FuNGI

A0A409VR47

Protein Details

Accession

A0A409VR47

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
40-66	QEEREAKEREQEKKRRLKIFEEEKRKE	Basic
471-496	LEEERRHEEEKRQRKKERERAMARGH	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
29-81	RRRKEALLRKQQEEREAKEREQEKKRRLKIFEEEKRKEQLERKREEERKAREL
410-411	KK
475-496	RRHEEEKRQRKKERERAMARGH

Subcellular Location(s)

nucl 20, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013256 Chromatin_SPT2
Pfam	View protein in Pfam PF08243 SPT2

Amino Acid Sequences

MTSFASLMAISASHTKESQQAVENALQERRRKEALLRKQQEEREAKEREQEKKRRLKIFEEEKRKEQLERKREEERKARELALQRREEEQRNALLYGPKKAAKLAGAASGSSSGGGGSSKWPASSSGVKEAVRRRRLPEDEDDEPQGVVLTREELRERKQQAERRKLFAPSKRQAMTTNSYRKAGVRLPGGAVNIVKNGKEPEMSSAGLSVKDRLASQPNTLLMLNQQKKDKRTLDEIQMDIRARKSGKTIEGEDALGFDDWFSSSKKKTSAKASPAPPALSSTPPIAAAPSRTSVTKTLPSASGSFSTSSTQKSTSNVSRPSSTKPIPATTQKLRAGSNSRGSSADMPSTTSSQNKLPKIGKSSSSSAAAAASHRSAPISSSYSSQSQSRSIKRPRSPSYSPSPPPPSKKRAIKEDLSSQIWSLFGKDRSKYTARDVYSDDEDMEADATILEREEKASARIARREEQAALEEERRHEEEKRQRKKERERAMARGH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.16
2	0.17
3	0.23
4	0.26
5	0.29
6	0.3
7	0.31
8	0.33
9	0.37
10	0.39
11	0.36
12	0.39
13	0.41
14	0.41
15	0.42
16	0.44
17	0.43
18	0.42
19	0.48
20	0.52
21	0.58
22	0.63
23	0.67
24	0.68
25	0.73
26	0.75
27	0.76
28	0.72
29	0.68
30	0.65
31	0.63
32	0.58
33	0.59
34	0.62
35	0.62
36	0.65
37	0.68
38	0.7
39	0.75
40	0.82
41	0.83
42	0.8
43	0.78
44	0.78
45	0.8
46	0.8
47	0.8
48	0.78
49	0.74
50	0.76
51	0.7
52	0.66
53	0.63
54	0.64
55	0.62
56	0.63
57	0.64
58	0.68
59	0.73
60	0.75
61	0.77
62	0.75
63	0.72
64	0.68
65	0.64
66	0.6
67	0.62
68	0.62
69	0.62
70	0.58
71	0.53
72	0.54
73	0.59
74	0.58
75	0.54
76	0.49
77	0.44
78	0.41
79	0.4
80	0.36
81	0.36
82	0.33
83	0.33
84	0.33
85	0.31
86	0.29
87	0.3
88	0.3
89	0.25
90	0.26
91	0.22
92	0.23
93	0.2
94	0.2
95	0.19
96	0.17
97	0.16
98	0.12
99	0.11
100	0.05
101	0.05
102	0.05
103	0.06
104	0.07
105	0.1
106	0.11
107	0.11
108	0.12
109	0.13
110	0.17
111	0.23
112	0.25
113	0.28
114	0.33
115	0.33
116	0.39
117	0.46
118	0.52
119	0.53
120	0.54
121	0.52
122	0.57
123	0.6
124	0.6
125	0.59
126	0.56
127	0.52
128	0.51
129	0.48
130	0.39
131	0.34
132	0.28
133	0.2
134	0.13
135	0.1
136	0.07
137	0.08
138	0.09
139	0.11
140	0.14
141	0.17
142	0.21
143	0.29
144	0.32
145	0.37
146	0.45
147	0.51
148	0.59
149	0.67
150	0.67
151	0.63
152	0.63
153	0.63
154	0.62
155	0.62
156	0.62
157	0.57
158	0.6
159	0.56
160	0.54
161	0.51
162	0.48
163	0.47
164	0.46
165	0.49
166	0.43
167	0.43
168	0.42
169	0.4
170	0.38
171	0.35
172	0.31
173	0.24
174	0.23
175	0.23
176	0.24
177	0.24
178	0.21
179	0.17
180	0.13
181	0.13
182	0.13
183	0.11
184	0.11
185	0.12
186	0.12
187	0.12
188	0.12
189	0.13
190	0.15
191	0.15
192	0.14
193	0.14
194	0.14
195	0.14
196	0.14
197	0.12
198	0.09
199	0.1
200	0.1
201	0.11
202	0.16
203	0.17
204	0.18
205	0.19
206	0.19
207	0.2
208	0.19
209	0.17
210	0.15
211	0.23
212	0.26
213	0.26
214	0.31
215	0.34
216	0.36
217	0.43
218	0.44
219	0.38
220	0.41
221	0.43
222	0.45
223	0.45
224	0.44
225	0.38
226	0.36
227	0.33
228	0.27
229	0.23
230	0.18
231	0.14
232	0.14
233	0.16
234	0.17
235	0.2
236	0.22
237	0.24
238	0.23
239	0.23
240	0.23
241	0.2
242	0.17
243	0.13
244	0.1
245	0.07
246	0.05
247	0.04
248	0.04
249	0.05
250	0.07
251	0.09
252	0.1
253	0.13
254	0.19
255	0.23
256	0.28
257	0.36
258	0.43
259	0.48
260	0.54
261	0.55
262	0.55
263	0.53
264	0.49
265	0.4
266	0.35
267	0.29
268	0.22
269	0.2
270	0.15
271	0.14
272	0.13
273	0.13
274	0.1
275	0.09
276	0.1
277	0.1
278	0.11
279	0.12
280	0.12
281	0.14
282	0.15
283	0.18
284	0.2
285	0.2
286	0.2
287	0.2
288	0.21
289	0.21
290	0.2
291	0.18
292	0.15
293	0.15
294	0.14
295	0.15
296	0.14
297	0.15
298	0.15
299	0.16
300	0.16
301	0.17
302	0.22
303	0.26
304	0.32
305	0.36
306	0.36
307	0.39
308	0.4
309	0.44
310	0.45
311	0.41
312	0.39
313	0.37
314	0.38
315	0.38
316	0.43
317	0.44
318	0.42
319	0.48
320	0.46
321	0.46
322	0.43
323	0.44
324	0.44
325	0.42
326	0.45
327	0.38
328	0.36
329	0.34
330	0.35
331	0.33
332	0.28
333	0.25
334	0.17
335	0.18
336	0.18
337	0.19
338	0.19
339	0.19
340	0.19
341	0.23
342	0.3
343	0.3
344	0.35
345	0.37
346	0.41
347	0.45
348	0.47
349	0.45
350	0.43
351	0.45
352	0.41
353	0.39
354	0.34
355	0.28
356	0.25
357	0.21
358	0.17
359	0.15
360	0.13
361	0.11
362	0.11
363	0.11
364	0.1
365	0.11
366	0.14
367	0.15
368	0.15
369	0.17
370	0.19
371	0.22
372	0.23
373	0.25
374	0.23
375	0.28
376	0.35
377	0.4
378	0.47
379	0.54
380	0.62
381	0.67
382	0.75
383	0.75
384	0.76
385	0.74
386	0.71
387	0.71
388	0.71
389	0.67
390	0.66
391	0.68
392	0.67
393	0.71
394	0.73
395	0.71
396	0.72
397	0.77
398	0.76
399	0.77
400	0.77
401	0.74
402	0.72
403	0.73
404	0.7
405	0.63
406	0.56
407	0.46
408	0.39
409	0.33
410	0.26
411	0.2
412	0.2
413	0.23
414	0.28
415	0.3
416	0.32
417	0.39
418	0.43
419	0.44
420	0.46
421	0.48
422	0.44
423	0.46
424	0.45
425	0.44
426	0.43
427	0.4
428	0.32
429	0.25
430	0.23
431	0.19
432	0.16
433	0.11
434	0.07
435	0.06
436	0.06
437	0.06
438	0.06
439	0.07
440	0.07
441	0.08
442	0.11
443	0.12
444	0.14
445	0.21
446	0.27
447	0.33
448	0.39
449	0.43
450	0.47
451	0.5
452	0.52
453	0.46
454	0.43
455	0.39
456	0.37
457	0.36
458	0.35
459	0.34
460	0.33
461	0.37
462	0.37
463	0.36
464	0.37
465	0.43
466	0.49
467	0.56
468	0.65
469	0.7
470	0.76
471	0.84
472	0.91
473	0.92
474	0.92
475	0.92
476	0.89

A0A409VR47

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer