Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409WYT5

Protein Details
Accession A0A409WYT5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
43-72PPPRPKSTPGERPTQRRRQKSPLRSEEQQLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
58-59RR
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 11.5, cyto 8.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029028  Alpha/beta_knot_MTases  
IPR005304  Rbsml_bgen_MeTrfase_EMG1/NEP1  
IPR029026  tRNA_m1G_MTases_N  
Gene Ontology GO:0070037  F:rRNA (pseudouridine) methyltransferase activity  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0070475  P:rRNA base methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF03587  EMG1  
CDD cd18088  Nep1-like  
Amino Acid Sequences MEAPTATVPARRRRHSGSIDTSHAEGIPNIHKILGADNLPLEPPPRPKSTPGERPTQRRRQKSPLRSEEQQLDDDAAAEEQENGPVMQVDDESRANSKQIDHTTSTTSSITILKNTNNQTTTTTTAGERPTRPLPSSKTRKMASTATPLNPHAAIHYPANPAMLPVQAHVPRGVAATTQRRLFVILEQACLEAYKVSGGSGSGAKGRGGKEFGGGEAKYTLLNCDDHQGILAKTGRDIADARPDITHQCLLTLLDSPLNKAGLLQVYIHTARGVLIEVNPHVRIPRTFKRFSGLMVQLLHKLSIRGVNGPEKLLKVVKNPVTDHLPPNTIKLTLSCDAPTQRLSKYLPTLPSTHNIAVFVGAMARGKDDFADAYVDEKIGISAYPLSASVACGKFCCALEELWDIV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.68
2 0.71
3 0.73
4 0.73
5 0.7
6 0.7
7 0.65
8 0.58
9 0.49
10 0.41
11 0.32
12 0.23
13 0.21
14 0.2
15 0.21
16 0.2
17 0.19
18 0.19
19 0.19
20 0.21
21 0.21
22 0.17
23 0.16
24 0.17
25 0.17
26 0.17
27 0.17
28 0.17
29 0.17
30 0.24
31 0.28
32 0.34
33 0.36
34 0.42
35 0.5
36 0.59
37 0.65
38 0.61
39 0.66
40 0.67
41 0.74
42 0.79
43 0.81
44 0.81
45 0.8
46 0.84
47 0.84
48 0.88
49 0.88
50 0.89
51 0.88
52 0.86
53 0.8
54 0.78
55 0.74
56 0.67
57 0.57
58 0.47
59 0.38
60 0.3
61 0.26
62 0.2
63 0.13
64 0.09
65 0.08
66 0.08
67 0.07
68 0.07
69 0.07
70 0.07
71 0.07
72 0.07
73 0.07
74 0.07
75 0.07
76 0.08
77 0.1
78 0.11
79 0.12
80 0.14
81 0.14
82 0.15
83 0.16
84 0.17
85 0.21
86 0.26
87 0.29
88 0.3
89 0.32
90 0.35
91 0.34
92 0.34
93 0.27
94 0.22
95 0.19
96 0.19
97 0.18
98 0.18
99 0.19
100 0.2
101 0.26
102 0.3
103 0.34
104 0.31
105 0.31
106 0.31
107 0.31
108 0.32
109 0.26
110 0.24
111 0.19
112 0.22
113 0.25
114 0.27
115 0.25
116 0.27
117 0.3
118 0.32
119 0.33
120 0.35
121 0.37
122 0.43
123 0.52
124 0.53
125 0.56
126 0.54
127 0.55
128 0.53
129 0.52
130 0.46
131 0.44
132 0.43
133 0.38
134 0.4
135 0.38
136 0.35
137 0.31
138 0.26
139 0.19
140 0.16
141 0.15
142 0.14
143 0.16
144 0.16
145 0.16
146 0.17
147 0.15
148 0.13
149 0.12
150 0.11
151 0.08
152 0.07
153 0.13
154 0.13
155 0.14
156 0.14
157 0.14
158 0.13
159 0.13
160 0.13
161 0.08
162 0.12
163 0.17
164 0.2
165 0.21
166 0.21
167 0.2
168 0.22
169 0.21
170 0.18
171 0.2
172 0.18
173 0.18
174 0.18
175 0.18
176 0.16
177 0.15
178 0.14
179 0.05
180 0.05
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.05
187 0.05
188 0.06
189 0.07
190 0.07
191 0.08
192 0.11
193 0.12
194 0.12
195 0.13
196 0.13
197 0.13
198 0.13
199 0.13
200 0.14
201 0.13
202 0.12
203 0.11
204 0.11
205 0.09
206 0.09
207 0.09
208 0.07
209 0.08
210 0.08
211 0.1
212 0.1
213 0.1
214 0.1
215 0.11
216 0.1
217 0.13
218 0.15
219 0.12
220 0.12
221 0.15
222 0.14
223 0.14
224 0.15
225 0.13
226 0.19
227 0.2
228 0.2
229 0.18
230 0.19
231 0.19
232 0.2
233 0.2
234 0.11
235 0.11
236 0.11
237 0.11
238 0.11
239 0.11
240 0.1
241 0.11
242 0.11
243 0.12
244 0.13
245 0.13
246 0.12
247 0.1
248 0.11
249 0.09
250 0.1
251 0.1
252 0.09
253 0.12
254 0.13
255 0.13
256 0.11
257 0.1
258 0.09
259 0.09
260 0.09
261 0.06
262 0.07
263 0.08
264 0.09
265 0.12
266 0.12
267 0.12
268 0.12
269 0.14
270 0.16
271 0.23
272 0.31
273 0.37
274 0.39
275 0.4
276 0.44
277 0.42
278 0.41
279 0.42
280 0.35
281 0.31
282 0.3
283 0.31
284 0.29
285 0.29
286 0.27
287 0.19
288 0.17
289 0.15
290 0.17
291 0.17
292 0.17
293 0.2
294 0.25
295 0.26
296 0.28
297 0.28
298 0.25
299 0.26
300 0.27
301 0.25
302 0.24
303 0.32
304 0.35
305 0.38
306 0.39
307 0.4
308 0.43
309 0.45
310 0.44
311 0.39
312 0.39
313 0.34
314 0.36
315 0.33
316 0.27
317 0.24
318 0.21
319 0.24
320 0.21
321 0.22
322 0.2
323 0.22
324 0.24
325 0.26
326 0.28
327 0.25
328 0.24
329 0.28
330 0.29
331 0.31
332 0.35
333 0.38
334 0.39
335 0.39
336 0.43
337 0.41
338 0.43
339 0.43
340 0.39
341 0.34
342 0.3
343 0.27
344 0.23
345 0.2
346 0.15
347 0.1
348 0.09
349 0.09
350 0.08
351 0.09
352 0.09
353 0.09
354 0.09
355 0.1
356 0.1
357 0.1
358 0.12
359 0.11
360 0.13
361 0.13
362 0.13
363 0.11
364 0.11
365 0.1
366 0.08
367 0.08
368 0.07
369 0.08
370 0.09
371 0.09
372 0.09
373 0.11
374 0.11
375 0.12
376 0.19
377 0.19
378 0.2
379 0.2
380 0.22
381 0.24
382 0.24
383 0.26
384 0.2
385 0.18
386 0.22