Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A420HCH3

Protein Details
Accession A0A420HCH3    Localization Confidence High Confidence Score 22.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
187-211AEVVPEKKERKKRNHDPNAPKRPLTBasic
348-374EPVPVPKTPRSKPNRKQKVKSIPSEASHydrophilic
389-439QTASAEKEKSPEKKRKRQKKKEDISVKDDSSVEAPRLVSKSRKKKSKSEQNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
193-206KKERKKRNHDPNAP
357-364RSKPNRKQ
395-410KEKSPEKKRKRQKKKE
426-435VSKSRKKKSK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, mito_nucl 13, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MARPKKPEEKRGATLQIDVDSFMRTRDSAVAQLASKEFESSNKLISLQFFSTFRAHFLRVFKTNIVDAIFNPIHDLYTSLSRRRSRRVCTETSRSVTSRDAQIHENLPTHVVTGLHTLQDDIVTGLQTLQDAIKTLFTAYIKHINAVLGEHGASLDVDAALAKLGEIPLLNIGDNLGSATSQGKTPAEVVPEKKERKKRNHDPNAPKRPLTPFFLYMQTARPIIAKDLGADVPKGAVGVEGTRRWQTMNEEDKQLWTDAYKENLRLYHARIHSYKSGNLNAKDMDEAEAARYAAENNITVLVLDPPVDAPLAGESSTAAFIDEDVETEQVPEIGPEPEPEPEPESEQEPVPVPKTPRSKPNRKQKVKSIPSEASLDSEAIIPSSSIIPQTASAEKEKSPEKKRKRQKKKEDISVKDDSSVEAPRLVSKSRKKKSKSEQN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.56
3 0.49
4 0.4
5 0.35
6 0.27
7 0.21
8 0.19
9 0.16
10 0.15
11 0.12
12 0.14
13 0.17
14 0.19
15 0.2
16 0.23
17 0.25
18 0.24
19 0.27
20 0.25
21 0.23
22 0.21
23 0.19
24 0.17
25 0.17
26 0.23
27 0.21
28 0.23
29 0.23
30 0.24
31 0.24
32 0.26
33 0.28
34 0.23
35 0.25
36 0.23
37 0.25
38 0.27
39 0.26
40 0.27
41 0.26
42 0.26
43 0.27
44 0.32
45 0.35
46 0.36
47 0.39
48 0.37
49 0.36
50 0.35
51 0.33
52 0.29
53 0.23
54 0.19
55 0.24
56 0.23
57 0.19
58 0.2
59 0.18
60 0.17
61 0.16
62 0.17
63 0.1
64 0.19
65 0.24
66 0.26
67 0.34
68 0.41
69 0.46
70 0.55
71 0.62
72 0.61
73 0.68
74 0.71
75 0.72
76 0.74
77 0.77
78 0.75
79 0.71
80 0.68
81 0.58
82 0.52
83 0.47
84 0.42
85 0.39
86 0.35
87 0.33
88 0.31
89 0.33
90 0.34
91 0.33
92 0.31
93 0.25
94 0.23
95 0.2
96 0.18
97 0.15
98 0.13
99 0.1
100 0.13
101 0.14
102 0.13
103 0.13
104 0.12
105 0.11
106 0.11
107 0.1
108 0.07
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.06
117 0.05
118 0.06
119 0.07
120 0.07
121 0.07
122 0.08
123 0.1
124 0.1
125 0.11
126 0.13
127 0.21
128 0.21
129 0.21
130 0.22
131 0.19
132 0.19
133 0.18
134 0.16
135 0.08
136 0.08
137 0.07
138 0.06
139 0.06
140 0.05
141 0.05
142 0.04
143 0.03
144 0.03
145 0.03
146 0.03
147 0.03
148 0.03
149 0.03
150 0.03
151 0.03
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.03
164 0.03
165 0.03
166 0.05
167 0.05
168 0.06
169 0.07
170 0.07
171 0.08
172 0.1
173 0.11
174 0.13
175 0.16
176 0.18
177 0.23
178 0.32
179 0.37
180 0.43
181 0.51
182 0.57
183 0.64
184 0.73
185 0.77
186 0.8
187 0.85
188 0.88
189 0.91
190 0.92
191 0.93
192 0.84
193 0.74
194 0.66
195 0.6
196 0.53
197 0.47
198 0.39
199 0.3
200 0.29
201 0.31
202 0.29
203 0.24
204 0.23
205 0.19
206 0.16
207 0.14
208 0.12
209 0.11
210 0.11
211 0.12
212 0.09
213 0.08
214 0.1
215 0.11
216 0.1
217 0.1
218 0.09
219 0.07
220 0.07
221 0.06
222 0.04
223 0.04
224 0.03
225 0.05
226 0.07
227 0.08
228 0.1
229 0.11
230 0.11
231 0.12
232 0.13
233 0.16
234 0.22
235 0.28
236 0.29
237 0.31
238 0.31
239 0.31
240 0.31
241 0.27
242 0.18
243 0.12
244 0.12
245 0.12
246 0.16
247 0.17
248 0.17
249 0.19
250 0.2
251 0.23
252 0.22
253 0.23
254 0.26
255 0.26
256 0.3
257 0.29
258 0.32
259 0.35
260 0.35
261 0.37
262 0.33
263 0.38
264 0.4
265 0.39
266 0.38
267 0.32
268 0.3
269 0.27
270 0.23
271 0.18
272 0.12
273 0.11
274 0.1
275 0.1
276 0.09
277 0.09
278 0.08
279 0.07
280 0.07
281 0.08
282 0.07
283 0.07
284 0.07
285 0.07
286 0.07
287 0.07
288 0.07
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.06
295 0.05
296 0.05
297 0.06
298 0.06
299 0.06
300 0.06
301 0.06
302 0.06
303 0.07
304 0.07
305 0.06
306 0.05
307 0.05
308 0.07
309 0.06
310 0.07
311 0.07
312 0.08
313 0.07
314 0.08
315 0.08
316 0.06
317 0.06
318 0.06
319 0.06
320 0.07
321 0.08
322 0.09
323 0.1
324 0.11
325 0.13
326 0.15
327 0.16
328 0.16
329 0.2
330 0.2
331 0.2
332 0.2
333 0.19
334 0.19
335 0.19
336 0.21
337 0.19
338 0.22
339 0.23
340 0.3
341 0.38
342 0.41
343 0.49
344 0.57
345 0.66
346 0.71
347 0.8
348 0.83
349 0.85
350 0.89
351 0.89
352 0.91
353 0.89
354 0.87
355 0.84
356 0.77
357 0.69
358 0.64
359 0.54
360 0.45
361 0.37
362 0.28
363 0.2
364 0.18
365 0.15
366 0.11
367 0.11
368 0.07
369 0.07
370 0.08
371 0.09
372 0.08
373 0.09
374 0.09
375 0.1
376 0.14
377 0.17
378 0.18
379 0.21
380 0.24
381 0.24
382 0.29
383 0.36
384 0.42
385 0.49
386 0.57
387 0.64
388 0.72
389 0.83
390 0.89
391 0.92
392 0.94
393 0.95
394 0.96
395 0.96
396 0.96
397 0.96
398 0.92
399 0.88
400 0.85
401 0.75
402 0.67
403 0.56
404 0.47
405 0.39
406 0.34
407 0.28
408 0.22
409 0.21
410 0.23
411 0.26
412 0.29
413 0.36
414 0.43
415 0.53
416 0.61
417 0.71
418 0.72
419 0.8