FuNGI

A0A409VLM1

Protein Details

Accession

A0A409VLM1

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
687-706	LRDCNPPKNNWKHNRGRGGR	Basic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

plas 13, cyto 5, nucl 3, mito 3, mito_nucl 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM

Amino Acid Sequences

MPPDVRLSPPWAASSSAPLLTPVDNIHTMQLTDSLDTSSTNSKQKEDKLPHDASVFVGRLVSSSHSLVIDDVIVVSFCISLPSNMDQGDLTRLLMEHLSEHAQVKNIKVVRDSKGGVCAFVQCEVWPFLLIFFQISNNAQSATSLIQTLQSSVPKPFLGRILRYEPARAFRSLLVSYREPTQYVASTGVNMLSSIHSEIKLDLPVAMRIWKHRNSRLTSTRFHNILYNLEAVQAAETYVSDTSGASVQDNVFYLHPLKFDENVRIDSVLLKAHLTSPYTVITQFGVVLRTSREIFPIADVEYGWSDSRPCIFCLLTSFCKDLDGGPQRHMSFESYPEPHRSPRSPTMENMCWEIKWEHRDDCVSALMTLRRVPHFTVTWAHQPNTFGQGLNLPGRRHIFQSYASHNRHRTFTHQSSAPHCMHTNHFQQSVEPSGSSDDQMNDHRIVPVLSVIHDHDKHEATHESWADESNSTATRKEISSSGTVEDGSNTSSLLDQLPPIERSESVPENTDEAEGQKKIGRDKQESERIFARERSTEDSNAAESEGQDLYLPPTPALDASMIAPITSRSNFPLVPTISGTDAPYTAKYSDYKDLYGVSKGSRLEKEIDPTTLFVGGLEMFGPGAWNEEKVKAFFSRFGGLECVKVVRPMNSCAAFAFVKFDNTEAPARAVFEEHNRVYEGRAMRVQLRDCNPPKNNWKHNRGRGGRPHQHHFAVPRRTNYRPSFGTQERPSFHMNQEKPSFLNTNLASQTHPLPPHVSAAGVRLPRDDISATNIVEPSSVSLDVSSNARNSPPGEHYREWYDDAESLINTPEPSSLGSSASTTGVTFSTSPSYGYPITNGPYFPPPSWVHPYPPHVPYQIPYYPGYSVYPPTAVQSPQVLTSPPVSDVSGPATGLQHNWPPVGMYTSYIPYSTMPSRTQSVEQGQPQSHMPAQAPVVPTGFIQNEQGTLIAVYQPEALDQYLAGTVPAVSMTPSGVVSTQQRWEYTAPQKFEPGNTTINSFVPQQSRPQSAGFHAPPSQQSTTTTPPREIDINIGPPLYRRQGPGRRESQHGHAFTRQPNHPRSVSNGRPTRAHMHYPANIHATDLGHLTTPPAISGDWNRWNNAR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.3
2	0.28
3	0.25
4	0.23
5	0.22
6	0.22
7	0.2
8	0.21
9	0.16
10	0.17
11	0.18
12	0.19
13	0.2
14	0.19
15	0.19
16	0.18
17	0.2
18	0.17
19	0.16
20	0.16
21	0.14
22	0.14
23	0.14
24	0.16
25	0.19
26	0.23
27	0.3
28	0.31
29	0.35
30	0.42
31	0.49
32	0.57
33	0.59
34	0.63
35	0.65
36	0.66
37	0.65
38	0.59
39	0.52
40	0.43
41	0.41
42	0.33
43	0.24
44	0.21
45	0.17
46	0.16
47	0.17
48	0.17
49	0.14
50	0.14
51	0.16
52	0.15
53	0.16
54	0.16
55	0.15
56	0.12
57	0.09
58	0.08
59	0.07
60	0.06
61	0.06
62	0.06
63	0.05
64	0.05
65	0.07
66	0.08
67	0.08
68	0.12
69	0.15
70	0.18
71	0.17
72	0.18
73	0.16
74	0.17
75	0.21
76	0.17
77	0.15
78	0.13
79	0.13
80	0.13
81	0.14
82	0.13
83	0.09
84	0.11
85	0.14
86	0.15
87	0.17
88	0.17
89	0.22
90	0.24
91	0.24
92	0.3
93	0.31
94	0.31
95	0.34
96	0.39
97	0.39
98	0.43
99	0.44
100	0.38
101	0.43
102	0.42
103	0.37
104	0.32
105	0.3
106	0.25
107	0.24
108	0.22
109	0.14
110	0.17
111	0.18
112	0.17
113	0.14
114	0.13
115	0.12
116	0.13
117	0.13
118	0.1
119	0.09
120	0.1
121	0.12
122	0.13
123	0.14
124	0.14
125	0.15
126	0.14
127	0.13
128	0.14
129	0.12
130	0.12
131	0.11
132	0.1
133	0.12
134	0.13
135	0.15
136	0.16
137	0.18
138	0.2
139	0.21
140	0.24
141	0.21
142	0.22
143	0.23
144	0.27
145	0.3
146	0.32
147	0.36
148	0.39
149	0.43
150	0.43
151	0.46
152	0.42
153	0.43
154	0.42
155	0.37
156	0.34
157	0.31
158	0.34
159	0.31
160	0.31
161	0.3
162	0.29
163	0.29
164	0.32
165	0.32
166	0.27
167	0.27
168	0.26
169	0.22
170	0.21
171	0.22
172	0.17
173	0.17
174	0.17
175	0.15
176	0.12
177	0.11
178	0.1
179	0.08
180	0.09
181	0.11
182	0.12
183	0.11
184	0.12
185	0.13
186	0.14
187	0.15
188	0.14
189	0.13
190	0.13
191	0.14
192	0.15
193	0.17
194	0.17
195	0.23
196	0.3
197	0.36
198	0.43
199	0.49
200	0.57
201	0.6
202	0.68
203	0.71
204	0.7
205	0.68
206	0.66
207	0.65
208	0.58
209	0.52
210	0.47
211	0.39
212	0.36
213	0.33
214	0.28
215	0.2
216	0.2
217	0.19
218	0.14
219	0.13
220	0.09
221	0.07
222	0.05
223	0.05
224	0.06
225	0.06
226	0.06
227	0.06
228	0.06
229	0.07
230	0.08
231	0.09
232	0.08
233	0.1
234	0.1
235	0.11
236	0.12
237	0.12
238	0.1
239	0.11
240	0.14
241	0.13
242	0.14
243	0.15
244	0.16
245	0.18
246	0.21
247	0.26
248	0.27
249	0.28
250	0.28
251	0.26
252	0.24
253	0.22
254	0.21
255	0.15
256	0.12
257	0.11
258	0.1
259	0.12
260	0.14
261	0.14
262	0.14
263	0.14
264	0.15
265	0.16
266	0.16
267	0.14
268	0.12
269	0.11
270	0.11
271	0.1
272	0.1
273	0.09
274	0.1
275	0.11
276	0.13
277	0.14
278	0.14
279	0.14
280	0.15
281	0.15
282	0.15
283	0.16
284	0.14
285	0.12
286	0.12
287	0.12
288	0.11
289	0.12
290	0.11
291	0.09
292	0.09
293	0.1
294	0.14
295	0.14
296	0.14
297	0.16
298	0.16
299	0.16
300	0.2
301	0.25
302	0.24
303	0.25
304	0.26
305	0.23
306	0.23
307	0.23
308	0.19
309	0.23
310	0.28
311	0.27
312	0.29
313	0.34
314	0.33
315	0.34
316	0.35
317	0.28
318	0.21
319	0.23
320	0.26
321	0.24
322	0.27
323	0.31
324	0.32
325	0.34
326	0.38
327	0.37
328	0.39
329	0.45
330	0.5
331	0.48
332	0.49
333	0.52
334	0.51
335	0.49
336	0.45
337	0.37
338	0.29
339	0.29
340	0.27
341	0.24
342	0.25
343	0.27
344	0.25
345	0.26
346	0.28
347	0.26
348	0.26
349	0.23
350	0.18
351	0.15
352	0.16
353	0.15
354	0.14
355	0.16
356	0.17
357	0.16
358	0.17
359	0.18
360	0.2
361	0.2
362	0.21
363	0.22
364	0.23
365	0.3
366	0.31
367	0.31
368	0.29
369	0.29
370	0.28
371	0.3
372	0.27
373	0.18
374	0.15
375	0.17
376	0.17
377	0.21
378	0.24
379	0.19
380	0.22
381	0.24
382	0.25
383	0.26
384	0.25
385	0.22
386	0.22
387	0.28
388	0.32
389	0.39
390	0.41
391	0.45
392	0.49
393	0.49
394	0.47
395	0.43
396	0.42
397	0.42
398	0.43
399	0.42
400	0.4
401	0.41
402	0.42
403	0.47
404	0.42
405	0.34
406	0.31
407	0.28
408	0.28
409	0.31
410	0.33
411	0.31
412	0.32
413	0.29
414	0.29
415	0.29
416	0.29
417	0.23
418	0.17
419	0.13
420	0.14
421	0.14
422	0.14
423	0.13
424	0.1
425	0.11
426	0.13
427	0.16
428	0.15
429	0.15
430	0.14
431	0.14
432	0.13
433	0.11
434	0.11
435	0.08
436	0.07
437	0.08
438	0.09
439	0.13
440	0.14
441	0.15
442	0.16
443	0.17
444	0.17
445	0.19
446	0.19
447	0.15
448	0.19
449	0.19
450	0.16
451	0.15
452	0.16
453	0.14
454	0.13
455	0.12
456	0.09
457	0.11
458	0.11
459	0.11
460	0.11
461	0.12
462	0.12
463	0.13
464	0.12
465	0.13
466	0.14
467	0.15
468	0.15
469	0.14
470	0.14
471	0.12
472	0.12
473	0.09
474	0.08
475	0.07
476	0.06
477	0.06
478	0.05
479	0.06
480	0.06
481	0.06
482	0.05
483	0.07
484	0.09
485	0.1
486	0.1
487	0.1
488	0.1
489	0.12
490	0.16
491	0.17
492	0.15
493	0.16
494	0.16
495	0.16
496	0.16
497	0.15
498	0.1
499	0.1
500	0.12
501	0.1
502	0.1
503	0.12
504	0.13
505	0.16
506	0.21
507	0.25
508	0.27
509	0.32
510	0.4
511	0.47
512	0.46
513	0.45
514	0.45
515	0.42
516	0.39
517	0.37
518	0.31
519	0.23
520	0.25
521	0.27
522	0.25
523	0.24
524	0.22
525	0.2
526	0.19
527	0.16
528	0.15
529	0.1
530	0.07
531	0.08
532	0.07
533	0.06
534	0.06
535	0.06
536	0.07
537	0.1
538	0.1
539	0.08
540	0.08
541	0.08
542	0.08
543	0.08
544	0.07
545	0.05
546	0.05
547	0.06
548	0.06
549	0.06
550	0.06
551	0.06
552	0.07
553	0.08
554	0.08
555	0.08
556	0.1
557	0.1
558	0.11
559	0.16
560	0.15
561	0.15
562	0.15
563	0.15
564	0.14
565	0.14
566	0.14
567	0.09
568	0.09
569	0.08
570	0.08
571	0.09
572	0.08
573	0.09
574	0.11
575	0.13
576	0.18
577	0.19
578	0.19
579	0.18
580	0.19
581	0.19
582	0.18
583	0.16
584	0.11
585	0.13
586	0.14
587	0.17
588	0.16
589	0.17
590	0.2
591	0.2
592	0.24
593	0.22
594	0.23
595	0.2
596	0.2
597	0.18
598	0.14
599	0.13
600	0.08
601	0.07
602	0.06
603	0.05
604	0.05
605	0.04
606	0.03
607	0.03
608	0.04
609	0.03
610	0.05
611	0.05
612	0.06
613	0.08
614	0.11
615	0.12
616	0.12
617	0.14
618	0.14
619	0.15
620	0.16
621	0.17
622	0.18
623	0.17
624	0.18
625	0.19
626	0.17
627	0.17
628	0.15
629	0.14
630	0.11
631	0.14
632	0.14
633	0.15
634	0.17
635	0.19
636	0.23
637	0.23
638	0.23
639	0.2
640	0.22
641	0.18
642	0.16
643	0.16
644	0.11
645	0.12
646	0.11
647	0.12
648	0.1
649	0.12
650	0.14
651	0.11
652	0.12
653	0.11
654	0.12
655	0.12
656	0.12
657	0.1
658	0.13
659	0.19
660	0.18
661	0.19
662	0.19
663	0.19
664	0.19
665	0.23
666	0.2
667	0.16
668	0.18
669	0.18
670	0.2
671	0.24
672	0.26
673	0.27
674	0.29
675	0.36
676	0.37
677	0.45
678	0.44
679	0.47
680	0.55
681	0.59
682	0.66
683	0.66
684	0.73
685	0.74
686	0.8
687	0.83
688	0.79
689	0.78
690	0.78
691	0.8
692	0.79
693	0.74
694	0.72
695	0.66
696	0.62
697	0.55
698	0.51
699	0.5
700	0.51
701	0.5
702	0.5
703	0.51
704	0.52
705	0.59
706	0.55
707	0.53
708	0.45
709	0.45
710	0.46
711	0.44
712	0.49
713	0.45
714	0.48
715	0.43
716	0.43
717	0.43
718	0.38
719	0.4
720	0.41
721	0.38
722	0.39
723	0.4
724	0.38
725	0.36
726	0.36
727	0.34
728	0.24
729	0.3
730	0.22
731	0.24
732	0.24
733	0.24
734	0.21
735	0.21
736	0.23
737	0.21
738	0.21
739	0.18
740	0.19
741	0.19
742	0.2
743	0.19
744	0.16
745	0.12
746	0.14
747	0.18
748	0.17
749	0.17
750	0.15
751	0.16
752	0.16
753	0.17
754	0.15
755	0.11
756	0.15
757	0.18
758	0.18
759	0.17
760	0.17
761	0.16
762	0.15
763	0.14
764	0.1
765	0.09
766	0.09
767	0.07
768	0.07
769	0.08
770	0.09
771	0.11
772	0.11
773	0.1
774	0.11
775	0.12
776	0.13
777	0.14
778	0.17
779	0.21
780	0.26
781	0.32
782	0.33
783	0.36
784	0.39
785	0.4
786	0.39
787	0.34
788	0.28
789	0.22
790	0.22
791	0.2
792	0.15
793	0.13
794	0.11
795	0.11
796	0.09
797	0.09
798	0.08
799	0.08
800	0.09
801	0.1
802	0.1
803	0.1
804	0.11
805	0.11
806	0.11
807	0.11
808	0.11
809	0.09
810	0.09
811	0.08
812	0.09
813	0.08
814	0.08
815	0.11
816	0.11
817	0.12
818	0.11
819	0.15
820	0.15
821	0.15
822	0.16
823	0.15
824	0.18
825	0.18
826	0.18
827	0.17
828	0.22
829	0.24
830	0.23
831	0.26
832	0.26
833	0.31
834	0.38
835	0.38
836	0.39
837	0.42
838	0.47
839	0.47
840	0.47
841	0.45
842	0.39
843	0.38
844	0.33
845	0.35
846	0.32
847	0.28
848	0.27
849	0.25
850	0.24
851	0.25
852	0.25
853	0.2
854	0.19
855	0.17
856	0.18
857	0.16
858	0.17
859	0.19
860	0.18
861	0.17
862	0.18
863	0.18
864	0.18
865	0.19
866	0.17
867	0.15
868	0.17
869	0.17
870	0.15
871	0.15
872	0.15
873	0.14
874	0.15
875	0.17
876	0.15
877	0.14
878	0.13
879	0.13
880	0.13
881	0.14
882	0.16
883	0.17
884	0.17
885	0.18
886	0.16
887	0.16
888	0.17
889	0.18
890	0.16
891	0.13
892	0.14
893	0.16
894	0.17
895	0.16
896	0.16
897	0.13
898	0.18
899	0.2
900	0.22
901	0.22
902	0.24
903	0.27
904	0.3
905	0.31
906	0.32
907	0.34
908	0.37
909	0.4
910	0.43
911	0.41
912	0.4
913	0.38
914	0.37
915	0.33
916	0.28
917	0.24
918	0.21
919	0.21
920	0.24
921	0.24
922	0.21
923	0.2
924	0.18
925	0.17
926	0.18
927	0.18
928	0.14
929	0.16
930	0.15
931	0.15
932	0.14
933	0.14
934	0.11
935	0.1
936	0.1
937	0.09
938	0.08
939	0.08
940	0.09
941	0.09
942	0.09
943	0.1
944	0.09
945	0.08
946	0.08
947	0.08
948	0.07
949	0.07
950	0.07
951	0.06
952	0.06
953	0.06
954	0.06
955	0.05
956	0.05
957	0.05
958	0.06
959	0.06
960	0.07
961	0.07
962	0.07
963	0.1
964	0.14
965	0.17
966	0.23
967	0.25
968	0.25
969	0.27
970	0.3
971	0.36
972	0.42
973	0.45
974	0.44
975	0.42
976	0.48
977	0.46
978	0.47
979	0.43
980	0.37
981	0.34
982	0.31
983	0.32
984	0.29
985	0.28
986	0.26
987	0.24
988	0.25
989	0.25
990	0.26
991	0.31
992	0.36
993	0.39
994	0.4
995	0.4
996	0.38
997	0.37
998	0.45
999	0.38
1000	0.37
1001	0.36
1002	0.37
1003	0.38
1004	0.42
1005	0.4
1006	0.32
1007	0.34
1008	0.36
1009	0.41
1010	0.47
1011	0.47
1012	0.43
1013	0.42
1014	0.44
1015	0.43
1016	0.38
1017	0.36
1018	0.33
1019	0.34
1020	0.32
1021	0.31
1022	0.28
1023	0.28
1024	0.33
1025	0.32
1026	0.29
1027	0.29
1028	0.38
1029	0.46
1030	0.54
1031	0.61
1032	0.65
1033	0.64
1034	0.68
1035	0.68
1036	0.66
1037	0.67
1038	0.63
1039	0.58
1040	0.55
1041	0.58
1042	0.58
1043	0.61
1044	0.6
1045	0.6
1046	0.62
1047	0.64
1048	0.6
1049	0.56
1050	0.58
1051	0.6
1052	0.61
1053	0.63
1054	0.65
1055	0.61
1056	0.61
1057	0.63
1058	0.63
1059	0.59
1060	0.57
1061	0.53
1062	0.53
1063	0.55
1064	0.56
1065	0.56
1066	0.52
1067	0.45
1068	0.39
1069	0.36
1070	0.28
1071	0.24
1072	0.21
1073	0.17
1074	0.14
1075	0.14
1076	0.14
1077	0.14
1078	0.13
1079	0.12
1080	0.12
1081	0.11
1082	0.15
1083	0.2
1084	0.28
1085	0.35
1086	0.38

A0A409VLM1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer