Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409XF61

Protein Details
Accession A0A409XF61    Localization Confidence High Confidence Score 15.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
183-206GDAMPENRKNRKEKMRKAFRYAVAHydrophilic
685-710DSPSPQKEAKRAKEKRRISNPNAPTAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
191-199KNRKEKMRK
692-701EAKRAKEKRR
Subcellular Location(s) nucl 11.5, mito 9, cyto_nucl 9, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019495  EXOSC1_C  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR033494  NUDE  
IPR006964  NUDE_dom  
IPR003029  S1_domain  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005856  C:cytoskeleton  
GO:0000178  C:exosome (RNase complex)  
GO:0008017  F:microtubule binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF10447  EXOSC1  
PF04880  NUDE_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50126  S1  
CDD cd05791  S1_CSL4  
Amino Acid Sequences MRSLLPGQPVPLPARAPAPQLGPGVYEKHGVIRASLLGPPRFEGSTLTVPRVQPHTPIPGSIVIGFVTRLSPLQALISITVVDGVPLPAGEEFTGVIRSQDVRATEKDRVKIGDSFRGGDVVRTQVISLGDARSYFVTTARNDLGVIFATSEAGKLGRSSSREPLIHDFKFHRSDIGACIMAGDAMPENRKNRKEKMRKAFRYAVASELDVAQNGNGVINSLPNLQLCPQPLLPPLLRDRSRKQLGLNMTAVLSATDALRKDRHISLDDNNIGYSSNTDWREKYNEVLDMLSETRTELDEFHQASKELEAELESELQRTEKSQQELQTKVARAEHERDEWKGKFISLQTTHNTTTTSLQRELDQLRQEHQKTKVHLRELEMGNDDLERNERAVSSSLADMEAKYSKALEEKILLEHELLEKAALEEDTQRLKDELRDANVEISILKDQLKSYNSRHSSSSSLARTEDSRRSILSTDDLLQTTPPSTIDLNDILPPFESPANVLTTPKASLSRPAVPSPFMPRVSQQEKPTPLRNSSNMIRSTLPSFSSPSTSSPRTLVKPPTSRNPTSMSTTSSTGSVAKNKGVQMVSDMRARVRNLEQKIHTRVPRLRMVSITGRQSVTPSISPFTPINGASSSSSPSNASTAKTSLESQRKSAESRLSNDSGSDVHFKKDTGDSSGWVLIMEDSPSPQKEAKRAKEKRRISNPNAPTAFRPTASAIHRPTSPSLSTGLMNPMAASTGLRRPISRLSGGTSSSASSASRPQTPTFLPKPSSSTYAPTSSMKRSTGPGTSSAYNQLKRSSLGKSPVAPVPPLPRTVRERPITMTGYPKSTTRAISPEVSKALPGLPDDLSANVTIRPSSRVPSSSSGISSISLLSKSRIGRPSGGFTGRKSGGGEPSSTNALDLKDLELSS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.3
3 0.31
4 0.3
5 0.3
6 0.31
7 0.31
8 0.3
9 0.27
10 0.27
11 0.27
12 0.25
13 0.24
14 0.2
15 0.23
16 0.27
17 0.24
18 0.22
19 0.21
20 0.22
21 0.22
22 0.25
23 0.27
24 0.25
25 0.26
26 0.27
27 0.28
28 0.26
29 0.24
30 0.24
31 0.24
32 0.31
33 0.32
34 0.34
35 0.36
36 0.36
37 0.41
38 0.43
39 0.38
40 0.33
41 0.35
42 0.4
43 0.37
44 0.37
45 0.35
46 0.32
47 0.33
48 0.28
49 0.24
50 0.16
51 0.15
52 0.14
53 0.12
54 0.1
55 0.09
56 0.09
57 0.1
58 0.1
59 0.1
60 0.11
61 0.12
62 0.12
63 0.12
64 0.12
65 0.11
66 0.1
67 0.1
68 0.09
69 0.07
70 0.07
71 0.07
72 0.06
73 0.06
74 0.07
75 0.06
76 0.07
77 0.07
78 0.07
79 0.07
80 0.08
81 0.1
82 0.09
83 0.09
84 0.1
85 0.12
86 0.13
87 0.16
88 0.18
89 0.2
90 0.25
91 0.3
92 0.37
93 0.41
94 0.43
95 0.44
96 0.44
97 0.43
98 0.44
99 0.44
100 0.44
101 0.4
102 0.39
103 0.35
104 0.36
105 0.32
106 0.28
107 0.26
108 0.2
109 0.19
110 0.17
111 0.17
112 0.17
113 0.17
114 0.16
115 0.16
116 0.14
117 0.14
118 0.13
119 0.15
120 0.12
121 0.13
122 0.12
123 0.13
124 0.16
125 0.16
126 0.22
127 0.21
128 0.21
129 0.2
130 0.19
131 0.18
132 0.15
133 0.14
134 0.09
135 0.08
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.07
140 0.07
141 0.07
142 0.07
143 0.1
144 0.13
145 0.17
146 0.21
147 0.27
148 0.34
149 0.35
150 0.39
151 0.44
152 0.48
153 0.45
154 0.46
155 0.43
156 0.42
157 0.46
158 0.42
159 0.35
160 0.28
161 0.29
162 0.28
163 0.29
164 0.23
165 0.18
166 0.18
167 0.15
168 0.14
169 0.12
170 0.09
171 0.06
172 0.08
173 0.11
174 0.15
175 0.21
176 0.29
177 0.37
178 0.42
179 0.51
180 0.6
181 0.68
182 0.75
183 0.81
184 0.84
185 0.85
186 0.87
187 0.86
188 0.8
189 0.76
190 0.66
191 0.58
192 0.48
193 0.4
194 0.32
195 0.25
196 0.2
197 0.13
198 0.12
199 0.08
200 0.08
201 0.07
202 0.07
203 0.05
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.08
208 0.08
209 0.09
210 0.09
211 0.1
212 0.11
213 0.14
214 0.15
215 0.18
216 0.18
217 0.19
218 0.21
219 0.24
220 0.23
221 0.25
222 0.28
223 0.33
224 0.38
225 0.42
226 0.45
227 0.5
228 0.55
229 0.53
230 0.5
231 0.48
232 0.48
233 0.48
234 0.43
235 0.34
236 0.28
237 0.26
238 0.23
239 0.16
240 0.11
241 0.06
242 0.05
243 0.07
244 0.08
245 0.1
246 0.12
247 0.14
248 0.18
249 0.2
250 0.24
251 0.24
252 0.27
253 0.29
254 0.36
255 0.37
256 0.33
257 0.3
258 0.26
259 0.23
260 0.2
261 0.17
262 0.1
263 0.15
264 0.17
265 0.19
266 0.2
267 0.23
268 0.28
269 0.27
270 0.28
271 0.25
272 0.25
273 0.23
274 0.23
275 0.19
276 0.16
277 0.16
278 0.13
279 0.1
280 0.08
281 0.08
282 0.08
283 0.09
284 0.08
285 0.09
286 0.15
287 0.16
288 0.18
289 0.18
290 0.18
291 0.18
292 0.18
293 0.16
294 0.1
295 0.09
296 0.08
297 0.07
298 0.08
299 0.1
300 0.09
301 0.09
302 0.09
303 0.09
304 0.09
305 0.1
306 0.14
307 0.17
308 0.21
309 0.24
310 0.31
311 0.36
312 0.38
313 0.4
314 0.42
315 0.38
316 0.36
317 0.34
318 0.3
319 0.28
320 0.31
321 0.3
322 0.3
323 0.31
324 0.31
325 0.35
326 0.34
327 0.33
328 0.29
329 0.25
330 0.23
331 0.22
332 0.28
333 0.24
334 0.27
335 0.27
336 0.31
337 0.31
338 0.29
339 0.28
340 0.21
341 0.22
342 0.23
343 0.24
344 0.22
345 0.22
346 0.22
347 0.26
348 0.27
349 0.27
350 0.27
351 0.24
352 0.26
353 0.33
354 0.35
355 0.36
356 0.4
357 0.4
358 0.4
359 0.49
360 0.51
361 0.48
362 0.49
363 0.46
364 0.48
365 0.44
366 0.42
367 0.34
368 0.29
369 0.24
370 0.21
371 0.18
372 0.1
373 0.1
374 0.08
375 0.07
376 0.07
377 0.07
378 0.08
379 0.09
380 0.1
381 0.09
382 0.09
383 0.09
384 0.09
385 0.09
386 0.08
387 0.08
388 0.09
389 0.08
390 0.08
391 0.08
392 0.07
393 0.09
394 0.1
395 0.1
396 0.1
397 0.11
398 0.12
399 0.13
400 0.13
401 0.1
402 0.1
403 0.1
404 0.08
405 0.07
406 0.06
407 0.05
408 0.05
409 0.06
410 0.05
411 0.04
412 0.05
413 0.08
414 0.1
415 0.1
416 0.1
417 0.1
418 0.11
419 0.12
420 0.17
421 0.17
422 0.18
423 0.19
424 0.19
425 0.19
426 0.19
427 0.17
428 0.11
429 0.09
430 0.08
431 0.07
432 0.07
433 0.07
434 0.07
435 0.11
436 0.13
437 0.16
438 0.19
439 0.27
440 0.29
441 0.3
442 0.31
443 0.3
444 0.31
445 0.29
446 0.33
447 0.25
448 0.23
449 0.22
450 0.21
451 0.21
452 0.23
453 0.25
454 0.22
455 0.21
456 0.2
457 0.21
458 0.21
459 0.19
460 0.17
461 0.13
462 0.13
463 0.13
464 0.13
465 0.12
466 0.11
467 0.11
468 0.09
469 0.08
470 0.06
471 0.07
472 0.07
473 0.07
474 0.09
475 0.1
476 0.1
477 0.12
478 0.12
479 0.11
480 0.1
481 0.1
482 0.09
483 0.09
484 0.08
485 0.06
486 0.07
487 0.1
488 0.1
489 0.1
490 0.1
491 0.1
492 0.11
493 0.11
494 0.12
495 0.1
496 0.14
497 0.18
498 0.24
499 0.25
500 0.27
501 0.27
502 0.26
503 0.27
504 0.29
505 0.29
506 0.25
507 0.23
508 0.23
509 0.3
510 0.33
511 0.37
512 0.35
513 0.37
514 0.42
515 0.45
516 0.5
517 0.46
518 0.46
519 0.45
520 0.44
521 0.42
522 0.39
523 0.42
524 0.36
525 0.34
526 0.31
527 0.28
528 0.28
529 0.24
530 0.21
531 0.16
532 0.16
533 0.15
534 0.17
535 0.17
536 0.18
537 0.22
538 0.23
539 0.23
540 0.23
541 0.27
542 0.27
543 0.31
544 0.35
545 0.38
546 0.43
547 0.46
548 0.53
549 0.57
550 0.55
551 0.53
552 0.51
553 0.45
554 0.43
555 0.41
556 0.34
557 0.29
558 0.29
559 0.26
560 0.22
561 0.2
562 0.16
563 0.16
564 0.18
565 0.17
566 0.18
567 0.2
568 0.2
569 0.24
570 0.22
571 0.2
572 0.19
573 0.23
574 0.23
575 0.23
576 0.23
577 0.2
578 0.24
579 0.24
580 0.24
581 0.26
582 0.31
583 0.32
584 0.39
585 0.41
586 0.45
587 0.51
588 0.54
589 0.51
590 0.51
591 0.52
592 0.5
593 0.53
594 0.49
595 0.44
596 0.38
597 0.39
598 0.39
599 0.38
600 0.36
601 0.32
602 0.29
603 0.28
604 0.28
605 0.25
606 0.21
607 0.18
608 0.16
609 0.15
610 0.15
611 0.18
612 0.17
613 0.17
614 0.16
615 0.14
616 0.15
617 0.14
618 0.16
619 0.14
620 0.15
621 0.15
622 0.13
623 0.14
624 0.13
625 0.13
626 0.14
627 0.14
628 0.14
629 0.14
630 0.15
631 0.15
632 0.16
633 0.18
634 0.24
635 0.32
636 0.32
637 0.32
638 0.37
639 0.38
640 0.38
641 0.41
642 0.41
643 0.36
644 0.39
645 0.43
646 0.39
647 0.37
648 0.35
649 0.31
650 0.23
651 0.21
652 0.23
653 0.18
654 0.18
655 0.19
656 0.19
657 0.2
658 0.23
659 0.23
660 0.22
661 0.22
662 0.21
663 0.23
664 0.24
665 0.21
666 0.17
667 0.15
668 0.1
669 0.1
670 0.1
671 0.07
672 0.08
673 0.11
674 0.11
675 0.14
676 0.17
677 0.19
678 0.28
679 0.38
680 0.46
681 0.55
682 0.64
683 0.73
684 0.8
685 0.86
686 0.87
687 0.88
688 0.89
689 0.86
690 0.87
691 0.8
692 0.8
693 0.73
694 0.64
695 0.56
696 0.53
697 0.47
698 0.37
699 0.34
700 0.27
701 0.3
702 0.32
703 0.37
704 0.33
705 0.33
706 0.35
707 0.35
708 0.35
709 0.34
710 0.31
711 0.25
712 0.23
713 0.22
714 0.21
715 0.2
716 0.21
717 0.17
718 0.16
719 0.14
720 0.12
721 0.11
722 0.1
723 0.09
724 0.09
725 0.13
726 0.19
727 0.2
728 0.21
729 0.24
730 0.3
731 0.34
732 0.34
733 0.3
734 0.3
735 0.32
736 0.33
737 0.31
738 0.25
739 0.21
740 0.19
741 0.18
742 0.14
743 0.12
744 0.17
745 0.19
746 0.24
747 0.27
748 0.27
749 0.31
750 0.34
751 0.41
752 0.41
753 0.44
754 0.41
755 0.4
756 0.44
757 0.43
758 0.45
759 0.38
760 0.37
761 0.35
762 0.35
763 0.36
764 0.35
765 0.36
766 0.37
767 0.39
768 0.36
769 0.34
770 0.34
771 0.36
772 0.37
773 0.34
774 0.33
775 0.33
776 0.32
777 0.32
778 0.38
779 0.4
780 0.39
781 0.39
782 0.39
783 0.36
784 0.37
785 0.38
786 0.34
787 0.34
788 0.37
789 0.39
790 0.39
791 0.41
792 0.43
793 0.43
794 0.39
795 0.36
796 0.38
797 0.36
798 0.39
799 0.37
800 0.39
801 0.45
802 0.52
803 0.57
804 0.53
805 0.53
806 0.52
807 0.57
808 0.54
809 0.49
810 0.49
811 0.42
812 0.42
813 0.4
814 0.36
815 0.34
816 0.33
817 0.33
818 0.29
819 0.32
820 0.31
821 0.36
822 0.38
823 0.39
824 0.38
825 0.36
826 0.32
827 0.28
828 0.26
829 0.22
830 0.2
831 0.17
832 0.15
833 0.16
834 0.17
835 0.16
836 0.16
837 0.14
838 0.14
839 0.13
840 0.13
841 0.13
842 0.14
843 0.17
844 0.18
845 0.22
846 0.26
847 0.27
848 0.31
849 0.35
850 0.38
851 0.36
852 0.35
853 0.33
854 0.28
855 0.26
856 0.22
857 0.19
858 0.17
859 0.15
860 0.15
861 0.16
862 0.21
863 0.23
864 0.31
865 0.35
866 0.36
867 0.41
868 0.45
869 0.5
870 0.52
871 0.56
872 0.51
873 0.47
874 0.52
875 0.47
876 0.44
877 0.4
878 0.37
879 0.37
880 0.37
881 0.37
882 0.31
883 0.33
884 0.34
885 0.31
886 0.28
887 0.22
888 0.21
889 0.2
890 0.18
891 0.17