Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

G8JSX4

Protein Details
Accession G8JSX4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-25INPKNARAKRALDKKEPKLVEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
335-339KKHKK
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 12.5, mito 4, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR039770  Rpf2  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0000470  P:maturation of LSU-rRNA  
GO:0000027  P:ribosomal large subunit assembly  
KEGG erc:Ecym_4046  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MIRTINPKNARAKRALDKKEPKLVENVKQALFIPGQTSNKFLHEAMIDLSGFKKPNIKRFSHRNDVRPFEDVEPIEFYSEKNDCSLVVVSSNSKKRKNNLTFIRTFGYKVYDMIELQICENYKLLSDFKKQTVGVGLKPIFSFQGEAFESHPVYKHVKSLFLDFFRGESSSLQDVAGLQYVISLTVEGDFKEGESLPNVLFRVYKLKTFRSSQGGKKLPRVELEEIGPRFDFKIGRIHTPSPEMVKDAHKKAKQLEFKTAKNVEIDGMGDKIGRIHVGKQDLNQLQTRKMKGLKAKYDQVDSETEAYINEDEHHLNDDSYGEDYVTASEIEPPSKKHKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.74
2 0.76
3 0.77
4 0.79
5 0.8
6 0.83
7 0.78
8 0.69
9 0.69
10 0.68
11 0.65
12 0.64
13 0.62
14 0.52
15 0.51
16 0.49
17 0.43
18 0.36
19 0.28
20 0.22
21 0.22
22 0.26
23 0.26
24 0.28
25 0.26
26 0.27
27 0.29
28 0.26
29 0.23
30 0.19
31 0.19
32 0.18
33 0.18
34 0.16
35 0.14
36 0.15
37 0.15
38 0.16
39 0.15
40 0.22
41 0.25
42 0.34
43 0.42
44 0.47
45 0.51
46 0.62
47 0.7
48 0.73
49 0.75
50 0.75
51 0.76
52 0.77
53 0.71
54 0.62
55 0.57
56 0.47
57 0.46
58 0.37
59 0.3
60 0.27
61 0.24
62 0.23
63 0.2
64 0.18
65 0.17
66 0.18
67 0.16
68 0.14
69 0.14
70 0.13
71 0.15
72 0.16
73 0.11
74 0.11
75 0.12
76 0.15
77 0.22
78 0.3
79 0.34
80 0.4
81 0.44
82 0.5
83 0.6
84 0.64
85 0.68
86 0.7
87 0.72
88 0.68
89 0.66
90 0.62
91 0.51
92 0.44
93 0.35
94 0.28
95 0.2
96 0.18
97 0.17
98 0.15
99 0.14
100 0.15
101 0.16
102 0.12
103 0.12
104 0.14
105 0.12
106 0.11
107 0.12
108 0.1
109 0.08
110 0.1
111 0.12
112 0.14
113 0.2
114 0.23
115 0.24
116 0.29
117 0.28
118 0.27
119 0.31
120 0.29
121 0.24
122 0.27
123 0.26
124 0.23
125 0.23
126 0.23
127 0.16
128 0.15
129 0.15
130 0.08
131 0.12
132 0.12
133 0.12
134 0.13
135 0.14
136 0.14
137 0.13
138 0.14
139 0.11
140 0.15
141 0.14
142 0.18
143 0.17
144 0.21
145 0.21
146 0.25
147 0.27
148 0.24
149 0.25
150 0.2
151 0.2
152 0.17
153 0.16
154 0.12
155 0.09
156 0.1
157 0.1
158 0.1
159 0.09
160 0.09
161 0.08
162 0.08
163 0.08
164 0.05
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.03
171 0.03
172 0.04
173 0.05
174 0.04
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.06
182 0.08
183 0.07
184 0.09
185 0.1
186 0.09
187 0.09
188 0.09
189 0.16
190 0.16
191 0.2
192 0.22
193 0.27
194 0.31
195 0.34
196 0.38
197 0.39
198 0.44
199 0.45
200 0.51
201 0.54
202 0.52
203 0.56
204 0.57
205 0.51
206 0.49
207 0.49
208 0.42
209 0.36
210 0.36
211 0.36
212 0.31
213 0.3
214 0.27
215 0.21
216 0.19
217 0.19
218 0.17
219 0.11
220 0.2
221 0.2
222 0.26
223 0.3
224 0.32
225 0.32
226 0.35
227 0.35
228 0.3
229 0.28
230 0.24
231 0.22
232 0.28
233 0.33
234 0.37
235 0.44
236 0.43
237 0.46
238 0.52
239 0.59
240 0.6
241 0.57
242 0.6
243 0.58
244 0.58
245 0.64
246 0.59
247 0.51
248 0.43
249 0.4
250 0.29
251 0.23
252 0.22
253 0.14
254 0.12
255 0.1
256 0.09
257 0.09
258 0.09
259 0.08
260 0.09
261 0.09
262 0.13
263 0.18
264 0.24
265 0.26
266 0.27
267 0.36
268 0.37
269 0.4
270 0.42
271 0.39
272 0.4
273 0.46
274 0.46
275 0.43
276 0.45
277 0.48
278 0.52
279 0.59
280 0.61
281 0.62
282 0.68
283 0.66
284 0.66
285 0.61
286 0.54
287 0.48
288 0.41
289 0.35
290 0.27
291 0.23
292 0.18
293 0.19
294 0.16
295 0.13
296 0.12
297 0.12
298 0.12
299 0.13
300 0.17
301 0.16
302 0.15
303 0.15
304 0.15
305 0.14
306 0.14
307 0.14
308 0.1
309 0.09
310 0.1
311 0.1
312 0.1
313 0.09
314 0.08
315 0.13
316 0.15
317 0.19
318 0.22
319 0.26