FuNGI

A0A409XU11

Protein Details

Accession

A0A409XU11

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
396-416	VKERWEKRTGFKVKRFRCDSG	Basic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto 12, nucl 5, mito 4, pero 2, cysk 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR025724 GAG-pre-integrase_dom IPR012337 RNaseH-like_sf
Pfam	View protein in Pfam PF13976 gag_pre-integrs

Amino Acid Sequences

MDREKAASDDGKDAAAPDTLLDRIVSRLLIECHRIEAESPSKRNGPGSEYSNLAKDSDNRPIAKHLNNPNGVRCTNCRGRSHDRDHCFNPGGGMAGQGPRDKAAAAAAAAAAAATVKKDGKEMASIAAASVDFLDEGEISCAMIESVDDNLSTLTLTSIPANATLLDSGATSHLIKSHEMFHSYSEANARNVTTANLGTLRTQGGGTCYVNVSYEGRSIRLKLNNCLHAPGAVVNLLLVGRLNSAGIGCNFIPNEGVHLSKNGITFASGRMINRLFSLDAEFIPGPPSDERVMFVKVSESMYLHHLRLGHPGESATRMLVKSLLKSQIKDVEPIKCEPCIIAKHVAMPHPSKSVGQQTPHRKKYFVAFQCTGMKVSNLQLIADKVPDTMLEAFITVKERWEKRTGFKVKRFRCDSGTEWKGAFTQYLNDHGRILAMLTTAQLPLMYWGEAALTAAYLLNVTTLNADGITPFEAMYGRPPNLSHLHIWGSRCFVHVPEE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.19
2	0.16
3	0.13
4	0.1
5	0.11
6	0.11
7	0.12
8	0.11
9	0.1
10	0.11
11	0.12
12	0.12
13	0.11
14	0.14
15	0.17
16	0.21
17	0.25
18	0.24
19	0.26
20	0.26
21	0.26
22	0.24
23	0.27
24	0.33
25	0.37
26	0.39
27	0.41
28	0.44
29	0.45
30	0.49
31	0.44
32	0.4
33	0.38
34	0.4
35	0.38
36	0.37
37	0.37
38	0.35
39	0.33
40	0.28
41	0.24
42	0.25
43	0.28
44	0.34
45	0.39
46	0.37
47	0.38
48	0.44
49	0.48
50	0.48
51	0.53
52	0.53
53	0.56
54	0.62
55	0.63
56	0.62
57	0.62
58	0.57
59	0.52
60	0.46
61	0.46
62	0.48
63	0.52
64	0.51
65	0.53
66	0.62
67	0.68
68	0.74
69	0.75
70	0.72
71	0.72
72	0.7
73	0.69
74	0.61
75	0.51
76	0.42
77	0.33
78	0.29
79	0.21
80	0.19
81	0.14
82	0.14
83	0.16
84	0.16
85	0.16
86	0.14
87	0.15
88	0.14
89	0.12
90	0.11
91	0.1
92	0.08
93	0.08
94	0.07
95	0.07
96	0.06
97	0.06
98	0.04
99	0.03
100	0.03
101	0.03
102	0.05
103	0.07
104	0.07
105	0.09
106	0.11
107	0.12
108	0.15
109	0.15
110	0.15
111	0.15
112	0.14
113	0.13
114	0.12
115	0.11
116	0.08
117	0.07
118	0.05
119	0.04
120	0.04
121	0.05
122	0.04
123	0.04
124	0.05
125	0.05
126	0.05
127	0.05
128	0.05
129	0.04
130	0.04
131	0.04
132	0.04
133	0.05
134	0.05
135	0.05
136	0.05
137	0.06
138	0.06
139	0.06
140	0.05
141	0.04
142	0.04
143	0.05
144	0.06
145	0.07
146	0.07
147	0.07
148	0.08
149	0.07
150	0.07
151	0.07
152	0.06
153	0.05
154	0.05
155	0.05
156	0.05
157	0.06
158	0.06
159	0.06
160	0.1
161	0.1
162	0.11
163	0.12
164	0.16
165	0.17
166	0.19
167	0.19
168	0.17
169	0.2
170	0.19
171	0.19
172	0.19
173	0.19
174	0.18
175	0.18
176	0.17
177	0.14
178	0.14
179	0.14
180	0.11
181	0.09
182	0.09
183	0.09
184	0.1
185	0.09
186	0.1
187	0.1
188	0.09
189	0.09
190	0.08
191	0.09
192	0.11
193	0.11
194	0.1
195	0.1
196	0.1
197	0.1
198	0.11
199	0.1
200	0.08
201	0.11
202	0.11
203	0.13
204	0.13
205	0.15
206	0.2
207	0.24
208	0.26
209	0.29
210	0.35
211	0.39
212	0.38
213	0.38
214	0.32
215	0.27
216	0.25
217	0.18
218	0.13
219	0.08
220	0.07
221	0.05
222	0.05
223	0.05
224	0.04
225	0.03
226	0.03
227	0.03
228	0.03
229	0.03
230	0.03
231	0.03
232	0.04
233	0.05
234	0.07
235	0.06
236	0.08
237	0.08
238	0.08
239	0.08
240	0.07
241	0.09
242	0.08
243	0.09
244	0.08
245	0.09
246	0.1
247	0.11
248	0.11
249	0.1
250	0.09
251	0.09
252	0.09
253	0.09
254	0.12
255	0.11
256	0.11
257	0.13
258	0.14
259	0.13
260	0.13
261	0.13
262	0.1
263	0.1
264	0.12
265	0.1
266	0.09
267	0.11
268	0.11
269	0.1
270	0.11
271	0.11
272	0.1
273	0.1
274	0.12
275	0.11
276	0.11
277	0.12
278	0.13
279	0.15
280	0.13
281	0.13
282	0.11
283	0.11
284	0.12
285	0.12
286	0.1
287	0.09
288	0.14
289	0.16
290	0.15
291	0.15
292	0.15
293	0.15
294	0.22
295	0.23
296	0.19
297	0.17
298	0.18
299	0.17
300	0.18
301	0.18
302	0.11
303	0.11
304	0.11
305	0.11
306	0.14
307	0.14
308	0.14
309	0.18
310	0.26
311	0.26
312	0.27
313	0.3
314	0.35
315	0.35
316	0.37
317	0.35
318	0.34
319	0.34
320	0.37
321	0.35
322	0.27
323	0.26
324	0.22
325	0.24
326	0.2
327	0.21
328	0.22
329	0.21
330	0.26
331	0.28
332	0.31
333	0.3
334	0.3
335	0.29
336	0.27
337	0.28
338	0.24
339	0.25
340	0.31
341	0.31
342	0.34
343	0.41
344	0.49
345	0.59
346	0.67
347	0.66
348	0.57
349	0.54
350	0.58
351	0.59
352	0.55
353	0.53
354	0.46
355	0.48
356	0.53
357	0.52
358	0.45
359	0.35
360	0.28
361	0.21
362	0.22
363	0.21
364	0.16
365	0.15
366	0.15
367	0.16
368	0.17
369	0.16
370	0.14
371	0.1
372	0.1
373	0.1
374	0.11
375	0.1
376	0.1
377	0.09
378	0.09
379	0.09
380	0.1
381	0.14
382	0.11
383	0.15
384	0.22
385	0.25
386	0.3
387	0.37
388	0.4
389	0.43
390	0.54
391	0.61
392	0.63
393	0.7
394	0.76
395	0.76
396	0.83
397	0.83
398	0.76
399	0.71
400	0.67
401	0.62
402	0.62
403	0.57
404	0.49
405	0.43
406	0.39
407	0.35
408	0.3
409	0.26
410	0.17
411	0.18
412	0.17
413	0.26
414	0.28
415	0.28
416	0.27
417	0.26
418	0.26
419	0.2
420	0.19
421	0.11
422	0.08
423	0.08
424	0.08
425	0.09
426	0.08
427	0.08
428	0.07
429	0.07
430	0.09
431	0.1
432	0.09
433	0.08
434	0.08
435	0.09
436	0.09
437	0.09
438	0.06
439	0.05
440	0.05
441	0.05
442	0.05
443	0.05
444	0.05
445	0.05
446	0.05
447	0.06
448	0.06
449	0.07
450	0.07
451	0.07
452	0.07
453	0.07
454	0.08
455	0.09
456	0.09
457	0.08
458	0.08
459	0.09
460	0.09
461	0.17
462	0.22
463	0.21
464	0.23
465	0.24
466	0.29
467	0.33
468	0.36
469	0.31
470	0.29
471	0.34
472	0.37
473	0.39
474	0.36
475	0.37
476	0.34
477	0.34
478	0.3

A0A409XU11

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer