Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A420J1X9

Protein Details
Accession A0A420J1X9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
236-260QGSGGKVKRERERRQKQTIEIDPRFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
105-114RGRGGRGGPR
275-286GGRGGRGGRGGR
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 13.333, cyto_mito 5.165, cyto 5, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04774  HABP4_PAI-RBP1  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MSAVVSKNLFELLALGNTHDEDSDKEIEPPVKVVEKSIMRTSKRNAPAEAPASRAPASFDSKRGNRGFSGNEGAFRDNNAGSAKNRGKPTDGFEREKFSGSNEGRGRGGRGGPRNFDRHSRGGIRISEKQINNAWGSNEGGAELSDEQAGEALANAEKNASFSKGTEDPKTEPTQEPEPEDVSISYADYIIQQNEKKAALAAQAPQIRKPNEGNSQNSKWENAKPISKDEAEDFFQGSGGKVKRERERRQKQTIEIDPRFVETSDRGGRGGGIQGGRGGRGGRGGRGDGYQRGGNSGGRKNTAPSTPINTDDTSAFPSLGSS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.12
3 0.13
4 0.14
5 0.14
6 0.12
7 0.11
8 0.1
9 0.15
10 0.18
11 0.18
12 0.19
13 0.23
14 0.25
15 0.25
16 0.25
17 0.24
18 0.26
19 0.25
20 0.25
21 0.29
22 0.31
23 0.35
24 0.41
25 0.46
26 0.44
27 0.5
28 0.54
29 0.56
30 0.6
31 0.6
32 0.54
33 0.5
34 0.54
35 0.54
36 0.51
37 0.45
38 0.38
39 0.37
40 0.35
41 0.31
42 0.26
43 0.24
44 0.29
45 0.27
46 0.3
47 0.36
48 0.38
49 0.47
50 0.46
51 0.45
52 0.4
53 0.42
54 0.39
55 0.35
56 0.39
57 0.31
58 0.32
59 0.31
60 0.31
61 0.27
62 0.25
63 0.23
64 0.16
65 0.18
66 0.16
67 0.17
68 0.15
69 0.25
70 0.29
71 0.33
72 0.36
73 0.35
74 0.38
75 0.38
76 0.42
77 0.44
78 0.45
79 0.45
80 0.44
81 0.49
82 0.46
83 0.45
84 0.4
85 0.31
86 0.34
87 0.29
88 0.36
89 0.31
90 0.31
91 0.31
92 0.32
93 0.31
94 0.24
95 0.27
96 0.25
97 0.31
98 0.33
99 0.36
100 0.4
101 0.43
102 0.43
103 0.45
104 0.44
105 0.39
106 0.41
107 0.39
108 0.38
109 0.37
110 0.4
111 0.38
112 0.38
113 0.4
114 0.42
115 0.38
116 0.38
117 0.36
118 0.35
119 0.31
120 0.27
121 0.22
122 0.16
123 0.17
124 0.14
125 0.11
126 0.08
127 0.07
128 0.06
129 0.06
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.03
138 0.03
139 0.03
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.05
146 0.06
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.11
151 0.17
152 0.19
153 0.2
154 0.23
155 0.23
156 0.27
157 0.29
158 0.28
159 0.24
160 0.26
161 0.29
162 0.28
163 0.28
164 0.26
165 0.24
166 0.21
167 0.21
168 0.17
169 0.12
170 0.11
171 0.08
172 0.07
173 0.06
174 0.05
175 0.06
176 0.07
177 0.08
178 0.11
179 0.12
180 0.13
181 0.15
182 0.15
183 0.14
184 0.13
185 0.13
186 0.11
187 0.12
188 0.13
189 0.18
190 0.22
191 0.22
192 0.25
193 0.31
194 0.3
195 0.31
196 0.32
197 0.33
198 0.38
199 0.44
200 0.47
201 0.48
202 0.5
203 0.53
204 0.51
205 0.46
206 0.4
207 0.38
208 0.39
209 0.36
210 0.39
211 0.35
212 0.39
213 0.41
214 0.38
215 0.36
216 0.32
217 0.31
218 0.27
219 0.26
220 0.22
221 0.17
222 0.17
223 0.16
224 0.13
225 0.16
226 0.15
227 0.19
228 0.23
229 0.3
230 0.38
231 0.49
232 0.59
233 0.64
234 0.73
235 0.79
236 0.85
237 0.85
238 0.83
239 0.82
240 0.81
241 0.8
242 0.71
243 0.65
244 0.55
245 0.51
246 0.45
247 0.35
248 0.28
249 0.19
250 0.25
251 0.26
252 0.26
253 0.24
254 0.23
255 0.23
256 0.22
257 0.22
258 0.19
259 0.14
260 0.14
261 0.16
262 0.17
263 0.17
264 0.17
265 0.15
266 0.11
267 0.18
268 0.19
269 0.19
270 0.22
271 0.23
272 0.24
273 0.27
274 0.3
275 0.26
276 0.29
277 0.29
278 0.26
279 0.27
280 0.27
281 0.27
282 0.3
283 0.34
284 0.35
285 0.36
286 0.37
287 0.38
288 0.42
289 0.42
290 0.38
291 0.35
292 0.38
293 0.38
294 0.41
295 0.41
296 0.36
297 0.34
298 0.32
299 0.3
300 0.26
301 0.23
302 0.2