Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409WHS3

Protein Details
Accession A0A409WHS3    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
175-202NGFKSNQKKKSGKSKGKKNKNAPAQPTWHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
181-195QKKKSGKSKGKKNKN
229-248DRRERMAEQRRQEERKRSRR
Subcellular Location(s) mito 15.5, cyto_mito 11.5, cyto 6.5, nucl 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000467  G_patch_dom  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR040052  RBM17  
IPR000504  RRM_dom  
IPR003954  RRM_dom_euk  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF01585  G-patch  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50174  G_PATCH  
PS50102  RRM  
CDD cd12374  RRM_UHM_SPF45_PUF60  
Amino Acid Sequences MSSRAGGLYGGIQFSSGSVFQSTASATSSTEPSKSPSTEPTKITIVESSSKEQDASVAPAFTATTSTSAAAAATPGKSTAAWSAALAFAPVRRNQAAKAKPAVNRLPAGAAVLPPAAGLSSTAVVFAPPVLVDPAASTANPPPPQRQQESASASGTQGWGRKVKPPSMILDEDVNGFKSNQKKKSGKSKGKKNKNAPAQPTWDPIELYDPMRPNDYNEYKMWRTKERIDRRERMAEQRRQEERKRSRRSASYSDSEATGSDDDERPRKSGKYDTFDRWSRGRAEPVHDAPVHDAAPVVVDRALTGDEAFQRRLAMSAARPVSPPPPASPVSAPPRPLDYEPPHKPSHMAVETGEEAYLRRLAMSTMNRNAPQPVAAAAAPPPPPAAPQQERPRSVSPPALAYNPFAPPSVPPPPPPGGPPGTLPGGFEERAKAAAAIAAKLSALGASAGASSLSSSAPPRGDVPSPDEESKPDPHGFAARLMAKWGHKEGQGLGAGADGIVNALVVEQVGNNNNNNNNNXVLFLTLGRILTGLGAGADGIVNALVVEQVGNNNNNNNNNNKPAKGKGGPTGKGIGVGSKMGKIINNNEDAKTREDKERFGEPSRVVVLTNMVGPEDLDDEDLREEIGDECSKNGTVERVIVHAVQPPPLNPDDAVRIFVLFAGPVGAWKTVRELDGRYFGGRTVRARYFPEPSFARYDLDRGL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.13
3 0.1
4 0.1
5 0.1
6 0.11
7 0.11
8 0.12
9 0.13
10 0.11
11 0.13
12 0.12
13 0.12
14 0.14
15 0.18
16 0.19
17 0.2
18 0.2
19 0.23
20 0.28
21 0.3
22 0.31
23 0.36
24 0.43
25 0.47
26 0.49
27 0.49
28 0.47
29 0.45
30 0.44
31 0.37
32 0.32
33 0.32
34 0.33
35 0.34
36 0.33
37 0.33
38 0.31
39 0.28
40 0.27
41 0.23
42 0.24
43 0.21
44 0.18
45 0.17
46 0.17
47 0.17
48 0.15
49 0.14
50 0.1
51 0.1
52 0.1
53 0.11
54 0.11
55 0.11
56 0.11
57 0.09
58 0.1
59 0.1
60 0.1
61 0.1
62 0.1
63 0.11
64 0.11
65 0.12
66 0.14
67 0.13
68 0.13
69 0.13
70 0.14
71 0.14
72 0.14
73 0.13
74 0.1
75 0.12
76 0.16
77 0.18
78 0.22
79 0.23
80 0.25
81 0.3
82 0.39
83 0.42
84 0.44
85 0.49
86 0.51
87 0.53
88 0.6
89 0.61
90 0.56
91 0.51
92 0.45
93 0.39
94 0.33
95 0.3
96 0.23
97 0.17
98 0.13
99 0.11
100 0.1
101 0.08
102 0.08
103 0.06
104 0.05
105 0.05
106 0.05
107 0.06
108 0.06
109 0.07
110 0.07
111 0.07
112 0.07
113 0.06
114 0.05
115 0.04
116 0.05
117 0.06
118 0.06
119 0.06
120 0.07
121 0.09
122 0.09
123 0.09
124 0.1
125 0.13
126 0.21
127 0.25
128 0.27
129 0.31
130 0.39
131 0.47
132 0.5
133 0.51
134 0.48
135 0.52
136 0.55
137 0.52
138 0.44
139 0.38
140 0.33
141 0.29
142 0.26
143 0.2
144 0.17
145 0.18
146 0.21
147 0.22
148 0.29
149 0.33
150 0.37
151 0.41
152 0.41
153 0.43
154 0.45
155 0.45
156 0.39
157 0.36
158 0.31
159 0.27
160 0.25
161 0.2
162 0.15
163 0.14
164 0.16
165 0.23
166 0.31
167 0.36
168 0.46
169 0.51
170 0.58
171 0.69
172 0.76
173 0.78
174 0.8
175 0.84
176 0.86
177 0.9
178 0.93
179 0.92
180 0.9
181 0.9
182 0.88
183 0.84
184 0.79
185 0.74
186 0.67
187 0.61
188 0.55
189 0.45
190 0.36
191 0.3
192 0.27
193 0.22
194 0.21
195 0.21
196 0.2
197 0.2
198 0.23
199 0.22
200 0.22
201 0.29
202 0.31
203 0.3
204 0.3
205 0.36
206 0.36
207 0.41
208 0.42
209 0.39
210 0.4
211 0.46
212 0.55
213 0.59
214 0.66
215 0.7
216 0.73
217 0.73
218 0.78
219 0.72
220 0.72
221 0.71
222 0.69
223 0.66
224 0.68
225 0.7
226 0.68
227 0.71
228 0.72
229 0.72
230 0.76
231 0.79
232 0.76
233 0.76
234 0.77
235 0.77
236 0.74
237 0.7
238 0.63
239 0.57
240 0.51
241 0.43
242 0.36
243 0.28
244 0.21
245 0.15
246 0.11
247 0.1
248 0.12
249 0.14
250 0.18
251 0.19
252 0.19
253 0.22
254 0.23
255 0.24
256 0.3
257 0.35
258 0.38
259 0.42
260 0.46
261 0.51
262 0.53
263 0.54
264 0.46
265 0.42
266 0.4
267 0.36
268 0.36
269 0.32
270 0.33
271 0.36
272 0.36
273 0.38
274 0.33
275 0.31
276 0.27
277 0.26
278 0.21
279 0.15
280 0.13
281 0.08
282 0.08
283 0.08
284 0.07
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.06
290 0.05
291 0.05
292 0.06
293 0.09
294 0.11
295 0.12
296 0.11
297 0.11
298 0.11
299 0.12
300 0.11
301 0.1
302 0.09
303 0.14
304 0.16
305 0.16
306 0.16
307 0.17
308 0.18
309 0.19
310 0.19
311 0.14
312 0.17
313 0.18
314 0.2
315 0.2
316 0.24
317 0.28
318 0.29
319 0.29
320 0.26
321 0.27
322 0.27
323 0.27
324 0.28
325 0.27
326 0.34
327 0.37
328 0.41
329 0.39
330 0.38
331 0.37
332 0.31
333 0.33
334 0.25
335 0.22
336 0.17
337 0.18
338 0.18
339 0.18
340 0.16
341 0.09
342 0.07
343 0.07
344 0.08
345 0.06
346 0.05
347 0.05
348 0.06
349 0.11
350 0.15
351 0.19
352 0.22
353 0.25
354 0.25
355 0.26
356 0.26
357 0.21
358 0.17
359 0.13
360 0.1
361 0.09
362 0.08
363 0.08
364 0.08
365 0.11
366 0.11
367 0.11
368 0.1
369 0.09
370 0.1
371 0.12
372 0.19
373 0.19
374 0.27
375 0.37
376 0.44
377 0.46
378 0.5
379 0.5
380 0.45
381 0.45
382 0.4
383 0.31
384 0.28
385 0.27
386 0.24
387 0.22
388 0.2
389 0.19
390 0.16
391 0.16
392 0.13
393 0.12
394 0.11
395 0.15
396 0.2
397 0.2
398 0.2
399 0.25
400 0.27
401 0.28
402 0.28
403 0.27
404 0.24
405 0.24
406 0.23
407 0.21
408 0.2
409 0.19
410 0.18
411 0.16
412 0.16
413 0.15
414 0.14
415 0.13
416 0.11
417 0.12
418 0.12
419 0.1
420 0.07
421 0.08
422 0.08
423 0.08
424 0.07
425 0.06
426 0.06
427 0.06
428 0.06
429 0.04
430 0.03
431 0.03
432 0.03
433 0.03
434 0.03
435 0.03
436 0.03
437 0.03
438 0.03
439 0.04
440 0.04
441 0.05
442 0.06
443 0.09
444 0.09
445 0.1
446 0.12
447 0.14
448 0.16
449 0.17
450 0.21
451 0.24
452 0.27
453 0.28
454 0.27
455 0.26
456 0.28
457 0.29
458 0.28
459 0.24
460 0.2
461 0.2
462 0.23
463 0.22
464 0.2
465 0.21
466 0.19
467 0.19
468 0.2
469 0.22
470 0.2
471 0.22
472 0.23
473 0.21
474 0.2
475 0.22
476 0.21
477 0.23
478 0.22
479 0.2
480 0.16
481 0.13
482 0.12
483 0.1
484 0.09
485 0.04
486 0.03
487 0.02
488 0.02
489 0.02
490 0.02
491 0.02
492 0.02
493 0.03
494 0.03
495 0.05
496 0.08
497 0.1
498 0.12
499 0.15
500 0.19
501 0.22
502 0.23
503 0.23
504 0.2
505 0.19
506 0.19
507 0.16
508 0.12
509 0.1
510 0.11
511 0.11
512 0.1
513 0.09
514 0.09
515 0.08
516 0.08
517 0.08
518 0.05
519 0.03
520 0.03
521 0.03
522 0.03
523 0.03
524 0.03
525 0.03
526 0.02
527 0.02
528 0.02
529 0.02
530 0.02
531 0.02
532 0.03
533 0.03
534 0.05
535 0.08
536 0.1
537 0.12
538 0.15
539 0.19
540 0.25
541 0.28
542 0.32
543 0.33
544 0.4
545 0.42
546 0.41
547 0.42
548 0.4
549 0.45
550 0.43
551 0.43
552 0.43
553 0.49
554 0.48
555 0.47
556 0.47
557 0.39
558 0.37
559 0.33
560 0.26
561 0.19
562 0.19
563 0.17
564 0.15
565 0.16
566 0.14
567 0.16
568 0.18
569 0.24
570 0.27
571 0.33
572 0.34
573 0.34
574 0.36
575 0.37
576 0.38
577 0.37
578 0.35
579 0.38
580 0.38
581 0.4
582 0.42
583 0.47
584 0.47
585 0.47
586 0.5
587 0.41
588 0.43
589 0.42
590 0.38
591 0.3
592 0.26
593 0.23
594 0.17
595 0.18
596 0.13
597 0.11
598 0.1
599 0.1
600 0.1
601 0.1
602 0.09
603 0.09
604 0.09
605 0.1
606 0.11
607 0.11
608 0.1
609 0.08
610 0.09
611 0.08
612 0.12
613 0.14
614 0.14
615 0.15
616 0.17
617 0.17
618 0.17
619 0.17
620 0.16
621 0.15
622 0.18
623 0.18
624 0.18
625 0.2
626 0.2
627 0.2
628 0.23
629 0.22
630 0.23
631 0.24
632 0.23
633 0.26
634 0.26
635 0.27
636 0.21
637 0.23
638 0.27
639 0.26
640 0.28
641 0.23
642 0.22
643 0.2
644 0.2
645 0.17
646 0.09
647 0.08
648 0.07
649 0.07
650 0.08
651 0.1
652 0.11
653 0.11
654 0.12
655 0.17
656 0.18
657 0.21
658 0.22
659 0.24
660 0.28
661 0.34
662 0.36
663 0.33
664 0.3
665 0.31
666 0.34
667 0.34
668 0.33
669 0.34
670 0.37
671 0.4
672 0.45
673 0.49
674 0.5
675 0.47
676 0.52
677 0.47
678 0.46
679 0.48
680 0.43
681 0.41
682 0.35