Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

K1WWT9

Protein Details
Accession K1WWT9    Localization Confidence High Confidence Score 17
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
156-181RAQASKSKQKQAKKKEKAEKAKNAALHydrophilic
217-245SEETSKDSKDKKKAPRRKKGKKPEAAAAEBasic
267-300GQAQGEKKPKSKPKKKPQEKKPKEEKEKKDGDEGBasic
306-326GEGEEKKPKSRNRGRGRGGGGBasic
340-370GEAKESGPSKPPKQKKPREPREPKNEVKASEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
161-177KSKQKQAKKKEKAEKAK
224-240SKDKKKAPRRKKGKKPE
272-364EKKPKSKPKKKPQEKKPKEEKEKKDGDEGAAPAAGEGEEKKPKSRNRGRGRGGGGGGGGGNKEGGAGGGEAKESGPSKPPKQKKPREPREPKN
Subcellular Location(s) mito 23, mito_nucl 13.333, cyto_mito 12.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR039722  Upf3  
IPR005120  UPF3_dom  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
Pfam View protein in Pfam  
PF03467  Smg4_UPF3  
CDD cd12455  RRM_like_Smg4_UPF3  
Amino Acid Sequences MVNKAPAPRLKLVVRRLPPTLPEATFWSVVEPWTSGALWKRYVQGRPGDNFGAHPVHSRAYVLMPDVASIVAFHTAFDGHLFRSKTGQEFQAVVEFAPVEKTPYRVKEKKDAKQGTIDNDYLSFLAARDSVPEPVEVTVSTPAPPPESTPLLDALRAQASKSKQKQAKKKEKAEKAKNAALASVADAAKNRAPTGGNVVMVAGAGREVYVQDGGAPSEETSKDSKDKKKAPRRKKGKKPEAAAAEAGAGKDDAGEGPSQAQQQQPQGQAQGEKKPKSKPKKKPQEKKPKEEKEKKDGDEGAAPAAGEGEEKKPKSRNRGRGRGGGGGGGGGNKEGGAGGGEAKESGPSKPPKQKKPREPREPKNEVKASEARIDM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.62
3 0.62
4 0.58
5 0.54
6 0.51
7 0.48
8 0.39
9 0.35
10 0.36
11 0.35
12 0.33
13 0.3
14 0.28
15 0.22
16 0.22
17 0.21
18 0.16
19 0.13
20 0.14
21 0.13
22 0.14
23 0.2
24 0.23
25 0.25
26 0.27
27 0.33
28 0.37
29 0.42
30 0.45
31 0.46
32 0.5
33 0.5
34 0.53
35 0.48
36 0.42
37 0.39
38 0.37
39 0.32
40 0.25
41 0.25
42 0.22
43 0.21
44 0.21
45 0.2
46 0.17
47 0.17
48 0.17
49 0.15
50 0.15
51 0.14
52 0.13
53 0.13
54 0.12
55 0.1
56 0.08
57 0.07
58 0.07
59 0.07
60 0.07
61 0.07
62 0.08
63 0.08
64 0.1
65 0.1
66 0.09
67 0.15
68 0.16
69 0.16
70 0.2
71 0.22
72 0.24
73 0.26
74 0.27
75 0.24
76 0.24
77 0.24
78 0.24
79 0.22
80 0.18
81 0.15
82 0.13
83 0.11
84 0.12
85 0.11
86 0.1
87 0.11
88 0.14
89 0.19
90 0.26
91 0.36
92 0.4
93 0.45
94 0.52
95 0.61
96 0.66
97 0.72
98 0.7
99 0.63
100 0.65
101 0.64
102 0.59
103 0.54
104 0.46
105 0.36
106 0.3
107 0.28
108 0.2
109 0.17
110 0.11
111 0.06
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.08
116 0.09
117 0.11
118 0.11
119 0.11
120 0.11
121 0.11
122 0.12
123 0.09
124 0.09
125 0.09
126 0.09
127 0.09
128 0.1
129 0.1
130 0.12
131 0.12
132 0.13
133 0.15
134 0.17
135 0.17
136 0.16
137 0.19
138 0.17
139 0.17
140 0.15
141 0.13
142 0.14
143 0.13
144 0.12
145 0.14
146 0.18
147 0.27
148 0.32
149 0.39
150 0.42
151 0.51
152 0.6
153 0.67
154 0.75
155 0.75
156 0.81
157 0.82
158 0.86
159 0.88
160 0.88
161 0.87
162 0.81
163 0.75
164 0.68
165 0.58
166 0.48
167 0.37
168 0.27
169 0.18
170 0.15
171 0.11
172 0.08
173 0.09
174 0.1
175 0.11
176 0.11
177 0.1
178 0.09
179 0.09
180 0.09
181 0.16
182 0.16
183 0.14
184 0.14
185 0.14
186 0.12
187 0.11
188 0.11
189 0.04
190 0.02
191 0.02
192 0.02
193 0.02
194 0.02
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.04
199 0.04
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.07
205 0.08
206 0.1
207 0.11
208 0.13
209 0.19
210 0.26
211 0.34
212 0.4
213 0.49
214 0.58
215 0.68
216 0.76
217 0.81
218 0.85
219 0.89
220 0.91
221 0.93
222 0.94
223 0.94
224 0.92
225 0.86
226 0.83
227 0.77
228 0.68
229 0.57
230 0.46
231 0.36
232 0.28
233 0.23
234 0.15
235 0.09
236 0.06
237 0.06
238 0.05
239 0.04
240 0.04
241 0.05
242 0.05
243 0.06
244 0.09
245 0.1
246 0.12
247 0.14
248 0.16
249 0.21
250 0.27
251 0.28
252 0.27
253 0.28
254 0.28
255 0.32
256 0.33
257 0.37
258 0.4
259 0.43
260 0.46
261 0.53
262 0.62
263 0.67
264 0.74
265 0.76
266 0.8
267 0.86
268 0.92
269 0.94
270 0.95
271 0.95
272 0.95
273 0.95
274 0.95
275 0.94
276 0.94
277 0.94
278 0.92
279 0.9
280 0.89
281 0.8
282 0.77
283 0.68
284 0.59
285 0.53
286 0.45
287 0.36
288 0.27
289 0.24
290 0.16
291 0.14
292 0.11
293 0.07
294 0.08
295 0.12
296 0.19
297 0.21
298 0.26
299 0.34
300 0.41
301 0.52
302 0.61
303 0.66
304 0.7
305 0.8
306 0.81
307 0.82
308 0.8
309 0.75
310 0.65
311 0.55
312 0.44
313 0.34
314 0.27
315 0.19
316 0.14
317 0.08
318 0.07
319 0.06
320 0.06
321 0.05
322 0.05
323 0.05
324 0.05
325 0.07
326 0.07
327 0.08
328 0.08
329 0.08
330 0.12
331 0.12
332 0.13
333 0.21
334 0.28
335 0.38
336 0.48
337 0.58
338 0.66
339 0.76
340 0.86
341 0.88
342 0.92
343 0.94
344 0.95
345 0.96
346 0.95
347 0.95
348 0.94
349 0.91
350 0.9
351 0.85
352 0.75
353 0.72
354 0.67
355 0.61