Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409XJK6

Protein Details
Accession A0A409XJK6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
229-252RSNLKPVGFKKRRLKRAIMQKRDWHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
237-245FKKRRLKRA
510-543GARGAAPAQRGQQRGGPHARGGRGAPVPQRGGRG
Subcellular Location(s) cyto 13.5, cyto_nucl 12, nucl 9.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR025696  rRNA_proc-arch_dom  
IPR016438  SKI2-like  
IPR012961  Ski2/MTR4_C  
IPR040801  Ski2_N  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0006401  P:RNA catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF08148  DSHCT  
PF13234  rRNA_proc-arch  
PF17911  Ski2_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18795  SF2_C_Ski2  
Amino Acid Sequences MDINPHFEVLDQIVNPSGEDASKILGRLQLATTPTASEVHEDIEKRLLLPPKTFPAQWLHSYQVHWQHAVSVPYLLSAELAPPSTVLNFVRSGLDGRVTGYTETTSTRLSNGSTSTSLDRAPGPSKNFVRGKSGYVPFWPGGFDDAPIELSNDNKGVGQGKGFRTVPPGFVRGLRLPGDPVEDENLVEIEHESVEELDEAEDENNKPDEEEEIPLDQTKEVDDLLPTSRSNLKPVGFKKRRLKRAIMQKRDWAHVIDVNTPLTNFHELVPEMAHKYPFELDTFQKQAVYHLEMGDSVFVAAHTSAGKTVVAEYAIALAEKHMTRAIYTSPIKALSNQKFRDFKQTFSSSSVGILTGDVQINPEASCLIMTTEILRSMLYKGADLIRDVEFVIFDEVHYVNDAERGVVWEEVIIMLPDHVNIILLSATVPNTKEFADWVGRTKKKDIYVISTPQRPVPLEHYLYAGREMYKIVDAQRNFVGQGYKEAGEALRRKQDKEREAAGLPPVQRVGARGAAPAQRGQQRGGPHARGGRGAPVPQRGGRGGGVPPRTMHTAADKNLYVHLLGHLRKKALLPVVVFTFSKKRCEENAATLTNADLCTSVEKSEVHVAIEKALARLKGMSQYLFRKLSSEMEWAGSDRKLPQIVRTRDLLSRGIGIHHGGLLPLVKELVEILFARGLVKILFATETFAMGVNMPAKCVVFSSIRKHDGRSFRDILPGEYTQMAGRAGRRGLDPTGTVIIVANDSLPEQTTLHTMMLGVPGKLSSQFRLTYNMILNLLRVEALRVEEMIKRSFSENSSQRLLPEQQRKVIESEKSLSALPRLECPECLPDIELHYDQTLSIIEKNGRQLEMALGHSQGSKILSAGRIVILRDGHFRHGNVSVILKQAPIQTLDTGLLAKVKTYFVLAWVHPNTKSGKEDIESEAVSPVWPLTPESLKIESGVYELTAVPLTSIAMVSNRIIQVQVNDIVDRHLISRMKDAIASLQSVVDEWSSAGSIPEVDWSRIRALEFQEVLRSRNLLVKQVQNNRCVLCPEFDHHVALIHGQKILQANIAFLKLAISDQNLELIPDYEQRIGVLKDLKFIDENSTIQLKGRVACEINSANELVLTELILENTLAGYEPEEVVALLSCFVFQEKTDVEPLLSPKLETGRDAIVAISERVGRIQDFHKVSVEEFRSNLKFGLVEVVYEWAKGMPFEQITALTDVAEGTIVRVITRLDETCREVRDAARVIGDAELFKKMEECQIKIKRDIVFAASLYF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.18
3 0.17
4 0.15
5 0.11
6 0.12
7 0.12
8 0.12
9 0.14
10 0.14
11 0.15
12 0.17
13 0.18
14 0.19
15 0.2
16 0.21
17 0.21
18 0.23
19 0.21
20 0.19
21 0.2
22 0.19
23 0.18
24 0.17
25 0.16
26 0.17
27 0.21
28 0.21
29 0.21
30 0.25
31 0.25
32 0.23
33 0.28
34 0.33
35 0.32
36 0.35
37 0.4
38 0.42
39 0.46
40 0.45
41 0.42
42 0.43
43 0.45
44 0.45
45 0.44
46 0.42
47 0.4
48 0.42
49 0.46
50 0.48
51 0.45
52 0.41
53 0.37
54 0.36
55 0.37
56 0.37
57 0.31
58 0.23
59 0.19
60 0.19
61 0.19
62 0.15
63 0.11
64 0.09
65 0.1
66 0.09
67 0.1
68 0.1
69 0.1
70 0.11
71 0.1
72 0.13
73 0.13
74 0.14
75 0.14
76 0.16
77 0.17
78 0.17
79 0.19
80 0.17
81 0.19
82 0.16
83 0.17
84 0.18
85 0.18
86 0.17
87 0.16
88 0.15
89 0.14
90 0.16
91 0.16
92 0.16
93 0.15
94 0.17
95 0.17
96 0.17
97 0.19
98 0.19
99 0.21
100 0.2
101 0.22
102 0.23
103 0.23
104 0.22
105 0.21
106 0.21
107 0.22
108 0.25
109 0.29
110 0.3
111 0.38
112 0.41
113 0.48
114 0.52
115 0.49
116 0.53
117 0.49
118 0.5
119 0.5
120 0.51
121 0.44
122 0.41
123 0.44
124 0.37
125 0.35
126 0.3
127 0.21
128 0.21
129 0.19
130 0.17
131 0.13
132 0.13
133 0.14
134 0.14
135 0.14
136 0.11
137 0.11
138 0.13
139 0.12
140 0.12
141 0.11
142 0.12
143 0.14
144 0.14
145 0.18
146 0.22
147 0.24
148 0.31
149 0.31
150 0.3
151 0.34
152 0.35
153 0.36
154 0.33
155 0.33
156 0.28
157 0.3
158 0.34
159 0.3
160 0.33
161 0.3
162 0.27
163 0.27
164 0.26
165 0.28
166 0.23
167 0.22
168 0.21
169 0.19
170 0.18
171 0.17
172 0.15
173 0.11
174 0.11
175 0.1
176 0.07
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.07
182 0.07
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.07
187 0.07
188 0.1
189 0.1
190 0.13
191 0.14
192 0.14
193 0.14
194 0.13
195 0.16
196 0.15
197 0.17
198 0.17
199 0.17
200 0.18
201 0.19
202 0.2
203 0.17
204 0.15
205 0.13
206 0.11
207 0.1
208 0.1
209 0.09
210 0.1
211 0.13
212 0.15
213 0.14
214 0.16
215 0.23
216 0.23
217 0.27
218 0.3
219 0.3
220 0.37
221 0.44
222 0.52
223 0.52
224 0.61
225 0.68
226 0.73
227 0.8
228 0.79
229 0.8
230 0.78
231 0.82
232 0.83
233 0.83
234 0.78
235 0.77
236 0.73
237 0.69
238 0.62
239 0.52
240 0.44
241 0.38
242 0.34
243 0.29
244 0.27
245 0.24
246 0.23
247 0.2
248 0.18
249 0.17
250 0.18
251 0.15
252 0.13
253 0.16
254 0.16
255 0.17
256 0.18
257 0.17
258 0.17
259 0.18
260 0.19
261 0.15
262 0.17
263 0.18
264 0.17
265 0.17
266 0.18
267 0.19
268 0.25
269 0.28
270 0.27
271 0.26
272 0.25
273 0.26
274 0.27
275 0.27
276 0.22
277 0.19
278 0.19
279 0.17
280 0.17
281 0.15
282 0.1
283 0.07
284 0.05
285 0.04
286 0.05
287 0.05
288 0.06
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.08
296 0.08
297 0.07
298 0.07
299 0.07
300 0.07
301 0.07
302 0.07
303 0.06
304 0.05
305 0.09
306 0.09
307 0.1
308 0.1
309 0.1
310 0.11
311 0.13
312 0.14
313 0.18
314 0.2
315 0.21
316 0.21
317 0.23
318 0.23
319 0.26
320 0.35
321 0.36
322 0.44
323 0.45
324 0.51
325 0.54
326 0.55
327 0.62
328 0.53
329 0.47
330 0.46
331 0.48
332 0.42
333 0.41
334 0.41
335 0.3
336 0.29
337 0.26
338 0.17
339 0.13
340 0.11
341 0.08
342 0.09
343 0.09
344 0.08
345 0.09
346 0.09
347 0.09
348 0.09
349 0.08
350 0.06
351 0.06
352 0.06
353 0.05
354 0.05
355 0.05
356 0.05
357 0.06
358 0.07
359 0.08
360 0.08
361 0.08
362 0.08
363 0.09
364 0.12
365 0.11
366 0.1
367 0.11
368 0.13
369 0.14
370 0.14
371 0.15
372 0.13
373 0.13
374 0.13
375 0.11
376 0.09
377 0.09
378 0.1
379 0.07
380 0.06
381 0.09
382 0.09
383 0.09
384 0.09
385 0.09
386 0.07
387 0.09
388 0.1
389 0.07
390 0.07
391 0.09
392 0.09
393 0.09
394 0.08
395 0.06
396 0.07
397 0.07
398 0.07
399 0.05
400 0.04
401 0.04
402 0.04
403 0.04
404 0.04
405 0.04
406 0.04
407 0.04
408 0.04
409 0.04
410 0.04
411 0.04
412 0.05
413 0.06
414 0.07
415 0.08
416 0.08
417 0.09
418 0.09
419 0.09
420 0.09
421 0.12
422 0.15
423 0.15
424 0.21
425 0.3
426 0.33
427 0.35
428 0.39
429 0.41
430 0.39
431 0.44
432 0.4
433 0.38
434 0.41
435 0.46
436 0.47
437 0.47
438 0.44
439 0.4
440 0.4
441 0.34
442 0.3
443 0.27
444 0.28
445 0.26
446 0.25
447 0.26
448 0.25
449 0.24
450 0.23
451 0.19
452 0.13
453 0.12
454 0.11
455 0.1
456 0.1
457 0.11
458 0.13
459 0.18
460 0.18
461 0.2
462 0.21
463 0.2
464 0.2
465 0.2
466 0.18
467 0.12
468 0.15
469 0.15
470 0.14
471 0.14
472 0.14
473 0.13
474 0.17
475 0.19
476 0.2
477 0.26
478 0.27
479 0.29
480 0.37
481 0.45
482 0.44
483 0.46
484 0.46
485 0.42
486 0.41
487 0.4
488 0.35
489 0.3
490 0.26
491 0.21
492 0.18
493 0.14
494 0.14
495 0.13
496 0.13
497 0.13
498 0.13
499 0.12
500 0.15
501 0.17
502 0.18
503 0.19
504 0.21
505 0.22
506 0.23
507 0.24
508 0.24
509 0.24
510 0.3
511 0.33
512 0.3
513 0.28
514 0.3
515 0.3
516 0.28
517 0.26
518 0.24
519 0.21
520 0.22
521 0.22
522 0.23
523 0.24
524 0.24
525 0.26
526 0.21
527 0.21
528 0.19
529 0.18
530 0.16
531 0.2
532 0.2
533 0.19
534 0.19
535 0.19
536 0.21
537 0.2
538 0.18
539 0.18
540 0.21
541 0.22
542 0.25
543 0.23
544 0.21
545 0.21
546 0.21
547 0.15
548 0.1
549 0.11
550 0.13
551 0.15
552 0.19
553 0.2
554 0.2
555 0.21
556 0.21
557 0.22
558 0.2
559 0.21
560 0.17
561 0.17
562 0.18
563 0.18
564 0.17
565 0.16
566 0.2
567 0.18
568 0.23
569 0.23
570 0.25
571 0.26
572 0.32
573 0.33
574 0.34
575 0.38
576 0.33
577 0.32
578 0.29
579 0.27
580 0.21
581 0.18
582 0.11
583 0.06
584 0.05
585 0.06
586 0.07
587 0.07
588 0.08
589 0.08
590 0.09
591 0.13
592 0.13
593 0.12
594 0.13
595 0.13
596 0.12
597 0.14
598 0.12
599 0.1
600 0.11
601 0.1
602 0.08
603 0.09
604 0.09
605 0.11
606 0.12
607 0.12
608 0.14
609 0.17
610 0.22
611 0.23
612 0.22
613 0.2
614 0.2
615 0.21
616 0.2
617 0.19
618 0.15
619 0.14
620 0.14
621 0.14
622 0.14
623 0.12
624 0.11
625 0.1
626 0.11
627 0.13
628 0.13
629 0.19
630 0.28
631 0.31
632 0.32
633 0.33
634 0.34
635 0.33
636 0.35
637 0.29
638 0.19
639 0.18
640 0.16
641 0.14
642 0.12
643 0.11
644 0.09
645 0.08
646 0.07
647 0.05
648 0.05
649 0.05
650 0.05
651 0.04
652 0.04
653 0.04
654 0.04
655 0.04
656 0.04
657 0.04
658 0.04
659 0.05
660 0.05
661 0.05
662 0.06
663 0.06
664 0.06
665 0.05
666 0.05
667 0.05
668 0.04
669 0.05
670 0.05
671 0.06
672 0.06
673 0.06
674 0.06
675 0.06
676 0.06
677 0.06
678 0.07
679 0.08
680 0.08
681 0.08
682 0.08
683 0.08
684 0.08
685 0.08
686 0.1
687 0.11
688 0.15
689 0.22
690 0.27
691 0.33
692 0.34
693 0.36
694 0.41
695 0.45
696 0.46
697 0.46
698 0.44
699 0.39
700 0.44
701 0.42
702 0.36
703 0.32
704 0.27
705 0.21
706 0.18
707 0.17
708 0.11
709 0.12
710 0.11
711 0.08
712 0.09
713 0.1
714 0.11
715 0.11
716 0.12
717 0.13
718 0.14
719 0.14
720 0.13
721 0.12
722 0.13
723 0.11
724 0.11
725 0.09
726 0.08
727 0.07
728 0.06
729 0.05
730 0.04
731 0.04
732 0.04
733 0.04
734 0.05
735 0.05
736 0.06
737 0.07
738 0.09
739 0.08
740 0.08
741 0.08
742 0.07
743 0.11
744 0.11
745 0.1
746 0.08
747 0.09
748 0.09
749 0.11
750 0.12
751 0.1
752 0.12
753 0.14
754 0.15
755 0.2
756 0.21
757 0.22
758 0.23
759 0.22
760 0.2
761 0.19
762 0.18
763 0.13
764 0.12
765 0.09
766 0.07
767 0.06
768 0.05
769 0.06
770 0.06
771 0.06
772 0.08
773 0.1
774 0.13
775 0.14
776 0.14
777 0.14
778 0.15
779 0.17
780 0.17
781 0.23
782 0.25
783 0.28
784 0.31
785 0.3
786 0.29
787 0.32
788 0.35
789 0.35
790 0.4
791 0.39
792 0.4
793 0.42
794 0.43
795 0.42
796 0.42
797 0.36
798 0.3
799 0.3
800 0.25
801 0.24
802 0.24
803 0.21
804 0.18
805 0.19
806 0.17
807 0.18
808 0.21
809 0.2
810 0.2
811 0.22
812 0.23
813 0.2
814 0.2
815 0.16
816 0.13
817 0.15
818 0.18
819 0.16
820 0.14
821 0.14
822 0.13
823 0.12
824 0.12
825 0.1
826 0.07
827 0.08
828 0.1
829 0.12
830 0.14
831 0.18
832 0.2
833 0.19
834 0.18
835 0.17
836 0.17
837 0.18
838 0.17
839 0.14
840 0.12
841 0.13
842 0.13
843 0.12
844 0.11
845 0.09
846 0.08
847 0.07
848 0.09
849 0.09
850 0.09
851 0.1
852 0.1
853 0.11
854 0.11
855 0.13
856 0.12
857 0.13
858 0.17
859 0.18
860 0.21
861 0.22
862 0.22
863 0.22
864 0.23
865 0.23
866 0.19
867 0.2
868 0.18
869 0.17
870 0.17
871 0.15
872 0.15
873 0.16
874 0.16
875 0.15
876 0.15
877 0.13
878 0.14
879 0.14
880 0.13
881 0.11
882 0.1
883 0.1
884 0.08
885 0.09
886 0.09
887 0.09
888 0.09
889 0.1
890 0.1
891 0.1
892 0.14
893 0.14
894 0.2
895 0.23
896 0.25
897 0.24
898 0.27
899 0.27
900 0.27
901 0.29
902 0.23
903 0.23
904 0.22
905 0.25
906 0.25
907 0.25
908 0.22
909 0.2
910 0.19
911 0.16
912 0.15
913 0.12
914 0.09
915 0.06
916 0.07
917 0.07
918 0.09
919 0.12
920 0.14
921 0.18
922 0.19
923 0.19
924 0.19
925 0.19
926 0.16
927 0.14
928 0.13
929 0.08
930 0.07
931 0.07
932 0.07
933 0.07
934 0.07
935 0.06
936 0.06
937 0.06
938 0.05
939 0.05
940 0.05
941 0.05
942 0.07
943 0.07
944 0.11
945 0.11
946 0.11
947 0.11
948 0.11
949 0.12
950 0.14
951 0.17
952 0.14
953 0.15
954 0.14
955 0.15
956 0.15
957 0.14
958 0.12
959 0.14
960 0.16
961 0.17
962 0.22
963 0.23
964 0.24
965 0.23
966 0.23
967 0.22
968 0.21
969 0.2
970 0.15
971 0.13
972 0.13
973 0.12
974 0.12
975 0.08
976 0.07
977 0.06
978 0.06
979 0.05
980 0.06
981 0.06
982 0.05
983 0.06
984 0.05
985 0.11
986 0.12
987 0.14
988 0.15
989 0.17
990 0.19
991 0.2
992 0.21
993 0.19
994 0.21
995 0.26
996 0.27
997 0.25
998 0.31
999 0.31
1000 0.31
1001 0.29
1002 0.26
1003 0.2
1004 0.25
1005 0.26
1006 0.25
1007 0.29
1008 0.35
1009 0.43
1010 0.53
1011 0.57
1012 0.54
1013 0.57
1014 0.52
1015 0.49
1016 0.43
1017 0.37
1018 0.29
1019 0.27
1020 0.27
1021 0.29
1022 0.29
1023 0.28
1024 0.25
1025 0.25
1026 0.22
1027 0.22
1028 0.22
1029 0.17
1030 0.16
1031 0.15
1032 0.18
1033 0.19
1034 0.19
1035 0.2
1036 0.16
1037 0.16
1038 0.17
1039 0.18
1040 0.15
1041 0.12
1042 0.12
1043 0.08
1044 0.09
1045 0.09
1046 0.09
1047 0.1
1048 0.11
1049 0.13
1050 0.12
1051 0.13
1052 0.12
1053 0.12
1054 0.12
1055 0.13
1056 0.15
1057 0.14
1058 0.14
1059 0.14
1060 0.17
1061 0.17
1062 0.19
1063 0.23
1064 0.21
1065 0.26
1066 0.26
1067 0.28
1068 0.25
1069 0.26
1070 0.28
1071 0.24
1072 0.24
1073 0.23
1074 0.25
1075 0.23
1076 0.23
1077 0.26
1078 0.22
1079 0.22
1080 0.23
1081 0.23
1082 0.22
1083 0.23
1084 0.27
1085 0.26
1086 0.26
1087 0.24
1088 0.23
1089 0.19
1090 0.18
1091 0.17
1092 0.12
1093 0.09
1094 0.07
1095 0.07
1096 0.07
1097 0.07
1098 0.07
1099 0.06
1100 0.05
1101 0.05
1102 0.05
1103 0.05
1104 0.05
1105 0.06
1106 0.07
1107 0.07
1108 0.07
1109 0.07
1110 0.07
1111 0.07
1112 0.08
1113 0.07
1114 0.06
1115 0.06
1116 0.06
1117 0.06
1118 0.07
1119 0.07
1120 0.07
1121 0.12
1122 0.13
1123 0.16
1124 0.18
1125 0.19
1126 0.18
1127 0.21
1128 0.24
1129 0.25
1130 0.24
1131 0.21
1132 0.21
1133 0.26
1134 0.26
1135 0.24
1136 0.24
1137 0.2
1138 0.21
1139 0.21
1140 0.18
1141 0.16
1142 0.16
1143 0.15
1144 0.14
1145 0.13
1146 0.12
1147 0.13
1148 0.15
1149 0.13
1150 0.15
1151 0.17
1152 0.24
1153 0.27
1154 0.29
1155 0.31
1156 0.31
1157 0.32
1158 0.37
1159 0.39
1160 0.32
1161 0.3
1162 0.36
1163 0.34
1164 0.34
1165 0.34
1166 0.25
1167 0.21
1168 0.19
1169 0.25
1170 0.18
1171 0.16
1172 0.15
1173 0.19
1174 0.18
1175 0.17
1176 0.17
1177 0.11
1178 0.11
1179 0.11
1180 0.11
1181 0.13
1182 0.14
1183 0.15
1184 0.15
1185 0.16
1186 0.18
1187 0.2
1188 0.19
1189 0.13
1190 0.13
1191 0.12
1192 0.1
1193 0.1
1194 0.07
1195 0.06
1196 0.08
1197 0.08
1198 0.08
1199 0.09
1200 0.09
1201 0.11
1202 0.16
1203 0.17
1204 0.19
1205 0.24
1206 0.3
1207 0.34
1208 0.36
1209 0.37
1210 0.35
1211 0.34
1212 0.38
1213 0.37
1214 0.33
1215 0.3
1216 0.28
1217 0.26
1218 0.25
1219 0.24
1220 0.18
1221 0.16
1222 0.18
1223 0.16
1224 0.15
1225 0.16
1226 0.16
1227 0.24
1228 0.28
1229 0.3
1230 0.37
1231 0.47
1232 0.52
1233 0.55
1234 0.59
1235 0.54
1236 0.52
1237 0.51
1238 0.44
1239 0.38