FuNGI

A0A409XN35

Protein Details

Accession

A0A409XN35

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
2-29	STAPTPAKSTKSKKDKDKERKGSLPLAS	Hydrophilic
61-86	ASWRIYYPGKLRKKLNKENVPSRAYI	Hydrophilic
358-379	AGAATERKKREREREKDKEVKE	Basic
401-424	TDKPLPPQSPKEKKTRRGGRGGGG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
11-23	TKSKKDKDKERKG
215-221	EEKKKAN
239-247	SSKKGSKKG
285-297	KPAKPPRPPRAPP
364-375	RKKREREREKDK
410-424	PKEKKTRRGGRGGGG
477-502	SRGGGGRRGRGGGRGRGGGGGGGGVG

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 12.5, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF03467 Smg4_UPF3
CDD	cd12455 RRM_like_Smg4_UPF3

Amino Acid Sequences

MSTAPTPAKSTKSKKDKDKERKGSLPLASERLKTVVRRLPPNLPEDVFWQSVQPWVTEETASWRIYYPGKLRKKLNKENVPSRAYIAFRNEDQLALFSREYDGHVFRDKAGNESQAVVEFAPYPKVPSEKRKPDSRNATIEKDEDYISFLESLKASENPEPVTLESLIASSQPLPPPKTTPLLEALKAEKSANRDKEAILRNHAHYQTAISSRKEEKKKANVPPSSNKPSEPAAATSGSSKKGSKKGTGPSANSELKPSKSSGQVSKNPPNTSNNAPASNQSTAKPAKPPRPPRAPPAAKQENRTNSSNIAVPPTPPPDGSSAASSVTPAAPPRRTRPVIGLASRQFEAALSGVAGLAGAATERKKREREREKDKEVKEAGSSSAVAQAPQVFARIDGSDTDKPLPPQSPKEKKTRRGGRGGGGGGGGNASEAPQVKIPSILQRAEVPPVIRKEGPAGVVVLPEVPAGPSGSGGNASRGGGGRRGRGGGRGRGGGGGGGGVGGGGGGGGGVGGGGG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.78
2	0.85
3	0.89
4	0.91
5	0.93
6	0.93
7	0.91
8	0.9
9	0.86
10	0.83
11	0.76
12	0.73
13	0.66
14	0.62
15	0.56
16	0.49
17	0.45
18	0.4
19	0.4
20	0.34
21	0.38
22	0.38
23	0.42
24	0.49
25	0.53
26	0.58
27	0.59
28	0.61
29	0.57
30	0.51
31	0.45
32	0.41
33	0.41
34	0.33
35	0.28
36	0.26
37	0.21
38	0.24
39	0.23
40	0.19
41	0.16
42	0.16
43	0.18
44	0.16
45	0.16
46	0.19
47	0.24
48	0.24
49	0.23
50	0.21
51	0.23
52	0.25
53	0.32
54	0.34
55	0.39
56	0.48
57	0.54
58	0.63
59	0.71
60	0.78
61	0.83
62	0.85
63	0.85
64	0.85
65	0.88
66	0.87
67	0.8
68	0.7
69	0.63
70	0.56
71	0.48
72	0.42
73	0.38
74	0.33
75	0.3
76	0.33
77	0.3
78	0.26
79	0.25
80	0.22
81	0.19
82	0.19
83	0.18
84	0.14
85	0.15
86	0.16
87	0.17
88	0.19
89	0.19
90	0.18
91	0.23
92	0.24
93	0.24
94	0.29
95	0.28
96	0.28
97	0.29
98	0.28
99	0.24
100	0.25
101	0.23
102	0.18
103	0.18
104	0.14
105	0.12
106	0.11
107	0.11
108	0.12
109	0.12
110	0.13
111	0.14
112	0.2
113	0.25
114	0.33
115	0.44
116	0.51
117	0.58
118	0.66
119	0.7
120	0.75
121	0.8
122	0.76
123	0.75
124	0.7
125	0.69
126	0.61
127	0.56
128	0.48
129	0.39
130	0.33
131	0.23
132	0.19
133	0.15
134	0.13
135	0.13
136	0.11
137	0.11
138	0.1
139	0.11
140	0.11
141	0.12
142	0.14
143	0.16
144	0.17
145	0.17
146	0.18
147	0.19
148	0.17
149	0.18
150	0.16
151	0.13
152	0.11
153	0.1
154	0.09
155	0.08
156	0.08
157	0.06
158	0.09
159	0.12
160	0.16
161	0.19
162	0.2
163	0.24
164	0.27
165	0.31
166	0.29
167	0.28
168	0.31
169	0.31
170	0.31
171	0.29
172	0.28
173	0.24
174	0.24
175	0.23
176	0.18
177	0.2
178	0.28
179	0.29
180	0.3
181	0.3
182	0.3
183	0.37
184	0.42
185	0.4
186	0.37
187	0.37
188	0.36
189	0.41
190	0.41
191	0.34
192	0.26
193	0.25
194	0.23
195	0.26
196	0.27
197	0.21
198	0.25
199	0.31
200	0.4
201	0.44
202	0.47
203	0.49
204	0.56
205	0.64
206	0.69
207	0.72
208	0.69
209	0.7
210	0.71
211	0.72
212	0.68
213	0.61
214	0.52
215	0.45
216	0.4
217	0.37
218	0.29
219	0.22
220	0.17
221	0.16
222	0.16
223	0.16
224	0.16
225	0.16
226	0.16
227	0.17
228	0.2
229	0.26
230	0.29
231	0.31
232	0.35
233	0.39
234	0.47
235	0.51
236	0.47
237	0.45
238	0.48
239	0.46
240	0.4
241	0.37
242	0.3
243	0.26
244	0.26
245	0.23
246	0.19
247	0.21
248	0.24
249	0.27
250	0.32
251	0.38
252	0.44
253	0.51
254	0.54
255	0.52
256	0.51
257	0.48
258	0.44
259	0.41
260	0.41
261	0.35
262	0.31
263	0.3
264	0.29
265	0.3
266	0.28
267	0.25
268	0.18
269	0.21
270	0.21
271	0.22
272	0.28
273	0.31
274	0.37
275	0.46
276	0.55
277	0.59
278	0.68
279	0.69
280	0.68
281	0.73
282	0.7
283	0.65
284	0.66
285	0.67
286	0.6
287	0.62
288	0.63
289	0.59
290	0.58
291	0.56
292	0.47
293	0.37
294	0.36
295	0.34
296	0.26
297	0.22
298	0.18
299	0.17
300	0.18
301	0.2
302	0.2
303	0.17
304	0.18
305	0.17
306	0.19
307	0.19
308	0.18
309	0.15
310	0.15
311	0.15
312	0.14
313	0.11
314	0.09
315	0.09
316	0.1
317	0.15
318	0.19
319	0.23
320	0.28
321	0.37
322	0.38
323	0.39
324	0.41
325	0.45
326	0.46
327	0.46
328	0.48
329	0.41
330	0.42
331	0.4
332	0.35
333	0.26
334	0.19
335	0.17
336	0.1
337	0.08
338	0.05
339	0.05
340	0.05
341	0.04
342	0.04
343	0.03
344	0.02
345	0.02
346	0.02
347	0.04
348	0.06
349	0.11
350	0.15
351	0.21
352	0.29
353	0.37
354	0.49
355	0.58
356	0.67
357	0.73
358	0.8
359	0.85
360	0.86
361	0.8
362	0.78
363	0.69
364	0.6
365	0.51
366	0.42
367	0.33
368	0.25
369	0.24
370	0.15
371	0.19
372	0.17
373	0.15
374	0.15
375	0.15
376	0.14
377	0.14
378	0.15
379	0.09
380	0.09
381	0.11
382	0.11
383	0.1
384	0.11
385	0.17
386	0.18
387	0.2
388	0.23
389	0.23
390	0.24
391	0.28
392	0.32
393	0.31
394	0.38
395	0.47
396	0.55
397	0.58
398	0.68
399	0.73
400	0.77
401	0.83
402	0.84
403	0.81
404	0.81
405	0.8
406	0.76
407	0.73
408	0.65
409	0.55
410	0.44
411	0.36
412	0.26
413	0.21
414	0.13
415	0.06
416	0.05
417	0.05
418	0.06
419	0.07
420	0.09
421	0.12
422	0.13
423	0.14
424	0.16
425	0.17
426	0.24
427	0.28
428	0.28
429	0.26
430	0.3
431	0.32
432	0.33
433	0.35
434	0.29
435	0.3
436	0.33
437	0.36
438	0.32
439	0.31
440	0.31
441	0.32
442	0.31
443	0.25
444	0.23
445	0.19
446	0.18
447	0.18
448	0.13
449	0.1
450	0.09
451	0.08
452	0.06
453	0.07
454	0.07
455	0.07
456	0.08
457	0.08
458	0.09
459	0.11
460	0.12
461	0.14
462	0.14
463	0.15
464	0.16
465	0.18
466	0.2
467	0.24
468	0.27
469	0.29
470	0.31
471	0.34
472	0.33
473	0.39
474	0.45
475	0.46
476	0.47
477	0.45
478	0.43
479	0.4
480	0.39
481	0.31
482	0.23
483	0.15
484	0.09
485	0.06
486	0.05
487	0.04
488	0.03
489	0.03
490	0.02
491	0.02
492	0.02
493	0.01
494	0.01
495	0.02
496	0.01

A0A409XN35

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer