Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A420HME5

Protein Details
Accession A0A420HME5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
29-49FLPKCPSKVLFPKKKLPIPGTHydrophilic
586-606GAQMRDEQRRRRSQYDRGTSLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 6.5, cyto_mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007201  Mei2-like_Rrm_C  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04059  RRM_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSQYSSTSKEDDSDPFISHTSLSATAMPFLPKCPSKVLFPKKKLPIPGTAQHLEQIIEANEGVEDFGFFTTNTSQSRNIKVTCGNGCDAAPIIEKALMKVRPFYKGTHRVIKVFPDAWIRCSNIRDAISTYDTICEACPEVSSRYVSLGEWIEVSSPGAKVNRSEHEGQVVVRFNYPHRIDCKQIERTVRILLEEDGHKLYASQKMPATAAGIFHLIAEYEDCLSTKAAIRRLDRRVIAGCAIIHIYLHEPDLVYDRVSDQNCMTPVRHQGLGVSSNVEDMVSNLSMGRFPYAQHDSSLTPSFASPMSPMTVNSGYMFASGNLPVISPSSTNSDSDSRGMSNSLRRMSNLGSIMTPHGPLSSSNGNFSNLNQFTPFTPQSNESNLIKRYKLESSVNRYNSGQRRSSPKTPHYISAKNRQNNGTHNMVDINRIREGVDVRTTIMLRNIPNKIDQSTLKSILDETSHGKYDFAYLRIDFSNDCNVGYAFVNFLDPLHIIEFINARANQKWYRFRSQKVAEVSYATIQGRDCLIQKFRNSCVMLELPIFRPKESRVGQEEPFPASDNPSKLRRSCENAEHVGLFAPNAGAQMRDEQRRRRSQYDRGTSLAQRDAFEVYMTDPWGLDVLENKYDCSSF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.27
3 0.28
4 0.25
5 0.22
6 0.2
7 0.17
8 0.15
9 0.15
10 0.16
11 0.16
12 0.18
13 0.19
14 0.21
15 0.19
16 0.2
17 0.26
18 0.26
19 0.28
20 0.33
21 0.34
22 0.4
23 0.5
24 0.59
25 0.63
26 0.68
27 0.75
28 0.77
29 0.81
30 0.81
31 0.74
32 0.72
33 0.69
34 0.68
35 0.66
36 0.58
37 0.53
38 0.46
39 0.43
40 0.34
41 0.27
42 0.23
43 0.16
44 0.14
45 0.13
46 0.11
47 0.1
48 0.09
49 0.09
50 0.06
51 0.06
52 0.05
53 0.06
54 0.06
55 0.06
56 0.09
57 0.11
58 0.15
59 0.17
60 0.2
61 0.26
62 0.3
63 0.37
64 0.41
65 0.4
66 0.4
67 0.42
68 0.45
69 0.44
70 0.43
71 0.37
72 0.32
73 0.31
74 0.28
75 0.24
76 0.19
77 0.16
78 0.13
79 0.13
80 0.14
81 0.14
82 0.15
83 0.21
84 0.23
85 0.22
86 0.29
87 0.31
88 0.34
89 0.36
90 0.39
91 0.43
92 0.49
93 0.55
94 0.58
95 0.59
96 0.56
97 0.57
98 0.58
99 0.54
100 0.44
101 0.41
102 0.4
103 0.38
104 0.38
105 0.39
106 0.36
107 0.34
108 0.35
109 0.34
110 0.31
111 0.31
112 0.28
113 0.27
114 0.28
115 0.27
116 0.26
117 0.23
118 0.18
119 0.17
120 0.16
121 0.14
122 0.11
123 0.1
124 0.09
125 0.1
126 0.11
127 0.13
128 0.15
129 0.17
130 0.16
131 0.16
132 0.17
133 0.16
134 0.17
135 0.16
136 0.14
137 0.13
138 0.12
139 0.11
140 0.11
141 0.11
142 0.09
143 0.08
144 0.11
145 0.12
146 0.13
147 0.15
148 0.2
149 0.24
150 0.27
151 0.3
152 0.28
153 0.3
154 0.31
155 0.28
156 0.28
157 0.27
158 0.23
159 0.22
160 0.22
161 0.2
162 0.28
163 0.29
164 0.29
165 0.3
166 0.32
167 0.35
168 0.41
169 0.48
170 0.45
171 0.49
172 0.5
173 0.48
174 0.47
175 0.46
176 0.39
177 0.32
178 0.27
179 0.22
180 0.2
181 0.18
182 0.18
183 0.15
184 0.15
185 0.14
186 0.13
187 0.15
188 0.18
189 0.18
190 0.2
191 0.2
192 0.21
193 0.22
194 0.21
195 0.2
196 0.14
197 0.13
198 0.11
199 0.1
200 0.09
201 0.08
202 0.08
203 0.06
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.06
210 0.06
211 0.07
212 0.08
213 0.12
214 0.15
215 0.2
216 0.26
217 0.3
218 0.37
219 0.42
220 0.47
221 0.43
222 0.42
223 0.38
224 0.34
225 0.31
226 0.25
227 0.2
228 0.15
229 0.14
230 0.11
231 0.08
232 0.07
233 0.07
234 0.06
235 0.07
236 0.06
237 0.06
238 0.07
239 0.1
240 0.1
241 0.09
242 0.09
243 0.1
244 0.15
245 0.16
246 0.16
247 0.14
248 0.16
249 0.18
250 0.19
251 0.18
252 0.16
253 0.2
254 0.22
255 0.22
256 0.19
257 0.18
258 0.19
259 0.2
260 0.17
261 0.14
262 0.11
263 0.1
264 0.1
265 0.09
266 0.06
267 0.05
268 0.07
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.06
273 0.06
274 0.07
275 0.07
276 0.06
277 0.06
278 0.12
279 0.15
280 0.16
281 0.16
282 0.18
283 0.17
284 0.2
285 0.21
286 0.15
287 0.12
288 0.12
289 0.12
290 0.1
291 0.1
292 0.07
293 0.07
294 0.08
295 0.07
296 0.08
297 0.1
298 0.11
299 0.11
300 0.1
301 0.1
302 0.09
303 0.09
304 0.09
305 0.06
306 0.06
307 0.06
308 0.06
309 0.06
310 0.06
311 0.05
312 0.06
313 0.06
314 0.05
315 0.06
316 0.1
317 0.11
318 0.11
319 0.14
320 0.15
321 0.16
322 0.16
323 0.16
324 0.12
325 0.12
326 0.13
327 0.12
328 0.15
329 0.18
330 0.2
331 0.2
332 0.2
333 0.21
334 0.21
335 0.24
336 0.2
337 0.17
338 0.14
339 0.14
340 0.15
341 0.14
342 0.13
343 0.09
344 0.08
345 0.08
346 0.08
347 0.11
348 0.16
349 0.16
350 0.17
351 0.18
352 0.2
353 0.19
354 0.2
355 0.25
356 0.19
357 0.19
358 0.18
359 0.18
360 0.17
361 0.23
362 0.23
363 0.16
364 0.17
365 0.19
366 0.22
367 0.24
368 0.28
369 0.24
370 0.28
371 0.3
372 0.31
373 0.29
374 0.28
375 0.27
376 0.26
377 0.28
378 0.3
379 0.34
380 0.4
381 0.48
382 0.48
383 0.47
384 0.46
385 0.5
386 0.5
387 0.48
388 0.43
389 0.38
390 0.45
391 0.5
392 0.57
393 0.58
394 0.56
395 0.59
396 0.58
397 0.61
398 0.59
399 0.6
400 0.58
401 0.6
402 0.64
403 0.6
404 0.62
405 0.59
406 0.56
407 0.53
408 0.52
409 0.46
410 0.38
411 0.33
412 0.31
413 0.28
414 0.29
415 0.27
416 0.24
417 0.2
418 0.2
419 0.19
420 0.18
421 0.2
422 0.18
423 0.18
424 0.16
425 0.16
426 0.18
427 0.18
428 0.17
429 0.18
430 0.18
431 0.17
432 0.23
433 0.25
434 0.24
435 0.27
436 0.28
437 0.27
438 0.27
439 0.27
440 0.27
441 0.3
442 0.32
443 0.29
444 0.27
445 0.27
446 0.24
447 0.23
448 0.18
449 0.17
450 0.17
451 0.19
452 0.19
453 0.18
454 0.17
455 0.22
456 0.23
457 0.2
458 0.2
459 0.18
460 0.2
461 0.21
462 0.22
463 0.17
464 0.16
465 0.22
466 0.19
467 0.19
468 0.18
469 0.17
470 0.18
471 0.18
472 0.15
473 0.09
474 0.09
475 0.09
476 0.08
477 0.08
478 0.08
479 0.07
480 0.08
481 0.09
482 0.09
483 0.09
484 0.11
485 0.12
486 0.11
487 0.18
488 0.18
489 0.19
490 0.21
491 0.26
492 0.3
493 0.37
494 0.46
495 0.46
496 0.56
497 0.6
498 0.63
499 0.68
500 0.68
501 0.67
502 0.64
503 0.61
504 0.51
505 0.47
506 0.43
507 0.35
508 0.33
509 0.25
510 0.2
511 0.17
512 0.17
513 0.16
514 0.16
515 0.17
516 0.19
517 0.25
518 0.29
519 0.36
520 0.39
521 0.41
522 0.47
523 0.46
524 0.41
525 0.4
526 0.36
527 0.32
528 0.3
529 0.3
530 0.25
531 0.3
532 0.3
533 0.25
534 0.27
535 0.27
536 0.34
537 0.35
538 0.39
539 0.4
540 0.45
541 0.46
542 0.5
543 0.5
544 0.43
545 0.41
546 0.36
547 0.29
548 0.3
549 0.34
550 0.31
551 0.33
552 0.37
553 0.42
554 0.42
555 0.49
556 0.51
557 0.53
558 0.56
559 0.6
560 0.61
561 0.59
562 0.59
563 0.53
564 0.46
565 0.39
566 0.31
567 0.23
568 0.16
569 0.11
570 0.08
571 0.09
572 0.08
573 0.08
574 0.09
575 0.17
576 0.23
577 0.32
578 0.4
579 0.48
580 0.58
581 0.68
582 0.75
583 0.76
584 0.78
585 0.79
586 0.83
587 0.84
588 0.78
589 0.72
590 0.7
591 0.64
592 0.61
593 0.57
594 0.48
595 0.39
596 0.35
597 0.33
598 0.28
599 0.25
600 0.2
601 0.15
602 0.16
603 0.16
604 0.15
605 0.12
606 0.12
607 0.13
608 0.12
609 0.11
610 0.13
611 0.17
612 0.23
613 0.23
614 0.24