Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A420IHT9

Protein Details
Accession A0A420IHT9    Localization Confidence High Confidence Score 16.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
32-62FRDRYDTRDRDRDRRHRSRSPRESRYSRSSWBasic
228-248LSAVRKEKKTEYRQYMNRVGGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
42-122DRDRRHRSRSPRESRYSRSSWRDERDERGSRNRERRHDEREERSGRARETDSGAEYRDKRGNSRSGRHSSSKRERETRKDA
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MEETRAYRADSKQKWGEPDRRSNTSYRERDVFRDRYDTRDRDRDRRHRSRSPRESRYSRSSWRDERDERGSRNRERRHDEREERSGRARETDSGAEYRDKRGNSRSGRHSSSKRERETRKDARSVSPEVEKLTKINRGRPDAIGVSDRIATPPVSFKVDLAQEFDHMDVDSVGRKANNDRTGITKASSTESQEDEILVEEDGLAAMKAMMGFADFGTTHQKKVPGNNLSAVRKEKKTEYRQYMNRVGGFNRPLSPSHPSR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.68
3 0.7
4 0.68
5 0.74
6 0.73
7 0.7
8 0.69
9 0.65
10 0.65
11 0.66
12 0.64
13 0.58
14 0.58
15 0.54
16 0.59
17 0.63
18 0.6
19 0.53
20 0.56
21 0.52
22 0.53
23 0.59
24 0.58
25 0.57
26 0.61
27 0.64
28 0.65
29 0.74
30 0.77
31 0.79
32 0.83
33 0.85
34 0.85
35 0.89
36 0.9
37 0.9
38 0.9
39 0.89
40 0.88
41 0.87
42 0.84
43 0.81
44 0.77
45 0.74
46 0.71
47 0.7
48 0.68
49 0.67
50 0.69
51 0.64
52 0.64
53 0.65
54 0.64
55 0.61
56 0.63
57 0.64
58 0.64
59 0.7
60 0.72
61 0.71
62 0.72
63 0.75
64 0.73
65 0.76
66 0.75
67 0.73
68 0.75
69 0.7
70 0.64
71 0.64
72 0.59
73 0.49
74 0.44
75 0.38
76 0.3
77 0.3
78 0.29
79 0.24
80 0.21
81 0.22
82 0.23
83 0.23
84 0.25
85 0.26
86 0.25
87 0.26
88 0.3
89 0.37
90 0.38
91 0.45
92 0.49
93 0.51
94 0.55
95 0.59
96 0.59
97 0.6
98 0.65
99 0.66
100 0.64
101 0.67
102 0.68
103 0.7
104 0.74
105 0.74
106 0.69
107 0.66
108 0.62
109 0.58
110 0.57
111 0.5
112 0.42
113 0.35
114 0.3
115 0.26
116 0.25
117 0.2
118 0.17
119 0.17
120 0.21
121 0.21
122 0.26
123 0.3
124 0.34
125 0.35
126 0.35
127 0.35
128 0.29
129 0.29
130 0.24
131 0.19
132 0.15
133 0.13
134 0.13
135 0.1
136 0.1
137 0.09
138 0.08
139 0.1
140 0.11
141 0.13
142 0.13
143 0.13
144 0.15
145 0.18
146 0.18
147 0.18
148 0.16
149 0.14
150 0.15
151 0.15
152 0.12
153 0.09
154 0.09
155 0.06
156 0.06
157 0.07
158 0.07
159 0.08
160 0.08
161 0.09
162 0.14
163 0.22
164 0.26
165 0.26
166 0.27
167 0.3
168 0.34
169 0.34
170 0.3
171 0.23
172 0.2
173 0.22
174 0.23
175 0.21
176 0.2
177 0.21
178 0.21
179 0.2
180 0.19
181 0.15
182 0.14
183 0.12
184 0.09
185 0.07
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.04
191 0.03
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.04
199 0.04
200 0.06
201 0.06
202 0.07
203 0.17
204 0.18
205 0.19
206 0.22
207 0.27
208 0.29
209 0.37
210 0.46
211 0.42
212 0.44
213 0.49
214 0.54
215 0.53
216 0.56
217 0.56
218 0.53
219 0.51
220 0.53
221 0.55
222 0.58
223 0.64
224 0.69
225 0.71
226 0.75
227 0.79
228 0.82
229 0.81
230 0.77
231 0.71
232 0.64
233 0.56
234 0.53
235 0.5
236 0.44
237 0.4
238 0.36
239 0.33
240 0.34