Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409WFN0

Protein Details
Accession A0A409WFN0    Localization Confidence High Confidence Score 18.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
99-129IAKPSEQKDKEKKEKKAKRRPGRRGGKAVPGBasic
150-176ETDEAAKPKKKKKSKAARKAKKAEDEABasic
194-217TEGSAKKPRARKPKAPRPTRPAGEBasic
253-274IVSARIVRRRWGQPRKSKGYGFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
105-126QKDKEKKEKKAKRRPGRRGGKA
155-171AKPKKKKKSKAARKAKK
198-214AKKPRARKPKAPRPTRP
Subcellular Location(s) cyto 22, nucl 3.5, mito_nucl 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSDVQAASVTEKAVVQEKVEEAPGFKVFAGNLAYSTTDEGLKAFFAPVANDILSAQVILRGTRSAGYGFVALATAEAAQKAVDALDKQELDGRPVIVEIAKPSEQKDKEKKEKKAKRRPGRRGGKAVPGEVSEAEANGEAPKADGAAVPETDEAAKPKKKKKSKAARKAKKAEDEAYETPVVPAAAPVEGEAATEGSAKKPRARKPKAPRPTRPAGEDPAGEPSKTMLFVANLGFNVDDAGLSALFTEAGINIVSARIVRRRWGQPRKSKGYGFVDVGNEAEQNKAIAALEGKEVGGRAIAVKVAVNTPHDETADEAAPAATDGATEATPAAAAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.17
3 0.19
4 0.2
5 0.21
6 0.23
7 0.22
8 0.18
9 0.21
10 0.21
11 0.19
12 0.17
13 0.17
14 0.14
15 0.17
16 0.18
17 0.14
18 0.14
19 0.14
20 0.15
21 0.14
22 0.16
23 0.13
24 0.11
25 0.11
26 0.11
27 0.1
28 0.1
29 0.1
30 0.08
31 0.09
32 0.09
33 0.1
34 0.11
35 0.13
36 0.12
37 0.12
38 0.12
39 0.11
40 0.1
41 0.09
42 0.08
43 0.07
44 0.08
45 0.08
46 0.09
47 0.09
48 0.09
49 0.1
50 0.11
51 0.1
52 0.1
53 0.11
54 0.1
55 0.09
56 0.09
57 0.08
58 0.07
59 0.06
60 0.06
61 0.05
62 0.05
63 0.05
64 0.05
65 0.05
66 0.05
67 0.05
68 0.05
69 0.06
70 0.06
71 0.08
72 0.13
73 0.13
74 0.13
75 0.19
76 0.19
77 0.2
78 0.21
79 0.19
80 0.15
81 0.15
82 0.15
83 0.1
84 0.1
85 0.09
86 0.12
87 0.14
88 0.15
89 0.17
90 0.25
91 0.28
92 0.37
93 0.45
94 0.51
95 0.6
96 0.69
97 0.77
98 0.8
99 0.87
100 0.89
101 0.9
102 0.91
103 0.91
104 0.93
105 0.93
106 0.93
107 0.93
108 0.9
109 0.88
110 0.82
111 0.8
112 0.71
113 0.61
114 0.51
115 0.41
116 0.33
117 0.24
118 0.21
119 0.12
120 0.09
121 0.08
122 0.07
123 0.07
124 0.06
125 0.06
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.06
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.13
142 0.18
143 0.24
144 0.32
145 0.41
146 0.5
147 0.59
148 0.68
149 0.74
150 0.8
151 0.85
152 0.89
153 0.89
154 0.91
155 0.9
156 0.85
157 0.81
158 0.74
159 0.66
160 0.58
161 0.54
162 0.45
163 0.39
164 0.33
165 0.25
166 0.21
167 0.18
168 0.15
169 0.08
170 0.07
171 0.05
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.05
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.05
182 0.06
183 0.07
184 0.12
185 0.14
186 0.19
187 0.27
188 0.35
189 0.46
190 0.54
191 0.62
192 0.69
193 0.79
194 0.84
195 0.86
196 0.87
197 0.84
198 0.85
199 0.78
200 0.72
201 0.65
202 0.59
203 0.52
204 0.43
205 0.36
206 0.34
207 0.31
208 0.25
209 0.21
210 0.17
211 0.15
212 0.15
213 0.14
214 0.08
215 0.08
216 0.09
217 0.1
218 0.11
219 0.1
220 0.1
221 0.09
222 0.08
223 0.08
224 0.06
225 0.05
226 0.04
227 0.05
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.03
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.05
242 0.06
243 0.08
244 0.13
245 0.14
246 0.19
247 0.27
248 0.37
249 0.48
250 0.58
251 0.65
252 0.71
253 0.8
254 0.84
255 0.83
256 0.76
257 0.74
258 0.7
259 0.64
260 0.56
261 0.49
262 0.42
263 0.35
264 0.34
265 0.26
266 0.19
267 0.15
268 0.13
269 0.1
270 0.09
271 0.08
272 0.08
273 0.07
274 0.08
275 0.09
276 0.09
277 0.1
278 0.1
279 0.1
280 0.1
281 0.1
282 0.09
283 0.08
284 0.07
285 0.07
286 0.07
287 0.08
288 0.08
289 0.09
290 0.1
291 0.12
292 0.14
293 0.16
294 0.18
295 0.21
296 0.23
297 0.22
298 0.21
299 0.21
300 0.23
301 0.21
302 0.18
303 0.15
304 0.13
305 0.13
306 0.12
307 0.1
308 0.06
309 0.05
310 0.05
311 0.07
312 0.07
313 0.07
314 0.07
315 0.06