Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A420IFJ9

Protein Details
Accession A0A420IFJ9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
292-313AEEKRKRREYRTTRKQLFRRLDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
295-300KRKRRE
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028942  WHIM1_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF15612  WHIM1  
Amino Acid Sequences MSSDDSSELSSAPSDTENDIQVVKKNGLLKFFTKADSKSTSIEQEPLHSVPKRDPSPAHDYILADNPDIAFIVMFRSRFTEAFPKSLANFGPQEFEQDIIQDVPGEGAESFMCALLSLLLNRKQDVKPGHYSRALEEAIQSHKSQWAKDWENKTPLSKGATFSSMVPEQRLTLLRTLILWALSSSDVIKGIIQSSYKQQRQEDDLNQPLSVQPWGSDSERRRYFLIEGLHDTQFRVYRESSCAYLKRTWWSVASNIDELKALAEKLQTQDGSQKARLLSGKILAAIPRFEAAEEKRKRREYRTTRKQLFRRLDPEFSIYEGRTRGKRVKYTLSDEEEDEKTDLHSSRRSTRNSGTGTTTEINQPTITQSGRHVKLRQGGTYGESVLRKIYTSSVKNQLENTEIETEPYNKQTTSATISGRNGNSLKPVKTTGLEKTNDSSDSASEEEDASEQDYHVDEETCPESDFDVTGNFSGEDEDDQDNDHKRPMIKLPVSPPSPERKAATVNGITPEIETTKANLASGLRDDDLAGSGPHITKEINTSLCSSSTVADYRNSKKIQIVQSDQNSV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.15
3 0.17
4 0.18
5 0.18
6 0.2
7 0.2
8 0.24
9 0.26
10 0.24
11 0.25
12 0.3
13 0.32
14 0.35
15 0.38
16 0.35
17 0.37
18 0.39
19 0.39
20 0.38
21 0.37
22 0.38
23 0.39
24 0.39
25 0.36
26 0.37
27 0.39
28 0.36
29 0.39
30 0.33
31 0.32
32 0.34
33 0.32
34 0.36
35 0.33
36 0.33
37 0.35
38 0.44
39 0.43
40 0.44
41 0.46
42 0.46
43 0.52
44 0.54
45 0.5
46 0.44
47 0.42
48 0.39
49 0.43
50 0.37
51 0.28
52 0.25
53 0.21
54 0.19
55 0.17
56 0.14
57 0.07
58 0.05
59 0.09
60 0.11
61 0.11
62 0.12
63 0.15
64 0.18
65 0.18
66 0.22
67 0.28
68 0.28
69 0.32
70 0.32
71 0.32
72 0.3
73 0.34
74 0.3
75 0.25
76 0.25
77 0.22
78 0.25
79 0.22
80 0.26
81 0.22
82 0.23
83 0.18
84 0.16
85 0.17
86 0.13
87 0.13
88 0.09
89 0.08
90 0.07
91 0.07
92 0.07
93 0.06
94 0.06
95 0.06
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.06
100 0.05
101 0.05
102 0.05
103 0.06
104 0.08
105 0.13
106 0.19
107 0.2
108 0.21
109 0.27
110 0.26
111 0.33
112 0.37
113 0.38
114 0.43
115 0.47
116 0.52
117 0.51
118 0.52
119 0.46
120 0.46
121 0.4
122 0.31
123 0.26
124 0.24
125 0.23
126 0.24
127 0.23
128 0.18
129 0.22
130 0.24
131 0.23
132 0.26
133 0.31
134 0.36
135 0.44
136 0.5
137 0.51
138 0.55
139 0.57
140 0.54
141 0.46
142 0.43
143 0.39
144 0.35
145 0.3
146 0.27
147 0.26
148 0.24
149 0.23
150 0.24
151 0.23
152 0.21
153 0.2
154 0.18
155 0.17
156 0.19
157 0.21
158 0.17
159 0.16
160 0.16
161 0.15
162 0.15
163 0.15
164 0.13
165 0.11
166 0.09
167 0.07
168 0.08
169 0.08
170 0.08
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.07
178 0.09
179 0.09
180 0.1
181 0.18
182 0.27
183 0.3
184 0.34
185 0.35
186 0.37
187 0.43
188 0.49
189 0.46
190 0.44
191 0.46
192 0.42
193 0.4
194 0.37
195 0.31
196 0.24
197 0.2
198 0.12
199 0.07
200 0.08
201 0.11
202 0.12
203 0.18
204 0.21
205 0.3
206 0.33
207 0.34
208 0.33
209 0.33
210 0.32
211 0.31
212 0.31
213 0.23
214 0.25
215 0.26
216 0.27
217 0.25
218 0.24
219 0.21
220 0.21
221 0.19
222 0.18
223 0.15
224 0.16
225 0.19
226 0.21
227 0.21
228 0.22
229 0.24
230 0.25
231 0.26
232 0.26
233 0.27
234 0.28
235 0.27
236 0.25
237 0.24
238 0.23
239 0.23
240 0.24
241 0.21
242 0.19
243 0.18
244 0.16
245 0.14
246 0.12
247 0.09
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.07
252 0.09
253 0.11
254 0.11
255 0.1
256 0.16
257 0.18
258 0.21
259 0.2
260 0.21
261 0.19
262 0.22
263 0.22
264 0.19
265 0.17
266 0.15
267 0.15
268 0.13
269 0.13
270 0.11
271 0.11
272 0.1
273 0.09
274 0.08
275 0.07
276 0.06
277 0.09
278 0.11
279 0.2
280 0.26
281 0.32
282 0.38
283 0.46
284 0.5
285 0.54
286 0.62
287 0.63
288 0.69
289 0.74
290 0.78
291 0.79
292 0.85
293 0.84
294 0.82
295 0.78
296 0.74
297 0.69
298 0.62
299 0.57
300 0.49
301 0.45
302 0.36
303 0.31
304 0.26
305 0.19
306 0.17
307 0.17
308 0.18
309 0.18
310 0.22
311 0.27
312 0.3
313 0.36
314 0.38
315 0.45
316 0.47
317 0.52
318 0.54
319 0.51
320 0.47
321 0.43
322 0.42
323 0.34
324 0.3
325 0.23
326 0.17
327 0.13
328 0.14
329 0.14
330 0.13
331 0.17
332 0.19
333 0.27
334 0.34
335 0.37
336 0.4
337 0.42
338 0.47
339 0.46
340 0.45
341 0.4
342 0.33
343 0.33
344 0.29
345 0.26
346 0.22
347 0.19
348 0.18
349 0.15
350 0.14
351 0.12
352 0.14
353 0.13
354 0.11
355 0.16
356 0.24
357 0.27
358 0.32
359 0.33
360 0.35
361 0.42
362 0.44
363 0.4
364 0.33
365 0.31
366 0.28
367 0.26
368 0.23
369 0.19
370 0.16
371 0.15
372 0.14
373 0.13
374 0.12
375 0.11
376 0.15
377 0.19
378 0.22
379 0.27
380 0.36
381 0.39
382 0.4
383 0.41
384 0.38
385 0.34
386 0.31
387 0.28
388 0.22
389 0.2
390 0.19
391 0.19
392 0.2
393 0.19
394 0.22
395 0.2
396 0.16
397 0.17
398 0.17
399 0.18
400 0.21
401 0.23
402 0.22
403 0.25
404 0.27
405 0.32
406 0.31
407 0.33
408 0.28
409 0.25
410 0.31
411 0.32
412 0.31
413 0.28
414 0.3
415 0.28
416 0.3
417 0.33
418 0.32
419 0.34
420 0.35
421 0.34
422 0.34
423 0.35
424 0.33
425 0.3
426 0.24
427 0.17
428 0.18
429 0.17
430 0.14
431 0.12
432 0.12
433 0.11
434 0.1
435 0.1
436 0.09
437 0.09
438 0.09
439 0.09
440 0.09
441 0.1
442 0.1
443 0.11
444 0.09
445 0.12
446 0.14
447 0.14
448 0.14
449 0.14
450 0.14
451 0.13
452 0.13
453 0.1
454 0.1
455 0.1
456 0.1
457 0.1
458 0.09
459 0.09
460 0.1
461 0.1
462 0.09
463 0.11
464 0.12
465 0.11
466 0.13
467 0.17
468 0.2
469 0.21
470 0.22
471 0.23
472 0.24
473 0.28
474 0.33
475 0.39
476 0.4
477 0.45
478 0.49
479 0.54
480 0.55
481 0.53
482 0.52
483 0.51
484 0.51
485 0.5
486 0.46
487 0.41
488 0.44
489 0.44
490 0.46
491 0.4
492 0.39
493 0.37
494 0.35
495 0.31
496 0.26
497 0.25
498 0.19
499 0.17
500 0.14
501 0.14
502 0.19
503 0.19
504 0.19
505 0.19
506 0.18
507 0.2
508 0.22
509 0.23
510 0.17
511 0.17
512 0.17
513 0.16
514 0.16
515 0.14
516 0.12
517 0.09
518 0.11
519 0.12
520 0.12
521 0.13
522 0.12
523 0.12
524 0.17
525 0.22
526 0.22
527 0.23
528 0.26
529 0.27
530 0.27
531 0.28
532 0.24
533 0.19
534 0.2
535 0.21
536 0.2
537 0.25
538 0.31
539 0.36
540 0.44
541 0.44
542 0.43
543 0.47
544 0.53
545 0.56
546 0.58
547 0.59
548 0.59