Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409XHQ9

Protein Details
Accession A0A409XHQ9    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
24-43MGPGRKLYHKPYCKSCHLKSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 11.5, extr 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001781  Znf_LIM  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00412  LIM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00478  LIM_DOMAIN_1  
PS50023  LIM_DOMAIN_2  
CDD cd09326  LIM_CRP_like  
Amino Acid Sequences MHPFGGTQICPRCSKAVYLAEQVMGPGRKLYHKPYCKSCHLKSFGTRDLRHANLPYAQPPAEDAGTPSSPTSPSRGMFAPLRPLSTGAGAPRATSPLPRLRPNRSLATSPISSSFPRGPNPSTQAYQSPANGTMPSANVNVTSDPKADSPSTTDDSATADEEAEVHDSLIADTDNANYIPVETETNEEDEERRDVLSEPTPSSYPSNTGRPGIGTIPRTVPLYLNGNSARTPYKHHFSQSLGSISSSSSPPSSTPNSNLSKEAEDIPQYAEYTYNTFSGLGNPTTTTIPLGRSNTTSGVVMSSSPGSRSFGNISPLSQTATGTRYGIALDGGNIGVQMTGTGTPRKWGAGTPQCPRCAKSVYFAEQVKAAGKTYHKHCLRCVECNTTLDSSRLRDHDGDPFCVRCYGKLHGPQGSGYALLGKAGG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.41
3 0.42
4 0.43
5 0.46
6 0.45
7 0.41
8 0.39
9 0.36
10 0.33
11 0.26
12 0.21
13 0.19
14 0.19
15 0.26
16 0.3
17 0.39
18 0.44
19 0.52
20 0.59
21 0.67
22 0.73
23 0.76
24 0.81
25 0.79
26 0.78
27 0.75
28 0.75
29 0.73
30 0.73
31 0.71
32 0.71
33 0.65
34 0.62
35 0.63
36 0.59
37 0.56
38 0.5
39 0.45
40 0.41
41 0.42
42 0.38
43 0.35
44 0.32
45 0.27
46 0.26
47 0.26
48 0.21
49 0.18
50 0.17
51 0.18
52 0.18
53 0.19
54 0.18
55 0.16
56 0.17
57 0.18
58 0.22
59 0.21
60 0.21
61 0.23
62 0.24
63 0.27
64 0.29
65 0.31
66 0.35
67 0.32
68 0.33
69 0.3
70 0.3
71 0.27
72 0.25
73 0.24
74 0.16
75 0.2
76 0.18
77 0.18
78 0.18
79 0.19
80 0.18
81 0.18
82 0.23
83 0.27
84 0.33
85 0.4
86 0.46
87 0.51
88 0.58
89 0.61
90 0.63
91 0.57
92 0.54
93 0.49
94 0.48
95 0.42
96 0.36
97 0.33
98 0.27
99 0.24
100 0.25
101 0.28
102 0.25
103 0.28
104 0.31
105 0.31
106 0.35
107 0.39
108 0.39
109 0.35
110 0.34
111 0.33
112 0.32
113 0.31
114 0.27
115 0.24
116 0.21
117 0.21
118 0.18
119 0.16
120 0.14
121 0.13
122 0.13
123 0.12
124 0.1
125 0.1
126 0.11
127 0.11
128 0.13
129 0.13
130 0.12
131 0.13
132 0.13
133 0.16
134 0.15
135 0.15
136 0.15
137 0.19
138 0.21
139 0.2
140 0.19
141 0.17
142 0.18
143 0.18
144 0.15
145 0.11
146 0.08
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.04
159 0.05
160 0.05
161 0.06
162 0.05
163 0.06
164 0.05
165 0.05
166 0.06
167 0.06
168 0.07
169 0.06
170 0.08
171 0.09
172 0.1
173 0.1
174 0.09
175 0.09
176 0.1
177 0.11
178 0.1
179 0.09
180 0.09
181 0.1
182 0.12
183 0.14
184 0.15
185 0.15
186 0.16
187 0.16
188 0.17
189 0.17
190 0.15
191 0.15
192 0.16
193 0.2
194 0.2
195 0.2
196 0.19
197 0.18
198 0.19
199 0.17
200 0.18
201 0.15
202 0.15
203 0.15
204 0.16
205 0.16
206 0.16
207 0.14
208 0.12
209 0.15
210 0.15
211 0.18
212 0.17
213 0.17
214 0.17
215 0.18
216 0.19
217 0.15
218 0.2
219 0.21
220 0.26
221 0.27
222 0.29
223 0.3
224 0.3
225 0.33
226 0.3
227 0.28
228 0.22
229 0.2
230 0.18
231 0.16
232 0.15
233 0.12
234 0.1
235 0.08
236 0.08
237 0.09
238 0.13
239 0.16
240 0.17
241 0.2
242 0.27
243 0.31
244 0.32
245 0.33
246 0.31
247 0.28
248 0.27
249 0.26
250 0.2
251 0.17
252 0.17
253 0.16
254 0.15
255 0.14
256 0.13
257 0.11
258 0.1
259 0.11
260 0.12
261 0.11
262 0.1
263 0.1
264 0.1
265 0.13
266 0.15
267 0.13
268 0.12
269 0.12
270 0.13
271 0.13
272 0.13
273 0.12
274 0.1
275 0.12
276 0.16
277 0.18
278 0.18
279 0.19
280 0.21
281 0.21
282 0.21
283 0.19
284 0.14
285 0.13
286 0.11
287 0.1
288 0.09
289 0.09
290 0.08
291 0.09
292 0.1
293 0.11
294 0.11
295 0.14
296 0.17
297 0.18
298 0.23
299 0.22
300 0.22
301 0.23
302 0.23
303 0.23
304 0.19
305 0.16
306 0.13
307 0.14
308 0.15
309 0.13
310 0.12
311 0.11
312 0.11
313 0.1
314 0.09
315 0.08
316 0.07
317 0.07
318 0.07
319 0.06
320 0.06
321 0.06
322 0.05
323 0.04
324 0.04
325 0.04
326 0.06
327 0.08
328 0.12
329 0.12
330 0.14
331 0.15
332 0.16
333 0.16
334 0.17
335 0.25
336 0.33
337 0.4
338 0.47
339 0.53
340 0.58
341 0.59
342 0.59
343 0.53
344 0.5
345 0.44
346 0.43
347 0.44
348 0.44
349 0.49
350 0.48
351 0.44
352 0.4
353 0.39
354 0.34
355 0.27
356 0.22
357 0.2
358 0.22
359 0.29
360 0.33
361 0.42
362 0.45
363 0.47
364 0.51
365 0.58
366 0.59
367 0.6
368 0.61
369 0.59
370 0.57
371 0.55
372 0.54
373 0.47
374 0.43
375 0.37
376 0.35
377 0.3
378 0.32
379 0.33
380 0.33
381 0.33
382 0.34
383 0.4
384 0.41
385 0.42
386 0.4
387 0.4
388 0.37
389 0.39
390 0.37
391 0.31
392 0.32
393 0.32
394 0.37
395 0.45
396 0.49
397 0.5
398 0.51
399 0.48
400 0.46
401 0.41
402 0.33
403 0.24
404 0.21
405 0.15