Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409VXA7

Protein Details
Accession A0A409VXA7    Localization Confidence High Confidence Score 19.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
452-475MMLAGKPKNKTKSKSKTTPAAAKGHydrophilic
508-536GSDAEDDDKRKRKRNRPKPKPKAATATTABasic
550-570GEEKPKPKAAAPKPKPKASGFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
457-504KPKNKTKSKSKTTPAAAKGKSKAADDASEGGTPKKVVKKKAAAAPAKA
515-531DKRKRKRNRPKPKPKAA
553-566KPKPKAAAPKPKPK
Subcellular Location(s) nucl 11.5, mito_nucl 8.833, cyto 7.5, cyto_mito 6.833, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011993  PH-like_dom_sf  
IPR013719  RTT106/SPT16-like_middle_dom  
IPR000969  SSRP1/POB3  
IPR024954  SSRP1_DD  
IPR038167  SSRP1_sf  
Gene Ontology GO:0005694  C:chromosome  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
Pfam View protein in Pfam  
PF08512  Rtt106  
PF03531  SSrecog  
Amino Acid Sequences MACLCVPSFFVLADCGHRMVSHRIGSRQARADAAEPLWRQSRDDRDVVQRVELGVADFDLHGEELAFRVSDKTAFELPLRHVANSNTASKTEVSLEFSNLTPAASDFNPTQKSKQLGDEPTEIRFFVPGTITKLKGSDKSDAEDNANVNVHSDNDDDDEEISTASSTTPSKSTRPSARTRTTSSSRPTRSSCSRRGGATTWACFLIAGEDVCYKVLYQSMARLFLLQKDDQQVLFILGLSTPIRQGQTLSQYLVMQFTREKEITAELNMSEEDLAKYDGKLKKNYEDPTYVIVSSVFRALAGKKIIGSASFQSRDGHPGLKANLKAIQGDLFMLECYSFFFSKQPLLIELADIQQVTFSRVGSSAAASTAGRTFDIKTTTKAGGPEYLFTSINKEHEVTEVYLRDADFLMKAVVDDEDDEDEDMQSEDFQASDSDSSDGSGAQTASDASGDMMLAGKPKNKTKSKSKTTPAAAKGKSKAADDASEGGTPKKVVKKKAAAAPAKADANGSDAEDDDKRKRKRNRPKPKPKAATATTAAKKEDGDEPMDVNGEEKPKPKAAAPKPKPKASGFWLCGWGTAMR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.17
3 0.16
4 0.17
5 0.2
6 0.25
7 0.3
8 0.34
9 0.37
10 0.4
11 0.49
12 0.54
13 0.57
14 0.57
15 0.52
16 0.48
17 0.44
18 0.43
19 0.39
20 0.35
21 0.35
22 0.29
23 0.31
24 0.36
25 0.34
26 0.35
27 0.38
28 0.46
29 0.44
30 0.48
31 0.49
32 0.51
33 0.58
34 0.57
35 0.51
36 0.43
37 0.37
38 0.34
39 0.29
40 0.2
41 0.13
42 0.11
43 0.1
44 0.08
45 0.08
46 0.07
47 0.07
48 0.06
49 0.06
50 0.06
51 0.06
52 0.07
53 0.07
54 0.06
55 0.08
56 0.09
57 0.11
58 0.12
59 0.16
60 0.17
61 0.19
62 0.21
63 0.23
64 0.25
65 0.32
66 0.32
67 0.29
68 0.29
69 0.29
70 0.35
71 0.35
72 0.36
73 0.29
74 0.28
75 0.29
76 0.27
77 0.27
78 0.23
79 0.21
80 0.22
81 0.21
82 0.23
83 0.22
84 0.22
85 0.22
86 0.18
87 0.17
88 0.11
89 0.1
90 0.12
91 0.1
92 0.13
93 0.12
94 0.19
95 0.25
96 0.27
97 0.29
98 0.32
99 0.36
100 0.36
101 0.42
102 0.43
103 0.42
104 0.45
105 0.49
106 0.44
107 0.43
108 0.41
109 0.34
110 0.26
111 0.22
112 0.18
113 0.12
114 0.13
115 0.13
116 0.19
117 0.23
118 0.24
119 0.24
120 0.27
121 0.29
122 0.32
123 0.33
124 0.33
125 0.31
126 0.33
127 0.35
128 0.34
129 0.34
130 0.31
131 0.28
132 0.23
133 0.22
134 0.19
135 0.16
136 0.15
137 0.13
138 0.12
139 0.11
140 0.1
141 0.11
142 0.11
143 0.11
144 0.11
145 0.11
146 0.1
147 0.09
148 0.08
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.07
153 0.07
154 0.08
155 0.12
156 0.15
157 0.18
158 0.23
159 0.31
160 0.37
161 0.43
162 0.51
163 0.56
164 0.62
165 0.64
166 0.65
167 0.65
168 0.61
169 0.62
170 0.6
171 0.61
172 0.57
173 0.57
174 0.54
175 0.54
176 0.59
177 0.6
178 0.61
179 0.59
180 0.57
181 0.53
182 0.54
183 0.49
184 0.47
185 0.44
186 0.37
187 0.31
188 0.28
189 0.27
190 0.23
191 0.2
192 0.13
193 0.08
194 0.07
195 0.07
196 0.07
197 0.07
198 0.08
199 0.08
200 0.07
201 0.06
202 0.07
203 0.08
204 0.08
205 0.13
206 0.14
207 0.15
208 0.15
209 0.17
210 0.16
211 0.18
212 0.21
213 0.17
214 0.18
215 0.19
216 0.2
217 0.18
218 0.19
219 0.15
220 0.12
221 0.11
222 0.09
223 0.06
224 0.05
225 0.06
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.07
230 0.08
231 0.08
232 0.09
233 0.1
234 0.16
235 0.17
236 0.17
237 0.16
238 0.16
239 0.16
240 0.18
241 0.15
242 0.1
243 0.1
244 0.11
245 0.14
246 0.14
247 0.14
248 0.12
249 0.14
250 0.14
251 0.14
252 0.13
253 0.09
254 0.1
255 0.09
256 0.08
257 0.06
258 0.06
259 0.05
260 0.05
261 0.07
262 0.06
263 0.07
264 0.14
265 0.19
266 0.22
267 0.27
268 0.28
269 0.31
270 0.38
271 0.41
272 0.37
273 0.34
274 0.32
275 0.3
276 0.29
277 0.25
278 0.18
279 0.16
280 0.12
281 0.1
282 0.1
283 0.06
284 0.05
285 0.06
286 0.06
287 0.1
288 0.1
289 0.1
290 0.09
291 0.1
292 0.11
293 0.1
294 0.11
295 0.1
296 0.14
297 0.15
298 0.15
299 0.16
300 0.16
301 0.19
302 0.19
303 0.18
304 0.14
305 0.16
306 0.17
307 0.21
308 0.2
309 0.19
310 0.21
311 0.2
312 0.2
313 0.17
314 0.16
315 0.12
316 0.12
317 0.1
318 0.06
319 0.06
320 0.05
321 0.05
322 0.04
323 0.05
324 0.07
325 0.07
326 0.07
327 0.08
328 0.1
329 0.12
330 0.13
331 0.12
332 0.11
333 0.14
334 0.13
335 0.13
336 0.12
337 0.11
338 0.11
339 0.1
340 0.09
341 0.07
342 0.08
343 0.09
344 0.09
345 0.08
346 0.08
347 0.08
348 0.09
349 0.09
350 0.09
351 0.07
352 0.07
353 0.08
354 0.07
355 0.08
356 0.08
357 0.08
358 0.08
359 0.09
360 0.1
361 0.11
362 0.16
363 0.17
364 0.18
365 0.21
366 0.22
367 0.23
368 0.23
369 0.22
370 0.22
371 0.21
372 0.21
373 0.19
374 0.2
375 0.19
376 0.17
377 0.21
378 0.18
379 0.18
380 0.18
381 0.17
382 0.15
383 0.16
384 0.19
385 0.16
386 0.18
387 0.17
388 0.16
389 0.17
390 0.16
391 0.15
392 0.13
393 0.12
394 0.08
395 0.08
396 0.08
397 0.06
398 0.06
399 0.06
400 0.06
401 0.06
402 0.06
403 0.07
404 0.07
405 0.08
406 0.08
407 0.08
408 0.08
409 0.08
410 0.08
411 0.06
412 0.05
413 0.06
414 0.05
415 0.05
416 0.05
417 0.05
418 0.06
419 0.07
420 0.08
421 0.08
422 0.08
423 0.08
424 0.08
425 0.08
426 0.07
427 0.08
428 0.07
429 0.06
430 0.07
431 0.06
432 0.06
433 0.06
434 0.06
435 0.05
436 0.05
437 0.05
438 0.04
439 0.05
440 0.05
441 0.08
442 0.1
443 0.14
444 0.19
445 0.27
446 0.36
447 0.44
448 0.51
449 0.6
450 0.69
451 0.75
452 0.8
453 0.81
454 0.8
455 0.8
456 0.82
457 0.79
458 0.77
459 0.71
460 0.68
461 0.64
462 0.61
463 0.56
464 0.48
465 0.44
466 0.38
467 0.36
468 0.31
469 0.3
470 0.26
471 0.25
472 0.24
473 0.21
474 0.19
475 0.18
476 0.21
477 0.27
478 0.31
479 0.37
480 0.46
481 0.54
482 0.61
483 0.68
484 0.72
485 0.69
486 0.67
487 0.65
488 0.61
489 0.53
490 0.45
491 0.38
492 0.28
493 0.25
494 0.21
495 0.16
496 0.12
497 0.11
498 0.14
499 0.16
500 0.21
501 0.27
502 0.35
503 0.42
504 0.51
505 0.62
506 0.7
507 0.79
508 0.85
509 0.88
510 0.9
511 0.95
512 0.96
513 0.97
514 0.95
515 0.92
516 0.91
517 0.83
518 0.8
519 0.74
520 0.73
521 0.67
522 0.61
523 0.54
524 0.45
525 0.41
526 0.36
527 0.36
528 0.29
529 0.27
530 0.24
531 0.24
532 0.24
533 0.25
534 0.22
535 0.16
536 0.17
537 0.18
538 0.2
539 0.22
540 0.26
541 0.3
542 0.32
543 0.37
544 0.44
545 0.51
546 0.59
547 0.65
548 0.72
549 0.76
550 0.82
551 0.82
552 0.75
553 0.72
554 0.69
555 0.7
556 0.63
557 0.59
558 0.57
559 0.51
560 0.48