FuNGI

G8JVV0

Protein Details

Accession

G8JVV0

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
226-247	DEGGRFRRGNSKRKTRQLKLLD	Basic
492-511	KDSSPKKRSSRSPLAGPRIF	Hydrophilic
592-619	LIKELKAKVSKRPENKTRMKLYVKKLVK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
231-244	FRRGNSKRKTRQLK
602-603	KR

Subcellular Location(s)

nucl 24.5, cyto_nucl 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
KEGG	erc:Ecym_7113 -
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MNGVVKRENWSEYQEFPLRAADTRDLENVKVHLLKFQSKKQVEPNKDFHLPIRLHRKDTRNVQFQLTRAEIVQRQKEIAEYKKKLESERIDAPPVAAPGSASNDGSTTGGLAGGSAGGAAGGDAAGGSKGSPTGESVSPETVLGEGESQKEKENNLDSGEIKETQPEAGDSSKDGSKTAAPSTKLEEVGVAEDPSKVGLVKYDGKEQVDFEFHAGTTDPLADVAPDEGGRFRRGNSKRKTRQLKLLDEKARKLRFEEFYPWVMEDFDGLNTWVGSYEAGNSDSYVFLSAENDGSFTMIPADKVYRFTARNKYATLTIEEAEKRMEKNGAGAPRWLMKHLDNIGTTTTRYDRTRRRLRAVDGNDRQNEEDRQDNSEVELDYDEEFADDEEAPIIDGNEEENKESEQRIKKEMLMANAMGLRDDELVEDDNDLFGEKKIDEEGEKVKKALLKTDLGALYESDDDSNPYLSESDVEEDEEKKVKEEDGEEHNLSKDSSPKKRSSRSPLAGPRIFVKSIKNCVLVLGADKSVLTNFPEGEWNPTVKGRTSEPLDLADIQSSEIKKDDSTLLENDDLLTEQDIIDAVRGKEITLKQLIKELKAKVSKRPENKTRMKLYVKKLVKLNGTFLELAQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.42
2	0.39
3	0.37
4	0.39
5	0.33
6	0.32
7	0.34
8	0.31
9	0.28
10	0.31
11	0.35
12	0.33
13	0.32
14	0.33
15	0.3
16	0.29
17	0.3
18	0.27
19	0.27
20	0.3
21	0.37
22	0.41
23	0.48
24	0.54
25	0.53
26	0.59
27	0.64
28	0.7
29	0.7
30	0.72
31	0.71
32	0.68
33	0.7
34	0.65
35	0.58
36	0.56
37	0.49
38	0.5
39	0.54
40	0.51
41	0.54
42	0.6
43	0.65
44	0.65
45	0.73
46	0.75
47	0.73
48	0.7
49	0.71
50	0.67
51	0.61
52	0.59
53	0.51
54	0.42
55	0.33
56	0.36
57	0.34
58	0.38
59	0.42
60	0.37
61	0.36
62	0.35
63	0.39
64	0.4
65	0.44
66	0.47
67	0.45
68	0.48
69	0.53
70	0.56
71	0.55
72	0.57
73	0.54
74	0.5
75	0.55
76	0.54
77	0.51
78	0.48
79	0.45
80	0.39
81	0.33
82	0.26
83	0.17
84	0.13
85	0.12
86	0.17
87	0.17
88	0.15
89	0.14
90	0.14
91	0.15
92	0.15
93	0.13
94	0.08
95	0.07
96	0.06
97	0.06
98	0.05
99	0.05
100	0.04
101	0.04
102	0.03
103	0.03
104	0.02
105	0.02
106	0.02
107	0.02
108	0.02
109	0.02
110	0.02
111	0.02
112	0.03
113	0.03
114	0.03
115	0.03
116	0.04
117	0.05
118	0.06
119	0.07
120	0.11
121	0.13
122	0.15
123	0.17
124	0.18
125	0.18
126	0.18
127	0.16
128	0.12
129	0.11
130	0.09
131	0.09
132	0.09
133	0.11
134	0.14
135	0.14
136	0.17
137	0.19
138	0.19
139	0.23
140	0.26
141	0.25
142	0.25
143	0.27
144	0.25
145	0.25
146	0.27
147	0.23
148	0.19
149	0.19
150	0.17
151	0.15
152	0.15
153	0.13
154	0.12
155	0.12
156	0.13
157	0.11
158	0.14
159	0.15
160	0.15
161	0.15
162	0.14
163	0.15
164	0.17
165	0.22
166	0.24
167	0.24
168	0.25
169	0.3
170	0.32
171	0.3
172	0.27
173	0.22
174	0.17
175	0.17
176	0.17
177	0.12
178	0.09
179	0.09
180	0.09
181	0.08
182	0.08
183	0.06
184	0.05
185	0.06
186	0.1
187	0.17
188	0.18
189	0.24
190	0.27
191	0.28
192	0.29
193	0.28
194	0.26
195	0.22
196	0.2
197	0.15
198	0.13
199	0.12
200	0.12
201	0.11
202	0.09
203	0.07
204	0.07
205	0.06
206	0.05
207	0.05
208	0.05
209	0.05
210	0.05
211	0.05
212	0.05
213	0.05
214	0.07
215	0.09
216	0.12
217	0.12
218	0.13
219	0.23
220	0.31
221	0.41
222	0.48
223	0.58
224	0.64
225	0.74
226	0.83
227	0.78
228	0.81
229	0.79
230	0.8
231	0.77
232	0.77
233	0.76
234	0.7
235	0.69
236	0.68
237	0.63
238	0.53
239	0.47
240	0.44
241	0.39
242	0.39
243	0.4
244	0.34
245	0.33
246	0.33
247	0.31
248	0.24
249	0.21
250	0.17
251	0.12
252	0.09
253	0.07
254	0.06
255	0.06
256	0.06
257	0.06
258	0.06
259	0.05
260	0.04
261	0.04
262	0.04
263	0.05
264	0.06
265	0.07
266	0.07
267	0.07
268	0.07
269	0.07
270	0.07
271	0.07
272	0.06
273	0.05
274	0.06
275	0.06
276	0.06
277	0.06
278	0.06
279	0.05
280	0.06
281	0.05
282	0.05
283	0.06
284	0.05
285	0.06
286	0.06
287	0.08
288	0.08
289	0.1
290	0.12
291	0.15
292	0.17
293	0.23
294	0.31
295	0.34
296	0.36
297	0.35
298	0.34
299	0.33
300	0.32
301	0.28
302	0.21
303	0.16
304	0.17
305	0.16
306	0.15
307	0.14
308	0.14
309	0.12
310	0.12
311	0.12
312	0.09
313	0.12
314	0.16
315	0.18
316	0.18
317	0.18
318	0.18
319	0.2
320	0.21
321	0.19
322	0.17
323	0.14
324	0.19
325	0.21
326	0.22
327	0.19
328	0.19
329	0.2
330	0.18
331	0.17
332	0.14
333	0.13
334	0.14
335	0.16
336	0.23
337	0.3
338	0.4
339	0.5
340	0.55
341	0.61
342	0.63
343	0.65
344	0.67
345	0.66
346	0.66
347	0.62
348	0.62
349	0.57
350	0.52
351	0.48
352	0.41
353	0.36
354	0.27
355	0.27
356	0.21
357	0.23
358	0.23
359	0.22
360	0.2
361	0.21
362	0.19
363	0.13
364	0.12
365	0.09
366	0.09
367	0.09
368	0.08
369	0.06
370	0.06
371	0.05
372	0.06
373	0.05
374	0.05
375	0.05
376	0.05
377	0.05
378	0.05
379	0.05
380	0.04
381	0.04
382	0.05
383	0.07
384	0.08
385	0.08
386	0.09
387	0.1
388	0.11
389	0.12
390	0.19
391	0.24
392	0.26
393	0.29
394	0.31
395	0.31
396	0.37
397	0.39
398	0.34
399	0.29
400	0.26
401	0.24
402	0.24
403	0.22
404	0.15
405	0.12
406	0.1
407	0.08
408	0.08
409	0.07
410	0.06
411	0.08
412	0.08
413	0.08
414	0.08
415	0.07
416	0.07
417	0.07
418	0.07
419	0.06
420	0.08
421	0.07
422	0.07
423	0.08
424	0.1
425	0.1
426	0.12
427	0.2
428	0.25
429	0.26
430	0.25
431	0.27
432	0.29
433	0.28
434	0.31
435	0.28
436	0.24
437	0.23
438	0.29
439	0.28
440	0.25
441	0.25
442	0.19
443	0.16
444	0.14
445	0.14
446	0.09
447	0.08
448	0.09
449	0.09
450	0.1
451	0.08
452	0.09
453	0.09
454	0.08
455	0.09
456	0.09
457	0.1
458	0.1
459	0.11
460	0.12
461	0.13
462	0.15
463	0.18
464	0.17
465	0.17
466	0.17
467	0.17
468	0.18
469	0.2
470	0.22
471	0.25
472	0.31
473	0.3
474	0.31
475	0.31
476	0.29
477	0.27
478	0.23
479	0.24
480	0.27
481	0.35
482	0.41
483	0.49
484	0.57
485	0.65
486	0.73
487	0.76
488	0.78
489	0.75
490	0.79
491	0.8
492	0.8
493	0.74
494	0.66
495	0.6
496	0.53
497	0.48
498	0.4
499	0.38
500	0.36
501	0.41
502	0.44
503	0.42
504	0.38
505	0.37
506	0.36
507	0.29
508	0.25
509	0.2
510	0.15
511	0.13
512	0.13
513	0.13
514	0.12
515	0.13
516	0.11
517	0.11
518	0.11
519	0.12
520	0.17
521	0.17
522	0.23
523	0.24
524	0.24
525	0.24
526	0.27
527	0.28
528	0.25
529	0.27
530	0.25
531	0.29
532	0.33
533	0.35
534	0.33
535	0.33
536	0.33
537	0.32
538	0.29
539	0.24
540	0.19
541	0.16
542	0.19
543	0.17
544	0.16
545	0.16
546	0.17
547	0.15
548	0.17
549	0.2
550	0.19
551	0.23
552	0.23
553	0.26
554	0.25
555	0.25
556	0.23
557	0.2
558	0.17
559	0.14
560	0.12
561	0.09
562	0.08
563	0.08
564	0.08
565	0.08
566	0.09
567	0.13
568	0.12
569	0.15
570	0.15
571	0.15
572	0.22
573	0.24
574	0.28
575	0.33
576	0.35
577	0.32
578	0.4
579	0.43
580	0.41
581	0.47
582	0.44
583	0.45
584	0.52
585	0.54
586	0.56
587	0.64
588	0.68
589	0.71
590	0.78
591	0.79
592	0.81
593	0.88
594	0.88
595	0.86
596	0.85
597	0.86
598	0.84
599	0.82
600	0.82
601	0.78
602	0.75
603	0.73
604	0.71
605	0.69
606	0.63
607	0.61
608	0.54
609	0.52

G8JVV0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer