FuNGI

A0A409VM47

Protein Details

Accession

A0A409VM47

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
386-414	AGQDHKPRKTVDKKKITRRIGKMQKKIEE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
272-289	KRGKGDKKEKPAGERKSK
390-410	HKPRKTVDKKKITRRIGKMQK

Subcellular Location(s)

nucl 13, cyto_nucl 11.666, mito_nucl 9.666, cyto 9, cyto_mito 7.666

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016813 NADH_Ub_cplx-1_21kDa_fun IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom IPR034393 TatSF1-like IPR034392 TatSF1-like_RRM1
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd22849 NuzM cd12281 RRM1_TatSF1_like cd12285 RRM3_RBM39_like

Amino Acid Sequences

MAATKKAAESTLYHLSPKGFWKKFREVVAVNPEISSGLPSASLHRYPPPASRPEQYSTPAGKASDPAQNPYWKRDVRRAYPQLSVVTQSDLSTLLIEHSNAPAVSAPTEGADQAAVPAAKPVALNLSEAISAITSTAKYVPHKVVHGSVNKRTHQFMSAPPPPLPPSPAVGTSVEVQAAAFADDPRIYFSKTANTWRFEQDDGTELEFDAAKSSWIPLVDDDEISRQQAAYSIAGVDEETPAAPVLKRENKKRKAEEDYTSADPNSAAISIKRGKGDKKEKPAGERKSKNTAVYVTGLPPDTEQEEIVELFSKCGVIEEDEDGEPKVKMYAREDGSFNGEALVVYFKEDSVALALTILEDAELRLGQPHTVMKVSKADFAHKTPAAGQDHKPRKTVDKKKITRRIGKMQKKIEEWGEDDGFGPMPDPAEDIAASTKSRVVVLKHMFSPKDIEEDASLLLDLKEDVREECSSLGEVTNVVLYDLEEDGVITVKFRDPIAAQACVLKMDGRFFDKRRVEAELFTGRQRFKRSGTGEEVGGDSEEAEKKRLDEFAQWLLTEGD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.31
2	0.32
3	0.33
4	0.4
5	0.44
6	0.41
7	0.48
8	0.55
9	0.63
10	0.68
11	0.7
12	0.69
13	0.6
14	0.63
15	0.65
16	0.6
17	0.5
18	0.44
19	0.37
20	0.3
21	0.28
22	0.2
23	0.11
24	0.08
25	0.09
26	0.09
27	0.14
28	0.19
29	0.2
30	0.21
31	0.26
32	0.31
33	0.33
34	0.41
35	0.43
36	0.45
37	0.48
38	0.51
39	0.51
40	0.51
41	0.52
42	0.48
43	0.49
44	0.46
45	0.44
46	0.4
47	0.36
48	0.32
49	0.3
50	0.3
51	0.3
52	0.28
53	0.3
54	0.33
55	0.4
56	0.42
57	0.45
58	0.51
59	0.48
60	0.51
61	0.56
62	0.61
63	0.6
64	0.69
65	0.71
66	0.66
67	0.66
68	0.64
69	0.58
70	0.5
71	0.45
72	0.35
73	0.29
74	0.26
75	0.21
76	0.18
77	0.15
78	0.14
79	0.11
80	0.1
81	0.09
82	0.09
83	0.1
84	0.1
85	0.1
86	0.12
87	0.11
88	0.12
89	0.12
90	0.11
91	0.11
92	0.11
93	0.1
94	0.09
95	0.1
96	0.09
97	0.08
98	0.07
99	0.06
100	0.06
101	0.08
102	0.07
103	0.07
104	0.08
105	0.08
106	0.09
107	0.09
108	0.09
109	0.1
110	0.11
111	0.12
112	0.11
113	0.12
114	0.11
115	0.12
116	0.11
117	0.07
118	0.06
119	0.06
120	0.06
121	0.05
122	0.06
123	0.08
124	0.11
125	0.14
126	0.19
127	0.24
128	0.26
129	0.28
130	0.29
131	0.32
132	0.36
133	0.42
134	0.43
135	0.46
136	0.5
137	0.52
138	0.52
139	0.5
140	0.45
141	0.4
142	0.37
143	0.35
144	0.37
145	0.39
146	0.4
147	0.38
148	0.39
149	0.38
150	0.37
151	0.33
152	0.25
153	0.22
154	0.21
155	0.22
156	0.21
157	0.19
158	0.19
159	0.18
160	0.17
161	0.14
162	0.11
163	0.1
164	0.08
165	0.07
166	0.06
167	0.05
168	0.05
169	0.06
170	0.06
171	0.07
172	0.1
173	0.11
174	0.11
175	0.12
176	0.13
177	0.19
178	0.22
179	0.31
180	0.33
181	0.35
182	0.37
183	0.39
184	0.4
185	0.34
186	0.32
187	0.23
188	0.21
189	0.2
190	0.18
191	0.15
192	0.12
193	0.12
194	0.11
195	0.1
196	0.09
197	0.07
198	0.06
199	0.06
200	0.07
201	0.08
202	0.08
203	0.08
204	0.07
205	0.11
206	0.11
207	0.11
208	0.11
209	0.12
210	0.12
211	0.12
212	0.12
213	0.08
214	0.07
215	0.09
216	0.1
217	0.08
218	0.08
219	0.08
220	0.07
221	0.07
222	0.07
223	0.06
224	0.04
225	0.04
226	0.04
227	0.04
228	0.04
229	0.05
230	0.05
231	0.06
232	0.13
233	0.21
234	0.27
235	0.37
236	0.48
237	0.57
238	0.66
239	0.71
240	0.72
241	0.72
242	0.73
243	0.66
244	0.61
245	0.56
246	0.49
247	0.43
248	0.35
249	0.27
250	0.2
251	0.16
252	0.12
253	0.08
254	0.06
255	0.05
256	0.09
257	0.12
258	0.14
259	0.17
260	0.19
261	0.22
262	0.31
263	0.41
264	0.44
265	0.51
266	0.57
267	0.56
268	0.62
269	0.68
270	0.67
271	0.67
272	0.67
273	0.62
274	0.63
275	0.63
276	0.57
277	0.49
278	0.42
279	0.33
280	0.29
281	0.25
282	0.17
283	0.16
284	0.15
285	0.13
286	0.11
287	0.1
288	0.09
289	0.08
290	0.07
291	0.07
292	0.07
293	0.07
294	0.07
295	0.08
296	0.08
297	0.07
298	0.07
299	0.07
300	0.06
301	0.07
302	0.07
303	0.06
304	0.07
305	0.08
306	0.1
307	0.1
308	0.1
309	0.1
310	0.1
311	0.09
312	0.08
313	0.09
314	0.09
315	0.11
316	0.14
317	0.21
318	0.23
319	0.25
320	0.26
321	0.25
322	0.27
323	0.25
324	0.22
325	0.15
326	0.12
327	0.1
328	0.1
329	0.1
330	0.06
331	0.06
332	0.06
333	0.06
334	0.06
335	0.06
336	0.06
337	0.06
338	0.06
339	0.05
340	0.05
341	0.05
342	0.04
343	0.04
344	0.04
345	0.03
346	0.03
347	0.03
348	0.03
349	0.04
350	0.04
351	0.06
352	0.06
353	0.06
354	0.08
355	0.09
356	0.1
357	0.13
358	0.13
359	0.13
360	0.19
361	0.2
362	0.24
363	0.24
364	0.28
365	0.28
366	0.31
367	0.36
368	0.3
369	0.29
370	0.26
371	0.32
372	0.32
373	0.33
374	0.35
375	0.39
376	0.48
377	0.5
378	0.51
379	0.46
380	0.51
381	0.58
382	0.64
383	0.64
384	0.66
385	0.73
386	0.81
387	0.89
388	0.89
389	0.87
390	0.85
391	0.85
392	0.85
393	0.86
394	0.84
395	0.82
396	0.79
397	0.72
398	0.68
399	0.62
400	0.54
401	0.47
402	0.43
403	0.35
404	0.28
405	0.26
406	0.22
407	0.18
408	0.14
409	0.12
410	0.07
411	0.07
412	0.07
413	0.07
414	0.07
415	0.07
416	0.07
417	0.08
418	0.1
419	0.1
420	0.11
421	0.1
422	0.12
423	0.11
424	0.13
425	0.15
426	0.15
427	0.23
428	0.29
429	0.32
430	0.35
431	0.4
432	0.39
433	0.38
434	0.4
435	0.32
436	0.31
437	0.27
438	0.24
439	0.19
440	0.2
441	0.19
442	0.14
443	0.13
444	0.09
445	0.08
446	0.07
447	0.07
448	0.07
449	0.08
450	0.08
451	0.09
452	0.12
453	0.13
454	0.14
455	0.14
456	0.14
457	0.14
458	0.14
459	0.14
460	0.1
461	0.1
462	0.09
463	0.1
464	0.08
465	0.07
466	0.07
467	0.06
468	0.08
469	0.08
470	0.07
471	0.06
472	0.06
473	0.06
474	0.08
475	0.07
476	0.06
477	0.08
478	0.1
479	0.11
480	0.11
481	0.14
482	0.14
483	0.22
484	0.26
485	0.26
486	0.25
487	0.26
488	0.27
489	0.24
490	0.24
491	0.18
492	0.16
493	0.18
494	0.21
495	0.24
496	0.31
497	0.33
498	0.42
499	0.46
500	0.47
501	0.46
502	0.51
503	0.47
504	0.42
505	0.46
506	0.45
507	0.42
508	0.43
509	0.47
510	0.43
511	0.46
512	0.5
513	0.48
514	0.44
515	0.52
516	0.52
517	0.53
518	0.57
519	0.54
520	0.49
521	0.45
522	0.41
523	0.32
524	0.27
525	0.19
526	0.12
527	0.13
528	0.17
529	0.17
530	0.19
531	0.19
532	0.2
533	0.23
534	0.26
535	0.25
536	0.27
537	0.31
538	0.36
539	0.38
540	0.36

A0A409VM47

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer