FuNGI

A0A409WM50

Protein Details

Accession

A0A409WM50

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
517-538	DTVRNPSYHKPHRRMRLVRSVL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 14, cyto 9, mito_nucl 9

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR044641 Lsm7/SmG-like IPR010920 LSM_dom_sf IPR002885 Pentatricopeptide_repeat IPR001163 Sm_dom_euk/arc IPR034098 Sm_G IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0003723 F:RNA binding GO:0006364 P:rRNA processing GO:0000387 P:spliceosomal snRNP assembly
Pfam	View protein in Pfam PF01423 LSM
PROSITE	View protein in PROSITE PS51375 PPR
CDD	cd01719 Sm_G

Amino Acid Sequences

MSKASQPELKKFMDKKLFVHLQGGRKVSGVLRGYDLFLNLVIDDAMEESTPAQKHPIGTVVIRVICAMKRRVFSHSILRNYRTAISSLSRSYSVDFTSTLSATQQLRFKDLANALAENTTDPSYVWANYSNLLALLGSEPLPLEIHQQVLRHCTPSVPQLRRSQVQQLDSGKHDFLAPDVEVRFQTLLRNIRSIGAEPSLGDYNFIIEQFAAYGHYEGTLNVYEEIKRAGITPDHRTYGFCLRALAYRLSLPVDQYKRPALFERIQNLFKMYMDDMRNYNVPMTGLNLEVSLRIMKETLDRKELESILRRGYAVDLANLDRIPLEYTENRKDNPEPFPFTTAVLNTTLEILGMLGDVSKLVQAFEVLTQPLPQASQHFFNSFESDEEGDFGVDVDASPPFPMPSAMPNTTTYTIMLRHLCRLGHSILARHYILDARTTSKAAAIDLRLQVQCLFAKKKPLDSISAPRVAISRMTLLPAMGEANRDKNLGLIKWLTSKVPTMIQKQQQALKYYSLVFDTVRNPSYHKPHRRMRLVRSVLRSSYPGMTPEEKAKLAVQVHARPTEYTYKELFEVDIKDPPPPPTTQPSELKPFNIRLHILILKRNIIELEDLNKNLRMIYGRTVQRVKERLGRRVWQTKDIFLRTEEGRVEVTKNRWKEIVNFRTTAPDEPEIHRKRPTYFRRMSTLTIASSLREHHQHHHSRLFALPRPSPILQRHLDRSSKP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.61
2	0.56
3	0.6
4	0.63
5	0.54
6	0.59
7	0.55
8	0.53
9	0.56
10	0.56
11	0.46
12	0.4
13	0.41
14	0.34
15	0.36
16	0.3
17	0.25
18	0.27
19	0.27
20	0.28
21	0.27
22	0.26
23	0.18
24	0.16
25	0.15
26	0.11
27	0.1
28	0.08
29	0.06
30	0.06
31	0.06
32	0.06
33	0.05
34	0.06
35	0.06
36	0.12
37	0.13
38	0.13
39	0.16
40	0.18
41	0.2
42	0.21
43	0.25
44	0.23
45	0.23
46	0.27
47	0.28
48	0.27
49	0.25
50	0.24
51	0.22
52	0.22
53	0.27
54	0.3
55	0.3
56	0.34
57	0.36
58	0.42
59	0.44
60	0.45
61	0.5
62	0.52
63	0.56
64	0.57
65	0.58
66	0.55
67	0.53
68	0.52
69	0.43
70	0.36
71	0.3
72	0.28
73	0.29
74	0.28
75	0.28
76	0.26
77	0.25
78	0.26
79	0.25
80	0.22
81	0.19
82	0.17
83	0.16
84	0.18
85	0.17
86	0.15
87	0.14
88	0.17
89	0.18
90	0.22
91	0.25
92	0.23
93	0.27
94	0.27
95	0.28
96	0.3
97	0.3
98	0.3
99	0.28
100	0.28
101	0.24
102	0.24
103	0.23
104	0.16
105	0.17
106	0.13
107	0.1
108	0.1
109	0.12
110	0.13
111	0.13
112	0.14
113	0.15
114	0.15
115	0.16
116	0.16
117	0.14
118	0.12
119	0.12
120	0.1
121	0.07
122	0.07
123	0.07
124	0.06
125	0.06
126	0.06
127	0.07
128	0.08
129	0.07
130	0.11
131	0.11
132	0.14
133	0.16
134	0.18
135	0.19
136	0.26
137	0.27
138	0.25
139	0.25
140	0.23
141	0.23
142	0.3
143	0.38
144	0.36
145	0.41
146	0.47
147	0.53
148	0.55
149	0.56
150	0.56
151	0.52
152	0.5
153	0.5
154	0.47
155	0.44
156	0.44
157	0.43
158	0.34
159	0.28
160	0.26
161	0.2
162	0.15
163	0.15
164	0.12
165	0.13
166	0.13
167	0.14
168	0.14
169	0.15
170	0.15
171	0.12
172	0.15
173	0.18
174	0.24
175	0.25
176	0.26
177	0.26
178	0.27
179	0.28
180	0.27
181	0.23
182	0.18
183	0.16
184	0.14
185	0.16
186	0.16
187	0.15
188	0.14
189	0.11
190	0.11
191	0.12
192	0.11
193	0.09
194	0.06
195	0.06
196	0.06
197	0.06
198	0.06
199	0.06
200	0.06
201	0.06
202	0.07
203	0.07
204	0.06
205	0.09
206	0.08
207	0.09
208	0.09
209	0.11
210	0.1
211	0.11
212	0.12
213	0.1
214	0.09
215	0.09
216	0.1
217	0.14
218	0.18
219	0.25
220	0.27
221	0.29
222	0.29
223	0.29
224	0.31
225	0.35
226	0.33
227	0.26
228	0.23
229	0.22
230	0.25
231	0.27
232	0.24
233	0.17
234	0.15
235	0.16
236	0.17
237	0.16
238	0.14
239	0.2
240	0.22
241	0.22
242	0.24
243	0.29
244	0.27
245	0.29
246	0.31
247	0.29
248	0.31
249	0.35
250	0.38
251	0.38
252	0.38
253	0.37
254	0.35
255	0.29
256	0.24
257	0.21
258	0.16
259	0.17
260	0.18
261	0.19
262	0.18
263	0.2
264	0.2
265	0.18
266	0.18
267	0.12
268	0.11
269	0.09
270	0.11
271	0.09
272	0.09
273	0.09
274	0.08
275	0.08
276	0.08
277	0.08
278	0.07
279	0.06
280	0.05
281	0.06
282	0.06
283	0.12
284	0.17
285	0.19
286	0.23
287	0.23
288	0.25
289	0.28
290	0.29
291	0.27
292	0.27
293	0.26
294	0.24
295	0.24
296	0.23
297	0.2
298	0.19
299	0.18
300	0.13
301	0.11
302	0.11
303	0.11
304	0.12
305	0.11
306	0.11
307	0.07
308	0.07
309	0.08
310	0.07
311	0.09
312	0.12
313	0.17
314	0.24
315	0.26
316	0.26
317	0.28
318	0.3
319	0.31
320	0.34
321	0.33
322	0.32
323	0.32
324	0.34
325	0.32
326	0.3
327	0.27
328	0.21
329	0.18
330	0.13
331	0.12
332	0.09
333	0.09
334	0.08
335	0.06
336	0.06
337	0.04
338	0.03
339	0.03
340	0.03
341	0.02
342	0.02
343	0.02
344	0.02
345	0.03
346	0.03
347	0.03
348	0.03
349	0.03
350	0.04
351	0.05
352	0.06
353	0.06
354	0.06
355	0.06
356	0.06
357	0.06
358	0.06
359	0.06
360	0.08
361	0.1
362	0.13
363	0.14
364	0.14
365	0.16
366	0.16
367	0.18
368	0.15
369	0.14
370	0.12
371	0.11
372	0.1
373	0.1
374	0.09
375	0.07
376	0.06
377	0.06
378	0.05
379	0.04
380	0.04
381	0.03
382	0.03
383	0.04
384	0.04
385	0.04
386	0.04
387	0.04
388	0.05
389	0.05
390	0.09
391	0.14
392	0.15
393	0.17
394	0.18
395	0.21
396	0.22
397	0.22
398	0.19
399	0.15
400	0.15
401	0.16
402	0.18
403	0.16
404	0.17
405	0.18
406	0.18
407	0.18
408	0.2
409	0.18
410	0.18
411	0.18
412	0.18
413	0.18
414	0.22
415	0.2
416	0.17
417	0.17
418	0.15
419	0.14
420	0.14
421	0.14
422	0.13
423	0.14
424	0.15
425	0.15
426	0.14
427	0.14
428	0.12
429	0.14
430	0.12
431	0.15
432	0.16
433	0.19
434	0.17
435	0.17
436	0.17
437	0.16
438	0.17
439	0.18
440	0.21
441	0.19
442	0.29
443	0.29
444	0.34
445	0.37
446	0.37
447	0.37
448	0.37
449	0.44
450	0.4
451	0.43
452	0.38
453	0.33
454	0.32
455	0.28
456	0.24
457	0.16
458	0.14
459	0.11
460	0.12
461	0.12
462	0.11
463	0.1
464	0.1
465	0.1
466	0.07
467	0.09
468	0.09
469	0.12
470	0.13
471	0.13
472	0.13
473	0.14
474	0.16
475	0.14
476	0.16
477	0.14
478	0.15
479	0.18
480	0.2
481	0.18
482	0.17
483	0.18
484	0.17
485	0.22
486	0.25
487	0.27
488	0.35
489	0.4
490	0.44
491	0.47
492	0.5
493	0.49
494	0.48
495	0.44
496	0.38
497	0.34
498	0.3
499	0.27
500	0.22
501	0.18
502	0.15
503	0.16
504	0.17
505	0.19
506	0.2
507	0.2
508	0.22
509	0.27
510	0.37
511	0.44
512	0.51
513	0.56
514	0.63
515	0.72
516	0.8
517	0.82
518	0.8
519	0.8
520	0.79
521	0.77
522	0.75
523	0.7
524	0.61
525	0.55
526	0.48
527	0.4
528	0.34
529	0.28
530	0.23
531	0.23
532	0.24
533	0.24
534	0.27
535	0.28
536	0.25
537	0.25
538	0.24
539	0.25
540	0.24
541	0.27
542	0.28
543	0.3
544	0.34
545	0.36
546	0.36
547	0.31
548	0.34
549	0.38
550	0.33
551	0.32
552	0.29
553	0.28
554	0.28
555	0.28
556	0.25
557	0.19
558	0.21
559	0.19
560	0.23
561	0.22
562	0.24
563	0.26
564	0.28
565	0.28
566	0.26
567	0.29
568	0.31
569	0.37
570	0.41
571	0.45
572	0.47
573	0.52
574	0.52
575	0.51
576	0.48
577	0.48
578	0.45
579	0.44
580	0.4
581	0.33
582	0.37
583	0.38
584	0.36
585	0.35
586	0.34
587	0.33
588	0.32
589	0.32
590	0.26
591	0.22
592	0.22
593	0.19
594	0.21
595	0.21
596	0.22
597	0.23
598	0.24
599	0.23
600	0.21
601	0.21
602	0.18
603	0.17
604	0.21
605	0.28
606	0.31
607	0.38
608	0.42
609	0.43
610	0.49
611	0.51
612	0.51
613	0.51
614	0.54
615	0.56
616	0.6
617	0.63
618	0.64
619	0.68
620	0.68
621	0.68
622	0.64
623	0.63
624	0.64
625	0.6
626	0.53
627	0.44
628	0.45
629	0.37
630	0.39
631	0.32
632	0.25
633	0.24
634	0.23
635	0.26
636	0.27
637	0.34
638	0.38
639	0.4
640	0.41
641	0.42
642	0.43
643	0.49
644	0.54
645	0.56
646	0.53
647	0.51
648	0.49
649	0.54
650	0.54
651	0.48
652	0.43
653	0.39
654	0.37
655	0.4
656	0.5
657	0.48
658	0.51
659	0.53
660	0.51
661	0.53
662	0.6
663	0.65
664	0.65
665	0.68
666	0.69
667	0.71
668	0.72
669	0.68
670	0.64
671	0.58
672	0.48
673	0.43
674	0.38
675	0.31
676	0.28
677	0.27
678	0.26
679	0.29
680	0.31
681	0.35
682	0.45
683	0.53
684	0.59
685	0.64
686	0.61
687	0.57
688	0.59
689	0.59
690	0.55
691	0.53
692	0.49
693	0.46
694	0.51
695	0.5
696	0.52
697	0.5
698	0.52
699	0.51
700	0.55
701	0.58
702	0.59

A0A409WM50

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer