FuNGI

A0A409XQD4

Protein Details

Accession

A0A409XQD4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
258-284	QGGKNARKAKSKKKCTNCSKNGHEKSD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
252-271	AKGKGSQGGKNARKAKSKKK

Subcellular Location(s)

nucl 19, cyto_nucl 13, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013103 RVT_2 IPR001878 Znf_CCHC
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding
Pfam	View protein in Pfam PF14223 Retrotran_gag_2 PF07727 RVT_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50158 ZF_CCHC

Amino Acid Sequences

MGPEDANINMSSSNNLKVLNLLKLQDDSSNWVTYKARIVNNLTSKGLARHLNGNVRKLDELREDEGKWFLGDLKTPLTESQLDEHESKIDAYEQKQAQVREAIYETVSKSAFLEIKGEATAAAMWRKLTTMHEKKGTMTYTDTLAKLASSRYVEGSNMRTHISGMLELREKLADMGNALNDGLFSAYLKTSLSPDYCPLLTSLNASSKASGNVLSIHDLINFIYEEVDNKEAEKNVDEAKENVALAASHRDAKGKGSQGGKNARKAKSKKKCTNCSKNGHEKSDCYAEGGGKADQAPEWWKKQVAKGKAKTANTATEDNDDASFLVEINDTPTEGPDTQQSNEPTNVSNVSKAPENDLTQSAPFLPPPKSTSSPILTYPHENLTNSDSSNDGEEHSNRPKRSRPAAGFYSSKNQTKIGENAGMLAHMQEVEDDTSTEDFLTAQVLKSLVEDALAAGGYDAPTADEALFRDIPPNLAHLDPSQLVCRLWRPLYGSKQGAYRFYQFMSETLNKLGLTVSKSDDALFYRFNEDGTYIIIRAATDDFTIVGDCDATTDAFLDALEKHVELVRLGPINWLLGTSVEQDFDKHTIKLGQEAFIDQIATKFGQQNAHPITTPLPPNIDLSHGLQHVSPQLATPAEKTR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.18
2	0.18
3	0.18
4	0.22
5	0.25
6	0.28
7	0.29
8	0.27
9	0.27
10	0.29
11	0.3
12	0.28
13	0.25
14	0.27
15	0.27
16	0.29
17	0.27
18	0.29
19	0.29
20	0.29
21	0.35
22	0.36
23	0.36
24	0.38
25	0.43
26	0.49
27	0.55
28	0.57
29	0.5
30	0.44
31	0.42
32	0.39
33	0.39
34	0.34
35	0.29
36	0.32
37	0.38
38	0.46
39	0.49
40	0.52
41	0.49
42	0.48
43	0.48
44	0.42
45	0.41
46	0.39
47	0.39
48	0.38
49	0.39
50	0.38
51	0.37
52	0.37
53	0.32
54	0.25
55	0.2
56	0.19
57	0.16
58	0.18
59	0.18
60	0.2
61	0.2
62	0.21
63	0.21
64	0.21
65	0.22
66	0.21
67	0.22
68	0.22
69	0.25
70	0.24
71	0.24
72	0.22
73	0.21
74	0.19
75	0.16
76	0.18
77	0.19
78	0.2
79	0.28
80	0.28
81	0.32
82	0.37
83	0.37
84	0.35
85	0.36
86	0.34
87	0.29
88	0.29
89	0.25
90	0.22
91	0.23
92	0.21
93	0.19
94	0.19
95	0.15
96	0.14
97	0.17
98	0.18
99	0.16
100	0.17
101	0.14
102	0.16
103	0.15
104	0.15
105	0.11
106	0.09
107	0.1
108	0.1
109	0.11
110	0.11
111	0.11
112	0.11
113	0.12
114	0.13
115	0.17
116	0.26
117	0.33
118	0.39
119	0.45
120	0.46
121	0.48
122	0.52
123	0.48
124	0.4
125	0.34
126	0.28
127	0.26
128	0.28
129	0.26
130	0.2
131	0.19
132	0.17
133	0.14
134	0.14
135	0.14
136	0.13
137	0.14
138	0.15
139	0.16
140	0.17
141	0.2
142	0.22
143	0.21
144	0.21
145	0.21
146	0.19
147	0.19
148	0.19
149	0.17
150	0.16
151	0.14
152	0.16
153	0.17
154	0.17
155	0.17
156	0.15
157	0.14
158	0.13
159	0.13
160	0.1
161	0.09
162	0.1
163	0.09
164	0.1
165	0.09
166	0.08
167	0.06
168	0.06
169	0.05
170	0.04
171	0.04
172	0.05
173	0.05
174	0.06
175	0.06
176	0.07
177	0.08
178	0.11
179	0.13
180	0.13
181	0.15
182	0.17
183	0.17
184	0.17
185	0.16
186	0.15
187	0.14
188	0.14
189	0.15
190	0.16
191	0.18
192	0.17
193	0.18
194	0.17
195	0.18
196	0.17
197	0.15
198	0.11
199	0.12
200	0.13
201	0.13
202	0.13
203	0.12
204	0.11
205	0.11
206	0.1
207	0.09
208	0.08
209	0.06
210	0.06
211	0.06
212	0.07
213	0.09
214	0.11
215	0.09
216	0.1
217	0.12
218	0.12
219	0.13
220	0.13
221	0.13
222	0.14
223	0.16
224	0.16
225	0.15
226	0.16
227	0.17
228	0.16
229	0.13
230	0.11
231	0.09
232	0.09
233	0.11
234	0.1
235	0.11
236	0.12
237	0.14
238	0.14
239	0.17
240	0.21
241	0.21
242	0.25
243	0.28
244	0.3
245	0.36
246	0.46
247	0.47
248	0.5
249	0.55
250	0.55
251	0.59
252	0.64
253	0.68
254	0.68
255	0.75
256	0.77
257	0.8
258	0.85
259	0.87
260	0.91
261	0.89
262	0.87
263	0.85
264	0.86
265	0.82
266	0.77
267	0.68
268	0.58
269	0.52
270	0.48
271	0.39
272	0.29
273	0.24
274	0.18
275	0.17
276	0.17
277	0.14
278	0.09
279	0.09
280	0.08
281	0.08
282	0.08
283	0.12
284	0.14
285	0.16
286	0.17
287	0.2
288	0.21
289	0.28
290	0.34
291	0.39
292	0.46
293	0.48
294	0.55
295	0.59
296	0.58
297	0.55
298	0.5
299	0.46
300	0.39
301	0.36
302	0.28
303	0.23
304	0.23
305	0.2
306	0.17
307	0.12
308	0.09
309	0.07
310	0.07
311	0.05
312	0.05
313	0.04
314	0.04
315	0.06
316	0.05
317	0.05
318	0.05
319	0.06
320	0.07
321	0.07
322	0.08
323	0.1
324	0.13
325	0.13
326	0.18
327	0.2
328	0.2
329	0.21
330	0.21
331	0.18
332	0.17
333	0.19
334	0.14
335	0.14
336	0.12
337	0.13
338	0.14
339	0.14
340	0.16
341	0.17
342	0.18
343	0.18
344	0.19
345	0.18
346	0.16
347	0.16
348	0.13
349	0.11
350	0.1
351	0.12
352	0.12
353	0.13
354	0.16
355	0.21
356	0.23
357	0.25
358	0.29
359	0.29
360	0.29
361	0.3
362	0.31
363	0.27
364	0.27
365	0.26
366	0.25
367	0.23
368	0.22
369	0.2
370	0.21
371	0.2
372	0.18
373	0.17
374	0.14
375	0.12
376	0.14
377	0.12
378	0.1
379	0.11
380	0.12
381	0.17
382	0.25
383	0.31
384	0.31
385	0.35
386	0.41
387	0.46
388	0.52
389	0.57
390	0.52
391	0.54
392	0.57
393	0.58
394	0.53
395	0.47
396	0.48
397	0.43
398	0.41
399	0.35
400	0.32
401	0.3
402	0.32
403	0.33
404	0.28
405	0.26
406	0.23
407	0.23
408	0.21
409	0.19
410	0.15
411	0.12
412	0.08
413	0.05
414	0.05
415	0.04
416	0.05
417	0.05
418	0.06
419	0.06
420	0.07
421	0.07
422	0.07
423	0.07
424	0.06
425	0.06
426	0.05
427	0.07
428	0.07
429	0.06
430	0.07
431	0.08
432	0.08
433	0.08
434	0.09
435	0.07
436	0.06
437	0.06
438	0.05
439	0.05
440	0.05
441	0.04
442	0.04
443	0.04
444	0.04
445	0.04
446	0.04
447	0.04
448	0.04
449	0.05
450	0.05
451	0.06
452	0.06
453	0.11
454	0.12
455	0.12
456	0.14
457	0.14
458	0.15
459	0.15
460	0.16
461	0.13
462	0.13
463	0.14
464	0.12
465	0.15
466	0.15
467	0.15
468	0.16
469	0.15
470	0.15
471	0.16
472	0.18
473	0.21
474	0.2
475	0.22
476	0.26
477	0.32
478	0.4
479	0.45
480	0.45
481	0.42
482	0.46
483	0.46
484	0.44
485	0.4
486	0.37
487	0.32
488	0.29
489	0.31
490	0.26
491	0.24
492	0.27
493	0.26
494	0.23
495	0.23
496	0.24
497	0.2
498	0.2
499	0.2
500	0.16
501	0.15
502	0.16
503	0.17
504	0.17
505	0.17
506	0.18
507	0.19
508	0.18
509	0.19
510	0.18
511	0.17
512	0.19
513	0.19
514	0.19
515	0.17
516	0.15
517	0.13
518	0.14
519	0.14
520	0.11
521	0.11
522	0.11
523	0.1
524	0.11
525	0.12
526	0.1
527	0.09
528	0.09
529	0.08
530	0.08
531	0.09
532	0.08
533	0.07
534	0.06
535	0.06
536	0.06
537	0.07
538	0.07
539	0.06
540	0.07
541	0.07
542	0.07
543	0.07
544	0.07
545	0.07
546	0.09
547	0.1
548	0.09
549	0.1
550	0.12
551	0.13
552	0.12
553	0.14
554	0.16
555	0.17
556	0.17
557	0.19
558	0.17
559	0.18
560	0.17
561	0.16
562	0.11
563	0.1
564	0.12
565	0.13
566	0.13
567	0.13
568	0.13
569	0.14
570	0.17
571	0.2
572	0.22
573	0.18
574	0.2
575	0.24
576	0.24
577	0.31
578	0.3
579	0.28
580	0.27
581	0.28
582	0.26
583	0.22
584	0.22
585	0.15
586	0.14
587	0.13
588	0.13
589	0.14
590	0.17
591	0.2
592	0.25
593	0.26
594	0.35
595	0.38
596	0.4
597	0.38
598	0.35
599	0.34
600	0.35
601	0.38
602	0.31
603	0.29
604	0.28
605	0.3
606	0.3
607	0.31
608	0.26
609	0.26
610	0.3
611	0.26
612	0.26
613	0.23
614	0.25
615	0.25
616	0.25
617	0.21
618	0.16
619	0.19
620	0.2
621	0.21

A0A409XQD4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer