Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A420IWB1

Protein Details
Accession A0A420IWB1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-50ASQPHISHSKKDRKRSVIRDSFSAHydrophilic
240-259ISYSDPYKRKRKTHDRDESPBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013907  Sds3  
Gene Ontology GO:0005654  C:nucleoplasm  
Pfam View protein in Pfam  
PF08598  Sds3  
Amino Acid Sequences MTRSHSPQLTPVMSSRGFNSHQSNSSASQPHISHSKKDRKRSVIRDSFSAMEEGFSANKDSYYRIHLQKLQIDMNLIASADPLVSGVLPNDPAEIERLVRNSTQANKVTQLGADFPVGAGRVYAEFAKDCNDAMEERDTALAILHRNVAVRMTDIQSTYNYYKTLALNEHKALRTTLRDRLINSITNKKIRLTKEKEIDVTESTALLLHPSQFGISNPSSPGGIHSKRATRNRRDVDETISYSDPYKRKRKTHDRDESPISTRQRYENGSGVPSWLAEKNNLIATQIESPLYSIEKLFTEKELAMTYNTAALAAYSYIVRHNEPESSPNDASSKNLDTDKTSRSSENSEAVDTVSSGSGGVSMERQPSHATRNTRVTYNSGFGIDAFDDVTSPSNFEILTRQIPKLPNIMSQSGLRNPTGKPETAPPAAGLSSEDINIEMELIRRARQLNEQRGLGRNLQIDEQALRLLSEAAFPKDGRGRERWVISENKENLHFTHKPGKIKERDIIDGGEVMSKKGSQA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.32
3 0.3
4 0.31
5 0.34
6 0.38
7 0.38
8 0.41
9 0.43
10 0.44
11 0.4
12 0.44
13 0.43
14 0.37
15 0.38
16 0.34
17 0.35
18 0.41
19 0.42
20 0.43
21 0.5
22 0.6
23 0.62
24 0.72
25 0.78
26 0.78
27 0.86
28 0.87
29 0.88
30 0.87
31 0.82
32 0.76
33 0.7
34 0.61
35 0.52
36 0.43
37 0.32
38 0.22
39 0.19
40 0.16
41 0.12
42 0.11
43 0.12
44 0.11
45 0.12
46 0.13
47 0.14
48 0.16
49 0.22
50 0.29
51 0.32
52 0.39
53 0.43
54 0.48
55 0.51
56 0.54
57 0.5
58 0.43
59 0.4
60 0.33
61 0.29
62 0.23
63 0.18
64 0.13
65 0.1
66 0.09
67 0.07
68 0.06
69 0.05
70 0.04
71 0.04
72 0.05
73 0.05
74 0.06
75 0.07
76 0.08
77 0.08
78 0.08
79 0.09
80 0.11
81 0.11
82 0.11
83 0.13
84 0.15
85 0.17
86 0.17
87 0.19
88 0.22
89 0.27
90 0.33
91 0.33
92 0.34
93 0.34
94 0.36
95 0.34
96 0.3
97 0.25
98 0.19
99 0.17
100 0.15
101 0.12
102 0.11
103 0.11
104 0.1
105 0.09
106 0.07
107 0.06
108 0.06
109 0.07
110 0.08
111 0.08
112 0.08
113 0.09
114 0.12
115 0.12
116 0.11
117 0.11
118 0.12
119 0.11
120 0.14
121 0.16
122 0.13
123 0.13
124 0.13
125 0.12
126 0.11
127 0.11
128 0.11
129 0.09
130 0.1
131 0.11
132 0.11
133 0.12
134 0.12
135 0.12
136 0.11
137 0.11
138 0.13
139 0.13
140 0.14
141 0.14
142 0.15
143 0.15
144 0.19
145 0.19
146 0.18
147 0.17
148 0.16
149 0.19
150 0.19
151 0.21
152 0.22
153 0.24
154 0.27
155 0.29
156 0.33
157 0.31
158 0.31
159 0.29
160 0.26
161 0.29
162 0.29
163 0.33
164 0.33
165 0.34
166 0.34
167 0.39
168 0.39
169 0.38
170 0.38
171 0.4
172 0.4
173 0.42
174 0.42
175 0.39
176 0.43
177 0.43
178 0.5
179 0.49
180 0.53
181 0.55
182 0.58
183 0.56
184 0.52
185 0.48
186 0.39
187 0.32
188 0.24
189 0.17
190 0.13
191 0.11
192 0.09
193 0.08
194 0.07
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.07
201 0.11
202 0.12
203 0.12
204 0.12
205 0.13
206 0.13
207 0.12
208 0.14
209 0.17
210 0.17
211 0.2
212 0.23
213 0.29
214 0.36
215 0.45
216 0.52
217 0.53
218 0.62
219 0.64
220 0.65
221 0.65
222 0.6
223 0.56
224 0.51
225 0.44
226 0.36
227 0.31
228 0.26
229 0.22
230 0.26
231 0.25
232 0.28
233 0.36
234 0.4
235 0.47
236 0.57
237 0.67
238 0.72
239 0.79
240 0.82
241 0.8
242 0.78
243 0.77
244 0.7
245 0.62
246 0.58
247 0.49
248 0.4
249 0.35
250 0.31
251 0.29
252 0.28
253 0.27
254 0.25
255 0.23
256 0.22
257 0.21
258 0.19
259 0.16
260 0.13
261 0.12
262 0.1
263 0.1
264 0.09
265 0.1
266 0.11
267 0.12
268 0.12
269 0.11
270 0.09
271 0.1
272 0.11
273 0.11
274 0.1
275 0.08
276 0.09
277 0.09
278 0.09
279 0.08
280 0.06
281 0.06
282 0.07
283 0.09
284 0.09
285 0.1
286 0.11
287 0.11
288 0.12
289 0.11
290 0.11
291 0.1
292 0.1
293 0.09
294 0.09
295 0.08
296 0.07
297 0.06
298 0.05
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.04
303 0.04
304 0.06
305 0.08
306 0.08
307 0.1
308 0.11
309 0.13
310 0.14
311 0.17
312 0.18
313 0.23
314 0.23
315 0.23
316 0.23
317 0.21
318 0.22
319 0.21
320 0.21
321 0.17
322 0.18
323 0.18
324 0.2
325 0.24
326 0.26
327 0.26
328 0.26
329 0.25
330 0.25
331 0.29
332 0.28
333 0.29
334 0.26
335 0.24
336 0.22
337 0.21
338 0.19
339 0.14
340 0.12
341 0.07
342 0.06
343 0.05
344 0.05
345 0.05
346 0.05
347 0.05
348 0.06
349 0.08
350 0.11
351 0.11
352 0.12
353 0.15
354 0.17
355 0.23
356 0.27
357 0.31
358 0.34
359 0.42
360 0.44
361 0.44
362 0.43
363 0.42
364 0.38
365 0.35
366 0.31
367 0.23
368 0.2
369 0.17
370 0.17
371 0.13
372 0.1
373 0.08
374 0.07
375 0.06
376 0.07
377 0.09
378 0.08
379 0.08
380 0.08
381 0.08
382 0.08
383 0.09
384 0.12
385 0.13
386 0.2
387 0.22
388 0.23
389 0.28
390 0.31
391 0.32
392 0.35
393 0.33
394 0.32
395 0.34
396 0.34
397 0.31
398 0.32
399 0.34
400 0.33
401 0.34
402 0.29
403 0.27
404 0.26
405 0.33
406 0.34
407 0.3
408 0.27
409 0.31
410 0.36
411 0.36
412 0.36
413 0.28
414 0.26
415 0.25
416 0.23
417 0.18
418 0.13
419 0.12
420 0.12
421 0.11
422 0.09
423 0.1
424 0.09
425 0.09
426 0.07
427 0.08
428 0.11
429 0.12
430 0.13
431 0.16
432 0.18
433 0.21
434 0.3
435 0.39
436 0.46
437 0.5
438 0.53
439 0.53
440 0.57
441 0.58
442 0.51
443 0.46
444 0.4
445 0.35
446 0.33
447 0.3
448 0.27
449 0.24
450 0.21
451 0.17
452 0.14
453 0.12
454 0.11
455 0.11
456 0.09
457 0.13
458 0.15
459 0.17
460 0.19
461 0.19
462 0.24
463 0.29
464 0.33
465 0.34
466 0.36
467 0.4
468 0.45
469 0.49
470 0.48
471 0.47
472 0.52
473 0.51
474 0.56
475 0.52
476 0.49
477 0.48
478 0.47
479 0.42
480 0.43
481 0.41
482 0.37
483 0.44
484 0.45
485 0.5
486 0.57
487 0.65
488 0.65
489 0.7
490 0.7
491 0.66
492 0.65
493 0.59
494 0.53
495 0.44
496 0.37
497 0.31
498 0.3
499 0.24
500 0.2
501 0.18