Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409XD17

Protein Details
Accession A0A409XD17    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
345-372VEPVKRETKAEKKEKREKEKLEKKRLAGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
239-286GGKKGAKGKADAEDSKKGGKKRKASPSPDEPSKKKTKPATKVTKGRMK
349-371KRETKAEKKEKREKEKLEKKRLA
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 10.833, cyto 8, cyto_mito 7.333, mito 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013243  SCA7_dom  
IPR037804  SGF73  
IPR003923  TFIID_30kDa  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF08313  SCA7  
PF03540  TFIID_30kDa  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51505  SCA7  
Amino Acid Sequences MSNSQQTPTYGYPISSPYVPVVAESSAQAQAQQSGQGASASASASATAASASTSVQAPAAQSRQAAEEARKDRTLADFMLMLDEYEPLIPNEVTDYYLQRVGFECEDVRLKRLLSLAAQKFVSDIAADAYQHARIRTNASGGRARVNQPLTGPGSAKPSPVPSSPFSWDIPSPSSSSEAAVPPSPPTSWLPARDMKIFGARPLTSTSDIGLVKCGDCGKPILRSFILEHSDTCAIIRTGGKKGAKGKADAEDSKKGGKKRKASPSPDEPSKKKTKPATKVTKGRMKGPVDYDKQCGVINDKGMPCSRSLTCKSHAMGAKRAVEGRSRKYDELLLEWQRANNPNFVEPVKRETKAEKKEKREKEKLEKKRLAGEAAAALGIDPATITKKLGASSSSKKIGKKAAAAAAAQQRLAEELREDVSEDLDELDSEVEVEELIKSVRTAKENGVIGVPLAVPCDAGTWFIQRRERARCCRDLLINALGSGGGTGAPGGIISSTMGLMNRSTSMTAGNPGGMLRLA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.24
3 0.23
4 0.19
5 0.2
6 0.19
7 0.17
8 0.16
9 0.14
10 0.14
11 0.14
12 0.15
13 0.15
14 0.15
15 0.16
16 0.14
17 0.16
18 0.16
19 0.17
20 0.15
21 0.14
22 0.15
23 0.13
24 0.13
25 0.11
26 0.11
27 0.09
28 0.09
29 0.08
30 0.07
31 0.07
32 0.07
33 0.06
34 0.05
35 0.05
36 0.05
37 0.05
38 0.05
39 0.07
40 0.07
41 0.08
42 0.08
43 0.09
44 0.1
45 0.15
46 0.18
47 0.18
48 0.17
49 0.18
50 0.2
51 0.22
52 0.24
53 0.23
54 0.3
55 0.33
56 0.37
57 0.37
58 0.35
59 0.34
60 0.35
61 0.34
62 0.26
63 0.23
64 0.19
65 0.18
66 0.2
67 0.18
68 0.14
69 0.11
70 0.1
71 0.09
72 0.08
73 0.09
74 0.07
75 0.1
76 0.09
77 0.09
78 0.11
79 0.11
80 0.12
81 0.13
82 0.15
83 0.14
84 0.18
85 0.18
86 0.17
87 0.18
88 0.2
89 0.19
90 0.19
91 0.17
92 0.17
93 0.23
94 0.23
95 0.24
96 0.23
97 0.22
98 0.23
99 0.24
100 0.23
101 0.2
102 0.29
103 0.29
104 0.31
105 0.31
106 0.28
107 0.27
108 0.25
109 0.21
110 0.11
111 0.09
112 0.07
113 0.08
114 0.08
115 0.09
116 0.1
117 0.13
118 0.14
119 0.15
120 0.15
121 0.15
122 0.2
123 0.21
124 0.25
125 0.25
126 0.28
127 0.32
128 0.31
129 0.35
130 0.34
131 0.35
132 0.36
133 0.35
134 0.31
135 0.27
136 0.31
137 0.28
138 0.26
139 0.24
140 0.2
141 0.25
142 0.24
143 0.24
144 0.2
145 0.22
146 0.23
147 0.24
148 0.27
149 0.23
150 0.27
151 0.29
152 0.3
153 0.27
154 0.27
155 0.26
156 0.24
157 0.24
158 0.22
159 0.19
160 0.17
161 0.19
162 0.16
163 0.16
164 0.16
165 0.14
166 0.15
167 0.15
168 0.14
169 0.13
170 0.14
171 0.13
172 0.13
173 0.14
174 0.18
175 0.21
176 0.23
177 0.26
178 0.3
179 0.32
180 0.32
181 0.32
182 0.27
183 0.3
184 0.27
185 0.24
186 0.24
187 0.21
188 0.2
189 0.22
190 0.23
191 0.19
192 0.18
193 0.18
194 0.17
195 0.18
196 0.16
197 0.15
198 0.13
199 0.11
200 0.12
201 0.13
202 0.09
203 0.09
204 0.12
205 0.12
206 0.18
207 0.19
208 0.22
209 0.2
210 0.22
211 0.23
212 0.25
213 0.26
214 0.2
215 0.19
216 0.18
217 0.19
218 0.17
219 0.15
220 0.12
221 0.09
222 0.1
223 0.12
224 0.12
225 0.13
226 0.19
227 0.2
228 0.22
229 0.28
230 0.32
231 0.32
232 0.31
233 0.31
234 0.3
235 0.34
236 0.34
237 0.33
238 0.31
239 0.3
240 0.33
241 0.34
242 0.35
243 0.39
244 0.43
245 0.47
246 0.52
247 0.62
248 0.66
249 0.7
250 0.72
251 0.73
252 0.73
253 0.72
254 0.7
255 0.61
256 0.59
257 0.62
258 0.57
259 0.55
260 0.57
261 0.58
262 0.61
263 0.69
264 0.73
265 0.73
266 0.79
267 0.8
268 0.79
269 0.71
270 0.67
271 0.65
272 0.56
273 0.5
274 0.48
275 0.48
276 0.45
277 0.46
278 0.43
279 0.35
280 0.34
281 0.31
282 0.25
283 0.21
284 0.18
285 0.17
286 0.19
287 0.19
288 0.2
289 0.21
290 0.21
291 0.17
292 0.19
293 0.19
294 0.2
295 0.25
296 0.28
297 0.29
298 0.33
299 0.33
300 0.36
301 0.39
302 0.36
303 0.37
304 0.38
305 0.38
306 0.34
307 0.35
308 0.3
309 0.33
310 0.35
311 0.36
312 0.39
313 0.4
314 0.39
315 0.39
316 0.41
317 0.35
318 0.34
319 0.35
320 0.29
321 0.28
322 0.28
323 0.28
324 0.28
325 0.33
326 0.3
327 0.26
328 0.24
329 0.23
330 0.25
331 0.25
332 0.25
333 0.21
334 0.26
335 0.28
336 0.27
337 0.28
338 0.33
339 0.42
340 0.48
341 0.57
342 0.6
343 0.65
344 0.75
345 0.83
346 0.86
347 0.86
348 0.86
349 0.86
350 0.88
351 0.89
352 0.89
353 0.86
354 0.78
355 0.76
356 0.69
357 0.6
358 0.49
359 0.4
360 0.3
361 0.23
362 0.21
363 0.12
364 0.09
365 0.07
366 0.06
367 0.04
368 0.03
369 0.03
370 0.06
371 0.07
372 0.07
373 0.09
374 0.11
375 0.12
376 0.13
377 0.15
378 0.2
379 0.26
380 0.33
381 0.39
382 0.41
383 0.43
384 0.46
385 0.51
386 0.49
387 0.48
388 0.47
389 0.44
390 0.43
391 0.41
392 0.42
393 0.41
394 0.37
395 0.32
396 0.26
397 0.21
398 0.2
399 0.2
400 0.15
401 0.09
402 0.1
403 0.11
404 0.11
405 0.12
406 0.11
407 0.11
408 0.1
409 0.1
410 0.09
411 0.08
412 0.08
413 0.07
414 0.07
415 0.06
416 0.06
417 0.06
418 0.04
419 0.04
420 0.05
421 0.04
422 0.05
423 0.05
424 0.06
425 0.06
426 0.12
427 0.16
428 0.19
429 0.22
430 0.24
431 0.31
432 0.32
433 0.33
434 0.29
435 0.24
436 0.21
437 0.2
438 0.17
439 0.1
440 0.09
441 0.08
442 0.07
443 0.07
444 0.08
445 0.07
446 0.09
447 0.1
448 0.16
449 0.21
450 0.27
451 0.33
452 0.38
453 0.46
454 0.54
455 0.63
456 0.67
457 0.7
458 0.72
459 0.72
460 0.73
461 0.71
462 0.65
463 0.6
464 0.55
465 0.48
466 0.4
467 0.34
468 0.27
469 0.21
470 0.16
471 0.11
472 0.05
473 0.04
474 0.04
475 0.03
476 0.03
477 0.03
478 0.04
479 0.03
480 0.04
481 0.04
482 0.05
483 0.06
484 0.07
485 0.08
486 0.09
487 0.09
488 0.11
489 0.12
490 0.13
491 0.13
492 0.12
493 0.14
494 0.15
495 0.18
496 0.18
497 0.17
498 0.16
499 0.15