Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409XUP0

Protein Details
Accession A0A409XUP0    Localization Confidence High Confidence Score 16.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
70-92GSMDDGRKEKKRKESSKFGKDMSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
76-86RKEKKRKESSK
171-192RGRERVRERLLEGIEERRRRAR
370-372KRR
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 10.5, mito 5, extr 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013907  Sds3  
Gene Ontology GO:0005654  C:nucleoplasm  
Pfam View protein in Pfam  
PF08598  Sds3  
Amino Acid Sequences MPPQSGIFAVPHGTIPTPTPSGIATASLGSGLVGGPSHLQQHQHQHQPQSRGNQHSAHQPAAGSSSRHGGSMDDGRKEKKRKESSKFGKDMSDRRDDGRHFTESISALHNTAHILSTRPEMSNLFLLRLYPLSLERSALTAQLENEERYSIECAQVAYEEERDRVEEEWKRGRERVRERLLEGIEERRRRAREEKDGEGIVGDAALDLHSRPPITRKLRNKLGTSPPPTPHNGSHINGSAHALSFPITNFHNTSGNPNGTIMASNLPITTGPFLNPHSLSVEDLPSPFPLPLTSTHLPPSGGTNGAALGGAGGAAGGGGAQGGGGRRRVKGGGAHQGQAVGGLGKSLLVLNTIRDNDLESDLGEIRRGNKRRRATAAATAARGVV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.16
3 0.2
4 0.2
5 0.19
6 0.19
7 0.18
8 0.19
9 0.18
10 0.17
11 0.13
12 0.11
13 0.11
14 0.1
15 0.1
16 0.07
17 0.07
18 0.05
19 0.05
20 0.04
21 0.05
22 0.06
23 0.08
24 0.11
25 0.13
26 0.17
27 0.22
28 0.33
29 0.4
30 0.49
31 0.54
32 0.6
33 0.65
34 0.7
35 0.7
36 0.7
37 0.7
38 0.67
39 0.66
40 0.6
41 0.56
42 0.56
43 0.55
44 0.46
45 0.39
46 0.32
47 0.28
48 0.29
49 0.28
50 0.2
51 0.17
52 0.21
53 0.2
54 0.2
55 0.2
56 0.16
57 0.18
58 0.26
59 0.3
60 0.3
61 0.33
62 0.38
63 0.47
64 0.54
65 0.57
66 0.58
67 0.65
68 0.69
69 0.76
70 0.82
71 0.84
72 0.87
73 0.85
74 0.76
75 0.73
76 0.69
77 0.67
78 0.62
79 0.59
80 0.5
81 0.48
82 0.52
83 0.46
84 0.46
85 0.43
86 0.39
87 0.32
88 0.31
89 0.32
90 0.26
91 0.26
92 0.23
93 0.19
94 0.16
95 0.15
96 0.15
97 0.12
98 0.11
99 0.11
100 0.08
101 0.09
102 0.1
103 0.13
104 0.15
105 0.15
106 0.15
107 0.15
108 0.17
109 0.2
110 0.19
111 0.17
112 0.15
113 0.15
114 0.15
115 0.14
116 0.13
117 0.08
118 0.09
119 0.12
120 0.12
121 0.12
122 0.12
123 0.13
124 0.13
125 0.13
126 0.13
127 0.11
128 0.11
129 0.13
130 0.14
131 0.13
132 0.13
133 0.12
134 0.12
135 0.11
136 0.14
137 0.11
138 0.1
139 0.11
140 0.1
141 0.1
142 0.1
143 0.11
144 0.09
145 0.11
146 0.11
147 0.11
148 0.11
149 0.12
150 0.12
151 0.12
152 0.17
153 0.19
154 0.23
155 0.31
156 0.33
157 0.35
158 0.38
159 0.42
160 0.45
161 0.5
162 0.55
163 0.54
164 0.54
165 0.52
166 0.54
167 0.49
168 0.41
169 0.34
170 0.32
171 0.3
172 0.29
173 0.3
174 0.3
175 0.31
176 0.34
177 0.4
178 0.4
179 0.45
180 0.48
181 0.5
182 0.48
183 0.46
184 0.42
185 0.34
186 0.26
187 0.16
188 0.1
189 0.06
190 0.03
191 0.02
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.04
196 0.05
197 0.05
198 0.06
199 0.1
200 0.19
201 0.26
202 0.35
203 0.43
204 0.51
205 0.61
206 0.66
207 0.66
208 0.64
209 0.67
210 0.66
211 0.63
212 0.6
213 0.53
214 0.51
215 0.5
216 0.46
217 0.38
218 0.35
219 0.34
220 0.3
221 0.3
222 0.3
223 0.28
224 0.24
225 0.24
226 0.19
227 0.14
228 0.13
229 0.1
230 0.07
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.08
235 0.1
236 0.11
237 0.13
238 0.15
239 0.15
240 0.2
241 0.24
242 0.24
243 0.22
244 0.21
245 0.2
246 0.17
247 0.17
248 0.13
249 0.09
250 0.09
251 0.09
252 0.08
253 0.08
254 0.08
255 0.08
256 0.09
257 0.08
258 0.08
259 0.1
260 0.12
261 0.16
262 0.16
263 0.16
264 0.16
265 0.17
266 0.17
267 0.17
268 0.17
269 0.14
270 0.14
271 0.14
272 0.13
273 0.13
274 0.12
275 0.1
276 0.09
277 0.1
278 0.12
279 0.19
280 0.2
281 0.21
282 0.24
283 0.25
284 0.25
285 0.23
286 0.25
287 0.19
288 0.19
289 0.17
290 0.15
291 0.13
292 0.13
293 0.12
294 0.08
295 0.05
296 0.04
297 0.03
298 0.03
299 0.02
300 0.02
301 0.02
302 0.02
303 0.02
304 0.01
305 0.02
306 0.02
307 0.02
308 0.03
309 0.05
310 0.08
311 0.13
312 0.16
313 0.17
314 0.21
315 0.22
316 0.24
317 0.29
318 0.35
319 0.4
320 0.41
321 0.42
322 0.4
323 0.39
324 0.36
325 0.29
326 0.22
327 0.12
328 0.08
329 0.07
330 0.06
331 0.05
332 0.06
333 0.06
334 0.06
335 0.07
336 0.08
337 0.1
338 0.16
339 0.18
340 0.18
341 0.18
342 0.2
343 0.2
344 0.22
345 0.2
346 0.14
347 0.16
348 0.18
349 0.18
350 0.18
351 0.17
352 0.21
353 0.3
354 0.39
355 0.45
356 0.52
357 0.61
358 0.69
359 0.75
360 0.78
361 0.74
362 0.76
363 0.77
364 0.72
365 0.64