Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

K1VKD7

Protein Details
Accession K1VKD7    Localization Confidence High Confidence Score 18.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
188-211VGMAKVNKKRTWRQYMNRRGGFNRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
15-33RGGARGRGGRDRSRSPVRD
108-123RPLDRRAIEEGRRRRE
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MPRDEPLRYNDSPPRGGARGRGGRDRSRSPVRDSRRYDDRRDRDYGGDRRPHDDRGDRDYGHPDRERRYERGGYDRGRGGYSRDSRDSRDSRDSRDRDWDRDRGDRERPLDRRAIEEGRRRREEERARGVVYTDDGRKIEPEAPPAEEEEQEAEPAEEMDEETAAMAAMMGFGGFGTTKGAEVEGNDVGMAKVNKKRTWRQYMNRRGGFNRPLDKIK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.42
3 0.41
4 0.4
5 0.43
6 0.45
7 0.48
8 0.54
9 0.54
10 0.59
11 0.64
12 0.65
13 0.63
14 0.65
15 0.64
16 0.64
17 0.67
18 0.68
19 0.71
20 0.72
21 0.71
22 0.72
23 0.73
24 0.75
25 0.76
26 0.76
27 0.71
28 0.7
29 0.65
30 0.6
31 0.64
32 0.62
33 0.6
34 0.59
35 0.55
36 0.55
37 0.55
38 0.52
39 0.49
40 0.48
41 0.44
42 0.44
43 0.48
44 0.43
45 0.43
46 0.47
47 0.44
48 0.43
49 0.44
50 0.4
51 0.4
52 0.48
53 0.51
54 0.47
55 0.51
56 0.49
57 0.47
58 0.51
59 0.52
60 0.46
61 0.45
62 0.44
63 0.38
64 0.34
65 0.31
66 0.26
67 0.28
68 0.31
69 0.31
70 0.33
71 0.34
72 0.36
73 0.44
74 0.44
75 0.41
76 0.46
77 0.43
78 0.45
79 0.53
80 0.52
81 0.46
82 0.54
83 0.51
84 0.48
85 0.51
86 0.49
87 0.43
88 0.47
89 0.48
90 0.43
91 0.45
92 0.43
93 0.41
94 0.44
95 0.43
96 0.39
97 0.4
98 0.36
99 0.34
100 0.33
101 0.35
102 0.34
103 0.4
104 0.45
105 0.48
106 0.51
107 0.5
108 0.48
109 0.53
110 0.55
111 0.55
112 0.56
113 0.51
114 0.49
115 0.46
116 0.45
117 0.35
118 0.28
119 0.22
120 0.15
121 0.14
122 0.14
123 0.14
124 0.14
125 0.15
126 0.18
127 0.16
128 0.18
129 0.18
130 0.19
131 0.2
132 0.21
133 0.2
134 0.17
135 0.16
136 0.14
137 0.13
138 0.12
139 0.11
140 0.09
141 0.08
142 0.08
143 0.07
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.03
152 0.03
153 0.03
154 0.02
155 0.02
156 0.02
157 0.02
158 0.02
159 0.02
160 0.03
161 0.03
162 0.03
163 0.05
164 0.05
165 0.06
166 0.06
167 0.07
168 0.07
169 0.08
170 0.11
171 0.1
172 0.1
173 0.09
174 0.09
175 0.09
176 0.13
177 0.14
178 0.16
179 0.22
180 0.29
181 0.34
182 0.42
183 0.53
184 0.59
185 0.69
186 0.74
187 0.79
188 0.83
189 0.89
190 0.92
191 0.88
192 0.83
193 0.76
194 0.75
195 0.71
196 0.69
197 0.66