Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409VLK3

Protein Details
Accession A0A409VLK3    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
240-261RDLFPRPPKTRRERRSSPEEAEBasic
265-286TTTTERHPSRWVRRRYRALLAHHydrophilic
330-352AWIEQQPKQSTRQRNRDDNRRKGHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) golg 6, plas 4, E.R. 4, mito 3, vacu 3, nucl 2, cyto 2, extr 2, cyto_nucl 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR046896  Cup1-like_N  
Pfam View protein in Pfam  
PF20263  LYRM2-like  
Amino Acid Sequences RIYDRPESYLIFIFAILSSPLSVVAQANDSQFFQIRARDDINAILSAKGEDRQADKFKFVQKVHHQPLPGPIQKANDRDRKAFNRILELAYGRVGKLKWDLLEASPVPMRHHSTSTLPEPIIRGVEKSRPPLYSPELKALFTSSLARLNKPLERRDLITPRTLPPRANPLSEEAQTFGPFSKRREVNIRRRFFQNELKKVLPPLEITKTEGRIVDAKVLLRPLGFQGTGVTQELETLIGRDLFPRPPKTRRERRSSPEEAESTQTTTTERHPSRWVRRRYRALLAHIPRLIYDPKSNSAEAFRVEKDPLGHHPHDRSVRCMPDADPVTMAWIEQQPKQSTRQRNRDDNRRKG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.14
3 0.11
4 0.09
5 0.08
6 0.07
7 0.08
8 0.07
9 0.09
10 0.08
11 0.09
12 0.11
13 0.13
14 0.15
15 0.15
16 0.16
17 0.17
18 0.17
19 0.19
20 0.18
21 0.21
22 0.22
23 0.25
24 0.27
25 0.26
26 0.26
27 0.26
28 0.26
29 0.23
30 0.22
31 0.17
32 0.16
33 0.15
34 0.15
35 0.14
36 0.14
37 0.14
38 0.17
39 0.24
40 0.31
41 0.32
42 0.34
43 0.37
44 0.43
45 0.49
46 0.48
47 0.5
48 0.53
49 0.62
50 0.65
51 0.64
52 0.57
53 0.5
54 0.57
55 0.56
56 0.51
57 0.43
58 0.39
59 0.41
60 0.46
61 0.52
62 0.53
63 0.52
64 0.52
65 0.54
66 0.61
67 0.61
68 0.62
69 0.6
70 0.53
71 0.51
72 0.48
73 0.44
74 0.38
75 0.32
76 0.26
77 0.23
78 0.22
79 0.14
80 0.16
81 0.14
82 0.14
83 0.16
84 0.18
85 0.16
86 0.18
87 0.19
88 0.17
89 0.22
90 0.21
91 0.2
92 0.2
93 0.2
94 0.2
95 0.22
96 0.26
97 0.22
98 0.24
99 0.23
100 0.25
101 0.29
102 0.3
103 0.3
104 0.25
105 0.24
106 0.23
107 0.22
108 0.2
109 0.16
110 0.14
111 0.14
112 0.21
113 0.24
114 0.28
115 0.3
116 0.29
117 0.31
118 0.33
119 0.36
120 0.37
121 0.36
122 0.38
123 0.36
124 0.35
125 0.33
126 0.3
127 0.25
128 0.17
129 0.18
130 0.11
131 0.17
132 0.18
133 0.18
134 0.19
135 0.22
136 0.25
137 0.28
138 0.3
139 0.28
140 0.3
141 0.32
142 0.37
143 0.4
144 0.38
145 0.38
146 0.37
147 0.35
148 0.4
149 0.38
150 0.32
151 0.27
152 0.35
153 0.32
154 0.31
155 0.28
156 0.26
157 0.27
158 0.27
159 0.26
160 0.18
161 0.16
162 0.15
163 0.15
164 0.11
165 0.13
166 0.14
167 0.16
168 0.23
169 0.24
170 0.26
171 0.36
172 0.46
173 0.52
174 0.6
175 0.63
176 0.58
177 0.6
178 0.61
179 0.56
180 0.56
181 0.55
182 0.51
183 0.52
184 0.5
185 0.47
186 0.44
187 0.41
188 0.33
189 0.25
190 0.22
191 0.21
192 0.21
193 0.24
194 0.25
195 0.25
196 0.25
197 0.23
198 0.2
199 0.19
200 0.18
201 0.18
202 0.17
203 0.16
204 0.16
205 0.16
206 0.15
207 0.12
208 0.12
209 0.1
210 0.1
211 0.1
212 0.09
213 0.09
214 0.1
215 0.11
216 0.11
217 0.1
218 0.07
219 0.08
220 0.08
221 0.07
222 0.06
223 0.06
224 0.06
225 0.07
226 0.07
227 0.08
228 0.11
229 0.16
230 0.22
231 0.29
232 0.35
233 0.41
234 0.51
235 0.6
236 0.69
237 0.73
238 0.76
239 0.78
240 0.8
241 0.82
242 0.8
243 0.74
244 0.7
245 0.63
246 0.55
247 0.5
248 0.43
249 0.35
250 0.28
251 0.23
252 0.17
253 0.17
254 0.19
255 0.25
256 0.26
257 0.28
258 0.36
259 0.45
260 0.55
261 0.63
262 0.7
263 0.7
264 0.79
265 0.85
266 0.83
267 0.83
268 0.79
269 0.77
270 0.76
271 0.71
272 0.68
273 0.59
274 0.53
275 0.44
276 0.41
277 0.36
278 0.29
279 0.3
280 0.27
281 0.31
282 0.35
283 0.35
284 0.33
285 0.33
286 0.32
287 0.29
288 0.29
289 0.25
290 0.24
291 0.25
292 0.26
293 0.25
294 0.26
295 0.3
296 0.35
297 0.36
298 0.39
299 0.42
300 0.48
301 0.55
302 0.54
303 0.53
304 0.52
305 0.53
306 0.49
307 0.47
308 0.4
309 0.41
310 0.42
311 0.37
312 0.3
313 0.25
314 0.27
315 0.24
316 0.23
317 0.17
318 0.19
319 0.21
320 0.23
321 0.31
322 0.34
323 0.37
324 0.46
325 0.52
326 0.58
327 0.66
328 0.73
329 0.75
330 0.8
331 0.87
332 0.9