Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409XN18

Protein Details
Accession A0A409XN18    Localization Confidence High Confidence Score 15.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-22MPPRTKKGKKPAPKKAAEATPPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
4-16RTKKGKKPAPKKA
157-164KLARKKRR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MPPRTKKGKKPAPKKAAEATPPPVEPETTGDEFVEDVTMAGVEESNPGSSKSGDVTPTEPEAGAKLETKKMTLEERKAKLDQLRKKMAASTKANRTALVEESAKAKVTARDAARLDRQRKLAETLRLKADAEERGEDVERQKNWEYTIEENDEWEKKLARKKRRADFEFHDDAHAARRRYKKDLDLIKPDLTSYNKQKAIAMGQNADALVGFDPIAGSSSEVAISQEQRLAAEDLYRDANTLIYGDSKPSEDAIDRVVSKINKESVLFIDKKGKFSRKRLNEEEGDITYINEHNRVFNKKIARYYDKYTAEIRASFERGTAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.86
2 0.83
3 0.82
4 0.78
5 0.73
6 0.68
7 0.63
8 0.56
9 0.52
10 0.45
11 0.36
12 0.31
13 0.28
14 0.28
15 0.25
16 0.25
17 0.22
18 0.21
19 0.2
20 0.19
21 0.15
22 0.08
23 0.06
24 0.05
25 0.05
26 0.05
27 0.05
28 0.05
29 0.04
30 0.06
31 0.07
32 0.08
33 0.08
34 0.09
35 0.11
36 0.11
37 0.12
38 0.13
39 0.16
40 0.16
41 0.18
42 0.19
43 0.2
44 0.22
45 0.22
46 0.19
47 0.16
48 0.15
49 0.15
50 0.15
51 0.16
52 0.17
53 0.21
54 0.22
55 0.22
56 0.23
57 0.24
58 0.32
59 0.36
60 0.42
61 0.46
62 0.5
63 0.55
64 0.54
65 0.56
66 0.54
67 0.56
68 0.56
69 0.56
70 0.6
71 0.56
72 0.56
73 0.57
74 0.55
75 0.55
76 0.54
77 0.52
78 0.53
79 0.59
80 0.58
81 0.53
82 0.49
83 0.42
84 0.36
85 0.32
86 0.24
87 0.17
88 0.19
89 0.19
90 0.17
91 0.15
92 0.15
93 0.14
94 0.16
95 0.21
96 0.2
97 0.26
98 0.27
99 0.3
100 0.37
101 0.43
102 0.44
103 0.43
104 0.45
105 0.41
106 0.41
107 0.43
108 0.4
109 0.41
110 0.42
111 0.41
112 0.4
113 0.39
114 0.37
115 0.33
116 0.3
117 0.24
118 0.21
119 0.18
120 0.16
121 0.16
122 0.17
123 0.16
124 0.17
125 0.19
126 0.18
127 0.21
128 0.22
129 0.22
130 0.22
131 0.25
132 0.24
133 0.21
134 0.24
135 0.24
136 0.22
137 0.21
138 0.22
139 0.2
140 0.18
141 0.16
142 0.15
143 0.15
144 0.23
145 0.3
146 0.39
147 0.47
148 0.56
149 0.63
150 0.71
151 0.71
152 0.7
153 0.68
154 0.66
155 0.6
156 0.52
157 0.44
158 0.34
159 0.31
160 0.31
161 0.29
162 0.22
163 0.25
164 0.31
165 0.34
166 0.4
167 0.44
168 0.42
169 0.46
170 0.54
171 0.54
172 0.55
173 0.55
174 0.51
175 0.47
176 0.42
177 0.37
178 0.31
179 0.3
180 0.29
181 0.33
182 0.34
183 0.34
184 0.35
185 0.33
186 0.35
187 0.33
188 0.28
189 0.22
190 0.2
191 0.2
192 0.19
193 0.17
194 0.12
195 0.08
196 0.06
197 0.05
198 0.05
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.06
208 0.06
209 0.07
210 0.07
211 0.09
212 0.09
213 0.1
214 0.1
215 0.1
216 0.12
217 0.12
218 0.11
219 0.12
220 0.11
221 0.11
222 0.13
223 0.13
224 0.12
225 0.11
226 0.11
227 0.09
228 0.09
229 0.08
230 0.08
231 0.09
232 0.1
233 0.11
234 0.12
235 0.12
236 0.12
237 0.13
238 0.11
239 0.12
240 0.13
241 0.16
242 0.16
243 0.16
244 0.2
245 0.2
246 0.21
247 0.26
248 0.26
249 0.25
250 0.25
251 0.27
252 0.26
253 0.32
254 0.31
255 0.29
256 0.36
257 0.36
258 0.41
259 0.47
260 0.52
261 0.53
262 0.63
263 0.71
264 0.71
265 0.79
266 0.79
267 0.8
268 0.74
269 0.71
270 0.65
271 0.56
272 0.48
273 0.38
274 0.32
275 0.25
276 0.23
277 0.19
278 0.18
279 0.17
280 0.2
281 0.26
282 0.33
283 0.34
284 0.38
285 0.46
286 0.49
287 0.57
288 0.6
289 0.63
290 0.62
291 0.66
292 0.69
293 0.64
294 0.6
295 0.55
296 0.52
297 0.47
298 0.44
299 0.41
300 0.36
301 0.36
302 0.33