Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409XPU1

Protein Details
Accession A0A409XPU1    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
344-372AYPDPIAKNTKKKKEKVYHPPPPGKGKNTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
351-371KNTKKKKEKVYHPPPPGKGKN
Subcellular Location(s) mito 23, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002305  aa-tRNA-synth_Ic  
IPR014729  Rossmann-like_a/b/a_fold  
IPR002307  Tyr-tRNA-ligase  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0004831  F:tyrosine-tRNA ligase activity  
GO:0006437  P:tyrosyl-tRNA aminoacylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00579  tRNA-synt_1b  
Amino Acid Sequences MLVYTCRNCPNRKTLVAPLLTTSSTHVPLNELAHLIAANCTDLHAFLDNMKAPLELITHRTKYYEFLLRAVFTSLGIPTSTLRFVEGSSFQLSKEYTMDNYRLCASVTEQDAKKAGAEVVKQVDSAPLSGLLYPGLQALDEQYLGVDFQFGGVDQRKIFTFAELYLPRLGYAKRAHLMNAMVPGLAGGKMSSSDPNSKIDFLDTAETVRKKLKAAFCEEGTVEGNGVLAFVEAVFIPISQLRLEHKMAVDAGSGTLLEEGMGDQRPFITEDAPKGTVFSIERDPKFGGTMHYSSFSAIHDDFACKNLHPSDLKKAVADGTVRLLNPIRKAFEENEEWQRIEKLAYPDPIAKNTKKKKEKVYHPPPPGKGKNTQAPRAPSPAASPEIVHAETKVVTQQVPTISQTSWRRANIFQACSRFLSRLKRRVSNVVTNISASPPRPNEPRRSL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.65
3 0.63
4 0.56
5 0.5
6 0.44
7 0.39
8 0.34
9 0.28
10 0.23
11 0.22
12 0.22
13 0.2
14 0.19
15 0.22
16 0.24
17 0.22
18 0.19
19 0.17
20 0.17
21 0.16
22 0.14
23 0.12
24 0.1
25 0.09
26 0.08
27 0.09
28 0.08
29 0.08
30 0.1
31 0.1
32 0.1
33 0.11
34 0.16
35 0.18
36 0.18
37 0.18
38 0.16
39 0.15
40 0.16
41 0.17
42 0.14
43 0.17
44 0.24
45 0.26
46 0.27
47 0.28
48 0.28
49 0.28
50 0.32
51 0.36
52 0.29
53 0.3
54 0.32
55 0.31
56 0.32
57 0.3
58 0.24
59 0.16
60 0.16
61 0.13
62 0.11
63 0.1
64 0.1
65 0.09
66 0.12
67 0.12
68 0.11
69 0.12
70 0.12
71 0.12
72 0.15
73 0.15
74 0.16
75 0.18
76 0.19
77 0.17
78 0.2
79 0.2
80 0.17
81 0.17
82 0.16
83 0.15
84 0.19
85 0.22
86 0.2
87 0.22
88 0.22
89 0.2
90 0.19
91 0.17
92 0.16
93 0.18
94 0.21
95 0.26
96 0.25
97 0.26
98 0.27
99 0.26
100 0.24
101 0.2
102 0.18
103 0.15
104 0.15
105 0.18
106 0.2
107 0.2
108 0.2
109 0.19
110 0.19
111 0.16
112 0.16
113 0.12
114 0.09
115 0.09
116 0.09
117 0.09
118 0.07
119 0.07
120 0.06
121 0.06
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.05
130 0.05
131 0.06
132 0.05
133 0.04
134 0.03
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.08
139 0.1
140 0.12
141 0.12
142 0.13
143 0.13
144 0.16
145 0.16
146 0.14
147 0.12
148 0.12
149 0.19
150 0.18
151 0.2
152 0.18
153 0.18
154 0.17
155 0.18
156 0.18
157 0.16
158 0.18
159 0.2
160 0.22
161 0.22
162 0.22
163 0.23
164 0.24
165 0.19
166 0.19
167 0.15
168 0.12
169 0.11
170 0.1
171 0.08
172 0.07
173 0.06
174 0.03
175 0.03
176 0.04
177 0.05
178 0.07
179 0.09
180 0.13
181 0.15
182 0.18
183 0.19
184 0.19
185 0.19
186 0.18
187 0.16
188 0.12
189 0.13
190 0.1
191 0.1
192 0.13
193 0.14
194 0.14
195 0.17
196 0.17
197 0.16
198 0.22
199 0.26
200 0.26
201 0.32
202 0.34
203 0.31
204 0.32
205 0.3
206 0.26
207 0.22
208 0.18
209 0.11
210 0.08
211 0.07
212 0.05
213 0.05
214 0.04
215 0.03
216 0.02
217 0.02
218 0.03
219 0.02
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.04
224 0.04
225 0.05
226 0.05
227 0.06
228 0.08
229 0.12
230 0.13
231 0.14
232 0.13
233 0.14
234 0.14
235 0.13
236 0.12
237 0.08
238 0.07
239 0.06
240 0.05
241 0.04
242 0.04
243 0.03
244 0.03
245 0.03
246 0.03
247 0.05
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.07
253 0.08
254 0.09
255 0.1
256 0.1
257 0.13
258 0.16
259 0.18
260 0.17
261 0.16
262 0.16
263 0.16
264 0.15
265 0.15
266 0.19
267 0.25
268 0.26
269 0.28
270 0.28
271 0.26
272 0.27
273 0.25
274 0.2
275 0.18
276 0.19
277 0.17
278 0.18
279 0.18
280 0.17
281 0.17
282 0.15
283 0.14
284 0.12
285 0.13
286 0.12
287 0.14
288 0.14
289 0.15
290 0.16
291 0.12
292 0.16
293 0.15
294 0.19
295 0.2
296 0.23
297 0.3
298 0.34
299 0.34
300 0.31
301 0.31
302 0.28
303 0.27
304 0.25
305 0.17
306 0.15
307 0.17
308 0.17
309 0.18
310 0.2
311 0.2
312 0.24
313 0.26
314 0.25
315 0.24
316 0.28
317 0.29
318 0.31
319 0.34
320 0.34
321 0.39
322 0.39
323 0.38
324 0.35
325 0.34
326 0.29
327 0.25
328 0.25
329 0.22
330 0.25
331 0.26
332 0.28
333 0.34
334 0.35
335 0.41
336 0.42
337 0.43
338 0.48
339 0.56
340 0.65
341 0.68
342 0.73
343 0.78
344 0.82
345 0.86
346 0.87
347 0.88
348 0.88
349 0.89
350 0.9
351 0.85
352 0.85
353 0.82
354 0.76
355 0.72
356 0.7
357 0.69
358 0.68
359 0.69
360 0.66
361 0.65
362 0.64
363 0.62
364 0.55
365 0.47
366 0.43
367 0.4
368 0.36
369 0.3
370 0.26
371 0.22
372 0.25
373 0.25
374 0.21
375 0.17
376 0.16
377 0.16
378 0.16
379 0.16
380 0.14
381 0.13
382 0.14
383 0.17
384 0.18
385 0.2
386 0.22
387 0.22
388 0.2
389 0.28
390 0.34
391 0.37
392 0.41
393 0.42
394 0.44
395 0.43
396 0.53
397 0.53
398 0.53
399 0.52
400 0.51
401 0.5
402 0.51
403 0.51
404 0.45
405 0.42
406 0.47
407 0.51
408 0.54
409 0.6
410 0.64
411 0.67
412 0.74
413 0.76
414 0.75
415 0.71
416 0.69
417 0.62
418 0.55
419 0.51
420 0.45
421 0.41
422 0.32
423 0.33
424 0.32
425 0.37
426 0.45
427 0.52