Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409WGS7

Protein Details
Accession A0A409WGS7    Localization Confidence High Confidence Score 19.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
264-335ADEEEKSSRKKKRKKRDDGSDDEDSSLKKKRKKRATSEDESESSDDEGTRKKKKKKKKSKAKAKAKAKDSDTBasic
338-413DTDSETEVKKKKKKKRAHSSDSESSSDGGVHHRKENKKKKRKVFSESESSSEESDAKSRRKKSKSMKRSESPTTGFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
270-280SSRKKKRKKRD
290-297LKKKRKKR
313-331RKKKKKKKKSKAKAKAKAK
346-356KKKKKKKRAHS
367-379VHHRKENKKKKRK
393-405AKSRRKKSKSMKR
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 12, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007832  RNA_pol_Rpc34  
IPR016049  RNA_pol_Rpc34-like  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005666  C:RNA polymerase III complex  
GO:0006383  P:transcription by RNA polymerase III  
Pfam View protein in Pfam  
PF05158  RNA_pol_Rpc34  
Amino Acid Sequences MSKRPPNEQESRLHQAALSSSKKEITARQAESIIPDAAARQQALNFLLGVGLLKGLTNSSGQLLFRAVSKEEIVATKGLGGEENLVLSHIKSSGNEGIWTKHLKAKTSLHQTVIDRCLKTLTQKRLIKRVPSVQHITRKIYMLEGIEPSISLTGGPWYTDNELDTEFIQNLTEACYKLIGDISFPKRRSGSEGALYPISNAPRYPTADSIRHSLRKARLTETDLSVEHVEMLLNVLILDGKIEKLPAFGSALWNSEAIGDGDSADEEEKSSRKKKRKKRDDGSDDEDSSLKKKRKKRATSEDESESSDDEGTRKKKKKKKKSKAKAKAKAKDSDTDTDTDSETEVKKKKKKKRAHSSDSESSSDGGVHHRKENKKKKRKVFSESESSSEESDAKSRRKKSKSMKRSESPTTGFDAFDTGSGGSVYRALKDEVTTVGLTESPCGLCPSFEFCKEGGPVNPKECIYYEDWLAARTMANSEET
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.4
3 0.4
4 0.4
5 0.36
6 0.29
7 0.3
8 0.32
9 0.33
10 0.34
11 0.36
12 0.37
13 0.42
14 0.43
15 0.45
16 0.45
17 0.43
18 0.43
19 0.4
20 0.3
21 0.21
22 0.18
23 0.15
24 0.17
25 0.19
26 0.17
27 0.15
28 0.15
29 0.18
30 0.19
31 0.19
32 0.15
33 0.13
34 0.12
35 0.1
36 0.1
37 0.06
38 0.06
39 0.05
40 0.05
41 0.05
42 0.05
43 0.07
44 0.07
45 0.08
46 0.09
47 0.12
48 0.12
49 0.13
50 0.14
51 0.13
52 0.15
53 0.17
54 0.16
55 0.15
56 0.16
57 0.16
58 0.17
59 0.18
60 0.17
61 0.15
62 0.14
63 0.13
64 0.13
65 0.12
66 0.11
67 0.1
68 0.1
69 0.1
70 0.1
71 0.08
72 0.08
73 0.08
74 0.08
75 0.09
76 0.08
77 0.09
78 0.09
79 0.14
80 0.18
81 0.19
82 0.21
83 0.21
84 0.22
85 0.26
86 0.29
87 0.26
88 0.27
89 0.29
90 0.29
91 0.34
92 0.39
93 0.44
94 0.51
95 0.52
96 0.5
97 0.53
98 0.52
99 0.53
100 0.53
101 0.49
102 0.39
103 0.36
104 0.36
105 0.31
106 0.38
107 0.4
108 0.42
109 0.46
110 0.51
111 0.56
112 0.64
113 0.68
114 0.66
115 0.64
116 0.65
117 0.6
118 0.62
119 0.64
120 0.6
121 0.64
122 0.62
123 0.6
124 0.53
125 0.49
126 0.42
127 0.36
128 0.31
129 0.23
130 0.21
131 0.17
132 0.15
133 0.13
134 0.12
135 0.11
136 0.09
137 0.08
138 0.05
139 0.04
140 0.06
141 0.06
142 0.07
143 0.07
144 0.09
145 0.1
146 0.11
147 0.11
148 0.1
149 0.11
150 0.11
151 0.11
152 0.11
153 0.09
154 0.09
155 0.08
156 0.07
157 0.07
158 0.09
159 0.11
160 0.1
161 0.1
162 0.1
163 0.1
164 0.11
165 0.13
166 0.09
167 0.09
168 0.16
169 0.23
170 0.29
171 0.3
172 0.32
173 0.31
174 0.32
175 0.37
176 0.35
177 0.32
178 0.3
179 0.3
180 0.3
181 0.3
182 0.29
183 0.23
184 0.2
185 0.17
186 0.13
187 0.11
188 0.12
189 0.14
190 0.17
191 0.18
192 0.2
193 0.23
194 0.26
195 0.28
196 0.31
197 0.33
198 0.34
199 0.33
200 0.35
201 0.36
202 0.39
203 0.4
204 0.39
205 0.38
206 0.38
207 0.4
208 0.35
209 0.32
210 0.25
211 0.24
212 0.21
213 0.17
214 0.12
215 0.1
216 0.08
217 0.05
218 0.06
219 0.04
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.05
232 0.05
233 0.06
234 0.07
235 0.07
236 0.09
237 0.1
238 0.11
239 0.11
240 0.11
241 0.1
242 0.09
243 0.09
244 0.07
245 0.06
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.04
250 0.05
251 0.04
252 0.04
253 0.04
254 0.05
255 0.07
256 0.12
257 0.2
258 0.29
259 0.39
260 0.49
261 0.59
262 0.69
263 0.79
264 0.85
265 0.88
266 0.91
267 0.91
268 0.89
269 0.85
270 0.79
271 0.68
272 0.57
273 0.48
274 0.37
275 0.3
276 0.29
277 0.28
278 0.3
279 0.37
280 0.46
281 0.57
282 0.67
283 0.75
284 0.79
285 0.83
286 0.84
287 0.82
288 0.77
289 0.68
290 0.59
291 0.49
292 0.38
293 0.29
294 0.21
295 0.15
296 0.11
297 0.16
298 0.2
299 0.3
300 0.38
301 0.47
302 0.56
303 0.67
304 0.77
305 0.83
306 0.88
307 0.9
308 0.93
309 0.94
310 0.97
311 0.97
312 0.96
313 0.95
314 0.93
315 0.88
316 0.84
317 0.76
318 0.72
319 0.65
320 0.6
321 0.51
322 0.43
323 0.38
324 0.31
325 0.28
326 0.21
327 0.17
328 0.15
329 0.14
330 0.2
331 0.25
332 0.33
333 0.41
334 0.5
335 0.6
336 0.68
337 0.77
338 0.81
339 0.86
340 0.89
341 0.91
342 0.91
343 0.9
344 0.88
345 0.82
346 0.72
347 0.61
348 0.51
349 0.41
350 0.31
351 0.22
352 0.21
353 0.22
354 0.22
355 0.28
356 0.35
357 0.44
358 0.55
359 0.66
360 0.7
361 0.76
362 0.84
363 0.88
364 0.91
365 0.92
366 0.9
367 0.89
368 0.85
369 0.85
370 0.77
371 0.7
372 0.62
373 0.53
374 0.44
375 0.35
376 0.28
377 0.19
378 0.22
379 0.25
380 0.31
381 0.38
382 0.47
383 0.56
384 0.61
385 0.71
386 0.76
387 0.81
388 0.83
389 0.86
390 0.87
391 0.86
392 0.87
393 0.85
394 0.81
395 0.74
396 0.65
397 0.59
398 0.5
399 0.42
400 0.34
401 0.28
402 0.2
403 0.17
404 0.15
405 0.1
406 0.09
407 0.09
408 0.09
409 0.07
410 0.11
411 0.11
412 0.12
413 0.14
414 0.15
415 0.16
416 0.17
417 0.18
418 0.16
419 0.18
420 0.16
421 0.15
422 0.14
423 0.15
424 0.14
425 0.13
426 0.14
427 0.11
428 0.12
429 0.15
430 0.15
431 0.13
432 0.15
433 0.21
434 0.24
435 0.26
436 0.28
437 0.25
438 0.3
439 0.31
440 0.33
441 0.33
442 0.36
443 0.4
444 0.4
445 0.44
446 0.39
447 0.4
448 0.37
449 0.35
450 0.32
451 0.29
452 0.27
453 0.28
454 0.28
455 0.26
456 0.26
457 0.22
458 0.19
459 0.16
460 0.17