Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409VLL0

Protein Details
Accession A0A409VLL0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
214-239LEQGSQKRKGRPARREKGKKARAALDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
220-235KRKGRPARREKGKKAR
Subcellular Location(s) mito 9, nucl 6, cyto 6, cyto_nucl 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019188  SNAPC1  
Pfam View protein in Pfam  
PF09808  SNAPC1  
Amino Acid Sequences MSLAPTPSTSRGDVVLQPNYFTSSVYVKALRDDISTLVFRFHEAFSQPGCTKPFALFKAVWLSLGWNWLQFKVFDSRSRHTFLDVTLRLFLERTVKTEAPFTRVVALFGMYVFYYTQIKDTFPALYSITNIPIPCGTYCVLHPGIVLKTSVVQITMPDSLTNAHTLPLQPYARYVLSCLQRDLVFHIFPKSDLGAANPRELPREIFTEDGMAFLEQGSQKRKGRPARREKGKKARAALDNLEKWTAEDEQGSSEIDKALSEYTNSKATMLGADGTRLPKGSVEKVGEIVVARLKETQESEVQDDGDMIPRLEEILEGQPAGIFGLVTH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.37
3 0.34
4 0.33
5 0.33
6 0.34
7 0.31
8 0.25
9 0.21
10 0.17
11 0.19
12 0.21
13 0.23
14 0.2
15 0.23
16 0.25
17 0.24
18 0.22
19 0.21
20 0.19
21 0.2
22 0.21
23 0.19
24 0.19
25 0.17
26 0.17
27 0.18
28 0.17
29 0.17
30 0.17
31 0.2
32 0.19
33 0.26
34 0.25
35 0.27
36 0.29
37 0.27
38 0.27
39 0.28
40 0.34
41 0.29
42 0.33
43 0.28
44 0.29
45 0.34
46 0.33
47 0.29
48 0.22
49 0.22
50 0.19
51 0.21
52 0.19
53 0.15
54 0.16
55 0.16
56 0.17
57 0.15
58 0.17
59 0.21
60 0.24
61 0.28
62 0.34
63 0.38
64 0.41
65 0.45
66 0.43
67 0.38
68 0.36
69 0.31
70 0.34
71 0.3
72 0.28
73 0.25
74 0.25
75 0.23
76 0.22
77 0.21
78 0.18
79 0.17
80 0.18
81 0.23
82 0.23
83 0.24
84 0.3
85 0.3
86 0.28
87 0.29
88 0.26
89 0.25
90 0.24
91 0.24
92 0.17
93 0.17
94 0.12
95 0.11
96 0.11
97 0.06
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.07
102 0.07
103 0.1
104 0.1
105 0.1
106 0.11
107 0.12
108 0.12
109 0.11
110 0.13
111 0.11
112 0.11
113 0.12
114 0.12
115 0.12
116 0.13
117 0.12
118 0.11
119 0.11
120 0.12
121 0.1
122 0.11
123 0.1
124 0.09
125 0.1
126 0.14
127 0.14
128 0.13
129 0.13
130 0.13
131 0.13
132 0.13
133 0.12
134 0.08
135 0.08
136 0.09
137 0.09
138 0.07
139 0.06
140 0.06
141 0.08
142 0.08
143 0.08
144 0.07
145 0.07
146 0.08
147 0.08
148 0.09
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.08
153 0.09
154 0.13
155 0.13
156 0.12
157 0.13
158 0.15
159 0.15
160 0.14
161 0.15
162 0.15
163 0.2
164 0.21
165 0.21
166 0.2
167 0.2
168 0.2
169 0.22
170 0.2
171 0.15
172 0.15
173 0.16
174 0.15
175 0.15
176 0.15
177 0.12
178 0.1
179 0.09
180 0.11
181 0.16
182 0.17
183 0.19
184 0.2
185 0.2
186 0.22
187 0.22
188 0.22
189 0.17
190 0.19
191 0.18
192 0.17
193 0.17
194 0.16
195 0.16
196 0.14
197 0.12
198 0.08
199 0.07
200 0.06
201 0.09
202 0.08
203 0.12
204 0.16
205 0.22
206 0.27
207 0.32
208 0.41
209 0.48
210 0.57
211 0.65
212 0.72
213 0.76
214 0.83
215 0.88
216 0.91
217 0.92
218 0.9
219 0.86
220 0.8
221 0.78
222 0.72
223 0.67
224 0.62
225 0.6
226 0.54
227 0.5
228 0.45
229 0.36
230 0.31
231 0.27
232 0.22
233 0.14
234 0.12
235 0.11
236 0.12
237 0.13
238 0.13
239 0.11
240 0.11
241 0.1
242 0.09
243 0.09
244 0.08
245 0.09
246 0.09
247 0.1
248 0.11
249 0.14
250 0.17
251 0.18
252 0.17
253 0.16
254 0.16
255 0.15
256 0.14
257 0.14
258 0.1
259 0.12
260 0.14
261 0.15
262 0.15
263 0.15
264 0.14
265 0.15
266 0.19
267 0.22
268 0.27
269 0.28
270 0.29
271 0.3
272 0.3
273 0.27
274 0.23
275 0.21
276 0.18
277 0.15
278 0.14
279 0.15
280 0.16
281 0.18
282 0.2
283 0.22
284 0.23
285 0.26
286 0.29
287 0.28
288 0.28
289 0.25
290 0.23
291 0.2
292 0.21
293 0.18
294 0.15
295 0.13
296 0.13
297 0.13
298 0.12
299 0.12
300 0.09
301 0.12
302 0.13
303 0.13
304 0.13
305 0.13
306 0.13
307 0.13
308 0.1