0.27
819	0.26
820	0.26
821	0.34
822	0.37
823	0.35
824	0.38
825	0.38
826	0.34
827	0.3
828	0.26
829	0.18
830	0.12
831	0.11
832	0.09
833	0.08
834	0.07
835	0.07
836	0.06
837	0.06
838	0.06
839	0.04
840	0.04
841	0.04
842	0.04
843	0.05
844	0.06
845	0.08
846	0.08
847	0.08
848	0.08
849	0.09
850	0.1
851	0.1
852	0.17
853	0.17
854	0.18
855	0.2
856	0.21
857	0.2
858	0.2
859	0.19
860	0.12
861	0.12
862	0.1
863	0.09
864	0.09
865	0.09
866	0.08
867	0.08
868	0.08
869	0.06
870	0.07
871	0.06
872	0.05
873	0.05
874	0.05
875	0.05
876	0.04
877	0.04
878	0.06
879	0.07
880	0.08
881	0.08
882	0.08
883	0.08
884	0.08
885	0.1
886	0.09
887	0.1
888	0.1
889	0.12
890	0.12
891	0.12
892	0.13
893	0.11
894	0.12
895	0.1
896	0.1
897	0.08
898	0.08
899	0.1
900	0.1
901	0.1
902	0.09
903	0.09
904	0.1
905	0.11
906	0.11
907	0.1
908	0.13
909	0.14
910	0.14
911	0.16
912	0.14
913	0.13
914	0.12
915	0.11
916	0.1
917	0.12
918	0.12
919	0.12
920	0.15
921	0.17
922	0.17
923	0.17
924	0.16
925	0.14
926	0.15
927	0.13
928	0.12
929	0.14
930	0.16
931	0.23
932	0.23
933	0.23
934	0.22
935	0.22
936	0.27
937	0.24
938	0.28
939	0.27
940	0.28
941	0.27
942	0.3
943	0.32
944	0.26
945	0.28
946	0.22
947	0.19
948	0.18
949	0.18
950	0.19
951	0.17
952	0.17
953	0.16
954	0.16
955	0.14
956	0.13
957	0.14
958	0.11
959	0.11
960	0.09
961	0.08
962	0.08
963	0.09
964	0.08
965	0.07
966	0.06
967	0.05
968	0.05
969	0.05
970	0.05
971	0.05
972	0.05
973	0.07
974	0.09
975	0.1
976	0.12
977	0.13
978	0.12
979	0.15
980	0.14
981	0.13
982	0.14
983	0.15
984	0.14
985	0.13
986	0.13
987	0.1
988	0.11
989	0.11
990	0.12
991	0.14
992	0.15
993	0.17
994	0.2
995	0.2
996	0.21
997	0.28
998	0.27
999	0.29
1000	0.3
1001	0.31
1002	0.33
1003	0.41
1004	0.5
1005	0.49
1006	0.55
1007	0.53
1008	0.55
1009	0.52
1010	0.51
1011	0.48
1012	0.47
1013	0.44
1014	0.4
1015	0.41
1016	0.4
1017	0.4
1018	0.37
1019	0.31
1020	0.22
1021	0.18
1022	0.15
1023	0.09
1024	0.07
1025	0.07
1026	0.07
1027	0.09
1028	0.11
1029	0.11
1030	0.1
1031	0.11
1032	0.15
1033	0.16
1034	0.16
1035	0.21
1036	0.26
1037	0.29
1038	0.32
1039	0.32
1040	0.28
1041	0.27
1042	0.31
1043	0.27
1044	0.25
1045	0.29
1046	0.3
1047	0.31
1048	0.31
1049	0.32
1050	0.29
1051	0.25
1052	0.22
1053	0.19
1054	0.14
1055	0.12
1056	0.13
1057	0.12
1058	0.15
1059	0.14
1060	0.14
1061	0.13
1062	0.13
1063	0.12
1064	0.14
1065	0.2
1066	0.18
1067	0.19
1068	0.18
1069	0.19
1070	0.22
1071	0.26
1072	0.26
1073	0.24
1074	0.26
1075	0.28
1076	0.3
1077	0.29
1078	0.28
1079	0.28
1080	0.28
1081	0.27
1082	0.29
1083	0.27
1084	0.26
1085	0.27
1086	0.25
1087	0.23
1088	0.19
1089	0.15
1090	0.11
1091	0.1
1092	0.08
1093	0.06
1094	0.06
1095	0.05
1096	0.05
1097	0.05
1098	0.04
1099	0.04
1100	0.05
1101	0.06
1102	0.06
1103	0.07
1104	0.07
1105	0.07
1106	0.07
1107	0.09
1108	0.09
1109	0.09
1110	0.12
1111	0.11
1112	0.13
1113	0.17
1114	0.23
1115	0.32
1116	0.39
1117	0.44
1118	0.47
1119	0.53
1120	0.53
1121	0.52
1122	0.48
1123	0.4
1124	0.34
1125	0.3
1126	0.31
1127	0.26
1128	0.29
1129	0.3
1130	0.34
1131	0.38
1132	0.38
1133	0.37
1134	0.31
1135	0.3
1136	0.29
1137	0.27
1138	0.24
1139	0.18
1140	0.17
1141	0.17
1142	0.16
1143	0.15
1144	0.13
1145	0.12
1146	0.1
1147	0.14
1148	0.15
1149	0.15
1150	0.16
1151	0.16
1152	0.16
1153	0.22
1154	0.23
1155	0.19
1156	0.19
1157	0.19
1158	0.17
1159	0.17
1160	0.18
1161	0.14
1162	0.15
1163	0.16
1164	0.17
1165	0.17
1166	0.17
1167	0.17
1168	0.16
1169	0.16
1170	0.13
1171	0.11
1172	0.1
1173	0.09
1174	0.09
1175	0.09
1176	0.08
1177	0.07
1178	0.06
1179	0.06
1180	0.06
1181	0.07
1182	0.07
1183	0.08
1184	0.11
1185	0.12
1186	0.13
1187	0.16
1188	0.19
1189	0.18
1190	0.22
1191	0.23
1192	0.23
1193	0.27
1194	0.28
1195	0.29
1196	0.33
1197	0.36
1198	0.35
1199	0.35
1200	0.34
1201	0.3
1202	0.31
1203	0.3
1204	0.29
1205	0.27
1206	0.27
1207	0.3
1208	0.28
1209	0.27
1210	0.26
1211	0.23
1212	0.22
1213	0.21
1214	0.21
1215	0.18
1216	0.18
1217	0.19
1218	0.17
1219	0.18
1220	0.17
1221	0.19
1222	0.18
1223	0.24
1224	0.26
1225	0.3
1226	0.34
1227	0.42
1228	0.43
1229	0.45
1230	0.49
1231	0.5
1232	0.56
1233	0.61
1234	0.61
1235	0.57
1236	0.61
1237	0.61
1238	0.63
1239	0.6
1240	0.58
1241	0.51
1242	0.48
1243	0.48
1244	0.41
1245	0.44
1246	0.45
1247	0.46
1248	0.46
1249	0.51
1250	0.53
1251	0.51
1252	0.53
1253	0.53
1254	0.53
1255	0.54
1256	0.55
1257	0.51
1258	0.55
1259	0.57
1260	0.63
1261	0.64
1262	0.61
1263	0.58
1264	0.58
1265	0.59
1266	0.55
1267	0.55
1268	0.52
1269	0.48
1270	0.51
1271	0.48
1272	0.46
1273	0.49
1274	0.55
1275	0.57
1276	0.55
1277	0.58
1278	0.51
1279	0.5
1280	0.5
1281	0.51
1282	0.52
1283	0.54
1284	0.58
1285	0.59
1286	0.62
1287	0.63
1288	0.6
1289	0.56
1290	0.49
1291	0.46
1292	0.42
1293	0.38
1294	0.37
1295	0.38
1296	0.37
1297	0.33
1298	0.34
1299	0.31
1300	0.33
1301	0.33
1302	0.33
1303	0.37
1304	0.37
1305	0.43
1306	0.48
1307	0.48
1308	0.53
1309	0.55
1310	0.61
1311	0.65

A0A420HDF4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer