Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409VMM0

Protein Details
Accession A0A409VMM0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
47-66VQRPDKKPTVWARQNKGVKDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
299-322VEKRKRELEERRKLLEAKRKKMKA
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 13.5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025066  CCDC174-like  
Pfam View protein in Pfam  
PF13300  DUF4078  
Amino Acid Sequences MSHTTKSKAKGINASSFFDLKAELSKQEADFAKAKAAGRSTSIVGGVQRPDKKPTVWARQNKGVKDRAGRDVQLEEIAKPTLDSARAALERKAKIYEKLRKGKTGGLNDVQYDALLVDFDSNNATSKYYEEDSADENESLTAPTRPEDDPMVEYEDEFGRIRTARRSEVPRNMVTNREDDVDEDEIYVAGNPVNHFPTYQPSEERMAEIAKTYAEENNPLGQHYDASKEVRAKGAGFYQFSGDEATRAAQMEELKASREETTKIRQELGAEDVKFGEVEGMRHGEGHGSTGGVVVGRGVEKRKRELEERRKLLEAKRKKMKASNPSAATSQSIATPETPKSLQSPKKVPSISSPPVSSAGASKSSGSTSANKPVHISEDPFSSLEAVSPSKGKGKHKALSPSEEADSFLARLEHEFLGADIKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.55
3 0.49
4 0.43
5 0.34
6 0.28
7 0.19
8 0.21
9 0.2
10 0.18
11 0.2
12 0.24
13 0.23
14 0.29
15 0.3
16 0.29
17 0.31
18 0.3
19 0.32
20 0.32
21 0.33
22 0.31
23 0.32
24 0.29
25 0.28
26 0.3
27 0.27
28 0.24
29 0.23
30 0.2
31 0.19
32 0.22
33 0.23
34 0.28
35 0.33
36 0.35
37 0.4
38 0.42
39 0.41
40 0.47
41 0.52
42 0.56
43 0.59
44 0.66
45 0.68
46 0.75
47 0.8
48 0.77
49 0.75
50 0.71
51 0.67
52 0.66
53 0.63
54 0.61
55 0.6
56 0.54
57 0.49
58 0.44
59 0.39
60 0.35
61 0.31
62 0.23
63 0.2
64 0.19
65 0.16
66 0.14
67 0.15
68 0.12
69 0.12
70 0.13
71 0.11
72 0.17
73 0.2
74 0.21
75 0.25
76 0.29
77 0.3
78 0.32
79 0.36
80 0.33
81 0.38
82 0.47
83 0.53
84 0.55
85 0.64
86 0.66
87 0.66
88 0.65
89 0.66
90 0.64
91 0.61
92 0.57
93 0.52
94 0.49
95 0.44
96 0.43
97 0.35
98 0.26
99 0.19
100 0.12
101 0.07
102 0.05
103 0.05
104 0.05
105 0.05
106 0.06
107 0.07
108 0.07
109 0.09
110 0.09
111 0.1
112 0.09
113 0.1
114 0.13
115 0.13
116 0.14
117 0.14
118 0.15
119 0.16
120 0.19
121 0.19
122 0.16
123 0.14
124 0.13
125 0.13
126 0.11
127 0.1
128 0.09
129 0.08
130 0.08
131 0.11
132 0.12
133 0.13
134 0.14
135 0.15
136 0.15
137 0.16
138 0.19
139 0.16
140 0.15
141 0.15
142 0.14
143 0.14
144 0.13
145 0.11
146 0.1
147 0.11
148 0.13
149 0.17
150 0.2
151 0.22
152 0.28
153 0.36
154 0.42
155 0.49
156 0.53
157 0.49
158 0.51
159 0.49
160 0.47
161 0.4
162 0.35
163 0.28
164 0.24
165 0.21
166 0.17
167 0.19
168 0.16
169 0.14
170 0.12
171 0.11
172 0.09
173 0.09
174 0.08
175 0.05
176 0.04
177 0.05
178 0.05
179 0.07
180 0.08
181 0.08
182 0.09
183 0.09
184 0.14
185 0.17
186 0.18
187 0.18
188 0.19
189 0.22
190 0.22
191 0.22
192 0.18
193 0.15
194 0.13
195 0.12
196 0.1
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.08
201 0.08
202 0.09
203 0.1
204 0.13
205 0.13
206 0.12
207 0.12
208 0.11
209 0.11
210 0.1
211 0.12
212 0.11
213 0.12
214 0.14
215 0.16
216 0.17
217 0.17
218 0.17
219 0.16
220 0.15
221 0.18
222 0.19
223 0.17
224 0.16
225 0.16
226 0.15
227 0.15
228 0.15
229 0.1
230 0.08
231 0.08
232 0.08
233 0.07
234 0.08
235 0.07
236 0.08
237 0.08
238 0.09
239 0.1
240 0.1
241 0.11
242 0.11
243 0.12
244 0.12
245 0.13
246 0.15
247 0.17
248 0.24
249 0.29
250 0.29
251 0.29
252 0.28
253 0.28
254 0.27
255 0.28
256 0.25
257 0.2
258 0.19
259 0.18
260 0.17
261 0.16
262 0.14
263 0.12
264 0.07
265 0.08
266 0.09
267 0.11
268 0.11
269 0.11
270 0.11
271 0.1
272 0.09
273 0.11
274 0.09
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.06
280 0.06
281 0.04
282 0.04
283 0.05
284 0.07
285 0.12
286 0.17
287 0.2
288 0.26
289 0.32
290 0.36
291 0.44
292 0.54
293 0.6
294 0.67
295 0.69
296 0.67
297 0.65
298 0.65
299 0.64
300 0.63
301 0.62
302 0.61
303 0.65
304 0.67
305 0.69
306 0.73
307 0.74
308 0.74
309 0.74
310 0.73
311 0.66
312 0.64
313 0.59
314 0.52
315 0.44
316 0.35
317 0.25
318 0.18
319 0.15
320 0.14
321 0.15
322 0.17
323 0.16
324 0.19
325 0.19
326 0.19
327 0.23
328 0.32
329 0.37
330 0.42
331 0.49
332 0.5
333 0.58
334 0.58
335 0.55
336 0.53
337 0.56
338 0.53
339 0.5
340 0.46
341 0.4
342 0.41
343 0.39
344 0.31
345 0.25
346 0.22
347 0.2
348 0.19
349 0.18
350 0.17
351 0.17
352 0.19
353 0.18
354 0.21
355 0.23
356 0.33
357 0.34
358 0.34
359 0.35
360 0.35
361 0.38
362 0.35
363 0.34
364 0.26
365 0.27
366 0.29
367 0.27
368 0.26
369 0.22
370 0.18
371 0.16
372 0.17
373 0.14
374 0.14
375 0.15
376 0.17
377 0.23
378 0.29
379 0.35
380 0.42
381 0.5
382 0.54
383 0.61
384 0.69
385 0.69
386 0.71
387 0.68
388 0.62
389 0.56
390 0.5
391 0.44
392 0.34
393 0.3
394 0.22
395 0.19
396 0.15
397 0.13
398 0.14
399 0.16
400 0.15
401 0.14
402 0.14
403 0.13