Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A420IRK1

Protein Details
Accession A0A420IRK1    Localization Confidence High Confidence Score 22.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
76-115RTLKASKRKRSDAIAKKPKTAKRERKKRLRRSNDEDPDGQBasic
167-189MDAALKQPSKRRRKKDEVDLEEAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
79-106KASKRKRSDAIAKKPKTAKRERKKRLRR
158-181RRRRALDKAMDAALKQPSKRRRKK
432-438KQGKKRA
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MTDSETGATSLNSKDHENDLEAPPLDLEHEKDLESGLSDNESELSEVDEAEFAEFDPTTVALDERPRVDIDEDVARTLKASKRKRSDAIAKKPKTAKRERKKRLRRSNDEDPDGQVIDEKRSRKLKSKNHGEFQDTERVKERRIASPEHEENLTPEERRRRALDKAMDAALKQPSKRRRKKDEVDLEEAFDDEIAALKLRMEQACEADNSARERSQPAIHKLKMLPEVVALLNRNTVQHSIVDPDTNFLQSVKFFLEPLNDGSLPAYNIQRDIFSALNKLPIEKEALLSSGIGKVVLYYTKSKKPELEIKRTAERLLGEWSRPILKRSDDYRKRQIMTKEFDHHAAQLALRPTGLNSSQISASQNTHLSQREIERERILAQPVRSNRARIERSNSSYTVAPKSTFDPTRGPDPSSRPIGAGGMEAFRKMTAKQGKKRA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.24
3 0.27
4 0.28
5 0.31
6 0.31
7 0.35
8 0.33
9 0.3
10 0.26
11 0.23
12 0.22
13 0.18
14 0.18
15 0.17
16 0.17
17 0.17
18 0.18
19 0.18
20 0.16
21 0.15
22 0.14
23 0.1
24 0.1
25 0.1
26 0.1
27 0.1
28 0.1
29 0.1
30 0.09
31 0.1
32 0.09
33 0.09
34 0.09
35 0.08
36 0.08
37 0.08
38 0.08
39 0.07
40 0.08
41 0.08
42 0.07
43 0.08
44 0.07
45 0.08
46 0.08
47 0.08
48 0.09
49 0.14
50 0.17
51 0.18
52 0.19
53 0.19
54 0.21
55 0.22
56 0.2
57 0.19
58 0.23
59 0.22
60 0.22
61 0.22
62 0.19
63 0.19
64 0.23
65 0.25
66 0.28
67 0.37
68 0.46
69 0.54
70 0.62
71 0.67
72 0.71
73 0.77
74 0.78
75 0.8
76 0.81
77 0.74
78 0.75
79 0.79
80 0.75
81 0.74
82 0.75
83 0.75
84 0.75
85 0.83
86 0.86
87 0.89
88 0.94
89 0.95
90 0.95
91 0.95
92 0.94
93 0.92
94 0.92
95 0.9
96 0.84
97 0.74
98 0.65
99 0.56
100 0.46
101 0.37
102 0.29
103 0.21
104 0.21
105 0.25
106 0.24
107 0.28
108 0.36
109 0.39
110 0.45
111 0.54
112 0.59
113 0.65
114 0.75
115 0.77
116 0.78
117 0.78
118 0.73
119 0.66
120 0.61
121 0.6
122 0.49
123 0.42
124 0.41
125 0.38
126 0.35
127 0.38
128 0.37
129 0.34
130 0.38
131 0.4
132 0.38
133 0.46
134 0.47
135 0.43
136 0.4
137 0.32
138 0.3
139 0.29
140 0.26
141 0.18
142 0.2
143 0.27
144 0.28
145 0.31
146 0.34
147 0.34
148 0.38
149 0.45
150 0.47
151 0.42
152 0.43
153 0.41
154 0.38
155 0.33
156 0.31
157 0.28
158 0.24
159 0.22
160 0.27
161 0.35
162 0.46
163 0.55
164 0.62
165 0.67
166 0.75
167 0.83
168 0.86
169 0.87
170 0.83
171 0.8
172 0.7
173 0.61
174 0.5
175 0.41
176 0.3
177 0.18
178 0.11
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.05
186 0.08
187 0.08
188 0.09
189 0.1
190 0.11
191 0.12
192 0.12
193 0.12
194 0.1
195 0.12
196 0.14
197 0.14
198 0.13
199 0.12
200 0.14
201 0.15
202 0.2
203 0.23
204 0.28
205 0.34
206 0.34
207 0.37
208 0.37
209 0.39
210 0.37
211 0.32
212 0.25
213 0.17
214 0.18
215 0.15
216 0.16
217 0.12
218 0.08
219 0.09
220 0.1
221 0.1
222 0.09
223 0.1
224 0.09
225 0.09
226 0.1
227 0.11
228 0.12
229 0.13
230 0.12
231 0.12
232 0.12
233 0.11
234 0.11
235 0.08
236 0.08
237 0.07
238 0.08
239 0.09
240 0.08
241 0.08
242 0.09
243 0.1
244 0.11
245 0.13
246 0.15
247 0.13
248 0.13
249 0.13
250 0.13
251 0.12
252 0.12
253 0.12
254 0.09
255 0.1
256 0.1
257 0.1
258 0.1
259 0.12
260 0.11
261 0.11
262 0.13
263 0.12
264 0.17
265 0.17
266 0.17
267 0.15
268 0.15
269 0.18
270 0.16
271 0.16
272 0.12
273 0.13
274 0.12
275 0.12
276 0.11
277 0.09
278 0.08
279 0.07
280 0.06
281 0.06
282 0.07
283 0.08
284 0.1
285 0.15
286 0.2
287 0.27
288 0.3
289 0.33
290 0.35
291 0.4
292 0.48
293 0.51
294 0.56
295 0.56
296 0.59
297 0.62
298 0.61
299 0.55
300 0.47
301 0.39
302 0.3
303 0.3
304 0.27
305 0.22
306 0.22
307 0.23
308 0.26
309 0.26
310 0.26
311 0.24
312 0.25
313 0.31
314 0.37
315 0.47
316 0.5
317 0.58
318 0.66
319 0.7
320 0.68
321 0.69
322 0.69
323 0.67
324 0.65
325 0.64
326 0.6
327 0.55
328 0.55
329 0.5
330 0.42
331 0.35
332 0.29
333 0.23
334 0.2
335 0.2
336 0.17
337 0.16
338 0.16
339 0.13
340 0.17
341 0.17
342 0.16
343 0.15
344 0.17
345 0.17
346 0.19
347 0.21
348 0.19
349 0.2
350 0.2
351 0.22
352 0.21
353 0.25
354 0.26
355 0.25
356 0.27
357 0.3
358 0.36
359 0.38
360 0.41
361 0.38
362 0.37
363 0.38
364 0.38
365 0.38
366 0.34
367 0.32
368 0.36
369 0.39
370 0.45
371 0.45
372 0.44
373 0.45
374 0.5
375 0.54
376 0.52
377 0.57
378 0.58
379 0.62
380 0.65
381 0.59
382 0.52
383 0.49
384 0.47
385 0.45
386 0.38
387 0.33
388 0.29
389 0.31
390 0.37
391 0.36
392 0.35
393 0.36
394 0.38
395 0.45
396 0.46
397 0.47
398 0.45
399 0.49
400 0.53
401 0.52
402 0.49
403 0.41
404 0.39
405 0.37
406 0.31
407 0.26
408 0.2
409 0.18
410 0.17
411 0.17
412 0.16
413 0.16
414 0.16
415 0.15
416 0.23
417 0.3
418 0.4