FuNGI

A0A420JBH7

Protein Details

Accession

A0A420JBH7

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
11-50	GPTSNNKKPQFIRRSRAIDPLRPRKKPLRRPPHLDPPKSL	Hydrophilic
498-544	RDNDLLKKPHSRKRPGSPNLSESSGNESTRKKSKKKHAPNLETSDPK	Hydrophilic
597-619	KGDLSDRAKKRQKLKVSSTNVSS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
20-43	QFIRRSRAIDPLRPRKKPLRRPPH
416-432	ARKKLGKGVKKALKKRE
504-514	KKPHSRKRPGS
525-534	STRKKSKKKH

Subcellular Location(s)

nucl 25.5, cyto_nucl 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSAYPSGQSIGPTSNNKKPQFIRRSRAIDPLRPRKKPLRRPPHLDPPKSLLAESKLFYPVNGLAPQKKSLQQQACDQLRESNDGWTNEPEGEYCDFPLITTKKAVREGLRYHIARFAGKKEVDPWNQNEFTRPVVLHRRDPQQPSGRGSKDDEFEADQAIDSKEREKQEIARAEKEKQRVLDLAQIAPTGNNPSLASKKIISGRNEKTTQVYRLDKTLEEKKASDLRYEEALPWHIEDADNKNTWVGNYEAALSDINVAFIIQDGVFKMIPLEKWYKFASKGQFKAYTIDEAEAKMGKKVKESRWVMKENEQKEADRVNLEGRKAMVKLYTVKSESTTFRNSGKREVEDMDELDFNGDDLFQDDDELATVEPDKDEESKEAQDRIKKEQLGANFFGQANEAEVDQELFEEEKEAQARKKLGKGVKKALKKRERNYIYDSDSDHPYSETSEDDTSDEEKVKEIDRRLEEENKNKMKTENKSVTSTTIIKDVNFPAIRSRDNDLLKKPHSRKRPGSPNLSESSGNESTRKKSKKKHAPNLETSDPKSESRQTSFSSQSSTGPVNRYNTTFKINSSQARASDAYSALTTLNPNSDSEAMKGDLSDRAKKRQKLKVSSTNVSSRAGPRQCSPVLVTSPLGTQRSGPITTSEIVSALPTTGISIGNLMKSFGGRVGDDPAIQTKKAEFIRMVRENAKYGPDKLLRPK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.45
2	0.54
3	0.55
4	0.62
5	0.65
6	0.7
7	0.72
8	0.76
9	0.75
10	0.76
11	0.8
12	0.75
13	0.78
14	0.74
15	0.72
16	0.73
17	0.76
18	0.76
19	0.74
20	0.78
21	0.78
22	0.82
23	0.84
24	0.84
25	0.85
26	0.85
27	0.89
28	0.9
29	0.91
30	0.9
31	0.85
32	0.79
33	0.75
34	0.72
35	0.64
36	0.55
37	0.48
38	0.43
39	0.42
40	0.37
41	0.33
42	0.3
43	0.28
44	0.28
45	0.27
46	0.24
47	0.25
48	0.28
49	0.3
50	0.31
51	0.35
52	0.38
53	0.39
54	0.42
55	0.44
56	0.49
57	0.53
58	0.5
59	0.56
60	0.63
61	0.64
62	0.61
63	0.55
64	0.51
65	0.45
66	0.46
67	0.38
68	0.35
69	0.35
70	0.34
71	0.36
72	0.33
73	0.32
74	0.28
75	0.28
76	0.21
77	0.18
78	0.19
79	0.17
80	0.15
81	0.15
82	0.14
83	0.14
84	0.22
85	0.21
86	0.2
87	0.25
88	0.28
89	0.32
90	0.37
91	0.43
92	0.39
93	0.45
94	0.47
95	0.49
96	0.54
97	0.5
98	0.46
99	0.46
100	0.43
101	0.39
102	0.38
103	0.34
104	0.33
105	0.33
106	0.34
107	0.35
108	0.43
109	0.45
110	0.48
111	0.49
112	0.49
113	0.52
114	0.5
115	0.49
116	0.41
117	0.37
118	0.34
119	0.29
120	0.27
121	0.34
122	0.39
123	0.42
124	0.47
125	0.52
126	0.56
127	0.61
128	0.64
129	0.63
130	0.64
131	0.61
132	0.63
133	0.58
134	0.53
135	0.54
136	0.49
137	0.41
138	0.37
139	0.34
140	0.28
141	0.26
142	0.24
143	0.19
144	0.14
145	0.14
146	0.14
147	0.13
148	0.11
149	0.13
150	0.18
151	0.19
152	0.22
153	0.23
154	0.28
155	0.35
156	0.43
157	0.46
158	0.48
159	0.5
160	0.53
161	0.57
162	0.56
163	0.52
164	0.44
165	0.42
166	0.36
167	0.35
168	0.35
169	0.31
170	0.27
171	0.24
172	0.23
173	0.19
174	0.18
175	0.17
176	0.13
177	0.11
178	0.11
179	0.11
180	0.14
181	0.17
182	0.19
183	0.2
184	0.17
185	0.22
186	0.27
187	0.33
188	0.35
189	0.41
190	0.46
191	0.51
192	0.52
193	0.49
194	0.48
195	0.47
196	0.46
197	0.43
198	0.43
199	0.36
200	0.37
201	0.38
202	0.33
203	0.34
204	0.39
205	0.37
206	0.34
207	0.33
208	0.35
209	0.4
210	0.39
211	0.37
212	0.3
213	0.27
214	0.27
215	0.27
216	0.23
217	0.19
218	0.2
219	0.17
220	0.16
221	0.15
222	0.12
223	0.12
224	0.14
225	0.17
226	0.19
227	0.19
228	0.19
229	0.19
230	0.19
231	0.19
232	0.18
233	0.13
234	0.09
235	0.09
236	0.1
237	0.09
238	0.1
239	0.1
240	0.08
241	0.08
242	0.07
243	0.07
244	0.06
245	0.05
246	0.05
247	0.05
248	0.05
249	0.04
250	0.04
251	0.05
252	0.06
253	0.06
254	0.06
255	0.07
256	0.08
257	0.08
258	0.12
259	0.17
260	0.16
261	0.2
262	0.22
263	0.24
264	0.25
265	0.3
266	0.35
267	0.38
268	0.4
269	0.43
270	0.45
271	0.43
272	0.43
273	0.39
274	0.32
275	0.25
276	0.22
277	0.17
278	0.14
279	0.14
280	0.13
281	0.12
282	0.12
283	0.16
284	0.15
285	0.21
286	0.28
287	0.32
288	0.4
289	0.45
290	0.5
291	0.53
292	0.57
293	0.54
294	0.55
295	0.58
296	0.49
297	0.51
298	0.44
299	0.38
300	0.35
301	0.34
302	0.26
303	0.2
304	0.19
305	0.18
306	0.19
307	0.18
308	0.17
309	0.16
310	0.17
311	0.16
312	0.16
313	0.12
314	0.11
315	0.16
316	0.17
317	0.19
318	0.19
319	0.19
320	0.2
321	0.22
322	0.22
323	0.21
324	0.22
325	0.21
326	0.25
327	0.3
328	0.29
329	0.33
330	0.34
331	0.31
332	0.31
333	0.3
334	0.27
335	0.23
336	0.22
337	0.17
338	0.14
339	0.12
340	0.1
341	0.08
342	0.06
343	0.05
344	0.04
345	0.03
346	0.04
347	0.04
348	0.04
349	0.04
350	0.04
351	0.04
352	0.04
353	0.05
354	0.04
355	0.03
356	0.04
357	0.04
358	0.04
359	0.04
360	0.05
361	0.06
362	0.07
363	0.09
364	0.11
365	0.13
366	0.15
367	0.19
368	0.21
369	0.24
370	0.26
371	0.31
372	0.35
373	0.33
374	0.33
375	0.32
376	0.33
377	0.33
378	0.33
379	0.27
380	0.24
381	0.23
382	0.21
383	0.19
384	0.15
385	0.11
386	0.09
387	0.08
388	0.06
389	0.06
390	0.06
391	0.05
392	0.05
393	0.04
394	0.04
395	0.04
396	0.05
397	0.05
398	0.07
399	0.09
400	0.1
401	0.12
402	0.15
403	0.2
404	0.21
405	0.26
406	0.31
407	0.36
408	0.42
409	0.48
410	0.54
411	0.58
412	0.64
413	0.68
414	0.72
415	0.76
416	0.77
417	0.75
418	0.76
419	0.74
420	0.7
421	0.69
422	0.65
423	0.58
424	0.51
425	0.49
426	0.4
427	0.38
428	0.34
429	0.27
430	0.2
431	0.17
432	0.15
433	0.13
434	0.11
435	0.11
436	0.1
437	0.11
438	0.11
439	0.12
440	0.12
441	0.12
442	0.13
443	0.11
444	0.11
445	0.12
446	0.14
447	0.17
448	0.19
449	0.25
450	0.26
451	0.3
452	0.34
453	0.42
454	0.45
455	0.49
456	0.56
457	0.56
458	0.55
459	0.52
460	0.52
461	0.51
462	0.5
463	0.52
464	0.51
465	0.48
466	0.5
467	0.5
468	0.47
469	0.44
470	0.4
471	0.3
472	0.27
473	0.24
474	0.21
475	0.23
476	0.22
477	0.26
478	0.24
479	0.24
480	0.24
481	0.27
482	0.28
483	0.28
484	0.31
485	0.3
486	0.35
487	0.4
488	0.4
489	0.44
490	0.47
491	0.55
492	0.59
493	0.59
494	0.64
495	0.69
496	0.72
497	0.75
498	0.81
499	0.79
500	0.81
501	0.79
502	0.75
503	0.68
504	0.62
505	0.52
506	0.42
507	0.41
508	0.35
509	0.31
510	0.29
511	0.28
512	0.31
513	0.4
514	0.48
515	0.49
516	0.55
517	0.65
518	0.73
519	0.81
520	0.87
521	0.88
522	0.89
523	0.9
524	0.88
525	0.84
526	0.78
527	0.69
528	0.64
529	0.55
530	0.47
531	0.42
532	0.4
533	0.38
534	0.37
535	0.39
536	0.36
537	0.4
538	0.43
539	0.39
540	0.37
541	0.33
542	0.31
543	0.3
544	0.3
545	0.28
546	0.27
547	0.3
548	0.3
549	0.31
550	0.33
551	0.35
552	0.34
553	0.37
554	0.34
555	0.32
556	0.35
557	0.38
558	0.39
559	0.4
560	0.41
561	0.36
562	0.39
563	0.38
564	0.32
565	0.3
566	0.26
567	0.21
568	0.17
569	0.17
570	0.13
571	0.13
572	0.13
573	0.11
574	0.13
575	0.13
576	0.13
577	0.15
578	0.17
579	0.18
580	0.18
581	0.2
582	0.18
583	0.17
584	0.17
585	0.15
586	0.19
587	0.22
588	0.3
589	0.31
590	0.41
591	0.5
592	0.57
593	0.65
594	0.69
595	0.75
596	0.76
597	0.82
598	0.82
599	0.82
600	0.81
601	0.77
602	0.74
603	0.66
604	0.58
605	0.52
606	0.45
607	0.46
608	0.45
609	0.42
610	0.38
611	0.43
612	0.42
613	0.41
614	0.39
615	0.36
616	0.34
617	0.34
618	0.32
619	0.25
620	0.28
621	0.3
622	0.29
623	0.23
624	0.21
625	0.24
626	0.27
627	0.27
628	0.25
629	0.22
630	0.24
631	0.25
632	0.25
633	0.2
634	0.16
635	0.15
636	0.14
637	0.12
638	0.09
639	0.08
640	0.07
641	0.07
642	0.08
643	0.08
644	0.08
645	0.1
646	0.11
647	0.14
648	0.14
649	0.14
650	0.14
651	0.14
652	0.15
653	0.15
654	0.16
655	0.14
656	0.15
657	0.2
658	0.21
659	0.2
660	0.22
661	0.27
662	0.28
663	0.27
664	0.27
665	0.23
666	0.3
667	0.32
668	0.34
669	0.3
670	0.34
671	0.44
672	0.49
673	0.53
674	0.51
675	0.52
676	0.5
677	0.49
678	0.5
679	0.44
680	0.41
681	0.45
682	0.45

A0A420JBH7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer