Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409XC05

Protein Details
Accession A0A409XC05    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
98-119LEEYAKRKTKAKEKERKLEEEIBasic
318-340AWEWYVQRRPRMRSQSQRARMPMHydrophilic
389-412ANPQWVRYWADKEKKRRSTRQPLAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
103-114KRKTKAKEKERK
Subcellular Location(s) mito 16.5, cyto_mito 11, nucl 6, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR022801  Ribosomal_S4/S9  
IPR002942  S4_RNA-bd  
IPR036986  S4_RNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0015935  C:small ribosomal subunit  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF01479  S4  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50889  S4  
CDD cd00165  S4  
Amino Acid Sequences MRNRNPLNLHKSLPCMSWSPKNLYNLWRRTVGPEAEELTFKVTTEQTLFQQRWRSKAAMRAYHGEYIPEKVFKRWYLPDTIPDVRPRRQVFGDDQNELEEYAKRKTKAKEKERKLEEEIERKGLAPVGSLMFREVERRMDVFLFRCCFVHSVYEARRLIIHGYVKLNGKKHSHANTRLAPGDMVTVDPAAIRFLQPPHGPMDRIVGPVPKPNSTAQKSTDESKSAEQTSENVEAAENVEATTEATEATKEVADIPYWKRPPTPFYLPEYASPWLFIPAYIEVSFKTCSAVYVRHPTARPGYSEIPTPYDADGAVIRYAWEWYVQRRPRMRSQSQRARMPMDRVVELEKSLHKDRRAFTFSKEAYEKSKIEWRQTPPTGFDSKAWLESRANPQWVRYWADKEKKRRSTRQPLA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.38
3 0.39
4 0.43
5 0.45
6 0.46
7 0.49
8 0.52
9 0.54
10 0.58
11 0.62
12 0.6
13 0.59
14 0.56
15 0.52
16 0.51
17 0.54
18 0.47
19 0.39
20 0.36
21 0.35
22 0.32
23 0.31
24 0.27
25 0.23
26 0.2
27 0.18
28 0.17
29 0.15
30 0.16
31 0.18
32 0.2
33 0.22
34 0.31
35 0.32
36 0.34
37 0.43
38 0.44
39 0.46
40 0.48
41 0.47
42 0.42
43 0.5
44 0.54
45 0.53
46 0.54
47 0.55
48 0.53
49 0.54
50 0.5
51 0.45
52 0.37
53 0.34
54 0.32
55 0.31
56 0.29
57 0.27
58 0.32
59 0.31
60 0.37
61 0.39
62 0.39
63 0.41
64 0.42
65 0.45
66 0.46
67 0.48
68 0.46
69 0.48
70 0.5
71 0.48
72 0.54
73 0.51
74 0.49
75 0.47
76 0.48
77 0.46
78 0.51
79 0.51
80 0.44
81 0.41
82 0.37
83 0.35
84 0.31
85 0.25
86 0.18
87 0.15
88 0.2
89 0.25
90 0.26
91 0.33
92 0.4
93 0.49
94 0.56
95 0.65
96 0.7
97 0.74
98 0.83
99 0.83
100 0.81
101 0.76
102 0.75
103 0.71
104 0.69
105 0.62
106 0.55
107 0.49
108 0.43
109 0.38
110 0.31
111 0.23
112 0.15
113 0.14
114 0.12
115 0.12
116 0.11
117 0.11
118 0.1
119 0.1
120 0.12
121 0.12
122 0.13
123 0.14
124 0.15
125 0.16
126 0.16
127 0.18
128 0.18
129 0.22
130 0.21
131 0.19
132 0.19
133 0.19
134 0.18
135 0.17
136 0.18
137 0.14
138 0.2
139 0.22
140 0.3
141 0.29
142 0.28
143 0.28
144 0.25
145 0.25
146 0.22
147 0.21
148 0.16
149 0.18
150 0.21
151 0.25
152 0.28
153 0.3
154 0.31
155 0.32
156 0.32
157 0.38
158 0.43
159 0.47
160 0.5
161 0.53
162 0.53
163 0.53
164 0.51
165 0.44
166 0.35
167 0.27
168 0.21
169 0.14
170 0.1
171 0.07
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.04
177 0.05
178 0.05
179 0.06
180 0.07
181 0.12
182 0.12
183 0.13
184 0.17
185 0.18
186 0.18
187 0.17
188 0.2
189 0.17
190 0.18
191 0.17
192 0.15
193 0.15
194 0.19
195 0.2
196 0.17
197 0.18
198 0.2
199 0.27
200 0.28
201 0.31
202 0.3
203 0.34
204 0.34
205 0.36
206 0.35
207 0.29
208 0.28
209 0.26
210 0.26
211 0.21
212 0.2
213 0.17
214 0.16
215 0.17
216 0.18
217 0.15
218 0.12
219 0.11
220 0.11
221 0.12
222 0.11
223 0.07
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.06
238 0.06
239 0.07
240 0.11
241 0.14
242 0.22
243 0.23
244 0.24
245 0.27
246 0.29
247 0.33
248 0.36
249 0.41
250 0.37
251 0.42
252 0.46
253 0.43
254 0.43
255 0.42
256 0.36
257 0.27
258 0.24
259 0.18
260 0.15
261 0.13
262 0.11
263 0.1
264 0.1
265 0.13
266 0.12
267 0.12
268 0.11
269 0.13
270 0.14
271 0.12
272 0.12
273 0.09
274 0.1
275 0.12
276 0.15
277 0.18
278 0.27
279 0.29
280 0.33
281 0.34
282 0.36
283 0.4
284 0.39
285 0.37
286 0.33
287 0.35
288 0.31
289 0.35
290 0.33
291 0.3
292 0.29
293 0.28
294 0.22
295 0.19
296 0.17
297 0.14
298 0.13
299 0.11
300 0.1
301 0.08
302 0.08
303 0.08
304 0.09
305 0.08
306 0.11
307 0.11
308 0.17
309 0.28
310 0.33
311 0.42
312 0.49
313 0.55
314 0.61
315 0.7
316 0.74
317 0.75
318 0.8
319 0.83
320 0.84
321 0.85
322 0.79
323 0.76
324 0.7
325 0.65
326 0.59
327 0.51
328 0.44
329 0.38
330 0.37
331 0.31
332 0.27
333 0.25
334 0.23
335 0.26
336 0.32
337 0.37
338 0.39
339 0.45
340 0.47
341 0.54
342 0.56
343 0.52
344 0.49
345 0.54
346 0.5
347 0.51
348 0.51
349 0.44
350 0.43
351 0.48
352 0.44
353 0.37
354 0.45
355 0.43
356 0.48
357 0.53
358 0.54
359 0.58
360 0.64
361 0.63
362 0.58
363 0.59
364 0.56
365 0.49
366 0.43
367 0.4
368 0.36
369 0.39
370 0.37
371 0.34
372 0.33
373 0.38
374 0.46
375 0.47
376 0.51
377 0.46
378 0.47
379 0.5
380 0.52
381 0.5
382 0.46
383 0.47
384 0.51
385 0.6
386 0.66
387 0.7
388 0.77
389 0.82
390 0.87
391 0.89
392 0.9