FuNGI

A0A409VPN4

Protein Details

Accession

A0A409VPN4

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
801-820	LYCTLKQDSNHKKSKSRDLL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 14.5, cyto_nucl 10, mito 7, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR000210 BTB/POZ_dom IPR036898 RNA_pol_Rpb7-like_N_sf IPR041901 RNAP_I_Rpa43_N IPR041178 RPA43_OB IPR045113 Rpb7-like IPR011333 SKP1/BTB/POZ_sf
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0006352 P:DNA-templated transcription initiation
Pfam	View protein in Pfam PF00651 BTB PF17875 RPA43_OB
PROSITE	View protein in PROSITE PS50097 BTB
CDD	cd18186 BTB_POZ_ZBTB_KLHL-like cd04328 RNAP_I_Rpa43_N

Amino Acid Sequences

MSPSKRKVDSSVHPPNKKLKDSHVADGEFKLVHASIVLSIPPVFAANPTAGAHEMLDSMIMRYIPSLKGVVLSHSNLQFVDKVASIQGDCPFLVCTTSFDATVWSPRVGLSLSGKVNLCSPDHISLLVHRTFNVSIPRHHIPTDIWEFEYGPVENDPEYGKVDGKEEQDATVAEDGHEIDYSSGGKWVNRVTGEVLGSRDGLLEFTVIGLTVANEMLSLLGSLQPDPFSPRHTIQHDNTKTQKEDEGSSESEESEVDEGSSSESESDDVDDDESDIDTLQSLGKRKDLDDASKSVGRHSYLLTTMSTNPSHILIARNSRGLNNPSASLSSPTETHAAASGIFRSSGSPPWLFEDCETDDIESELSAEEDEEAIEINETFTKNCRFPGTVKIVVESTTFWAHKEILFFASPFFEAALSGNWAETGRPLSMSSIATISQSRSQKAETMPRHTSVGTSTDPDEAIASPATDASSDFDEMELVIEFDSSKDEISSHNQDVSESEKAKQRQDSLANLQGSSKYHSRRAASSSSMRTRADPLSPSKSIAGAQAIVHRNPRNGPDAVIVLKEEKASTFHDFLKFIYPQMECTITWNNVGSLMNISHKLSVPSLQNECLTFLLTHAAGKPIKAMRIAEIFQEEELYRESSRFVLDNPGGWTEHELNTLTQETLLKLEKRRNWFLERVLKLGLTMVAKEYQCCPTCPDSVVCAKLLEEKWRQAYHAVFRFGPPQPSMVFRYLRMLEGVSPALALTHTACQASAKAFVATLFDRMFSLGIRGGGADAVPLGGRVAVAAATATVNGPRRHFLYCTLKQDSNHKKSKSRDLL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.73
2	0.77
3	0.76
4	0.74
5	0.69
6	0.66
7	0.66
8	0.66
9	0.69
10	0.67
11	0.61
12	0.56
13	0.53
14	0.46
15	0.35
16	0.3
17	0.24
18	0.15
19	0.13
20	0.11
21	0.1
22	0.09
23	0.1
24	0.11
25	0.1
26	0.1
27	0.1
28	0.1
29	0.1
30	0.08
31	0.08
32	0.1
33	0.1
34	0.12
35	0.13
36	0.14
37	0.14
38	0.14
39	0.14
40	0.12
41	0.12
42	0.09
43	0.1
44	0.08
45	0.08
46	0.09
47	0.09
48	0.08
49	0.1
50	0.13
51	0.13
52	0.14
53	0.15
54	0.13
55	0.17
56	0.18
57	0.2
58	0.21
59	0.23
60	0.27
61	0.27
62	0.28
63	0.24
64	0.25
65	0.22
66	0.19
67	0.19
68	0.14
69	0.14
70	0.14
71	0.15
72	0.14
73	0.17
74	0.18
75	0.17
76	0.16
77	0.16
78	0.16
79	0.15
80	0.16
81	0.13
82	0.13
83	0.16
84	0.17
85	0.17
86	0.16
87	0.18
88	0.18
89	0.23
90	0.23
91	0.19
92	0.18
93	0.17
94	0.19
95	0.17
96	0.19
97	0.17
98	0.21
99	0.22
100	0.26
101	0.26
102	0.25
103	0.28
104	0.28
105	0.24
106	0.21
107	0.23
108	0.22
109	0.23
110	0.23
111	0.2
112	0.21
113	0.26
114	0.27
115	0.23
116	0.2
117	0.23
118	0.23
119	0.26
120	0.31
121	0.28
122	0.28
123	0.35
124	0.39
125	0.38
126	0.38
127	0.36
128	0.28
129	0.34
130	0.38
131	0.33
132	0.29
133	0.28
134	0.28
135	0.27
136	0.29
137	0.21
138	0.15
139	0.14
140	0.14
141	0.13
142	0.13
143	0.13
144	0.11
145	0.13
146	0.13
147	0.15
148	0.14
149	0.16
150	0.2
151	0.21
152	0.23
153	0.22
154	0.21
155	0.2
156	0.19
157	0.19
158	0.17
159	0.15
160	0.11
161	0.11
162	0.11
163	0.11
164	0.1
165	0.08
166	0.07
167	0.07
168	0.08
169	0.08
170	0.1
171	0.1
172	0.1
173	0.13
174	0.15
175	0.18
176	0.18
177	0.19
178	0.18
179	0.2
180	0.21
181	0.2
182	0.19
183	0.16
184	0.16
185	0.14
186	0.13
187	0.1
188	0.09
189	0.07
190	0.06
191	0.05
192	0.05
193	0.05
194	0.04
195	0.04
196	0.04
197	0.04
198	0.04
199	0.04
200	0.04
201	0.04
202	0.04
203	0.04
204	0.04
205	0.04
206	0.03
207	0.05
208	0.06
209	0.07
210	0.07
211	0.08
212	0.08
213	0.13
214	0.14
215	0.15
216	0.2
217	0.23
218	0.29
219	0.33
220	0.4
221	0.4
222	0.5
223	0.51
224	0.53
225	0.56
226	0.55
227	0.52
228	0.47
229	0.45
230	0.36
231	0.34
232	0.31
233	0.29
234	0.25
235	0.25
236	0.24
237	0.2
238	0.18
239	0.15
240	0.13
241	0.09
242	0.07
243	0.06
244	0.05
245	0.05
246	0.06
247	0.07
248	0.06
249	0.05
250	0.06
251	0.06
252	0.06
253	0.07
254	0.06
255	0.06
256	0.07
257	0.06
258	0.07
259	0.07
260	0.06
261	0.06
262	0.05
263	0.04
264	0.04
265	0.04
266	0.06
267	0.08
268	0.12
269	0.13
270	0.16
271	0.17
272	0.17
273	0.24
274	0.26
275	0.29
276	0.29
277	0.31
278	0.32
279	0.34
280	0.33
281	0.28
282	0.27
283	0.23
284	0.21
285	0.19
286	0.17
287	0.15
288	0.16
289	0.15
290	0.14
291	0.14
292	0.17
293	0.16
294	0.14
295	0.14
296	0.13
297	0.13
298	0.12
299	0.14
300	0.13
301	0.19
302	0.2
303	0.22
304	0.22
305	0.23
306	0.26
307	0.26
308	0.27
309	0.22
310	0.21
311	0.19
312	0.2
313	0.19
314	0.17
315	0.16
316	0.13
317	0.13
318	0.13
319	0.14
320	0.13
321	0.12
322	0.1
323	0.09
324	0.09
325	0.09
326	0.08
327	0.07
328	0.07
329	0.07
330	0.08
331	0.09
332	0.11
333	0.14
334	0.14
335	0.14
336	0.18
337	0.19
338	0.18
339	0.17
340	0.18
341	0.16
342	0.17
343	0.17
344	0.13
345	0.12
346	0.12
347	0.11
348	0.07
349	0.06
350	0.04
351	0.04
352	0.04
353	0.03
354	0.03
355	0.03
356	0.03
357	0.03
358	0.03
359	0.03
360	0.03
361	0.03
362	0.03
363	0.05
364	0.05
365	0.06
366	0.09
367	0.12
368	0.12
369	0.14
370	0.16
371	0.16
372	0.18
373	0.26
374	0.3
375	0.31
376	0.3
377	0.3
378	0.27
379	0.26
380	0.25
381	0.17
382	0.12
383	0.11
384	0.11
385	0.1
386	0.11
387	0.11
388	0.12
389	0.12
390	0.11
391	0.1
392	0.11
393	0.1
394	0.09
395	0.1
396	0.09
397	0.08
398	0.07
399	0.05
400	0.05
401	0.05
402	0.05
403	0.05
404	0.05
405	0.05
406	0.05
407	0.05
408	0.05
409	0.05
410	0.07
411	0.06
412	0.06
413	0.07
414	0.07
415	0.09
416	0.09
417	0.09
418	0.08
419	0.08
420	0.09
421	0.09
422	0.1
423	0.14
424	0.16
425	0.16
426	0.17
427	0.17
428	0.2
429	0.23
430	0.31
431	0.29
432	0.34
433	0.36
434	0.36
435	0.36
436	0.33
437	0.3
438	0.22
439	0.21
440	0.15
441	0.14
442	0.14
443	0.13
444	0.13
445	0.12
446	0.12
447	0.08
448	0.08
449	0.07
450	0.06
451	0.05
452	0.05
453	0.05
454	0.05
455	0.05
456	0.05
457	0.06
458	0.07
459	0.07
460	0.07
461	0.07
462	0.06
463	0.07
464	0.05
465	0.04
466	0.04
467	0.04
468	0.04
469	0.04
470	0.05
471	0.05
472	0.05
473	0.05
474	0.05
475	0.07
476	0.13
477	0.18
478	0.18
479	0.2
480	0.19
481	0.19
482	0.2
483	0.22
484	0.21
485	0.17
486	0.19
487	0.23
488	0.26
489	0.3
490	0.32
491	0.31
492	0.33
493	0.35
494	0.38
495	0.38
496	0.42
497	0.38
498	0.35
499	0.33
500	0.28
501	0.26
502	0.24
503	0.24
504	0.2
505	0.25
506	0.3
507	0.32
508	0.33
509	0.36
510	0.36
511	0.36
512	0.39
513	0.41
514	0.41
515	0.43
516	0.41
517	0.37
518	0.38
519	0.35
520	0.32
521	0.28
522	0.28
523	0.31
524	0.31
525	0.31
526	0.28
527	0.26
528	0.24
529	0.21
530	0.17
531	0.12
532	0.12
533	0.18
534	0.2
535	0.2
536	0.26
537	0.26
538	0.27
539	0.28
540	0.3
541	0.28
542	0.26
543	0.26
544	0.22
545	0.22
546	0.21
547	0.19
548	0.17
549	0.13
550	0.13
551	0.12
552	0.1
553	0.09
554	0.1
555	0.13
556	0.17
557	0.18
558	0.21
559	0.23
560	0.24
561	0.24
562	0.28
563	0.25
564	0.22
565	0.23
566	0.2
567	0.19
568	0.21
569	0.22
570	0.16
571	0.2
572	0.24
573	0.2
574	0.21
575	0.2
576	0.18
577	0.18
578	0.18
579	0.15
580	0.12
581	0.12
582	0.13
583	0.14
584	0.15
585	0.14
586	0.14
587	0.15
588	0.14
589	0.18
590	0.19
591	0.23
592	0.25
593	0.25
594	0.26
595	0.25
596	0.26
597	0.22
598	0.19
599	0.14
600	0.12
601	0.12
602	0.11
603	0.11
604	0.11
605	0.15
606	0.14
607	0.14
608	0.19
609	0.19
610	0.21
611	0.22
612	0.22
613	0.21
614	0.25
615	0.26
616	0.23
617	0.23
618	0.21
619	0.19
620	0.2
621	0.16
622	0.13
623	0.14
624	0.14
625	0.12
626	0.12
627	0.13
628	0.12
629	0.14
630	0.13
631	0.12
632	0.18
633	0.18
634	0.21
635	0.22
636	0.23
637	0.22
638	0.21
639	0.25
640	0.2
641	0.21
642	0.2
643	0.19
644	0.17
645	0.19
646	0.2
647	0.16
648	0.14
649	0.14
650	0.12
651	0.15
652	0.2
653	0.22
654	0.26
655	0.34
656	0.4
657	0.47
658	0.54
659	0.57
660	0.59
661	0.6
662	0.63
663	0.65
664	0.61
665	0.55
666	0.49
667	0.42
668	0.36
669	0.31
670	0.25
671	0.16
672	0.14
673	0.13
674	0.17
675	0.17
676	0.19
677	0.21
678	0.25
679	0.26
680	0.27
681	0.3
682	0.29
683	0.32
684	0.33
685	0.32
686	0.3
687	0.34
688	0.34
689	0.3
690	0.26
691	0.24
692	0.29
693	0.29
694	0.33
695	0.33
696	0.37
697	0.42
698	0.43
699	0.44
700	0.41
701	0.45
702	0.46
703	0.47
704	0.45
705	0.39
706	0.4
707	0.45
708	0.44
709	0.43
710	0.34
711	0.3
712	0.27
713	0.31
714	0.34
715	0.33
716	0.32
717	0.28
718	0.34
719	0.33
720	0.32
721	0.29
722	0.25
723	0.21
724	0.22
725	0.22
726	0.14
727	0.13
728	0.12
729	0.11
730	0.09
731	0.09
732	0.08
733	0.1
734	0.11
735	0.12
736	0.12
737	0.13
738	0.15
739	0.16
740	0.17
741	0.16
742	0.15
743	0.15
744	0.15
745	0.18
746	0.17
747	0.19
748	0.16
749	0.15
750	0.15
751	0.16
752	0.16
753	0.12
754	0.14
755	0.12
756	0.12
757	0.12
758	0.11
759	0.11
760	0.11
761	0.1
762	0.08
763	0.06
764	0.06
765	0.05
766	0.05
767	0.05
768	0.05
769	0.05
770	0.04
771	0.05
772	0.04
773	0.05
774	0.04
775	0.05
776	0.05
777	0.06
778	0.06
779	0.11
780	0.18
781	0.21
782	0.24
783	0.27
784	0.3
785	0.33
786	0.34
787	0.39
788	0.43
789	0.48
790	0.54
791	0.57
792	0.59
793	0.58
794	0.67
795	0.69
796	0.69
797	0.7
798	0.68
799	0.69
800	0.73

A0A409VPN4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer