Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A420HDM3

Protein Details
Accession A0A420HDM3    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
130-159IRCSQRPKKDLPEKKIRGSKARKIIAKKEEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
135-159RPKKDLPEKKIRGSKARKIIAKKEE
Subcellular Location(s) nucl 10.5, cyto_nucl 10.333, cyto 9, cyto_mito 8.333, mito 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029004  L28e/Mak16  
IPR002672  Ribosomal_L28e  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF01778  Ribosomal_L28e  
Amino Acid Sequences MSHYSSQVSADLIWEVVRPQNSFLVKRASSGGVQLSRDPLNLKNIHSRKYAGFVNDKAVGIVPGDASAGGVTLITKKPKNAQRPASASYSTTFGSSKSTRKTYKGIVNTTVRSMYRSDLRAEAVARASAIRCSQRPKKDLPEKKIRGSKARKIIAKKEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.09
3 0.13
4 0.15
5 0.15
6 0.17
7 0.23
8 0.27
9 0.28
10 0.31
11 0.34
12 0.32
13 0.32
14 0.33
15 0.29
16 0.25
17 0.25
18 0.27
19 0.22
20 0.24
21 0.23
22 0.24
23 0.22
24 0.23
25 0.23
26 0.19
27 0.24
28 0.25
29 0.27
30 0.34
31 0.37
32 0.4
33 0.4
34 0.4
35 0.33
36 0.35
37 0.35
38 0.29
39 0.3
40 0.28
41 0.29
42 0.29
43 0.28
44 0.23
45 0.21
46 0.17
47 0.12
48 0.11
49 0.07
50 0.04
51 0.04
52 0.04
53 0.04
54 0.03
55 0.03
56 0.03
57 0.03
58 0.03
59 0.05
60 0.07
61 0.1
62 0.11
63 0.12
64 0.2
65 0.27
66 0.36
67 0.43
68 0.48
69 0.51
70 0.56
71 0.58
72 0.54
73 0.47
74 0.39
75 0.32
76 0.27
77 0.2
78 0.16
79 0.13
80 0.1
81 0.14
82 0.16
83 0.2
84 0.24
85 0.3
86 0.33
87 0.36
88 0.4
89 0.41
90 0.47
91 0.49
92 0.48
93 0.48
94 0.49
95 0.47
96 0.45
97 0.41
98 0.33
99 0.27
100 0.25
101 0.21
102 0.22
103 0.22
104 0.23
105 0.21
106 0.23
107 0.23
108 0.23
109 0.22
110 0.18
111 0.16
112 0.14
113 0.13
114 0.12
115 0.13
116 0.16
117 0.19
118 0.21
119 0.3
120 0.39
121 0.47
122 0.51
123 0.57
124 0.64
125 0.7
126 0.77
127 0.77
128 0.8
129 0.78
130 0.83
131 0.84
132 0.79
133 0.79
134 0.79
135 0.79
136 0.78
137 0.79
138 0.77
139 0.78