Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409XI36

Protein Details
Accession A0A409XI36    Localization Confidence High Confidence Score 16.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
114-134DEELRRKEKEREKQRDVHNLDBasic
243-272DAEFKRRTAEKDKKKNKKFEQSLKELRKRTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
247-281KRRTAEKDKKKNKKFEQSLKELRKRTKEGVWQRRK
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009061  DNA-bd_dom_put_sf  
IPR029069  HotDog_dom_sf  
IPR000465  XPA  
IPR022656  XPA_C  
IPR022658  XPA_CS  
IPR037129  XPA_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF13622  4HBT_3  
PF05181  XPA_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00753  XPA_2  
CDD cd21077  DBD_Rad14  
cd03444  Thioesterase_II_repeat1  
Amino Acid Sequences MSFSNQRTSTPPPRTFDSSTLQATPEYVKQIEINRLKAKAIQRQKEQDLSSSYATNSNNKRPLSGTPTTQGQAVASSSKPLQRDSRLGTYFEYDLSKMVNSKGGFLMDDGKKVDEELRRKEKEREKQRDVHNLDIPMFLDSERNAKCKECNSMDIDPTFMKVFKCLVCKSCQNEHSDKYSLLTKTECKTDYLLTDPELRDEEAMPHLLKANPHASTYANMMLFLRCQVEDFAWKKWGSPEALDAEFKRRTAEKDKKKNKKFEQSLKELRKRTKEGVWQRRKDAEHKHVFSQVQGIRDGIGEQERTRSPIALKSAKGPYVSKDGIERYMYWMKARDIPRYEAPFQKCILAYESDLNFISTAGRVMGLKRGGKGPDSLSMNSTLDHAICNDFDAGDWLLYEIDCPRGGSGRAIVHGRMFTRDGTLVAVTTQEGVVRANRRGPVEEKLQPKL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.65
3 0.61
4 0.57
5 0.53
6 0.5
7 0.47
8 0.41
9 0.34
10 0.31
11 0.3
12 0.26
13 0.25
14 0.21
15 0.21
16 0.24
17 0.29
18 0.38
19 0.4
20 0.45
21 0.45
22 0.47
23 0.46
24 0.49
25 0.52
26 0.52
27 0.56
28 0.58
29 0.62
30 0.69
31 0.74
32 0.75
33 0.69
34 0.64
35 0.58
36 0.53
37 0.46
38 0.39
39 0.33
40 0.32
41 0.32
42 0.35
43 0.37
44 0.42
45 0.47
46 0.46
47 0.47
48 0.44
49 0.48
50 0.48
51 0.45
52 0.4
53 0.37
54 0.41
55 0.4
56 0.38
57 0.32
58 0.24
59 0.21
60 0.18
61 0.16
62 0.12
63 0.14
64 0.16
65 0.19
66 0.21
67 0.24
68 0.29
69 0.32
70 0.38
71 0.42
72 0.49
73 0.47
74 0.47
75 0.44
76 0.41
77 0.36
78 0.31
79 0.26
80 0.17
81 0.15
82 0.15
83 0.14
84 0.13
85 0.13
86 0.17
87 0.15
88 0.17
89 0.18
90 0.17
91 0.17
92 0.16
93 0.23
94 0.19
95 0.21
96 0.2
97 0.2
98 0.19
99 0.19
100 0.24
101 0.23
102 0.29
103 0.36
104 0.45
105 0.5
106 0.53
107 0.62
108 0.66
109 0.69
110 0.74
111 0.74
112 0.73
113 0.76
114 0.8
115 0.82
116 0.77
117 0.73
118 0.66
119 0.58
120 0.5
121 0.43
122 0.35
123 0.25
124 0.21
125 0.14
126 0.11
127 0.09
128 0.15
129 0.16
130 0.19
131 0.19
132 0.21
133 0.24
134 0.26
135 0.34
136 0.3
137 0.32
138 0.36
139 0.38
140 0.39
141 0.35
142 0.34
143 0.26
144 0.24
145 0.2
146 0.16
147 0.13
148 0.11
149 0.14
150 0.15
151 0.2
152 0.21
153 0.23
154 0.26
155 0.33
156 0.37
157 0.42
158 0.44
159 0.45
160 0.47
161 0.47
162 0.48
163 0.44
164 0.38
165 0.32
166 0.33
167 0.27
168 0.24
169 0.23
170 0.22
171 0.22
172 0.26
173 0.25
174 0.21
175 0.22
176 0.22
177 0.21
178 0.2
179 0.19
180 0.16
181 0.2
182 0.19
183 0.19
184 0.18
185 0.17
186 0.14
187 0.13
188 0.13
189 0.09
190 0.11
191 0.1
192 0.09
193 0.11
194 0.11
195 0.11
196 0.13
197 0.16
198 0.15
199 0.15
200 0.16
201 0.15
202 0.14
203 0.16
204 0.16
205 0.12
206 0.12
207 0.12
208 0.11
209 0.1
210 0.1
211 0.09
212 0.06
213 0.06
214 0.07
215 0.07
216 0.14
217 0.15
218 0.16
219 0.2
220 0.2
221 0.2
222 0.21
223 0.24
224 0.18
225 0.17
226 0.18
227 0.18
228 0.19
229 0.2
230 0.18
231 0.2
232 0.2
233 0.2
234 0.19
235 0.17
236 0.2
237 0.3
238 0.39
239 0.45
240 0.55
241 0.66
242 0.75
243 0.82
244 0.88
245 0.87
246 0.88
247 0.86
248 0.86
249 0.83
250 0.82
251 0.84
252 0.83
253 0.82
254 0.77
255 0.74
256 0.71
257 0.67
258 0.62
259 0.59
260 0.59
261 0.62
262 0.67
263 0.71
264 0.68
265 0.68
266 0.71
267 0.67
268 0.64
269 0.63
270 0.62
271 0.61
272 0.59
273 0.57
274 0.56
275 0.53
276 0.46
277 0.45
278 0.37
279 0.28
280 0.26
281 0.23
282 0.18
283 0.18
284 0.18
285 0.11
286 0.11
287 0.11
288 0.1
289 0.14
290 0.15
291 0.17
292 0.18
293 0.18
294 0.17
295 0.2
296 0.27
297 0.28
298 0.29
299 0.32
300 0.36
301 0.36
302 0.37
303 0.33
304 0.29
305 0.32
306 0.31
307 0.26
308 0.26
309 0.25
310 0.27
311 0.27
312 0.25
313 0.24
314 0.29
315 0.29
316 0.27
317 0.29
318 0.27
319 0.33
320 0.36
321 0.38
322 0.36
323 0.41
324 0.46
325 0.49
326 0.51
327 0.51
328 0.52
329 0.47
330 0.44
331 0.43
332 0.35
333 0.3
334 0.3
335 0.23
336 0.21
337 0.24
338 0.24
339 0.22
340 0.22
341 0.2
342 0.17
343 0.15
344 0.14
345 0.08
346 0.08
347 0.06
348 0.07
349 0.07
350 0.08
351 0.14
352 0.19
353 0.21
354 0.22
355 0.27
356 0.28
357 0.29
358 0.31
359 0.28
360 0.3
361 0.32
362 0.31
363 0.28
364 0.3
365 0.28
366 0.25
367 0.24
368 0.18
369 0.14
370 0.13
371 0.13
372 0.11
373 0.11
374 0.12
375 0.11
376 0.1
377 0.1
378 0.12
379 0.12
380 0.1
381 0.1
382 0.09
383 0.09
384 0.09
385 0.1
386 0.08
387 0.1
388 0.1
389 0.11
390 0.12
391 0.15
392 0.16
393 0.17
394 0.21
395 0.22
396 0.25
397 0.27
398 0.27
399 0.27
400 0.29
401 0.28
402 0.27
403 0.25
404 0.22
405 0.23
406 0.23
407 0.21
408 0.2
409 0.19
410 0.15
411 0.14
412 0.14
413 0.1
414 0.1
415 0.1
416 0.09
417 0.09
418 0.1
419 0.16
420 0.21
421 0.24
422 0.29
423 0.34
424 0.36
425 0.41
426 0.43
427 0.43
428 0.46
429 0.5