Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4R4Y6

Protein Details
Accession C4R4Y6    Localization Confidence High Confidence Score 16.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
31-51GLKFKPKLVARRTKEERDKSABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
30-46TGLKFKPKLVARRTKEE
62-77RRKTRGTVTRGRGRGR
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007811  RPC4  
Gene Ontology GO:0005666  C:RNA polymerase III complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006383  P:transcription by RNA polymerase III  
KEGG ppa:PAS_chr3_0574  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05132  RNA_pol_Rpc4  
Amino Acid Sequences MSDDSNLNRLDSISRRTTPVGNESNASKKTGLKFKPKLVARRTKEERDKSAPVVVESQDPMRRKTRGTVTRGRGRGRGAPAGTHMVVAGPLSHGVQGHVGGDSRTRSTPLPSSTASTSEALKKLHGKSGSDDEFEVDDTTVIDVNTKFELNQDTELFPVRAPRVEHQENGEADVKIETDPNLLPGNTTTSREVSLKPEPMSDDETGAFTATPLEIKEQSATPEPISSLDPLQEKEEKSKLTKDYEHIKQLMEQMNVSKDDDGDVSMEPQSLPKPLFFQLPNTLPTFEGVGSEMHNLNGIIGSLRVHKSGRTTVKIGNVIMDVAEGGKSPVFQELIAINHDKKEIYNLGSVENKLIVTPSI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.38
3 0.4
4 0.43
5 0.43
6 0.47
7 0.46
8 0.41
9 0.41
10 0.42
11 0.47
12 0.44
13 0.42
14 0.35
15 0.34
16 0.4
17 0.47
18 0.51
19 0.54
20 0.6
21 0.65
22 0.73
23 0.74
24 0.77
25 0.77
26 0.8
27 0.75
28 0.79
29 0.79
30 0.8
31 0.83
32 0.82
33 0.8
34 0.77
35 0.75
36 0.67
37 0.65
38 0.55
39 0.47
40 0.42
41 0.35
42 0.3
43 0.26
44 0.28
45 0.29
46 0.29
47 0.32
48 0.34
49 0.35
50 0.35
51 0.41
52 0.47
53 0.5
54 0.56
55 0.62
56 0.65
57 0.72
58 0.76
59 0.71
60 0.65
61 0.59
62 0.58
63 0.53
64 0.51
65 0.42
66 0.37
67 0.37
68 0.37
69 0.33
70 0.26
71 0.21
72 0.14
73 0.13
74 0.12
75 0.09
76 0.05
77 0.05
78 0.06
79 0.06
80 0.06
81 0.07
82 0.08
83 0.08
84 0.08
85 0.08
86 0.08
87 0.07
88 0.1
89 0.11
90 0.12
91 0.13
92 0.14
93 0.15
94 0.18
95 0.23
96 0.24
97 0.26
98 0.25
99 0.27
100 0.26
101 0.27
102 0.26
103 0.21
104 0.21
105 0.21
106 0.23
107 0.2
108 0.22
109 0.26
110 0.25
111 0.3
112 0.3
113 0.27
114 0.28
115 0.35
116 0.35
117 0.3
118 0.29
119 0.24
120 0.22
121 0.21
122 0.18
123 0.1
124 0.08
125 0.07
126 0.07
127 0.07
128 0.06
129 0.07
130 0.07
131 0.08
132 0.09
133 0.09
134 0.08
135 0.09
136 0.12
137 0.12
138 0.14
139 0.14
140 0.13
141 0.14
142 0.15
143 0.14
144 0.12
145 0.14
146 0.12
147 0.14
148 0.15
149 0.17
150 0.24
151 0.26
152 0.27
153 0.26
154 0.31
155 0.28
156 0.29
157 0.29
158 0.21
159 0.19
160 0.18
161 0.15
162 0.1
163 0.11
164 0.08
165 0.06
166 0.06
167 0.08
168 0.09
169 0.08
170 0.08
171 0.08
172 0.13
173 0.12
174 0.14
175 0.14
176 0.13
177 0.15
178 0.16
179 0.17
180 0.17
181 0.2
182 0.22
183 0.22
184 0.22
185 0.22
186 0.22
187 0.25
188 0.21
189 0.17
190 0.14
191 0.14
192 0.13
193 0.12
194 0.1
195 0.06
196 0.06
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.07
201 0.07
202 0.08
203 0.1
204 0.1
205 0.12
206 0.15
207 0.16
208 0.14
209 0.14
210 0.14
211 0.14
212 0.14
213 0.13
214 0.1
215 0.12
216 0.13
217 0.14
218 0.17
219 0.19
220 0.19
221 0.23
222 0.26
223 0.26
224 0.28
225 0.33
226 0.34
227 0.35
228 0.38
229 0.38
230 0.43
231 0.46
232 0.49
233 0.45
234 0.41
235 0.38
236 0.41
237 0.42
238 0.34
239 0.29
240 0.25
241 0.26
242 0.27
243 0.25
244 0.19
245 0.13
246 0.13
247 0.13
248 0.11
249 0.09
250 0.08
251 0.09
252 0.09
253 0.1
254 0.09
255 0.1
256 0.1
257 0.12
258 0.13
259 0.12
260 0.15
261 0.16
262 0.22
263 0.21
264 0.25
265 0.29
266 0.32
267 0.33
268 0.32
269 0.32
270 0.26
271 0.26
272 0.23
273 0.15
274 0.13
275 0.11
276 0.1
277 0.1
278 0.12
279 0.12
280 0.1
281 0.11
282 0.1
283 0.1
284 0.09
285 0.08
286 0.06
287 0.06
288 0.07
289 0.11
290 0.13
291 0.15
292 0.16
293 0.17
294 0.22
295 0.31
296 0.38
297 0.38
298 0.41
299 0.43
300 0.49
301 0.51
302 0.46
303 0.39
304 0.32
305 0.26
306 0.23
307 0.18
308 0.11
309 0.08
310 0.08
311 0.06
312 0.06
313 0.06
314 0.07
315 0.07
316 0.1
317 0.11
318 0.1
319 0.13
320 0.14
321 0.16
322 0.19
323 0.23
324 0.21
325 0.22
326 0.24
327 0.22
328 0.2
329 0.25
330 0.26
331 0.25
332 0.29
333 0.28
334 0.31
335 0.36
336 0.36
337 0.31
338 0.27
339 0.24
340 0.19